logo

Genes within 1Mb (chr12:96149426:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 2.22e-01 0.139 0.114 0.1 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 5.75e-01 0.0399 0.071 0.1 B L1
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 1.26e-01 0.153 0.0999 0.1 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 7.72e-03 0.233 0.0868 0.1 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 2.36e-02 0.212 0.0928 0.1 B L1
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0365 0.116 0.1 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 3.66e-01 0.0771 0.0852 0.1 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 5.56e-02 0.238 0.123 0.1 B L1
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 6.82e-01 0.0476 0.116 0.1 B L1
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 3.44e-01 0.0888 0.0936 0.1 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 7.70e-02 0.103 0.0579 0.1 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 8.72e-01 0.0131 0.0814 0.1 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 1.23e-01 -0.123 0.0797 0.1 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 2.53e-01 0.0992 0.0865 0.1 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 6.88e-01 0.0498 0.124 0.1 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 6.58e-01 0.0336 0.0758 0.1 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 8.28e-01 0.0203 0.0934 0.1 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 7.71e-01 0.033 0.113 0.1 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 2.43e-02 0.135 0.0594 0.1 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 8.58e-02 0.166 0.0964 0.1 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 5.16e-01 0.0419 0.0645 0.1 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0629 0.0971 0.1 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 3.03e-01 -0.114 0.11 0.1 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0417 0.0796 0.1 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 3.67e-01 0.0955 0.106 0.1 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 9.85e-01 0.00255 0.134 0.101 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 8.52e-01 0.021 0.112 0.101 DC L1
ENSG00000084110 HAL 153061 sc-eQTL 6.55e-01 0.057 0.127 0.101 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 4.74e-01 0.101 0.14 0.101 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 2.21e-01 0.128 0.104 0.101 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 2.05e-01 0.162 0.127 0.101 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0468 0.106 0.101 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 9.08e-01 0.0158 0.136 0.101 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 3.54e-01 -0.117 0.126 0.101 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 124103 sc-eQTL 8.53e-01 0.0229 0.123 0.101 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0784 0.127 0.1 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0429 0.093 0.1 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 153061 sc-eQTL 4.53e-01 0.088 0.117 0.1 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 2.91e-01 0.107 0.101 0.1 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 1.01e-02 0.338 0.13 0.1 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 2.41e-01 0.104 0.0886 0.1 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 6.42e-01 -0.039 0.0838 0.1 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 5.98e-01 -0.068 0.129 0.1 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0326 0.108 0.1 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 124103 sc-eQTL 1.83e-01 0.166 0.124 0.1 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 4.37e-03 0.353 0.123 0.101 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 2.18e-01 0.0824 0.0666 0.101 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 8.84e-01 0.0144 0.099 0.101 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0547 0.113 0.101 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00628 0.108 0.101 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0801 0.0891 0.101 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00443 0.113 0.101 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0494 0.138 0.1 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 6.04e-01 0.0293 0.0563 0.1 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 358274 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0175 0.104 0.1 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 9.75e-01 0.00343 0.107 0.1 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 1.31e-01 -0.177 0.117 0.1 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 3.28e-02 0.195 0.0909 0.1 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 2.31e-01 -0.102 0.0851 0.1 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 4.11e-01 -0.107 0.13 0.1 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -340145 sc-eQTL 3.84e-01 0.117 0.134 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 1.73e-01 0.2 0.146 0.107 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 5.02e-01 -0.082 0.122 0.107 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 2.48e-01 -0.177 0.153 0.107 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 8.18e-01 0.0317 0.138 0.107 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 6.14e-01 0.0738 0.146 0.107 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 3.90e-01 0.0966 0.112 0.107 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 3.99e-01 -0.116 0.138 0.107 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 7.06e-01 0.0545 0.144 0.107 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 8.19e-01 0.0238 0.104 0.107 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 2.65e-01 0.153 0.137 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 5.99e-01 0.0582 0.11 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 4.42e-02 0.254 0.125 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 5.96e-02 0.201 0.106 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 3.17e-01 0.121 0.12 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 5.69e-01 0.081 0.142 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 4.34e-01 0.094 0.12 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0672 0.141 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 1.24e-01 0.195 0.126 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00857 0.141 0.099 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 1.06e-01 0.17 0.105 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 2.50e-01 0.158 0.137 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 7.65e-01 0.0364 0.122 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 8.04e-02 -0.209 0.119 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 2.28e-01 0.158 0.131 0.099 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 2.80e-01 0.137 0.126 0.099 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 4.50e-01 -0.106 0.14 0.099 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 8.93e-01 0.0175 0.131 0.099 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 6.05e-01 0.07 0.135 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 5.32e-01 0.0555 0.0888 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 9.24e-01 -0.011 0.115 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 5.76e-03 0.255 0.0914 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 9.60e-02 0.183 0.109 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0143 0.138 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 8.15e-01 0.025 0.107 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 1.20e-02 0.343 0.135 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0397 0.131 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 1.23e-01 0.227 0.146 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 3.98e-01 0.0952 0.112 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 4.39e-01 0.105 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 8.37e-03 0.279 0.105 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 6.67e-03 0.339 0.124 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000855 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 6.44e-01 0.0577 0.125 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 8.18e-01 0.0343 0.148 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0513 0.111 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0343 0.145 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 6.57e-01 0.047 0.106 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0955 0.151 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 9.27e-01 0.0137 0.149 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 4.88e-01 -0.105 0.151 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 9.70e-01 0.00454 0.12 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 1.25e-01 0.201 0.13 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 9.75e-01 0.00484 0.152 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 1.57e-01 0.151 0.106 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 1.31e-01 0.0968 0.0638 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 8.88e-01 0.013 0.0925 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0793 0.0926 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 1.50e-02 0.224 0.0915 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 5.62e-01 0.0754 0.13 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 6.30e-01 0.0397 0.0824 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00403 0.101 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00205 0.113 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00246 0.0622 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 4.88e-01 0.0736 0.106 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0607 0.105 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 1.42e-01 -0.152 0.103 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 9.52e-01 0.00857 0.144 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00563 0.0852 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 9.60e-01 0.00588 0.116 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 2.31e-01 0.173 0.144 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 4.80e-01 0.0543 0.0767 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 8.03e-01 -0.032 0.128 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 2.20e-01 -0.145 0.118 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 6.74e-01 0.0464 0.11 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00224 0.136 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0527 0.115 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 1.85e-01 0.181 0.136 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 1.27e-01 -0.197 0.129 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 4.70e-02 0.148 0.0742 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 9.30e-01 0.0113 0.129 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 8.59e-01 -0.024 0.135 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 2.88e-01 0.131 0.123 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 3.11e-01 -0.139 0.137 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 5.97e-02 -0.213 0.112 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 3.44e-02 0.268 0.126 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 3.88e-01 0.115 0.134 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 7.79e-01 0.0256 0.0911 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 3.18e-02 0.259 0.12 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 4.13e-01 0.0894 0.109 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 2.54e-01 -0.132 0.115 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 2.98e-01 -0.126 0.121 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 7.91e-01 0.0276 0.104 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0702 0.123 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 2.56e-01 0.167 0.147 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 3.84e-01 0.087 0.0998 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 9.88e-01 0.00217 0.149 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 1.23e-01 0.226 0.146 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 9.91e-01 0.00142 0.124 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0151 0.135 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 9.99e-01 0.000126 0.143 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0873 0.14 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 2.09e-01 0.179 0.142 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 1.70e-01 0.162 0.117 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 5.22e-01 0.0886 0.138 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 1.66e-01 0.2 0.144 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0378 0.142 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 2.95e-01 -0.126 0.12 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 1.49e-01 0.19 0.131 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 8.10e-01 0.0344 0.143 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 6.75e-01 0.0597 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 2.79e-01 0.0884 0.0813 0.1 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 358274 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0777 0.11 0.1 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 4.92e-01 0.0951 0.138 0.1 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 5.44e-02 -0.242 0.125 0.1 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 3.06e-02 0.228 0.105 0.1 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 9.84e-01 0.0024 0.123 0.1 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0208 0.138 0.1 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -340145 sc-eQTL 9.98e-01 0.000391 0.136 0.1 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 1.97e-04 0.532 0.14 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0124 0.0847 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0761 0.143 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 2.36e-01 -0.148 0.125 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 5.21e-01 0.0853 0.133 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 3.34e-01 0.134 0.139 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 9.29e-01 0.0126 0.14 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 1.39e-01 0.207 0.14 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 1.86e-01 0.0955 0.072 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 9.48e-01 0.00832 0.127 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 4.39e-01 -0.101 0.13 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 7.07e-01 0.0436 0.116 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0674 0.11 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0729 0.127 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 3.75e-01 0.14 0.158 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 5.26e-02 -0.226 0.116 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 9.14e-01 0.016 0.147 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 5.97e-02 0.288 0.152 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0671 0.142 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0981 0.148 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 1.51e-01 -0.202 0.14 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 2.81e-01 0.139 0.129 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 2.98e-01 0.0821 0.0787 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0327 0.131 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 4.89e-01 0.0924 0.133 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00936 0.128 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 3.58e-02 -0.226 0.107 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 7.03e-01 0.051 0.134 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 9.96e-01 0.000776 0.169 0.107 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 1.06e-01 -0.232 0.142 0.107 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 3.23e-01 0.166 0.168 0.107 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 9.41e-01 0.00934 0.127 0.107 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 6.94e-01 0.0641 0.163 0.107 PB L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 2.62e-01 -0.169 0.15 0.107 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000273 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0923 0.189 0.107 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0078 0.135 0.107 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 3.43e-01 -0.129 0.136 0.102 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 9.19e-01 0.00905 0.0884 0.102 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 358274 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0199 0.0992 0.102 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0489 0.117 0.102 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0371 0.117 0.102 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 1.68e-01 0.195 0.141 0.102 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0389 0.089 0.102 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 2.78e-02 -0.283 0.128 0.102 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -340145 sc-eQTL 5.08e-01 0.0693 0.104 0.102 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0734 0.14 0.1 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 9.56e-04 0.317 0.0946 0.1 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0495 0.132 0.1 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 4.15e-01 -0.1 0.123 0.1 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 8.17e-01 0.0258 0.111 0.1 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 7.16e-01 0.0456 0.125 0.1 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0628 0.129 0.1 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 8.21e-01 0.0327 0.144 0.1 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0541 0.136 0.1 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 8.45e-01 0.0232 0.119 0.1 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 153061 sc-eQTL 4.15e-01 -0.101 0.123 0.1 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 5.95e-02 0.28 0.147 0.1 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 3.36e-01 0.102 0.105 0.1 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 1.02e-01 0.227 0.138 0.1 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 3.52e-01 -0.109 0.116 0.1 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0928 0.142 0.1 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 2.31e-01 -0.165 0.137 0.1 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 124103 sc-eQTL 6.22e-01 0.0591 0.12 0.1 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0283 0.138 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 7.51e-01 0.0334 0.105 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 153061 sc-eQTL 2.90e-01 0.121 0.114 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00805 0.119 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 3.56e-02 0.259 0.122 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 1.40e-01 0.14 0.0949 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 7.45e-01 -0.032 0.0983 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0274 0.135 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 8.24e-01 0.0246 0.111 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 124103 sc-eQTL 1.88e-01 0.166 0.126 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 5.70e-01 -0.079 0.139 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 8.25e-01 0.0263 0.118 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 153061 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0574 0.133 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 2.28e-01 0.162 0.134 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 3.60e-02 0.277 0.131 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0136 0.108 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 7.79e-02 -0.188 0.106 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 7.81e-01 0.0401 0.144 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 2.06e-01 -0.162 0.128 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 124103 sc-eQTL 5.57e-01 0.0798 0.136 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 2.47e-01 -0.202 0.174 0.094 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 7.08e-01 0.0433 0.116 0.094 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 358274 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0833 0.133 0.094 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 6.82e-01 0.0682 0.166 0.094 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 8.04e-01 -0.043 0.173 0.094 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 6.50e-01 0.0728 0.16 0.094 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 9.83e-01 0.00335 0.155 0.094 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 4.80e-01 0.121 0.17 0.094 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -340145 sc-eQTL 5.82e-01 0.0824 0.149 0.094 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 3.56e-01 -0.136 0.147 0.102 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 8.10e-01 0.0315 0.131 0.102 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 153061 sc-eQTL 8.88e-01 0.0187 0.132 0.102 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 3.70e-02 0.312 0.148 0.102 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 2.97e-03 0.4 0.133 0.102 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 9.49e-01 0.00769 0.121 0.102 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 5.31e-01 -0.081 0.129 0.102 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0945 0.134 0.102 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 7.59e-01 -0.04 0.13 0.102 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 124103 sc-eQTL 2.70e-01 0.149 0.135 0.102 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0912 0.138 0.1 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 2.65e-01 0.119 0.107 0.1 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 153061 sc-eQTL 7.52e-01 0.0379 0.12 0.1 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 2.33e-01 0.173 0.144 0.1 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 1.27e-01 0.203 0.133 0.1 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0908 0.114 0.1 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 1.85e-01 0.155 0.117 0.1 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 3.65e-01 -0.113 0.124 0.1 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0224 0.136 0.1 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 124103 sc-eQTL 4.06e-01 -0.118 0.142 0.1 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 5.95e-01 0.0801 0.15 0.096 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0515 0.135 0.096 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 153061 sc-eQTL 1.57e-01 0.161 0.113 0.096 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 8.01e-01 0.0389 0.154 0.096 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 5.79e-01 0.0707 0.127 0.096 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 5.11e-01 0.102 0.156 0.096 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0818 0.136 0.096 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 4.82e-01 -0.106 0.15 0.096 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 1.90e-01 -0.173 0.131 0.096 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 124103 sc-eQTL 1.01e-01 -0.21 0.128 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 2.43e-01 0.16 0.137 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 4.52e-01 0.069 0.0917 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 5.07e-02 0.249 0.126 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 1.61e-01 0.134 0.0949 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0751 0.109 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 2.93e-01 0.143 0.135 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 3.84e-01 0.092 0.105 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0847 0.138 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 2.49e-01 0.14 0.121 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 2.36e-01 0.153 0.129 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 2.28e-01 0.0962 0.0795 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 9.40e-01 0.00814 0.108 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 4.85e-03 0.25 0.0879 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 1.38e-03 0.323 0.0995 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 597950 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0427 0.125 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 6.53e-01 0.0462 0.103 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 1.22e-02 0.338 0.134 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 6.51e-01 -0.062 0.137 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0917 0.127 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 7.25e-01 0.0335 0.0952 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 153061 sc-eQTL 6.51e-01 0.0523 0.115 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 8.97e-01 0.014 0.109 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 3.70e-02 0.263 0.125 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 2.32e-01 0.109 0.0912 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 1.38e-01 -0.131 0.0878 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 9.20e-01 0.0139 0.138 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00632 0.11 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 124103 sc-eQTL 4.20e-01 0.103 0.128 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 2.04e-01 -0.181 0.142 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 6.81e-01 0.0401 0.0973 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 153061 sc-eQTL 5.99e-01 0.0606 0.115 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 6.74e-02 0.238 0.129 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 1.13e-02 0.321 0.126 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 9.60e-01 0.0047 0.0944 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 8.51e-01 0.0183 0.0973 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 2.29e-01 -0.15 0.124 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 931944 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0364 0.12 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 124103 sc-eQTL 5.82e-01 0.0727 0.132 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 931680 sc-eQTL 4.27e-02 0.26 0.127 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -251054 sc-eQTL 1.85e-01 0.0895 0.0673 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 675906 sc-eQTL 8.93e-01 0.0139 0.103 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 105906 sc-eQTL 9.12e-01 0.013 0.117 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -44949 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00708 0.107 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 290498 sc-eQTL 1.97e-01 -0.119 0.0916 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -757797 sc-eQTL 7.08e-01 -0.043 0.115 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111144 LTA4H 105906 eQTL 0.0382 0.0623 0.03 0.0 0.0 0.133

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina