logo

Genes within 1Mb (chr12:96231730:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 2.03e-01 0.0644 0.0505 0.259 B L1
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0414 0.0717 0.259 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 5.15e-01 -0.041 0.0629 0.259 B L1
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 1.88e-02 0.157 0.0662 0.259 B L1
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00229 0.0826 0.259 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0676 0.0607 0.259 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 6.03e-01 0.0463 0.0888 0.259 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0198 0.0419 0.259 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 7.25e-01 0.0206 0.0585 0.259 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 1.27e-01 0.0878 0.0573 0.259 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 1.50e-01 0.0895 0.0621 0.259 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 8.84e-01 -0.013 0.089 0.259 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 6.76e-01 0.0228 0.0545 0.259 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 4.39e-01 0.052 0.067 0.259 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 9.94e-02 -0.0709 0.0428 0.259 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0379 0.0695 0.259 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0178 0.0463 0.259 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 7.02e-01 0.0267 0.0697 0.259 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 8.25e-01 0.0176 0.0792 0.259 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 3.47e-02 -0.12 0.0565 0.259 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 3.18e-01 0.0758 0.0757 0.259 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00732 0.0786 0.268 DC L1
ENSG00000084110 HAL 235365 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0175 0.0894 0.268 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 6.46e-01 0.0454 0.0985 0.268 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 6.77e-01 0.0305 0.0731 0.268 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 3.64e-01 0.0814 0.0894 0.268 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0557 0.0744 0.268 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0222 0.0956 0.268 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 206407 sc-eQTL 1.45e-01 0.126 0.0859 0.268 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 4.59e-02 0.13 0.0649 0.259 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 235365 sc-eQTL 5.45e-04 -0.282 0.0802 0.259 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00402 0.0713 0.259 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0625 0.093 0.259 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 3.50e-01 0.0585 0.0624 0.259 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 2.44e-01 0.0687 0.0588 0.259 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 3.38e-01 0.0868 0.0904 0.259 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 206407 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0451 0.0877 0.259 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 3.13e-03 -0.14 0.0468 0.258 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0327 0.0708 0.258 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 7.29e-01 0.0281 0.0812 0.258 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 4.06e-02 -0.157 0.0763 0.258 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0751 0.0637 0.258 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 2.04e-01 0.103 0.0805 0.258 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0214 0.0403 0.259 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 440578 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0145 0.0746 0.259 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 7.50e-01 0.0246 0.077 0.259 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0566 0.0842 0.259 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0501 0.0657 0.259 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 9.26e-01 0.0057 0.0612 0.259 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 9.75e-02 0.154 0.0925 0.259 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -257841 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0217 0.0964 0.259 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 3.59e-01 0.0835 0.0908 0.263 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0419 0.114 0.263 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 1.86e-01 -0.136 0.103 0.263 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 6.04e-01 0.0567 0.109 0.263 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0142 0.0838 0.263 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 8.48e-01 0.0198 0.103 0.263 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 1.57e-01 0.152 0.107 0.263 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 3.01e-01 0.0793 0.0765 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 6.85e-01 0.0357 0.088 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 1.48e-01 -0.107 0.0739 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 1.95e-02 0.195 0.0827 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 7.46e-01 -0.032 0.0988 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0302 0.0834 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0298 0.0977 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0143 0.0756 0.261 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0333 0.0983 0.261 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 3.63e-02 -0.182 0.0863 0.261 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 1.94e-01 0.111 0.0854 0.261 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 4.96e-01 0.0641 0.094 0.261 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 1.55e-01 -0.129 0.0905 0.261 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 5.72e-02 0.191 0.0997 0.261 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 1.45e-01 0.0916 0.0627 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0117 0.0815 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 9.53e-01 0.00389 0.066 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 2.15e-01 0.0965 0.0777 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0343 0.098 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0314 0.0758 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 2.31e-01 0.116 0.097 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 4.03e-01 0.0662 0.079 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 9.62e-01 0.00453 0.0955 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0569 0.0749 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 4.83e-01 0.0621 0.0883 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 5.54e-01 0.0566 0.0954 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 2.35e-01 -0.104 0.0875 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0113 0.104 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 1.62e-01 -0.104 0.0741 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 7.75e-01 0.0306 0.107 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 1.60e-02 0.251 0.104 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0894 0.106 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0719 0.0847 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0014 0.0925 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 8.18e-02 0.186 0.106 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 9.33e-01 0.00387 0.0457 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0172 0.0659 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 2.22e-01 0.0807 0.0658 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0459 0.066 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 8.71e-01 0.0151 0.0926 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 4.10e-01 0.0484 0.0586 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 