logo

Genes within 1Mb (chr12:96154311:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 5.90e-01 0.0653 0.121 0.098 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0695 0.0751 0.098 B L1
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0408 0.106 0.098 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 6.16e-01 0.0469 0.0934 0.098 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0432 0.0995 0.098 B L1
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 6.12e-02 0.229 0.122 0.098 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 2.27e-01 -0.109 0.0901 0.098 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 1.53e-01 0.188 0.131 0.098 B L1
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0948 0.123 0.098 B L1
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0352 0.0995 0.098 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 8.43e-01 0.0123 0.0619 0.098 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 6.65e-01 0.0375 0.0864 0.098 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 5.89e-01 0.046 0.085 0.098 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 3.94e-01 0.0785 0.092 0.098 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 4.55e-02 0.262 0.13 0.098 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 1.63e-01 -0.112 0.0802 0.098 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 1.89e-01 0.13 0.0988 0.098 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 3.47e-01 0.112 0.119 0.098 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0239 0.0631 0.098 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 8.88e-03 -0.265 0.1 0.098 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 6.06e-01 0.035 0.0677 0.098 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0123 0.102 0.098 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 6.72e-01 0.0491 0.116 0.098 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 2.04e-01 -0.106 0.0832 0.098 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 3.14e-01 -0.112 0.111 0.098 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0191 0.139 0.099 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 6.11e-01 0.059 0.116 0.099 DC L1
ENSG00000084110 HAL 157946 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0851 0.132 0.099 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0551 0.145 0.099 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 4.68e-01 0.0783 0.108 0.099 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0442 0.132 0.099 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 1.46e-01 -0.16 0.109 0.099 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0321 0.141 0.099 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 7.97e-01 0.0335 0.13 0.099 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 128988 sc-eQTL 7.82e-01 0.0353 0.127 0.099 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0349 0.131 0.098 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 5.75e-01 -0.054 0.0961 0.098 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 157946 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0472 0.121 0.098 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0407 0.105 0.098 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 3.55e-01 0.127 0.137 0.098 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0115 0.0919 0.098 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 5.57e-01 0.0509 0.0865 0.098 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 7.07e-01 -0.05 0.133 0.098 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 1.33e-01 0.167 0.111 0.098 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 128988 sc-eQTL 7.34e-01 0.0438 0.129 0.098 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 5.24e-01 0.0833 0.13 0.099 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0502 0.0697 0.099 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 7.78e-01 0.0292 0.103 0.099 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 8.18e-01 0.0272 0.118 0.099 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 3.12e-01 -0.114 0.112 0.099 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 2.32e-02 -0.211 0.0921 0.099 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 9.92e-01 0.00114 0.118 0.099 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00419 0.145 0.098 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0575 0.0588 0.098 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 363159 sc-eQTL 1.28e-01 0.166 0.108 0.098 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 3.83e-02 -0.232 0.111 0.098 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 2.77e-01 0.134 0.123 0.098 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 6.08e-02 0.18 0.0953 0.098 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 8.91e-01 0.0123 0.0893 0.098 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0658 0.136 0.098 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -335260 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0102 0.141 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 3.47e-01 -0.152 0.161 0.102 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 1.14e-01 -0.211 0.133 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 2.56e-01 -0.191 0.167 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 4.29e-02 0.305 0.149 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0162 0.16 0.102 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 3.67e-01 -0.111 0.123 0.102 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 2.21e-01 -0.185 0.15 0.102 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0187 0.158 0.102 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0905 0.114 0.102 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0586 0.144 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 3.28e-01 -0.113 0.115 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 1.40e-01 -0.196 0.132 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 7.08e-01 -0.042 0.112 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 5.66e-01 0.0726 0.126 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 9.45e-02 0.249 0.148 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 4.24e-01 -0.101 0.126 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 2.44e-01 0.172 0.147 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 1.73e-01 -0.181 0.133 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0403 0.153 0.097 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 2.26e-01 0.139 0.114 0.097 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 4.32e-01 -0.117 0.149 0.097 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 3.53e-01 -0.123 0.132 0.097 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 5.76e-01 0.0727 0.13 0.097 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 1.36e-01 -0.212 0.142 0.097 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 4.15e-01 -0.112 0.137 0.097 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 