logo

Genes within 1Mb (chr12:96155863:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 5.53e-01 0.0726 0.122 0.096 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 4.22e-01 -0.061 0.0758 0.096 B L1
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0221 0.107 0.096 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 5.91e-01 0.0507 0.0943 0.096 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0358 0.1 0.096 B L1
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 5.18e-02 0.24 0.123 0.096 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0976 0.091 0.096 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 1.69e-01 0.183 0.133 0.096 B L1
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 3.18e-01 -0.124 0.124 0.096 B L1
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00755 0.101 0.096 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 7.38e-01 0.021 0.0626 0.096 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 5.04e-01 0.0584 0.0873 0.096 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 4.80e-01 0.0608 0.0859 0.096 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 4.82e-01 0.0655 0.093 0.096 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 5.38e-02 0.255 0.132 0.096 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 1.54e-01 -0.116 0.081 0.096 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 2.72e-01 0.11 0.1 0.096 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 3.47e-01 0.113 0.12 0.096 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00223 0.0635 0.096 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 1.04e-02 -0.261 0.101 0.096 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 5.05e-01 0.0455 0.0681 0.096 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0218 0.103 0.096 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 4.04e-01 0.0976 0.117 0.096 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0935 0.0839 0.096 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 2.10e-01 -0.14 0.111 0.096 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0276 0.14 0.097 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 6.34e-01 0.0557 0.117 0.097 DC L1
ENSG00000084110 HAL 159498 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0885 0.133 0.097 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0852 0.147 0.097 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 5.13e-01 0.0714 0.109 0.097 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0533 0.133 0.097 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 1.50e-01 -0.159 0.11 0.097 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0508 0.142 0.097 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 8.01e-01 0.0333 0.131 0.097 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 130540 sc-eQTL 8.38e-01 0.0263 0.129 0.097 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0615 0.132 0.096 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0527 0.0967 0.096 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 159498 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0583 0.122 0.096 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0528 0.105 0.096 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 4.28e-01 0.109 0.137 0.096 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00454 0.0924 0.096 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 4.56e-01 0.065 0.087 0.096 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0442 0.134 0.096 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 1.79e-01 0.151 0.112 0.096 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 130540 sc-eQTL 8.82e-01 0.0192 0.13 0.096 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 3.89e-01 0.114 0.132 0.097 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0513 0.0705 0.097 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 6.71e-01 0.0444 0.104 0.097 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 7.30e-01 0.0414 0.12 0.097 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0851 0.113 0.097 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 5.84e-02 -0.178 0.0934 0.097 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 9.39e-01 0.00911 0.119 0.097 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 8.34e-01 0.0306 0.146 0.096 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0587 0.0592 0.096 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 364711 sc-eQTL 1.16e-01 0.172 0.109 0.096 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 5.55e-02 -0.216 0.112 0.096 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 2.37e-01 0.147 0.124 0.096 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 4.96e-02 0.19 0.096 0.096 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 7.93e-01 0.0236 0.09 0.096 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0833 0.137 0.096 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -333708 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0207 0.142 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 2.62e-01 -0.182 0.162 0.099 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 1.47e-01 -0.195 0.134 0.099 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 4.63e-01 -0.124 0.169 0.099 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 3.86e-02 0.314 0.15 0.099 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0274 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0998 0.124 0.099 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 1.90e-01 -0.199 0.151 0.099 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0136 0.159 0.099 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 2.83e-01 -0.123 0.114 0.099 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0895 0.145 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 3.07e-01 -0.119 0.117 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 1.61e-01 -0.188 0.134 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0454 0.113 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 5.31e-01 0.0801 0.128 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 1.04e-01 0.244 0.15 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0916 0.127 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 2.38e-01 0.176 0.149 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 1.30e-01 -0.203 0.134 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0289 0.154 0.095 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 2.44e-01 0.134 0.115 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 4.28e-01 -0.119 0.149 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 2.92e-01 -0.14 0.133 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 4.98e-01 0.0886 0.13 0.095 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 1.65e-01 -0.199 0.143 0.095 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0965 0.138 0.095 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 1.97e-01 0.198 0.153 0.095 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0932 