3.15e-01 0.0727 0.0721 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0584 0.0454 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 6.40e-01 0.0364 0.0776 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 9.58e-01 0.00406 0.0773 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 2.55e-02 0.169 0.0752 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 1.88e-01 -0.138 0.105 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00755 0.0624 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0053 0.0852 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 1.65e-01 0.077 0.0553 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 6.23e-01 0.0457 0.0928 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 8.42e-01 0.0171 0.0857 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 3.69e-01 0.0716 0.0795 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 4.54e-01 0.0735 0.0979 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0593 0.0833 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0512 0.0989 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0375 0.0527 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00841 0.0911 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0311 0.0952 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0949 0.0865 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0589 0.0965 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0705 0.0795 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0216 0.0894 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0582 0.0636 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0302 0.0847 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 5.20e-02 -0.148 0.0757 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00772 0.0808 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 6.74e-02 0.155 0.0842 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0672 0.0725 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0188 0.0865 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 8.84e-02 -0.118 0.0691 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 5.17e-01 0.0674 0.104 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 9.98e-02 0.168 0.102 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 2.46e-01 -0.1 0.0863 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 2.54e-01 0.107 0.0935 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00284 0.0998 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 4.43e-01 0.075 0.0975 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 2.38e-01 -0.104 0.0878 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 6.68e-02 0.189 0.103 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 2.35e-01 -0.128 0.108 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 2.72e-01 0.117 0.106 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 1.53e-02 -0.218 0.089 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 6.74e-01 0.0416 0.0986 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 2.28e-02 0.243 0.106 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 1.34e-01 0.089 0.0591 0.255 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 440578 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0369 0.0801 0.255 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0178 0.101 0.255 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 6.70e-01 0.0391 0.0918 0.255 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0659 0.077 0.255 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 6.07e-01 -0.046 0.0893 0.255 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 2.04e-02 0.231 0.099 0.255 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -257841 sc-eQTL 7.24e-01 0.0351 0.0994 0.255 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0499 0.0624 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0486 0.105 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 4.00e-01 0.0779 0.0923 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0651 0.098 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 2.39e-01 -0.121 0.102 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0426 0.104 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 3.53e-03 -0.149 0.0505 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 5.02e-01 0.0607 0.0902 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 8.25e-01 0.0206 0.093 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 1.52e-01 -0.118 0.082 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 4.75e-01 0.0561 0.0783 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 3.28e-01 0.0883 0.0901 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 8.15e-01 0.0191 0.0813 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 1.02e-01 -0.167 0.102 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 2.49e-01 0.123 0.106 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0786 0.0988 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0268 0.103 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0516 0.0975 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 4.97e-02 -0.111 0.0564 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 4.85e-02 -0.186 0.0937 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0309 0.0963 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0727 0.092 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0945 0.0778 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 3.27e-02 0.205 0.0955 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 1.85e-01 -0.139 0.105 0.23 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 4.35e-01 0.0964 0.123 0.23 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 2.71e-01 0.102 0.0925 0.23 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 6.21e-01 0.059 0.119 0.23 PB L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00186 0.11 0.23 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 8.38e-01 0.0238 0.116 0.23 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 6.02e-01 0.0723 0.138 0.23 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0534 0.0623 0.261 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 440578 sc-eQTL 6.07e-02 -0.131 0.0695 0.261 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 7.90e-01 -0.022 0.0828 0.261 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 2.22e-01 0.101 0.0822 0.261 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 3.45e-01 0.0942 0.0995 0.261 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 3.45e-01 0.0594 0.0628 0.261 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0526 0.0913 0.261 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -257841 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0625 0.0738 0.261 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 3.98e-01 0.0586 0.0692 0.259 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 9.45e-01 0.00646 0.0943 0.259 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 3.03e-01 0.0903 0.0875 0.259 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 6.63e-01 0.0347 0.0795 0.259 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0635 0.0892 0.259 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 2.46e-01 -0.107 0.0918 0.259 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 5.60e-01 0.06 0.103 0.259 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0295 0.0845 0.273 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 235365 sc-eQTL 6.19e-02 0.163 0.087 0.273 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 9.50e-01 0.00672 0.106 0.273 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0908 0.075 0.273 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 3.70e-01 0.0891 0.0991 0.273 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0188 0.0832 0.273 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 3.74e-01 0.0901 0.101 0.273 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 206407 sc-eQTL 3.01e-01 0.0883 0.0852 0.273 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 3.08e-01 0.0759 0.0744 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 235365 sc-eQTL 7.67e-03 -0.215 0.08 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 6.00e-01 0.0443 0.0843 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00464 0.0879 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 3.22e-01 0.0671 0.0675 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 1.37e-01 0.104 0.0695 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 1.40e-01 0.142 0.0957 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 206407 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00529 0.0897 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 3.51e-02 0.177 0.0833 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 235365 sc-eQTL 9.85e-03 -0.242 0.093 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0649 0.0955 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 8.15e-01 0.0221 0.0944 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0512 0.0768 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 4.50e-01 0.0574 0.0759 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 8.25e-01 0.0228 0.103 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 206407 sc-eQTL 9.45e-01 0.00663 0.0965 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 1.02e-01 -0.136 0.0826 0.273 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 440578 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0366 0.0956 0.273 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 8.32e-01 0.0255 0.12 0.273 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 2.83e-01 -0.134 0.124 0.273 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 7.10e-02 -0.208 0.114 0.273 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 2.55e-01 -0.127 0.111 0.273 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000598 0.123 0.273 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -257841 sc-eQTL 5.91e-01 -0.058 0.108 0.273 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0216 0.0963 0.258 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 235365 sc-eQTL 2.87e-01 -0.104 0.0971 0.258 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00911 0.11 0.258 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 2.71e-01 -0.11 0.0996 0.258 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 6.00e-01 0.0467 0.0889 0.258 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 1.05e-01 0.154 0.0945 0.258 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 5.98e-01 0.0522 0.0988 0.258 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 206407 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0962 0.0992 0.258 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0762 0.0753 0.26 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 235365 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0745 0.0841 0.26 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 6.96e-01 0.0399 0.102 0.26 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 1.08e-01 -0.151 0.0933 0.26 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 5.07e-01 0.0535 0.0805 0.26 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 5.16e-01 0.0535 0.0823 0.26 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0128 0.0875 0.26 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 206407 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0948 0.0996 0.26 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 6.76e-01 0.0416 0.0994 0.277 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 235365 sc-eQTL 1.65e-02 -0.2 0.0824 0.277 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 3.39e-01 0.108 0.113 0.277 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 6.33e-02 0.174 0.0929 0.277 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 5.74e-01 0.0648 0.115 0.277 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 7.89e-01 0.0269 0.1 0.277 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 1.93e-01 -0.144 0.11 0.277 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 206407 sc-eQTL 8.59e-01 0.0169 0.0949 0.277 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 1.96e-01 0.0836 0.0644 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0408 0.0899 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 2.13e-02 -0.154 0.0663 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 3.02e-02 0.166 0.0759 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 7.80e-01 0.0267 0.0957 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0857 0.0742 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 7.10e-02 0.176 0.0968 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 1.17e-01 0.0877 0.0558 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0226 0.076 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0206 0.063 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 1.38e-01 0.106 0.0714 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 680254 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0138 0.0877 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0485 0.0722 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 5.25e-01 0.0609 0.0955 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 1.07e-02 0.171 0.0663 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 235365 sc-eQTL 3.11e-03 -0.239 0.0799 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0646 0.0767 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0142 0.0896 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 5.74e-01 0.0364 0.0647 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 3.30e-01 0.0609 0.0623 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 2.93e-01 0.103 0.0977 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 206407 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00289 0.0907 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0567 0.0692 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 235365 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0936 0.0817 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 7.89e-01 0.0249 0.0929 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0985 0.0906 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 1.88e-01 0.0884 0.0669 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 1.64e-01 0.0963 0.069 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 2.03e-01 0.113 0.0885 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 206407 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0159 0.0941 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -168750 sc-eQTL 1.25e-02 -0.121 0.0479 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 758210 sc-eQTL 7.16e-01 -0.027 0.074 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 188210 sc-eQTL 6.42e-01 0.0394 0.0846 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 37355 sc-eQTL 1.03e-01 -0.126 0.077 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 372802 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0504 0.0662 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 sc-eQTL 7.54e-02 0.147 0.082 0.259 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111144 LTA4H 188210 pQTL 0.0158 0.0469 0.0194 0.0 0.0 0.241
ENSG00000111145 ELK3 37355 eQTL 2.46e-07 0.0977 0.0188 0.0 0.0 0.242
ENSG00000139350 NEDD1 -675493 eQTL 0.0438 0.0533 0.0264 0.0 0.0 0.242

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111145 ELK3 37355 1.08e-05 1.38e-05 1.96e-06 7.89e-06 2.3e-06 5.21e-06 1.44e-05 2.2e-06 1.18e-05 6.13e-06 1.6e-05 6.62e-06 2.07e-05 4.15e-06 3.95e-06 6.97e-06 6.23e-06 9.3e-06 3.17e-06 3.15e-06 6.26e-06 1.16e-05 1.12e-05 3.58e-06 2.06e-05 4.52e-06 6.74e-06 4.89e-06 1.3e-05 1.12e-05 7.68e-06 1.05e-06 1.09e-06 3.54e-06 5.77e-06 2.79e-06 1.76e-06 2e-06 2.17e-06 1.03e-06 1.01e-06 1.6e-05 1.39e-06 1.95e-07 8.22e-07 1.96e-06 1.75e-06 7.99e-07 4.89e-07