logo

Genes within 1Mb (chr12:96210795:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0137 0.0868 0.248 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 6.17e-01 0.027 0.054 0.248 B L1
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0524 0.0763 0.248 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00589 0.0671 0.248 B L1
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 8.26e-01 0.0157 0.0714 0.248 B L1
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 9.34e-01 0.00726 0.088 0.248 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 4.65e-02 -0.129 0.0642 0.248 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 5.47e-01 0.0571 0.0946 0.248 B L1
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0315 0.0882 0.248 B L1
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 5.35e-02 0.139 0.0717 0.248 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 5.06e-01 0.03 0.045 0.248 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 5.78e-01 0.0349 0.0627 0.248 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0311 0.0618 0.248 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0552 0.0668 0.248 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0822 0.0953 0.248 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0642 0.0584 0.248 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0172 0.0721 0.248 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 4.99e-01 0.0589 0.0871 0.248 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 1.75e-02 0.109 0.0456 0.248 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00784 0.0746 0.248 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 7.03e-01 0.0189 0.0496 0.248 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00512 0.0747 0.248 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0226 0.0849 0.248 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0272 0.0612 0.248 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 8.79e-01 0.0124 0.0813 0.248 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 9.06e-01 0.0121 0.103 0.245 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 3.52e-02 0.18 0.085 0.245 DC L1
ENSG00000084110 HAL 214430 sc-eQTL 7.54e-01 0.0306 0.0978 0.245 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0871 0.108 0.245 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 1.35e-01 -0.119 0.0796 0.245 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 9.44e-01 0.0069 0.098 0.245 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0968 0.0812 0.245 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 9.04e-01 0.0126 0.105 0.245 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0479 0.0966 0.245 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 185472 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0967 0.0942 0.245 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 4.02e-01 0.078 0.0928 0.248 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 3.65e-01 0.0617 0.0679 0.248 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 214430 sc-eQTL 8.69e-03 0.223 0.0843 0.248 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 2.90e-02 0.161 0.0732 0.248 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 4.44e-02 -0.194 0.0959 0.248 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 7.47e-01 -0.021 0.065 0.248 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0538 0.0612 0.248 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 9.47e-02 0.157 0.0935 0.248 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 7.82e-01 0.0219 0.0789 0.248 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 185472 sc-eQTL 1.73e-02 -0.216 0.09 0.248 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 4.32e-01 -0.076 0.0965 0.247 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 2.15e-01 0.064 0.0515 0.247 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 9.60e-01 0.00382 0.0765 0.247 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 5.80e-01 0.0486 0.0876 0.247 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 9.97e-01 0.000266 0.0832 0.247 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0825 0.0687 0.247 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 8.14e-01 0.0206 0.0873 0.247 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 2.89e-01 0.113 0.106 0.248 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 2.10e-01 0.0543 0.0431 0.248 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 419643 sc-eQTL 8.36e-01 0.0166 0.08 0.248 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0678 0.0825 0.248 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 5.76e-02 0.171 0.0897 0.248 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 3.96e-02 0.145 0.0699 0.248 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0805 0.0654 0.248 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 2.85e-02 -0.218 0.0988 0.248 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -278776 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0603 0.103 0.248 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0564 0.123 0.242 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 6.19e-01 0.051 0.102 0.242 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0448 0.129 0.242 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0245 0.116 0.242 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 7.27e-01 0.0429 0.123 0.242 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 2.43e-01 0.11 0.0938 0.242 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 1.79e-01 -0.155 0.115 0.242 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 1.24e-01 -0.186 0.12 0.242 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00577 0.0872 0.242 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 2.95e-01 0.113 0.107 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 2.41e-01 -0.101 0.0863 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 2.08e-01 -0.125 0.0989 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 6.87e-01 0.0338 0.0838 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0735 0.0944 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 7.01e-01 0.0428 0.111 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 8.86e-03 -0.245 0.0927 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 1.53e-01 0.157 0.11 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 7.79e-01 -0.028 0.0996 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 5.09e-01 0.0755 0.114 0.241 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 4.04e-01 0.0712 0.0851 0.241 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0155 0.111 0.241 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 9.16e-01 0.0104 0.0984 0.241 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 6.06e-01 0.0499 0.0967 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 9.19e-01 0.0108 0.106 0.241 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 4.25e-01 0.0818 0.102 0.241 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 4.27e-01 0.0901 0.113 0.241 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0896 0.105 0.241 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0414 0.105 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0386 0.0692 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 2.25e-01 -0.109 0.0892 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0376 0.0725 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 5.98e-01 0.0452 0.0856 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0374 0.108 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0917 0.0831 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0841 0.107 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 2.34e-01 0.122 0.102 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00908 0.115 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 2.49e-01 0.102 0.0881 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 4.11e-01 0.0878 0.107 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 7.50e-01 0.0267 0.0837 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 2.87e-01 0.105 0.0985 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0361 0.107 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0446 0.098 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 7.36e-01 0.0393 0.117 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 9.20e-02 -0.147 0.0868 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 1.71e-02 0.257 0.107 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 3.35e-01 0.0762 0.0789 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 4.69e-01 0.082 0.113 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 1.89e-02 -0.26 0.11 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 4.50e-01 0.0853 0.113 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 5.85e-01 0.0492 0.09 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 9.28e-01 0.00885 0.0981 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 9.24e-01 0.0108 0.113 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 7.97e-02 0.144 0.0819 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 2.52e-01 0.0568 0.0494 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 4.62e-01 0.0525 0.0713 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 5.67e-01 -0.041 0.0716 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00456 0.0716 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0908 0.1 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 5.82e-01 -0.035 0.0636 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 9.80e-01 0.00199 0.0784 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 4.45e-01 0.067 0.0876 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 8.27e-01 0.0105 0.0482 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 3.94e-01 0.0701 0.082 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 5.64e-01 0.0473 0.0818 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 1.34e-01 -0.121 0.0801 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 6.61e-01 0.0488 0.111 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 1.77e-01 -0.089 0.0658 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0262 0.0902 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 7.60e-01 0.0338 0.11 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0912 0.0581 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 3.97e-01 0.0827 0.0976 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 6.49e-01 0.0411 0.0902 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 1.10e-01 -0.134 0.0834 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0182 0.103 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 9.19e-01 0.00892 0.0878 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 4.55e-01 0.0778 0.104 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 4.29e-01 0.0776 0.098 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 5.29e-02 0.11 0.0563 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0793 0.098 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 3.37e-01 0.0984 0.102 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0504 0.0933 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00193 0.104 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0278 0.0858 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0698 0.0961 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 9.53e-01 0.00598 0.101 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 2.45e-01 0.0799 0.0686 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 5.06e-02 0.178 0.0906 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 4.10e-01 -0.068 0.0823 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 2.42e-01 0.102 0.0869 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 8.15e-01 0.0214 0.0916 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 1.22e-01 -0.121 0.078 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 5.90e-01 0.0504 0.0933 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0294 0.112 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 8.35e-01 0.016 0.0763 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 7.43e-01 0.0375 0.114 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0687 0.112 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 7.78e-01 0.0269 0.095 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0529 0.103 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 2.94e-01 -0.115 0.109 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0433 0.107 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 5.16e-01 0.0721 0.111 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 3.07e-01 0.0936 0.0914 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0371 0.108 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0826 0.112 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 4.25e-01 -0.088 0.11 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 5.87e-01 0.051 0.0938 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 5.84e-01 0.0562 0.102 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 8.79e-01 -0.017 0.111 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 7.35e-01 0.0371 0.11 0.249 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0307 0.0628 0.249 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 419643 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0158 0.0847 0.249 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 7.71e-01 -0.031 0.107 0.249 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 4.03e-01 0.0811 0.0969 0.249 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 5.27e-02 0.157 0.0807 0.249 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0719 0.0942 0.249 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 3.00e-02 -0.229 0.105 0.249 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -278776 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0324 0.105 0.249 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0837 0.112 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 4.34e-01 -0.051 0.0651 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 6.64e-01 0.0478 0.11 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 2.94e-01 -0.101 0.0962 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0444 0.102 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 3.15e-01 -0.108 0.107 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 1.71e-02 0.256 0.107 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 2.85e-01 -0.116 0.108 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 9.26e-01 0.00517 0.0558 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 1.73e-01 -0.133 0.0974 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 4.68e-01 0.0732 0.101 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0559 0.0892 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0539 0.0849 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0706 0.0977 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0958 0.118 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 8.47e-01 0.0168 0.0872 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 5.24e-01 0.07 0.11 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0141 0.114 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00725 0.106 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 2.96e-02 -0.239 0.109 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 9.85e-01 -0.002 0.105 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 3.37e-01 0.0948 0.0986 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 7.21e-02 0.108 0.0599 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 4.38e-01 0.0778 0.1 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0188 0.102 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 9.99e-01 -6.34e-05 0.0978 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 2.65e-02 -0.183 0.0819 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0334 0.102 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0228 0.128 0.233 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 4.11e-01 0.0898 0.109 0.233 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 7.36e-01 0.043 0.128 0.233 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 6.07e-01 0.0496 0.0962 0.233 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 7.71e-01 -0.036 0.123 0.233 PB L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 3.78e-01 0.101 0.114 0.233 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 2.44e-01 -0.14 0.12 0.233 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 4.71e-01 -0.103 0.143 0.233 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 2.87e-02 0.221 0.0999 0.233 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 8.47e-02 0.179 0.104 0.25 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00134 0.0676 0.25 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 419643 sc-eQTL 5.17e-01 0.0492 0.0758 0.25 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 3.61e-01 0.0819 0.0894 0.25 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 4.77e-01 0.0635 0.0891 0.25 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0872 0.108 0.25 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0711 0.0679 0.25 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 7.47e-01 0.032 0.0988 0.25 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -278776 sc-eQTL 6.32e-01 0.0383 0.0799 0.25 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0396 0.108 0.248 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00887 0.0747 0.248 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0773 0.101 0.248 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0408 0.0945 0.248 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0112 0.0857 0.248 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 1.49e-01 0.139 0.0957 0.248 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 9.96e-02 -0.163 0.0986 0.248 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 8.53e-02 -0.19 0.11 0.248 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0752 0.107 0.234 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 7.82e-02 0.164 0.0926 0.234 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 214430 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0495 0.097 0.234 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 8.98e-01 -0.015 0.117 0.234 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0797 0.083 0.234 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 5.18e-02 -0.213 0.109 0.234 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 8.42e-01 0.0184 0.0919 0.234 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 2.13e-01 -0.139 0.112 0.234 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 9.03e-01 0.0132 0.108 0.234 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 185472 sc-eQTL 1.82e-01 -0.126 0.094 0.234 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 2.06e-01 0.132 0.104 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 2.65e-01 0.0886 0.0793 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 214430 sc-eQTL 9.67e-02 0.144 0.0862 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 4.59e-01 0.0666 0.0898 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 3.72e-02 -0.194 0.0927 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0448 0.0721 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0119 0.0745 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 1.15e-02 0.257 0.101 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 5.73e-01 0.0474 0.0839 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 185472 sc-eQTL 1.39e-01 -0.141 0.0952 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 7.96e-01 0.0273 0.106 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 7.91e-01 0.0238 0.0898 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 214430 sc-eQTL 3.26e-01 0.0989 0.101 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 5.41e-02 0.196 0.101 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 9.18e-02 -0.169 0.1 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 9.39e-01 0.0063 0.082 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0321 0.081 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0432 0.109 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0726 0.0974 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 185472 sc-eQTL 5.24e-02 -0.199 0.102 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0246 0.136 0.245 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 3.57e-01 0.0828 0.0896 0.245 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 419643 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0151 0.103 0.245 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 3.66e-01 -0.117 0.129 0.245 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 5.41e-01 0.0824 0.134 0.245 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 8.65e-01 0.0212 0.124 0.245 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 3.18e-01 -0.12 0.12 0.245 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0899 0.132 0.245 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -278776 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0485 0.116 0.245 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0676 0.114 0.249 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 1.32e-02 0.251 0.1 0.249 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 214430 sc-eQTL 1.42e-01 0.151 0.102 0.249 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 4.62e-01 0.0858 0.116 0.249 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 2.97e-02 -0.229 0.104 0.249 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0434 0.0941 0.249 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 9.30e-01 0.00882 0.101 0.249 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 7.59e-01 0.0321 0.105 0.249 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 1.32e-01 0.152 0.101 0.249 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 185472 sc-eQTL 3.22e-02 -0.224 0.104 0.249 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0346 0.102 0.256 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 3.66e-01 0.0718 0.0793 0.256 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 214430 sc-eQTL 1.67e-01 0.122 0.0882 0.256 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 9.95e-01 0.000609 0.107 0.256 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 2.42e-02 -0.222 0.0976 0.256 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0766 0.0847 0.256 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 1.39e-01 -0.128 0.0862 0.256 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 4.59e-01 0.0682 0.092 0.256 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0549 0.101 0.256 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 185472 sc-eQTL 1.33e-02 -0.258 0.103 0.256 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00532 0.119 0.243 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 1.40e-01 0.158 0.106 0.243 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 214430 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0357 0.0902 0.243 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0774 0.122 0.243 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 1.90e-01 -0.132 0.101 0.243 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0323 0.124 0.243 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0786 0.108 0.243 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 7.39e-02 0.212 0.118 0.243 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0878 0.105 0.243 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 185472 sc-eQTL 1.56e-01 -0.145 0.101 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 1.04e-01 0.172 0.106 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0225 0.0711 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0944 0.0987 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 7.74e-01 0.0213 0.0739 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0458 0.0844 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0168 0.105 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0602 0.0817 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 2.75e-01 0.117 0.107 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 2.43e-01 -0.11 0.0939 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0894 0.1 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0126 0.0619 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0117 0.0838 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0451 0.0695 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 4.68e-01 0.0575 0.0791 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 659319 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0347 0.0968 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 1.41e-01 -0.117 0.0793 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000914 0.106 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 9.21e-01 0.0105 0.106 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 2.73e-01 0.105 0.0954 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 2.55e-01 0.0816 0.0715 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 214430 sc-eQTL 4.18e-02 0.176 0.086 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 6.88e-02 0.148 0.0812 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 4.22e-02 -0.193 0.0944 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0416 0.0688 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0487 0.0664 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 1.12e-01 0.166 0.104 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0123 0.0827 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 185472 sc-eQTL 5.50e-02 -0.185 0.0958 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0626 0.107 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 4.74e-02 0.144 0.0723 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 214430 sc-eQTL 2.00e-01 0.111 0.0859 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 8.35e-01 0.0205 0.0978 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 6.19e-03 -0.26 0.0939 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0643 0.0706 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00605 0.073 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 5.44e-01 0.0569 0.0935 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 993313 sc-eQTL 5.16e-01 0.0583 0.0896 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 185472 sc-eQTL 3.63e-03 -0.286 0.097 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 993049 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0839 0.0996 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -189685 sc-eQTL 3.20e-01 0.052 0.0522 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 737275 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00634 0.0797 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 167275 sc-eQTL 4.05e-01 0.0758 0.0909 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 16420 sc-eQTL 9.79e-01 0.0022 0.0834 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 351867 sc-eQTL 1.24e-01 -0.109 0.0709 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0514 0.0889 0.246 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111145 ELK3 16420 eQTL 0.00085 -0.0734 0.0219 0.0 0.0 0.2
ENSG00000139350 NEDD1 -696428 eQTL 0.0319 0.0657 0.0306 0.0 0.0 0.2

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina