logo

Genes within 1Mb (chr12:96135888:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00295 0.0859 0.214 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 9.29e-01 0.00478 0.0534 0.214 B L1
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0326 0.0756 0.214 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 6.67e-01 0.0286 0.0664 0.214 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 8.02e-01 0.0178 0.0707 0.214 B L1
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 5.13e-01 -0.057 0.0871 0.214 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0358 0.0642 0.214 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0484 0.0937 0.214 B L1
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0848 0.0872 0.214 B L1
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0567 0.0697 0.214 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0288 0.0434 0.214 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 5.08e-01 0.0401 0.0606 0.214 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0216 0.0597 0.214 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 9.31e-01 0.00564 0.0646 0.214 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0184 0.0922 0.214 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 5.09e-02 -0.11 0.056 0.214 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0257 0.0696 0.214 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0667 0.0842 0.214 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 6.59e-01 0.0197 0.0447 0.214 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 6.78e-01 0.03 0.0721 0.214 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 7.65e-01 0.0144 0.048 0.214 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0254 0.0722 0.214 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0221 0.0821 0.214 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0391 0.0591 0.214 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0662 0.0785 0.214 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 7.23e-01 -0.035 0.0986 0.216 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 2.75e-02 -0.181 0.0815 0.216 DC L1
ENSG00000084110 HAL 139523 sc-eQTL 1.18e-01 0.147 0.0933 0.216 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 8.31e-01 0.0221 0.103 0.216 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0413 0.0767 0.216 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 4.61e-01 0.0694 0.0939 0.216 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0297 0.0782 0.216 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0039 0.1 0.216 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0384 0.0927 0.216 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 110565 sc-eQTL 5.30e-01 -0.057 0.0906 0.216 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 9.41e-01 0.00672 0.0913 0.214 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 2.33e-02 -0.151 0.066 0.214 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 139523 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0975 0.0839 0.214 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 5.07e-01 0.0482 0.0727 0.214 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0907 0.0949 0.214 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00584 0.0638 0.214 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0389 0.0601 0.214 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 7.05e-01 -0.035 0.0924 0.214 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0529 0.0774 0.214 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 110565 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0578 0.0895 0.214 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0315 0.0934 0.212 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 1.95e-01 0.0647 0.0497 0.212 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 2.04e-01 0.0939 0.0736 0.212 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 5.55e-01 -0.05 0.0847 0.212 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 5.80e-01 0.0446 0.0804 0.212 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0521 0.0666 0.212 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 7.91e-01 0.0224 0.0844 0.212 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 8.50e-01 0.0195 0.103 0.214 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 2.26e-01 0.051 0.0419 0.214 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 344736 sc-eQTL 9.61e-01 0.00384 0.0778 0.214 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0779 0.0802 0.214 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 4.72e-02 -0.174 0.0871 0.214 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 1.16e-01 -0.108 0.0682 0.214 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0955 0.0635 0.214 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 3.91e-01 0.0834 0.097 0.214 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -353683 sc-eQTL 9.92e-01 0.000967 0.101 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 1.04e-01 -0.188 0.115 0.207 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 2.84e-01 0.103 0.0958 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 6.01e-01 0.0633 0.121 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 1.47e-01 -0.158 0.108 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 4.10e-01 -0.095 0.115 0.207 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0876 0.0882 0.207 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 8.92e-01 0.0148 0.109 0.207 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 7.60e-01 0.0347 0.114 0.207 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 8.64e-01 0.014 0.082 0.207 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0313 0.102 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 6.70e-01 0.035 0.082 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0656 0.094 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 8.53e-01 0.0147 0.0795 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00607 0.0896 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 6.27e-01 0.0514 0.106 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0713 0.0891 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 4.50e-01 -0.079 0.104 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0339 0.0944 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 2.08e-01 0.136 0.108 0.216 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 1.30e-01 -0.122 0.0804 0.216 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0893 0.105 0.216 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 5.65e-01 0.0537 0.0933 0.216 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0931 0.0915 0.216 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0327 0.101 0.216 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 1.65e-01 0.135 0.0968 