2.04e-01 0.193 0.152 0.097 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 6.07e-01 -0.073 0.142 0.097 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 4.55e-01 0.106 0.142 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 2.16e-01 -0.116 0.0931 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0505 0.121 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 9.34e-01 0.00809 0.0979 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 3.65e-01 -0.105 0.115 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 8.70e-02 0.248 0.144 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 8.77e-02 -0.192 0.112 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00298 0.144 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0822 0.138 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 6.74e-01 0.0646 0.154 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 6.54e-01 0.0528 0.118 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 8.72e-01 -0.023 0.142 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 7.68e-01 0.0329 0.112 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0579 0.131 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 2.96e-01 0.148 0.142 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 1.25e-01 -0.2 0.13 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 3.89e-01 0.134 0.155 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0947 0.116 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0655 0.149 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 3.39e-01 0.104 0.109 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0415 0.156 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0518 0.154 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 1.64e-01 0.216 0.155 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00714 0.124 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 2.70e-01 -0.149 0.135 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 3.62e-01 0.143 0.156 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 9.49e-01 0.00727 0.113 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 5.92e-01 0.0364 0.0678 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 3.02e-01 0.101 0.0976 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 4.28e-01 0.0778 0.098 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 4.80e-01 0.0694 0.098 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 3.77e-02 0.285 0.136 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0972 0.0869 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 3.75e-01 0.0953 0.107 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0663 0.12 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0273 0.0661 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 7.52e-01 0.0357 0.113 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 9.86e-01 0.00203 0.112 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 7.59e-01 -0.034 0.11 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 2.59e-01 0.172 0.152 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000553 0.0905 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 8.02e-01 0.0311 0.124 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0434 0.153 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0983 0.0809 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 6.34e-02 -0.251 0.135 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 3.91e-01 -0.108 0.125 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00659 0.116 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 3.46e-01 0.135 0.143 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 6.94e-01 0.048 0.122 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 2.86e-01 0.154 0.144 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0937 0.136 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0456 0.0788 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 3.67e-03 -0.393 0.134 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 3.46e-01 0.134 0.142 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 4.09e-01 -0.107 0.129 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 8.86e-01 0.0207 0.144 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 1.03e-01 -0.194 0.118 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 4.03e-01 0.112 0.133 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 3.67e-01 0.126 0.139 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 8.04e-01 0.0236 0.0951 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0556 0.126 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 7.67e-01 0.0338 0.114 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 5.36e-01 0.0746 0.12 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 9.88e-01 0.00197 0.127 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 6.24e-01 0.0532 0.108 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 3.87e-01 -0.112 0.129 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 7.16e-01 0.0558 0.153 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 3.72e-01 0.0929 0.104 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0675 0.155 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0914 0.153 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 6.02e-01 0.0676 0.129 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 4.97e-02 0.274 0.139 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 3.74e-01 -0.133 0.149 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0199 0.146 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0576 0.154 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 2.06e-01 -0.161 0.127 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0575 0.149 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 4.80e-01 -0.11 0.156 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 9.51e-01 0.00938 0.153 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 7.67e-01 0.0387 0.13 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0217 0.142 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 1.19e-01 -0.241 0.154 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 9.45e-01 0.0102 0.149 0.1 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 1.67e-01 -0.118 0.0848 0.1 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 363159 sc-eQTL 5.92e-01 0.0616 0.115 0.1 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 3.98e-01 -0.122 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 4.89e-01 0.0911 0.131 0.1 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 7.21e-02 0.198 0.11 0.1 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0912 0.128 0.1 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 3.31e-01 -0.14 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -335260 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0544 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 7.96e-01 -0.039 0.151 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0972 0.0877 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 4.05e-01 0.124 0.148 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0773 0.13 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 2.46e-03 -0.414 0.135 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 5.27e-03 -0.4 0.142 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0117 0.146 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0768 0.146 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 9.52e-02 -0.126 0.0749 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 2.16e-01 -0.163 0.132 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 6.09e-01 0.0697 0.136 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0393 0.121 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 2.39e-02 -0.258 0.113 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00625 0.132 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0212 0.161 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 3.30e-01 0.116 0.119 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 9.54e-03 0.385 0.147 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0154 0.156 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 4.07e-01 -0.12 0.144 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 2.67e-01 -0.167 0.15 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 7.68e-01 0.0422 0.142 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 3.53e-01 0.127 0.136 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0628 0.0833 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 1.92e-01 0.18 0.138 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0135 0.141 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0226 0.135 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0385 0.114 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 7.94e-01 0.037 0.141 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 3.27e-01 0.214 0.217 0.074 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0932 0.186 0.074 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 6.69e-01 0.0933 0.218 0.074 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 4.58e-01 0.122 0.164 0.074 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 1.34e-01 -0.315 0.208 0.074 PB L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 7.32e-01 0.067 0.195 0.074 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 3.41e-01 0.196 0.205 0.074 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 5.50e-01 -0.146 0.244 0.074 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0266 0.174 0.074 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 4.29e-01 -0.114 0.144 0.1 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0305 0.0931 0.1 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 363159 sc-eQTL 8.49e-04 0.345 0.102 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 9.11e-02 -0.208 0.123 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0437 0.123 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 5.43e-01 0.0906 0.149 0.1 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 4.82e-01 0.0659 0.0937 0.1 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 4.45e-01 0.104 0.136 0.1 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -335260 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0863 0.11 0.1 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 8.64e-01 0.0255 0.148 0.098 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 9.53e-01 0.00605 0.103 0.098 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 3.66e-01 -0.127 0.14 0.098 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 4.66e-01 -0.095 0.13 0.098 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0194 0.118 0.098 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 9.81e-01 0.00321 0.133 0.098 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 4.34e-03 -0.387 0.134 0.098 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 3.88e-01 0.132 0.152 0.098 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00196 0.141 0.1 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 7.83e-01 0.034 0.123 0.1 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 157946 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0482 0.128 0.1 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0267 0.155 0.1 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 6.16e-01 0.0552 0.11 0.1 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 3.14e-01 -0.146 0.145 0.1 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 9.73e-01 0.00409 0.121 0.1 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 3.07e-01 -0.151 0.148 0.1 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 3.95e-01 -0.122 0.143 0.1 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 128988 sc-eQTL 8.50e-01 0.0236 0.125 0.1 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 6.47e-01 0.0659 0.144 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 8.08e-01 0.0266 0.11 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 157946 sc-eQTL 3.88e-01 -0.103 0.119 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 3.85e-01 -0.108 0.124 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 4.58e-01 0.0959 0.129 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 1.77e-01 -0.134 0.0992 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 5.87e-01 0.0559 0.103 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 9.56e-01 0.00786 0.141 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 1.79e-01 0.156 0.115 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 128988 sc-eQTL 9.13e-01 0.0144 0.132 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 9.75e-02 -0.241 0.145 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0204 0.124 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 157946 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0357 0.139 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 4.39e-01 -0.109 0.141 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 4.12e-01 0.114 0.139 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 6.18e-01 0.0565 0.113 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 8.85e-01 0.0162 0.112 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 8.88e-01 0.0214 0.151 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 2.67e-01 0.15 0.134 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 128988 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00625 0.142 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 7.63e-01 0.0539 0.179 0.109 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 8.75e-02 -0.202 0.117 0.109 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 363159 sc-eQTL 2.51e-01 0.156 0.135 0.109 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 1.03e-01 -0.276 0.168 0.109 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 8.01e-01 0.0446 0.177 0.109 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 5.47e-02 0.313 0.162 0.109 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 7.61e-02 -0.28 0.156 0.109 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 6.07e-01 0.09 0.174 0.109 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -335260 sc-eQTL 3.65e-01 0.139 0.153 0.109 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 4.63e-01 -0.116 0.158 0.098 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0162 0.141 0.098 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 157946 sc-eQTL 3.57e-01 0.131 0.142 0.098 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 7.18e-01 0.0583 0.161 0.098 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 8.31e-01 0.0312 0.146 0.098 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00278 0.13 0.098 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 2.31e-01 0.167 0.139 0.098 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0199 0.145 0.098 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 1.17e-02 0.351 0.138 0.098 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 128988 sc-eQTL 1.87e-01 -0.192 0.145 0.098 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 8.86e-02 -0.241 0.141 0.102 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 5.40e-01 0.0676 0.11 0.102 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 157946 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0951 0.123 0.102 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 4.14e-01 -0.122 0.148 0.102 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 3.31e-01 0.133 0.137 0.102 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0486 0.118 0.102 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 8.10e-01 0.029 0.12 0.102 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0521 0.128 0.102 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0453 0.14 0.102 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 128988 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0285 0.146 0.102 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 6.57e-01 -0.07 0.157 0.102 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 7.31e-01 0.0485 0.141 0.102 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 157946 sc-eQTL 3.43e-01 -0.113 0.119 0.102 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 2.35e-01 -0.191 0.16 0.102 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 8.08e-01 0.0324 0.133 0.102 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 4.10e-01 0.134 0.163 0.102 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 2.01e-01 -0.182 0.141 0.102 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 4.15e-01 0.128 0.157 0.102 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 5.43e-03 0.38 0.135 0.102 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 128988 sc-eQTL 7.24e-01 0.0476 0.134 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0198 0.145 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0425 0.0974 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 2.85e-01 -0.145 0.135 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0431 0.101 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 5.91e-01 0.0622 0.116 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0537 0.144 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 1.57e-01 -0.158 0.112 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 1.14e-01 0.232 0.146 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 2.53e-01 -0.147 0.129 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 5.26e-01 0.0867 0.136 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0847 0.084 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 7.13e-01 -0.042 0.114 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0336 0.0945 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 3.27e-01 -0.105 0.107 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 602835 sc-eQTL 6.33e-02 0.244 0.13 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 1.06e-02 -0.275 0.107 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 6.77e-01 0.0598 0.143 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 3.17e-01 -0.145 0.144 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 7.57e-01 0.0416 0.134 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 9.12e-01 0.0111 0.101 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 157946 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0483 0.122 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0806 0.115 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 5.81e-01 0.0738 0.134 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0625 0.0965 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 2.95e-01 0.0976 0.0929 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 9.56e-01 0.00801 0.146 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 1.24e-01 0.178 0.115 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 128988 sc-eQTL 8.81e-01 0.0203 0.135 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 1.38e-01 -0.218 0.147 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 3.83e-01 0.0878 0.1 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 157946 sc-eQTL 3.79e-01 -0.105 0.119 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0311 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 7.22e-01 0.047 0.132 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00786 0.0976 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 7.16e-01 0.0366 0.101 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 3.22e-01 -0.128 0.129 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 936829 sc-eQTL 3.29e-01 0.121 0.123 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 128988 sc-eQTL 3.65e-01 -0.124 0.136 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 936565 sc-eQTL 6.57e-01 0.06 0.135 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -246169 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0845 0.0705 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 680791 sc-eQTL 9.14e-01 0.0116 0.108 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 110791 sc-eQTL 5.61e-01 0.0716 0.123 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -40064 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0396 0.113 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 295383 sc-eQTL 5.69e-02 -0.183 0.0955 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -752912 sc-eQTL 9.77e-01 0.00342 0.12 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111144 LTA4H 110791 pQTL 0.0163 0.0656 0.0273 0.00105 0.0 0.112
ENSG00000180263 FGD6 936829 eQTL 0.0121 0.0799 0.0318 0.0 0.0 0.11

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000084110 \N 157946 3.24e-06 2.88e-06 4.68e-07 2.03e-06 7.91e-07 7.53e-07 2.33e-06 8.93e-07 2.34e-06 1.24e-06 2.77e-06 1.66e-06 4.11e-06 1.42e-06 8.95e-07 1.98e-06 1.57e-06 2.15e-06 1.51e-06 1.28e-06 1.39e-06 3.29e-06 2.88e-06 1.68e-06 4.08e-06 1.26e-06 1.45e-06 1.77e-06 3.19e-06 2.5e-06 2.08e-06 3.98e-07 6.22e-07 1.34e-06 1.47e-06 9.43e-07 8.89e-07 4.46e-07 1.23e-06 3.64e-07 2.23e-07 4.08e-06 5.55e-07 1.96e-07 3.46e-07 3.57e-07 8.67e-07 2.15e-07 1.58e-07