logo

Genes within 1Mb (chr12:96130939:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 2.99e-01 -0.147 0.141 0.077 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0385 0.0879 0.077 B L1
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 1.88e-01 0.164 0.124 0.077 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0405 0.109 0.077 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 3.14e-01 -0.117 0.116 0.077 B L1
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0151 0.143 0.077 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 5.81e-01 0.0584 0.106 0.077 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 4.79e-01 0.109 0.154 0.077 B L1
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 7.29e-01 0.0498 0.144 0.077 B L1
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0312 0.117 0.077 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 7.04e-01 0.0276 0.0726 0.077 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 4.19e-02 0.205 0.1 0.077 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 2.49e-01 -0.115 0.0995 0.077 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 6.30e-01 0.0522 0.108 0.077 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 6.50e-01 0.07 0.154 0.077 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 8.49e-04 -0.311 0.092 0.077 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 8.73e-01 0.0185 0.116 0.077 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0758 0.137 0.077 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 6.30e-02 -0.135 0.0723 0.077 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 6.04e-01 -0.061 0.118 0.077 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 1.28e-01 -0.119 0.0779 0.077 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0509 0.118 0.077 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 2.23e-01 -0.163 0.134 0.077 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0428 0.0965 0.077 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 8.05e-01 0.0317 0.128 0.077 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 1.22e-01 0.26 0.167 0.077 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0541 0.141 0.077 DC L1
ENSG00000084110 HAL 134574 sc-eQTL 8.16e-01 0.0373 0.16 0.077 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 2.13e-01 0.219 0.176 0.077 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 2.66e-01 0.146 0.13 0.077 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 3.48e-01 -0.15 0.16 0.077 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 7.95e-01 0.0346 0.133 0.077 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 2.17e-01 -0.211 0.17 0.077 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 1.92e-02 0.368 0.156 0.077 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 105616 sc-eQTL 4.73e-02 -0.305 0.153 0.077 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 3.58e-01 0.14 0.152 0.077 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 7.91e-01 0.0296 0.112 0.077 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 134574 sc-eQTL 2.92e-01 0.148 0.14 0.077 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 3.13e-01 0.122 0.121 0.077 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0198 0.159 0.077 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 8.40e-01 0.0216 0.107 0.077 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 1.87e-01 -0.133 0.1 0.077 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 9.04e-02 -0.261 0.153 0.077 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 4.08e-01 -0.107 0.129 0.077 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 105616 sc-eQTL 9.32e-01 0.0128 0.15 0.077 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 6.30e-01 -0.075 0.155 0.077 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0174 0.0831 0.077 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 9.29e-01 0.0111 0.123 0.077 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 4.58e-01 -0.105 0.141 0.077 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 6.52e-01 0.0604 0.134 0.077 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 6.60e-01 0.0488 0.111 0.077 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 3.39e-02 0.297 0.139 0.077 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 1.66e-01 -0.238 0.171 0.077 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 8.09e-01 -0.017 0.0701 0.077 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 339787 sc-eQTL 8.38e-01 0.0265 0.13 0.077 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0496 0.134 0.077 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 7.89e-02 -0.257 0.145 0.077 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 2.00e-01 -0.146 0.114 0.077 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 3.04e-01 -0.109 0.106 0.077 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 9.48e-01 0.0105 0.162 0.077 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -358632 sc-eQTL 2.10e-01 -0.21 0.167 0.077 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 4.00e-02 -0.389 0.188 0.079 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0683 0.158 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 5.62e-01 -0.115 0.199 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 1.83e-01 0.238 0.178 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 3.57e-01 0.174 0.189 0.079 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 3.69e-01 0.131 0.145 0.079 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 4.30e-01 0.141 0.178 0.079 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 6.79e-01 0.0775 0.187 0.079 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 9.74e-01 0.00439 0.135 0.079 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 6.04e-01 0.0872 0.168 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 2.90e-01 -0.143 0.135 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 3.14e-02 0.332 0.153 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0438 0.131 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 1.65e-01 -0.205 0.147 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 4.05e-01 -0.145 0.174 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 7.87e-01 0.0398 0.147 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 3.14e-01 -0.173 0.172 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 9.44e-02 -0.259 0.154 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 3.93e-01 -0.15 0.175 0.078 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0298 0.131 0.078 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0197 0.17 0.078 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 3.71e-01 -0.135 0.151 0.078 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 4.83e-01 0.104 0.148 0.078 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 6.67e-01 0.0702 0.163 0.078 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 2.91e-01 -0.166 0.157 0.078 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 8.01e-01 0.0438 0.174 0.078 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 5.68e-01 0.0926 0.162 0.078 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 2.43e-01 -0.198 0.169 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 8.80e-01 0.0169 0.112 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 2.30e-03 0.436 0.141 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 3.87e-01 -0.101 0.117 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 3.97e-01 -0.117 0.138 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 1.83e-01 -0.231 0.173 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 1.60e-01 0.189 0.134 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 4.59e-01 0.128 0.172 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 9.22e-01 0.0162 0.165 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 4.67e-01 0.13 0.179 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0447 0.137 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 6.02e-02 -0.31 0.164 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 1.78e-01 -0.175 0.129 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 4.10e-01 -0.126 0.153 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 9.20e-01 0.0167 0.165 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 2.04e-01 0.193 0.151 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0502 0.181 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 5.43e-01 0.0826 0.135 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 5.55e-01 -0.105 0.178 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 3.67e-01 -0.117 0.13 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 2.84e-01 0.199 0.185 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 2.75e-01 -0.2 0.183 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 5.53e-01 0.11 0.185 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0984 0.148 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 4.10e-01 -0.133 0.161 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 1.29e-01 0.282 0.185 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00899 0.133 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 2.32e-01 0.0954 0.0796 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 3.61e-02 0.24 0.114 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 8.21e-02 -0.2 0.115 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 8.65e-01 0.0196 0.116 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 1.40e-01 0.238 0.161 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 1.16e-02 -0.257 0.101 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0858 0.126 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 8.23e-01 0.0317 0.141 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0203 0.0777 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 4.86e-01 0.0922 0.132 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 7.85e-01 0.036 0.132 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 2.03e-01 -0.165 0.129 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 2.89e-01 -0.19 0.179 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 7.10e-03 -0.284 0.105 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 4.74e-01 0.104 0.145 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 9.28e-01 0.0163 0.181 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 4.24e-01 0.0767 0.0958 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 3.91e-01 0.137 0.16 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 8.94e-01 0.0198 0.148 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 2.75e-02 0.302 0.136 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 5.78e-01 0.0943 0.169 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 2.86e-01 -0.154 0.144 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0595 0.171 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0362 0.157 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0563 0.0906 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 2.86e-01 -0.167 0.156 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0747 0.164 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 7.89e-01 -0.04 0.149 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 1.09e-01 -0.266 0.165 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0433 0.137 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 3.80e-01 -0.135 0.153 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 4.04e-01 -0.134 0.16 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 7.67e-02 -0.193 0.109 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00426 0.145 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 3.18e-01 -0.131 0.131 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 4.00e-02 -0.284 0.137 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 2.79e-01 -0.158 0.145 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0629 0.125 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 1.40e-01 0.219 0.148 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 3.03e-01 -0.185 0.179 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0132 0.122 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 1.28e-01 0.277 0.181 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 2.12e-01 -0.224 0.179 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 3.18e-02 0.325 0.15 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00438 0.165 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 8.48e-01 0.0337 0.175 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 7.52e-01 0.0543 0.171 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 3.20e-01 0.177 0.177 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0441 0.147 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 3.74e-01 -0.153 0.172 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0637 0.18 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 2.79e-01 -0.191 0.176 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 3.69e-01 -0.135 0.15 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0585 0.164 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 7.80e-02 -0.313 0.177 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0892 0.172 0.078 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 8.60e-01 0.0173 0.0985 0.078 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 339787 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0554 0.133 0.078 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 9.51e-01 0.0102 0.167 0.078 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0437 0.152 0.078 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 1.48e-01 -0.184 0.127 0.078 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 2.51e-01 -0.17 0.148 0.078 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 1.41e-01 -0.244 0.165 0.078 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -358632 sc-eQTL 1.16e-01 -0.258 0.164 0.078 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0384 0.178 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0253 0.104 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 3.45e-01 -0.165 0.175 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 1.68e-01 -0.211 0.153 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00431 0.163 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 6.40e-02 0.315 0.169 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 2.12e-01 0.215 0.171 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 2.14e-01 -0.216 0.173 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0162 0.0893 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 7.01e-01 0.0601 0.156 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0287 0.161 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 7.30e-01 0.0494 0.143 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0566 0.136 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 1.93e-02 0.364 0.155 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 2.89e-01 0.198 0.186 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0162 0.138 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 4.92e-01 -0.12 0.174 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0102 0.181 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 3.74e-01 -0.149 0.168 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 6.76e-01 0.0732 0.175 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 1.34e-01 -0.248 0.165 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 6.46e-01 0.0738 0.16 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 2.54e-01 -0.112 0.0978 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 9.10e-01 0.0184 0.163 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 7.81e-01 0.0462 0.166 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 8.86e-01 0.0227 0.159 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 7.42e-01 0.0443 0.134 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 2.26e-01 0.201 0.166 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 4.96e-02 0.397 0.2 0.085 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 1.15e-01 0.272 0.172 0.085 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0684 0.203 0.085 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 8.91e-02 -0.259 0.151 0.085 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 6.97e-01 0.0764 0.196 0.085 PB L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0051 0.182 0.085 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00309 0.191 0.085 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 5.70e-01 0.129 0.227 0.085 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 9.80e-01 0.00406 0.162 0.085 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 1.73e-01 -0.231 0.169 0.078 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0601 0.11 0.078 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 339787 sc-eQTL 7.54e-01 0.0388 0.124 0.078 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 7.80e-01 0.0408 0.146 0.078 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 1.49e-01 -0.209 0.145 0.078 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 9.99e-03 0.45 0.173 0.078 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 2.89e-01 0.117 0.111 0.078 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 1.88e-01 0.212 0.16 0.078 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -358632 sc-eQTL 8.92e-01 0.0177 0.13 0.078 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0258 0.171 0.077 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 1.52e-01 -0.169 0.118 0.077 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 1.45e-01 0.234 0.16 0.077 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 4.99e-01 -0.101 0.15 0.077 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 2.15e-01 -0.168 0.135 0.077 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 2.38e-01 -0.18 0.152 0.077 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 4.89e-01 -0.109 0.157 0.077 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 6.44e-01 0.0811 0.175 0.077 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 4.45e-01 0.133 0.174 0.073 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 7.00e-01 0.0588 0.152 0.073 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 134574 sc-eQTL 6.95e-01 0.0621 0.158 0.073 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0122 0.191 0.073 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 1.68e-01 0.187 0.135 0.073 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 2.68e-01 0.198 0.179 0.073 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00649 0.15 0.073 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0237 0.183 0.073 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 4.68e-03 0.496 0.173 0.073 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 105616 sc-eQTL 3.63e-01 -0.14 0.154 0.073 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 5.59e-01 0.1 0.171 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 3.54e-01 -0.121 0.131 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 134574 sc-eQTL 2.92e-01 0.15 0.142 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 8.58e-01 0.0266 0.148 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 5.19e-01 0.0995 0.154 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0042 0.119 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 3.86e-01 -0.106 0.122 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 1.38e-02 -0.413 0.166 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 2.88e-01 -0.147 0.138 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 105616 sc-eQTL 3.02e-01 0.163 0.157 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 1.86e-01 0.228 0.172 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 7.84e-01 0.0403 0.147 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 134574 sc-eQTL 2.70e-01 0.182 0.165 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 7.63e-01 0.0505 0.167 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0462 0.165 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0761 0.134 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 1.11e-01 -0.212 0.132 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 1.97e-01 -0.231 0.179 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0469 0.16 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 105616 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0524 0.169 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 1.68e-01 0.288 0.208 0.082 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 9.16e-02 -0.233 0.137 0.082 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 339787 sc-eQTL 2.28e-01 0.191 0.158 0.082 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 3.18e-01 0.199 0.198 0.082 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 4.07e-01 -0.172 0.207 0.082 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0913 0.192 0.082 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 5.25e-01 -0.118 0.185 0.082 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 6.65e-01 0.0885 0.204 0.082 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -358632 sc-eQTL 1.49e-01 0.258 0.178 0.082 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 7.51e-01 -0.06 0.188 0.076 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0798 0.168 0.076 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 134574 sc-eQTL 6.14e-02 -0.316 0.168 0.076 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 2.50e-02 0.428 0.19 0.076 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 4.48e-01 0.132 0.174 0.076 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 7.43e-02 0.276 0.154 0.076 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 6.39e-01 0.0778 0.165 0.076 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 6.41e-01 0.0802 0.172 0.076 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 4.87e-01 -0.116 0.167 0.076 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 105616 sc-eQTL 6.61e-01 -0.076 0.173 0.076 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 4.60e-01 -0.129 0.174 0.077 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0445 0.136 0.077 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 134574 sc-eQTL 4.95e-01 0.104 0.152 0.077 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 3.76e-01 0.162 0.183 0.077 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 7.88e-01 0.0455 0.169 0.077 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 3.26e-01 -0.143 0.145 0.077 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 4.26e-01 -0.118 0.148 0.077 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0831 0.157 0.077 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0231 0.172 0.077 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 105616 sc-eQTL 5.73e-01 -0.101 0.18 0.077 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 1.07e-01 0.335 0.206 0.073 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 2.11e-01 0.233 0.185 0.073 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 134574 sc-eQTL 4.84e-01 -0.11 0.157 0.073 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 3.66e-01 0.192 0.212 0.073 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 1.08e-02 0.445 0.172 0.073 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 2.12e-01 -0.269 0.214 0.073 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 8.59e-01 0.0334 0.188 0.073 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 3.49e-01 0.194 0.207 0.073 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 1.60e-01 0.256 0.181 0.073 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 105616 sc-eQTL 6.72e-01 0.0754 0.178 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 3.24e-01 -0.167 0.169 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0998 0.113 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 2.44e-01 0.183 0.157 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 8.75e-01 0.0185 0.118 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0819 0.134 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 9.44e-01 0.0117 0.167 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 7.71e-01 -0.038 0.13 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 9.16e-01 0.0181 0.171 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0188 0.15 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0385 0.161 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0455 0.0992 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 1.02e-01 0.219 0.133 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0545 0.111 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 1.49e-01 -0.183 0.126 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 579463 sc-eQTL 6.38e-01 -0.073 0.155 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 1.90e-01 0.167 0.127 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 3.75e-01 0.15 0.169 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 6.40e-01 0.0798 0.17 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 2.99e-01 0.162 0.156 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 8.51e-01 -0.022 0.117 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 134574 sc-eQTL 1.03e-01 0.231 0.141 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0135 0.134 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 9.93e-01 0.00128 0.156 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0294 0.112 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 1.35e-01 -0.162 0.108 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 1.15e-02 -0.428 0.168 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0674 0.135 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 105616 sc-eQTL 8.12e-01 0.0375 0.158 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 9.96e-01 0.000872 0.176 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0617 0.12 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 134574 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0512 0.142 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 3.78e-02 0.333 0.159 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 3.70e-01 0.141 0.157 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 8.26e-01 0.0256 0.116 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 3.40e-01 -0.114 0.12 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 9.67e-01 0.00644 0.154 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 913457 sc-eQTL 1.44e-01 -0.215 0.147 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 105616 sc-eQTL 1.84e-01 -0.216 0.162 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 913193 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0885 0.16 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -269541 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0406 0.0843 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 657419 sc-eQTL 7.52e-01 0.0407 0.128 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 87419 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0387 0.147 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -63436 sc-eQTL 6.30e-01 0.0646 0.134 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 272011 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0217 0.115 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 sc-eQTL 2.46e-02 0.32 0.141 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028203 VEZT 913193 eQTL 0.0135 0.0689 0.0279 0.00207 0.0 0.0716
ENSG00000111142 METAP2 657419 pQTL 0.0176 0.0577 0.0243 0.0 0.0 0.0694
ENSG00000139350 NEDD1 -776284 eQTL 0.0259 -0.102 0.0457 0.0 0.0 0.0716
ENSG00000257715 AC007298.1 105616 eQTL 0.00417 0.105 0.0364 0.0 0.0 0.0716
ENSG00000257878 AC007298.2 134418 eQTL 0.00575 0.0613 0.0222 0.0 0.0 0.0716

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074527 \N 339787 1.09e-06 8.81e-07 1.59e-07 4.1e-07 1.12e-07 2.95e-07 6.09e-07 1.73e-07 6.27e-07 2.72e-07 1.02e-06 5.22e-07 1.02e-06 1.84e-07 3.31e-07 3.57e-07 5.63e-07 4.31e-07 3.06e-07 2.15e-07 2.48e-07 4.99e-07 4.08e-07 2.27e-07 1.22e-06 2.56e-07 4.25e-07 3.51e-07 4.76e-07 7.79e-07 3.77e-07 6.92e-08 4.77e-08 1.73e-07 3.66e-07 2.89e-07 1.84e-07 9.71e-08 6.66e-08 8.15e-09 5.38e-08 7.45e-07 5.84e-08 1.22e-08 1.58e-07 1.42e-08 1.26e-07 3.05e-08 6.26e-08