0.216 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 6.73e-01 0.0455 0.108 0.216 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0449 0.1 0.216 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0894 0.1 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0254 0.0662 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 7.67e-01 0.0253 0.0856 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0163 0.0693 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 7.27e-01 0.0286 0.0819 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 1.58e-01 -0.145 0.103 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 1.58e-01 0.112 0.0793 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 6.53e-01 0.046 0.102 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 1.29e-01 -0.149 0.0973 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 2.33e-01 0.131 0.11 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 1.30e-01 0.127 0.0838 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 6.69e-01 0.0435 0.102 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0132 0.0798 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00592 0.0941 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0929 0.101 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0864 0.0932 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 7.28e-01 0.0387 0.111 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 5.22e-01 0.0533 0.0832 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0512 0.109 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00533 0.0793 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 8.41e-02 0.196 0.113 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 3.23e-01 0.111 0.112 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 5.45e-02 -0.217 0.112 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0743 0.0902 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 3.83e-01 0.0859 0.0982 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0116 0.114 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0601 0.0792 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0666 0.0474 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0362 0.0687 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00195 0.0689 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0764 0.0687 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 7.01e-01 0.0371 0.0966 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 2.85e-02 -0.134 0.0605 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0345 0.0754 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0692 0.0848 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 2.32e-01 0.0558 0.0465 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 4.23e-01 0.0638 0.0794 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 5.87e-01 -0.043 0.0792 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 2.01e-02 0.18 0.077 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 9.29e-01 0.00956 0.108 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 1.88e-01 -0.084 0.0637 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 2.07e-01 0.11 0.087 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 6.24e-01 0.0537 0.109 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 2.38e-01 0.0685 0.0579 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 5.45e-01 0.0587 0.097 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 4.97e-01 0.061 0.0896 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 1.38e-01 -0.123 0.0829 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0712 0.102 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 1.81e-01 0.116 0.0868 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0351 0.103 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0502 0.0971 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0246 0.0562 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 9.64e-01 0.00439 0.0972 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0163 0.102 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 6.08e-02 0.173 0.0917 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0127 0.103 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 3.97e-01 0.072 0.0848 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 5.93e-02 -0.179 0.0945 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0525 0.0991 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 6.60e-01 0.0297 0.0675 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0436 0.0897 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 8.32e-01 0.0172 0.0809 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0901 0.0854 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 4.56e-01 0.067 0.0898 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0354 0.0769 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 3.48e-01 0.086 0.0914 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 5.24e-01 0.0675 0.106 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 6.92e-01 0.0286 0.0719 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 7.89e-01 0.0288 0.107 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00352 0.106 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0821 0.0894 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 6.84e-01 0.0395 0.0969 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 1.87e-01 -0.136 0.103 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 8.49e-02 -0.174 0.1 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 2.56e-01 0.125 0.11 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 8.04e-02 0.159 0.0905 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 6.81e-01 0.0441 0.107 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 3.09e-01 0.114 0.111 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 7.17e-01 0.0399 0.11 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 2.39e-01 -0.11 0.0932 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 9.79e-01 0.00274 0.102 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 4.40e-01 0.0855 0.111 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0301 0.107 0.214 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00453 0.0611 0.214 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 344736 sc-eQTL 7.46e-01 0.0267 0.0823 0.214 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0714 0.104 0.214 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 1.63e-01 -0.131 0.0939 0.214 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0597 0.0791 0.214 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0047 0.0918 0.214 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 1.90e-01 0.135 0.103 0.214 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -353683 sc-eQTL 4.70e-01 0.0739 0.102 0.214 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 3.47e-01 0.101 0.107 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 2.21e-02 0.143 0.0618 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 5.61e-01 0.0615 0.106 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0311 0.0927 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 6.28e-01 0.0477 0.0983 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0793 0.103 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0229 0.104 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0791 0.104 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 3.71e-01 0.0479 0.0534 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 2.55e-02 0.209 0.0927 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0722 0.0966 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0412 0.0856 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 7.83e-01 0.0224 0.0815 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0499 0.0938 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 5.16e-01 0.0761 0.117 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 2.71e-01 0.0954 0.0864 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 9.15e-02 0.184 0.108 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0438 0.114 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 1.83e-01 0.14 0.105 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 1.23e-01 -0.169 0.109 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 2.54e-01 0.118 0.104 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0614 0.0964 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 6.61e-01 0.0259 0.059 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 1.36e-01 -0.146 0.0974 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 8.92e-01 0.0136 0.0997 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 2.60e-01 0.108 0.0952 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 8.88e-01 0.0114 0.0809 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 8.58e-01 0.018 0.1 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 4.10e-01 0.114 0.138 0.193 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0806 0.117 0.193 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0491 0.138 0.193 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 2.09e-01 0.13 0.103 0.193 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0381 0.133 0.193 PB L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 3.33e-01 0.119 0.123 0.193 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0833 0.13 0.193 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0562 0.154 0.193 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 1.54e-01 0.157 0.109 0.193 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 2.76e-02 0.226 0.102 0.215 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0139 0.0666 0.215 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 344736 sc-eQTL 4.79e-01 0.0529 0.0747 0.215 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 1.69e-01 0.121 0.0879 0.215 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 8.51e-01 0.0165 0.0879 0.215 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 1.82e-01 -0.142 0.106 0.215 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 7.01e-01 0.0258 0.0671 0.215 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 3.61e-01 -0.089 0.0972 0.215 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -353683 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0504 0.0787 0.215 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 6.43e-01 -0.048 0.104 0.214 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 8.28e-01 0.0157 0.0718 0.214 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0955 0.0975 0.214 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 4.55e-01 0.0679 0.0909 0.214 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0315 0.0824 0.214 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0514 0.0925 0.214 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0566 0.0954 0.214 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0954 0.106 0.214 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 7.49e-01 0.033 0.103 0.22 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 2.18e-03 -0.272 0.0876 0.22 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 139523 sc-eQTL 1.44e-01 0.136 0.0929 0.22 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0798 0.113 0.22 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 6.61e-01 0.0351 0.08 0.22 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 6.63e-01 0.0461 0.106 0.22 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 3.66e-01 -0.08 0.0883 0.22 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 3.07e-01 0.11 0.107 0.22 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0387 0.104 0.22 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 110565 sc-eQTL 6.68e-01 -0.039 0.0908 0.22 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 8.01e-01 0.0254 0.101 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 5.99e-03 -0.21 0.0756 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 139523 sc-eQTL 2.24e-01 -0.102 0.0837 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 7.49e-01 0.0279 0.0871 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 1.32e-01 -0.136 0.0902 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0575 0.0698 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0856 0.0719 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 8.56e-01 -0.018 0.0993 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 7.94e-01 0.0213 0.0813 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 110565 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0987 0.0924 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0835 0.103 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 1.76e-01 -0.118 0.087 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 139523 sc-eQTL 6.03e-01 -0.051 0.098 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 1.46e-01 0.144 0.0987 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0399 0.0979 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00759 0.0798 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 6.01e-01 0.0413 0.0788 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0873 0.106 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 9.67e-01 0.00395 0.0949 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 110565 sc-eQTL 8.35e-01 0.0209 0.1 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 2.98e-01 0.138 0.132 0.218 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0711 0.0874 0.218 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 344736 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0918 0.1 0.218 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 9.57e-01 0.00686 0.126 0.218 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0635 0.131 0.218 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 1.42e-01 -0.178 0.12 0.218 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 1.32e-01 -0.176 0.116 0.218 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 7.04e-01 0.0492 0.129 0.218 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -353683 sc-eQTL 6.31e-02 -0.209 0.112 0.218 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0371 0.111 0.218 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 1.91e-01 0.129 0.098 0.218 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 139523 sc-eQTL 5.43e-01 0.0606 0.0994 0.218 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 1.15e-01 -0.177 0.112 0.218 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 2.95e-01 -0.107 0.102 0.218 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 1.54e-01 0.13 0.0905 0.218 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 7.68e-02 -0.172 0.0964 0.218 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 7.48e-02 -0.179 0.1 0.218 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 3.31e-02 -0.208 0.0968 0.218 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 110565 sc-eQTL 3.14e-01 -0.102 0.101 0.218 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 5.72e-03 0.283 0.101 0.219 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0657 0.0802 0.219 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 139523 sc-eQTL 2.02e-01 -0.114 0.0893 0.219 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 3.18e-01 0.108 0.108 0.219 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 8.34e-01 0.0209 0.0999 0.219 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00493 0.0858 0.219 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0187 0.0876 0.219 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 2.49e-01 0.107 0.0928 0.219 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 8.71e-02 -0.174 0.101 0.219 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 110565 sc-eQTL 6.08e-01 0.0545 0.106 0.219 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0286 0.114 0.226 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0463 0.102 0.226 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 139523 sc-eQTL 6.64e-01 0.0375 0.0862 0.226 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 2.01e-01 0.149 0.116 0.226 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 2.07e-01 0.122 0.096 0.226 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 2.93e-01 0.124 0.118 0.226 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 5.48e-01 0.0619 0.103 0.226 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00258 0.114 0.226 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 2.88e-01 -0.106 0.0997 0.226 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 110565 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0305 0.0974 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 7.56e-01 0.0323 0.104 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0396 0.0695 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 2.03e-01 -0.123 0.0963 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 6.45e-01 0.0333 0.0721 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 5.86e-01 -0.045 0.0824 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 9.53e-01 0.00611 0.103 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 9.29e-01 0.00713 0.0799 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0262 0.105 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0994 0.0918 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 8.46e-01 0.0188 0.0964 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 7.97e-01 0.0153 0.0594 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 6.02e-01 0.042 0.0804 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 7.63e-01 0.0202 0.0667 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0405 0.0759 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 584412 sc-eQTL 1.63e-01 -0.129 0.0924 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 8.93e-01 0.0103 0.0764 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 9.65e-01 0.00446 0.101 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 3.04e-01 -0.105 0.102 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0459 0.0927 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 2.95e-03 -0.205 0.0681 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 139523 sc-eQTL 2.17e-01 -0.104 0.0839 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 3.13e-01 0.08 0.0791 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0774 0.0923 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0358 0.0667 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0123 0.0644 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0629 0.101 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 9.89e-01 0.00115 0.0801 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 110565 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0431 0.0936 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 1.68e-01 0.146 0.105 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 8.47e-01 0.014 0.0722 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 139523 sc-eQTL 7.88e-01 -0.023 0.0853 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0468 0.0968 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0616 0.0945 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 5.09e-01 0.0462 0.0699 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0201 0.0722 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 7.60e-01 0.0284 0.0926 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 918406 sc-eQTL 4.48e-02 -0.177 0.0879 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 110565 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0498 0.0979 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 918142 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0771 0.0962 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -264592 sc-eQTL 3.79e-01 0.0446 0.0505 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 662368 sc-eQTL 2.57e-01 0.0873 0.0768 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 92368 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0711 0.0879 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -58487 sc-eQTL 6.63e-01 0.0352 0.0805 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 276960 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0475 0.0688 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -771335 sc-eQTL 5.34e-01 0.0535 0.0859 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111142 METAP2 662368 eQTL 0.0433 -0.0203 0.0101 0.00146 0.0 0.233

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina