logo

Genes within 1Mb (chr12:96166796:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0113 0.0899 0.201 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0156 0.0559 0.201 B L1
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0373 0.0791 0.201 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 1.39e-01 -0.103 0.0691 0.201 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 7.05e-01 -0.028 0.0739 0.201 B L1
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 8.34e-01 0.0191 0.0912 0.201 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0422 0.0671 0.201 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 2.36e-02 -0.221 0.0969 0.201 B L1
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 8.44e-01 0.0181 0.0914 0.201 B L1
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0243 0.0736 0.201 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 6.80e-02 0.0833 0.0454 0.201 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 6.61e-01 0.028 0.0639 0.201 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 3.10e-01 0.0639 0.0628 0.201 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0955 0.0678 0.201 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 2.50e-01 0.112 0.0969 0.201 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0543 0.0594 0.201 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0538 0.0732 0.201 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000984 0.0887 0.201 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 5.20e-01 0.0303 0.047 0.201 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 1.84e-01 0.101 0.0756 0.201 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 7.21e-01 0.018 0.0505 0.201 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 1.04e-01 -0.123 0.0755 0.201 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0412 0.0864 0.201 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0575 0.0622 0.201 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 2.24e-01 0.101 0.0825 0.201 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 7.69e-01 0.0307 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 3.94e-02 -0.179 0.0863 0.198 DC L1
ENSG00000084110 HAL 170431 sc-eQTL 2.30e-02 0.224 0.098 0.198 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 1.34e-01 -0.164 0.109 0.198 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0936 0.0809 0.198 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 6.73e-02 -0.181 0.0986 0.198 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 6.33e-01 0.0395 0.0827 0.198 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 1.74e-01 -0.144 0.106 0.198 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 1.14e-01 0.155 0.0974 0.198 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 141473 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0507 0.0958 0.198 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 7.74e-01 0.0278 0.0967 0.201 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0433 0.0707 0.201 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 170431 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0646 0.0891 0.201 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0555 0.077 0.201 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 2.50e-01 -0.116 0.1 0.201 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 4.51e-01 0.051 0.0675 0.201 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 7.02e-01 0.0244 0.0637 0.201 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 2.21e-01 -0.12 0.0976 0.201 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0298 0.082 0.201 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 141473 sc-eQTL 6.51e-01 -0.043 0.0948 0.201 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 5.03e-01 0.0657 0.098 0.2 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 1.11e-01 0.0835 0.0521 0.2 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0318 0.0776 0.2 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 2.72e-01 0.0978 0.0887 0.2 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 6.27e-01 0.0411 0.0844 0.2 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 5.27e-01 0.0443 0.0699 0.2 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 5.47e-01 0.0534 0.0885 0.2 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000437 0.109 0.201 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 1.49e-01 0.0641 0.0443 0.201 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 375644 sc-eQTL 1.94e-01 -0.107 0.0819 0.201 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 9.13e-01 0.00933 0.0849 0.201 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 6.21e-01 0.0461 0.0929 0.201 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 1.47e-01 -0.105 0.0722 0.201 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 3.99e-01 0.0569 0.0673 0.201 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 9.46e-01 0.00693 0.103 0.201 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -322775 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0957 0.106 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 3.84e-01 -0.111 0.128 0.196 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 2.29e-01 0.128 0.106 0.196 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0727 0.133 0.196 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0409 0.12 0.196 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0673 0.127 0.196 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 7.58e-01 0.0302 0.0976 0.196 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 1.59e-01 0.169 0.119 0.196 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 8.44e-01 0.0247 0.125 0.196 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00282 0.0904 0.196 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 3.58e-01 0.0995 0.108 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 8.81e-01 -0.013 0.0871 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 6.78e-01 0.0416 0.0999 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0335 0.0844 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0676 0.095 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0193 0.112 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000561 0.0948 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0512 0.111 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 3.69e-01 0.09 0.1 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0269 0.113 0.203 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00648 0.0844 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 5.94e-01 0.0585 0.11 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 3.67e-02 -0.203 0.0964 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0378 0.0958 0.203 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 1.22e-01 0.162 0.105 0.203 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 2.08e-01 -0.128 0.101 0.203 