0.142 0.095 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 3.62e-01 0.131 0.144 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 2.15e-01 -0.117 0.0943 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0534 0.122 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 8.79e-01 0.0151 0.0991 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 3.11e-01 -0.119 0.117 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 6.28e-02 0.273 0.146 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 8.93e-02 -0.193 0.113 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 7.79e-01 -0.041 0.146 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 6.53e-01 -0.063 0.14 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 5.96e-01 0.0822 0.155 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 5.21e-01 0.0762 0.118 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00606 0.143 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 8.20e-01 0.0255 0.112 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0571 0.132 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 3.60e-01 0.131 0.143 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 1.42e-01 -0.193 0.131 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 3.71e-01 0.14 0.156 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 1.88e-01 -0.154 0.117 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 4.89e-01 -0.104 0.151 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 3.87e-01 0.0952 0.11 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0476 0.158 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0862 0.155 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 8.22e-02 0.272 0.156 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0322 0.125 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 3.78e-01 -0.121 0.136 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 3.92e-01 0.135 0.158 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 7.52e-01 0.036 0.114 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 5.84e-01 0.0375 0.0684 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 2.70e-01 0.109 0.0985 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 2.92e-01 0.104 0.0988 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 4.62e-01 0.0728 0.0989 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 3.83e-02 0.286 0.137 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0975 0.0878 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 3.74e-01 0.0964 0.108 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0453 0.121 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0226 0.0668 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 5.61e-01 0.0662 0.114 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 9.29e-01 0.0101 0.113 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0186 0.112 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 2.59e-01 0.174 0.154 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000481 0.0915 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 9.68e-01 0.00507 0.125 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0513 0.155 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 1.47e-01 -0.119 0.0815 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 8.46e-02 -0.236 0.136 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0987 0.126 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0376 0.118 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 4.71e-01 0.104 0.144 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 8.82e-01 0.0183 0.123 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 4.01e-01 0.123 0.146 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 3.89e-01 -0.119 0.137 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0454 0.0796 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 3.62e-03 -0.397 0.135 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 3.76e-01 0.127 0.144 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 3.79e-01 -0.115 0.131 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 7.15e-01 0.0534 0.146 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 9.37e-02 -0.201 0.12 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 5.01e-01 0.091 0.135 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 1.81e-01 0.187 0.139 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 6.94e-01 0.0375 0.0951 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0462 0.126 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 6.45e-01 0.0526 0.114 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 5.23e-01 0.077 0.12 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 7.01e-01 0.0486 0.127 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 6.36e-01 0.0514 0.108 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 2.96e-01 -0.135 0.129 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 9.34e-01 0.0127 0.154 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 2.46e-01 0.121 0.104 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0803 0.156 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0873 0.154 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 4.83e-01 0.0917 0.13 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 5.19e-02 0.274 0.14 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 3.13e-01 -0.152 0.15 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0521 0.147 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0513 0.155 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 2.18e-01 -0.158 0.128 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0225 0.151 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0892 0.157 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0161 0.155 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 6.51e-01 0.0595 0.131 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 9.21e-01 0.0142 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 1.42e-01 -0.229 0.155 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 8.35e-01 0.0312 0.15 0.097 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 1.86e-01 -0.113 0.0855 0.097 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 364711 sc-eQTL 5.64e-01 0.0668 0.116 0.097 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 4.50e-01 -0.11 0.146 0.097 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 4.30e-01 0.105 0.132 0.097 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 6.97e-02 0.201 0.11 0.097 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0864 0.129 0.097 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 3.43e-01 -0.137 0.145 0.097 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -333708 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0732 0.144 0.097 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 9.33e-01 0.0127 0.152 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 2.38e-01 -0.105 0.0883 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 2.60e-01 0.168 0.149 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0713 0.131 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 5.81e-03 -0.38 0.136 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 4.56e-03 -0.409 0.143 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0212 0.147 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0863 0.148 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 8.59e-02 -0.13 0.0756 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 2.86e-01 -0.142 0.133 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 5.90e-01 0.0741 0.138 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0274 0.122 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 4.42e-02 -0.232 0.115 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 9.63e-01 0.00617 0.134 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0125 0.162 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 2.86e-01 0.128 0.12 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 1.83e-02 0.354 0.149 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0196 0.157 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0931 0.146 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 3.36e-01 -0.146 0.152 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 5.45e-01 0.0872 0.144 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 2.21e-01 0.168 0.137 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0455 0.0842 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 2.76e-01 0.152 0.139 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 7.84e-01 0.0391 0.142 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 9.65e-01 0.00598 0.136 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00597 0.115 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0181 0.143 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 3.42e-01 0.206 0.216 0.07 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 4.36e-01 -0.144 0.185 0.07 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 6.51e-01 0.0982 0.216 0.07 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 3.85e-01 0.142 0.163 0.07 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 1.29e-01 -0.317 0.207 0.07 PB L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 8.98e-01 0.025 0.194 0.07 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 3.72e-01 0.183 0.204 0.07 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0798 0.243 0.07 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0335 0.173 0.07 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0517 0.144 0.098 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0085 0.0935 0.098 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 364711 sc-eQTL 5.87e-04 0.356 0.102 0.098 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 1.16e-01 -0.194 0.123 0.098 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0685 0.123 0.098 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 4.94e-01 0.102 0.149 0.098 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 5.96e-01 0.05 0.0941 0.098 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 7.23e-01 0.0486 0.137 0.098 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -333708 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0711 0.111 0.098 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 8.64e-01 0.0256 0.15 0.096 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 8.92e-01 0.0142 0.104 0.096 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 3.79e-01 -0.125 0.141 0.096 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0905 0.132 0.096 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0302 0.119 0.096 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00513 0.134 0.096 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 5.23e-03 -0.383 0.136 0.096 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 3.58e-01 0.142 0.154 0.096 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00379 0.142 0.098 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 7.74e-01 0.0358 0.124 0.098 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 159498 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0522 0.129 0.098 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0579 0.156 0.098 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 6.70e-01 0.0473 0.111 0.098 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 3.01e-01 -0.151 0.146 0.098 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 9.44e-01 0.00862 0.123 0.098 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 2.33e-01 -0.178 0.149 0.098 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 4.23e-01 -0.116 0.144 0.098 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 130540 sc-eQTL 8.90e-01 0.0175 0.126 0.098 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 7.44e-01 0.0474 0.145 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 7.80e-01 0.031 0.111 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 159498 sc-eQTL 3.71e-01 -0.108 0.12 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 3.53e-01 -0.116 0.125 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 5.54e-01 0.0771 0.13 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 2.56e-01 -0.114 0.1 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 4.47e-01 0.0788 0.103 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 9.71e-01 0.00524 0.143 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 1.96e-01 0.151 0.116 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 130540 sc-eQTL 9.87e-01 0.00222 0.133 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 6.68e-02 -0.268 0.146 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 9.73e-01 0.0043 0.125 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 159498 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0728 0.14 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 3.67e-01 -0.128 0.142 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 4.69e-01 0.101 0.14 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 6.31e-01 0.0549 0.114 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 8.00e-01 0.0285 0.113 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 9.24e-01 0.0146 0.152 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 3.66e-01 0.123 0.135 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 130540 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0452 0.143 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 5.85e-01 0.0993 0.182 0.106 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 8.96e-02 -0.204 0.119 0.106 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 364711 sc-eQTL 3.79e-01 0.122 0.138 0.106 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 1.58e-01 -0.244 0.172 0.106 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 7.54e-01 0.0566 0.18 0.106 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 4.57e-02 0.331 0.164 0.106 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 1.16e-01 -0.252 0.159 0.106 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 7.37e-01 0.0597 0.178 0.106 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -333708 sc-eQTL 2.61e-01 0.175 0.155 0.106 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 4.63e-01 -0.117 0.16 0.096 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0248 0.142 0.096 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 159498 sc-eQTL 2.93e-01 0.151 0.143 0.096 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 7.19e-01 0.0587 0.163 0.096 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000207 0.147 0.096 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00925 0.131 0.096 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 2.14e-01 0.174 0.14 0.096 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00896 0.146 0.096 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 1.62e-02 0.338 0.139 0.096 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 130540 sc-eQTL 2.11e-01 -0.183 0.146 0.096 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 7.25e-02 -0.256 0.142 0.1 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 6.37e-01 0.0525 0.111 0.1 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 159498 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0992 0.124 0.1 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 4.03e-01 -0.126 0.15 0.1 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 3.74e-01 0.123 0.138 0.1 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 5.68e-01 -0.068 0.119 0.1 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 8.34e-01 0.0254 0.121 0.1 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0363 0.129 0.1 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0563 0.141 0.1 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 130540 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0433 0.147 0.1 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 4.78e-01 -0.113 0.159 0.099 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 8.50e-01 0.0269 0.142 0.099 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 159498 sc-eQTL 3.64e-01 -0.109 0.12 0.099 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 2.07e-01 -0.204 0.161 0.099 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 9.51e-01 0.0083 0.134 0.099 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 4.64e-01 0.121 0.164 0.099 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 2.00e-01 -0.183 0.143 0.099 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 3.36e-01 0.152 0.158 0.099 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 1.24e-02 0.345 0.137 0.099 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 130540 sc-eQTL 1.00e+00 8.49e-05 0.136 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0361 0.146 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0458 0.098 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 3.20e-01 -0.136 0.136 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0474 0.102 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 5.21e-01 0.0748 0.116 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0452 0.145 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 1.72e-01 -0.154 0.112 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 1.07e-01 0.238 0.147 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 1.93e-01 -0.169 0.129 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 4.10e-01 0.114 0.138 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0713 0.0849 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0351 0.115 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0299 0.0954 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 3.03e-01 -0.112 0.108 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 604387 sc-eQTL 5.81e-02 0.251 0.132 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 1.35e-02 -0.269 0.108 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 7.71e-01 0.0421 0.145 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 1.86e-01 -0.193 0.145 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 9.17e-01 0.0141 0.135 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 8.15e-01 0.0237 0.101 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 159498 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0673 0.122 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0994 0.115 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 6.73e-01 0.0569 0.134 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0481 0.0971 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 2.05e-01 0.119 0.0934 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 9.81e-01 0.00355 0.147 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 1.62e-01 0.163 0.116 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 130540 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00993 0.136 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 1.05e-01 -0.241 0.148 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 4.39e-01 0.0786 0.101 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 159498 sc-eQTL 3.85e-01 -0.104 0.12 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0366 0.136 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 8.12e-01 0.0316 0.133 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 8.55e-01 -0.018 0.0984 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 7.09e-01 0.0379 0.101 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 3.86e-01 -0.113 0.13 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 938381 sc-eQTL 3.97e-01 0.106 0.125 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 130540 sc-eQTL 3.18e-01 -0.137 0.137 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 938117 sc-eQTL 5.80e-01 0.0755 0.136 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -244617 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0823 0.0713 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 682343 sc-eQTL 9.02e-01 0.0135 0.109 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 112343 sc-eQTL 4.96e-01 0.0847 0.124 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -38512 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0166 0.114 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 296935 sc-eQTL 1.38e-01 -0.144 0.0968 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -751360 sc-eQTL 9.32e-01 0.0103 0.121 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000180263 FGD6 938381 eQTL 0.0312 0.069 0.032 0.0 0.0 0.11

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000084110 \N 159498 2.96e-06 2.78e-06 4.93e-07 2.01e-06 7.65e-07 7.86e-07 2.22e-06 8.94e-07 2.38e-06 1.27e-06 2.78e-06 1.67e-06 3.99e-06 1.4e-06 9.19e-07 2.11e-06 1.61e-06 2.16e-06 1.49e-06 1.39e-06 1.4e-06 3.17e-06 2.75e-06 1.56e-06 4.08e-06 1.25e-06 1.48e-06 1.81e-06 2.85e-06 2.5e-06 2.03e-06 3.82e-07 5.81e-07 1.36e-06 1.56e-06 8.93e-07 9.09e-07 4.24e-07 1.2e-06 3.63e-07 2.37e-07 4.08e-06 5.93e-07 1.67e-07 3.61e-07 3.72e-07 8.59e-07 2.49e-07 1.76e-07