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0603 0.112 0.203 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0302 0.105 0.203 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0568 0.105 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00894 0.0692 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 9.52e-01 0.00536 0.0895 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 1.44e-01 -0.106 0.0721 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 7.37e-01 0.0288 0.0856 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 3.12e-02 0.231 0.107 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0869 0.0831 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 1.52e-01 -0.153 0.106 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 1.86e-01 -0.135 0.102 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 9.09e-01 0.0131 0.114 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0138 0.0875 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 5.14e-01 -0.069 0.106 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0502 0.0828 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0797 0.0976 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 1.30e-01 -0.16 0.105 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 5.50e-01 0.058 0.097 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 3.96e-02 -0.237 0.114 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 1.39e-01 0.128 0.0861 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0902 0.113 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0172 0.0828 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 7.70e-01 0.0347 0.118 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 3.60e-01 0.107 0.117 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 3.69e-01 0.106 0.118 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 9.52e-01 0.00566 0.0944 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0754 0.103 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 5.04e-02 -0.232 0.118 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 9.27e-01 0.00777 0.0842 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 5.40e-01 0.031 0.0505 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 8.07e-01 0.0178 0.0729 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 4.31e-01 0.0576 0.073 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 1.31e-01 -0.11 0.0727 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 1.90e-01 0.134 0.102 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0892 0.0647 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0358 0.08 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 2.61e-01 -0.101 0.0895 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 4.17e-02 0.1 0.0489 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 6.36e-01 0.0398 0.0841 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 8.81e-01 0.0126 0.0838 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0193 0.0824 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 3.72e-01 0.102 0.114 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 8.37e-01 -0.014 0.0676 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0311 0.0924 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0793 0.116 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 1.50e-02 0.149 0.0607 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 2.91e-01 0.108 0.103 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 2.69e-01 -0.105 0.0947 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0582 0.0882 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 3.07e-01 -0.111 0.108 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 6.06e-01 0.0477 0.0924 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 1.18e-01 -0.171 0.109 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 3.13e-01 -0.104 0.103 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 3.24e-01 0.0587 0.0594 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 9.07e-02 0.174 0.102 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 5.04e-01 0.0719 0.107 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 8.73e-01 0.0157 0.0979 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0818 0.109 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0307 0.09 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0406 0.101 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 3.93e-01 0.0885 0.103 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00934 0.0706 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0965 0.0935 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 5.89e-01 0.0457 0.0845 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 7.82e-02 -0.157 0.0888 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 1.26e-01 -0.144 0.0934 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0156 0.0804 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 2.12e-01 0.119 0.0954 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 7.44e-01 0.0374 0.114 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 7.70e-01 0.0227 0.0777 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 1.28e-01 0.176 0.115 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 2.11e-01 -0.143 0.114 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0896 0.0965 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 6.42e-01 0.0487 0.105 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00159 0.111 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 1.02e-01 0.178 0.108 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 3.78e-01 -0.105 0.119 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 9.21e-02 0.165 0.0976 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 1.24e-01 0.177 0.115 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 5.16e-01 0.0783 0.12 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0835 0.118 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 4.43e-01 0.0774 0.101 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 7.22e-01 0.0392 0.11 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0544 0.119 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0294 0.113 0.199 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 1.11e-02 0.163 0.0636 0.199 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 375644 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0982 0.0868 0.199 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 2.49e-01 -0.126 0.109 0.199 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0534 0.0997 0.199 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0177 0.0837 0.199 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0214 0.097 0.199 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 5.85e-01 0.0596 0.109 0.199 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -322775 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0754 0.108 0.199 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 3.44e-01 -0.108 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 2.52e-02 0.148 0.0656 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0444 0.112 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 4.35e-01 0.0768 0.0981 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0682 0.104 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 9.76e-02 -0.18 0.108 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0903 0.11 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 8.07e-01 0.0267 0.109 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 2.15e-01 0.0698 0.0561 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 6.81e-01 0.0405 0.0986 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 3.17e-01 0.102 0.101 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 4.55e-01 0.0673 0.0899 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 5.20e-01 0.0551 0.0856 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 1.57e-01 0.14 0.0982 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 3.47e-01 0.116 0.123 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 7.23e-01 0.0322 0.0909 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0778 0.114 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 2.02e-01 0.152 0.119 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0511 0.111 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 3.98e-01 0.0974 0.115 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0348 0.109 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 2.37e-01 0.12 0.102 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 5.03e-01 0.0418 0.0623 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 7.96e-01 0.0268 0.104 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 2.62e-02 0.233 0.104 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 9.49e-01 0.00645 0.101 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 2.54e-01 0.0974 0.0852 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0737 0.106 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 2.50e-01 0.153 0.132 0.23 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 7.09e-01 0.0424 0.113 0.23 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 3.11e-03 -0.385 0.127 0.23 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 9.75e-01 0.00312 0.0999 0.23 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 3.33e-01 -0.124 0.128 0.23 PB L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 1.59e-01 -0.167 0.118 0.23 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 7.68e-01 -0.037 0.125 0.23 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 2.62e-01 0.167 0.148 0.23 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 3.07e-01 -0.108 0.105 0.23 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 3.98e-01 0.0903 0.107 0.202 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 4.35e-01 0.0541 0.0691 0.202 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 375644 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0848 0.0775 0.202 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 3.53e-01 0.0853 0.0916 0.202 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0249 0.0914 0.202 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 1.05e-01 -0.179 0.11 0.202 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 1.65e-01 0.0966 0.0694 0.202 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 9.42e-01 0.00734 0.101 0.202 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -322775 sc-eQTL 7.81e-01 0.0228 0.0819 0.202 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 9.06e-01 0.0129 0.109 0.201 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 4.00e-01 0.0636 0.0755 0.201 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0668 0.103 0.201 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 6.65e-02 0.175 0.095 0.201 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0648 0.0866 0.201 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0328 0.0974 0.201 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 2.31e-01 0.12 0.1 0.201 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 7.50e-01 0.0358 0.112 0.201 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 3.71e-01 0.098 0.109 0.2 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 2.25e-01 -0.116 0.0953 0.2 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 170431 sc-eQTL 2.45e-04 0.359 0.0959 0.2 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 1.72e-01 -0.164 0.119 0.2 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 6.57e-02 -0.156 0.0845 0.2 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 7.20e-01 0.0404 0.113 0.2 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 5.41e-02 -0.181 0.0933 0.2 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 5.01e-01 0.0773 0.115 0.2 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 3.15e-01 0.112 0.111 0.2 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 141473 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0355 0.0968 0.2 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 6.08e-01 0.055 0.107 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 6.56e-01 0.0365 0.0818 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 170431 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0698 0.0891 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0896 0.0923 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 2.69e-01 -0.107 0.0961 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 5.51e-01 0.0444 0.0742 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0244 0.0766 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0668 0.105 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0144 0.0864 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 141473 sc-eQTL 2.50e-01 -0.113 0.0981 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0204 0.109 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 8.08e-03 -0.243 0.0909 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 170431 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0391 0.104 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 2.92e-01 0.111 0.105 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 2.66e-01 -0.115 0.103 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 6.42e-01 0.0393 0.0844 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0179 0.0834 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00314 0.113 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 5.64e-01 -0.058 0.1 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 141473 sc-eQTL 4.80e-01 -0.075 0.106 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 1.35e-01 0.214 0.142 0.191 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 3.96e-01 0.0807 0.0947 0.191 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 375644 sc-eQTL 2.11e-01 -0.136 0.108 0.191 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 4.96e-01 0.093 0.136 0.191 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 4.25e-01 0.113 0.142 0.191 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 7.31e-01 0.0453 0.131 0.191 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 1.77e-01 0.171 0.126 0.191 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 3.33e-01 0.136 0.14 0.191 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -322775 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0846 0.123 0.191 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00728 0.117 0.198 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 1.32e-01 -0.157 0.104 0.198 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 170431 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0677 0.105 0.198 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 3.38e-01 -0.114 0.119 0.198 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0502 0.108 0.198 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 4.65e-01 0.0704 0.0963 0.198 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 3.03e-01 -0.106 0.103 0.198 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 6.10e-01 0.0546 0.107 0.198 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 1.49e-01 -0.15 0.103 0.198 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 141473 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0842 0.108 0.198 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0273 0.106 0.199 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0727 0.082 0.199 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 170431 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000152 0.0918 0.199 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0144 0.111 0.199 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0852 0.102 0.199 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 6.65e-01 -0.038 0.0878 0.199 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 8.20e-02 0.156 0.089 0.199 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 4.75e-02 -0.188 0.0943 0.199 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 5.28e-01 0.0659 0.104 0.199 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 141473 sc-eQTL 3.55e-01 0.101 0.109 0.199 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 9.41e-01 0.00887 0.121 0.201 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 3.52e-02 -0.226 0.106 0.201 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 170431 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0467 0.0911 0.201 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 4.51e-02 -0.246 0.122 0.201 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 5.86e-01 0.0557 0.102 0.201 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 4.42e-01 -0.096 0.125 0.201 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 3.25e-01 0.107 0.109 0.201 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 1.26e-01 -0.183 0.119 0.201 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0904 0.106 0.201 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 141473 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0903 0.103 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0435 0.109 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00859 0.0727 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0101 0.101 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 8.22e-02 -0.131 0.075 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0456 0.0862 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 4.35e-01 0.084 0.107 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 2.25e-01 -0.101 0.0833 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 7.49e-01 0.0351 0.11 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 6.54e-01 0.0431 0.0962 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0442 0.101 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 9.46e-01 0.00421 0.0623 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00236 0.0844 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0572 0.0699 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0152 0.0797 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 615320 sc-eQTL 5.70e-01 0.0553 0.0973 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0178 0.0802 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 1.03e-02 -0.271 0.105 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 7.09e-01 -0.04 0.107 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 7.78e-01 0.0277 0.0981 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0565 0.0735 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 170431 sc-eQTL 7.03e-01 -0.034 0.0891 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 7.03e-01 -0.032 0.0839 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 2.23e-01 -0.119 0.0975 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 4.72e-01 0.0509 0.0706 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0218 0.0682 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0578 0.107 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00985 0.0848 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 141473 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0793 0.099 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00968 0.112 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0973 0.076 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 170431 sc-eQTL 9.60e-01 0.00449 0.0902 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 1.44e-01 -0.149 0.102 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0683 0.0999 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 4.79e-01 0.0524 0.0739 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 5.77e-01 0.0426 0.0763 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 2.98e-01 -0.102 0.0977 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 949314 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0493 0.0938 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 141473 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0066 0.104 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 949050 sc-eQTL 2.16e-01 0.125 0.101 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -233684 sc-eQTL 1.91e-01 0.0693 0.0528 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 693276 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0545 0.0806 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 123276 sc-eQTL 2.39e-01 0.109 0.0919 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -27579 sc-eQTL 5.94e-01 0.0451 0.0844 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 307868 sc-eQTL 3.84e-01 0.0629 0.0721 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -740427 sc-eQTL 4.88e-01 0.0625 0.09 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000257878 AC007298.2 170275 eQTL 0.0396 0.0302 0.0147 0.00148 0.0 0.18

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina