logo

Genes within 1Mb (chr12:96130405:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0737 0.116 0.098 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 1.23e-01 -0.111 0.0716 0.098 B L1
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 2.18e-01 0.125 0.101 0.098 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 3.68e-01 0.0806 0.0893 0.098 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 8.06e-01 0.0234 0.0952 0.098 B L1
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 7.17e-01 0.0426 0.117 0.098 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 5.22e-01 0.0555 0.0864 0.098 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 6.68e-01 0.0542 0.126 0.098 B L1
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0258 0.118 0.098 B L1
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 7.21e-01 0.0341 0.0955 0.098 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 4.04e-01 0.0496 0.0593 0.098 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0189 0.0829 0.098 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0716 0.0815 0.098 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0259 0.0884 0.098 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 6.77e-01 0.0525 0.126 0.098 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0413 0.0772 0.098 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 4.54e-01 0.0712 0.095 0.098 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0691 0.115 0.098 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 8.77e-01 0.00947 0.0611 0.098 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 3.30e-01 0.0961 0.0984 0.098 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 9.03e-01 0.008 0.0656 0.098 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 3.72e-01 0.0883 0.0986 0.098 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 9.15e-01 0.0119 0.112 0.098 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 3.55e-01 0.0749 0.0808 0.098 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 7.93e-01 0.0283 0.108 0.098 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 3.88e-01 0.119 0.137 0.095 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 1.12e-01 0.182 0.114 0.095 DC L1
ENSG00000084110 HAL 134040 sc-eQTL 9.45e-02 -0.219 0.13 0.095 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 6.14e-03 0.393 0.142 0.095 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 7.40e-02 0.191 0.106 0.095 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 2.15e-01 0.163 0.131 0.095 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0796 0.109 0.095 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0194 0.14 0.095 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 1.94e-01 -0.168 0.129 0.095 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 105082 sc-eQTL 4.60e-02 -0.252 0.125 0.095 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0272 0.125 0.098 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 4.29e-01 0.0724 0.0914 0.098 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 134040 sc-eQTL 4.75e-01 0.0824 0.115 0.098 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 1.04e-01 0.162 0.099 0.098 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 2.41e-02 0.292 0.129 0.098 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 5.04e-02 0.17 0.0866 0.098 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 3.91e-02 -0.169 0.0816 0.098 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 8.72e-01 0.0204 0.127 0.098 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 1.58e-01 -0.15 0.106 0.098 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 105082 sc-eQTL 3.92e-01 0.105 0.122 0.098 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 1.70e-01 0.175 0.127 0.097 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 4.68e-01 0.0496 0.0683 0.097 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 1.39e-01 0.15 0.101 0.097 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 4.13e-01 0.0951 0.116 0.097 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 1.13e-01 0.174 0.109 0.097 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 4.01e-01 0.0766 0.0911 0.097 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0581 0.115 0.097 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0864 0.145 0.098 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0115 0.0592 0.098 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 339253 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0262 0.109 0.098 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 5.38e-01 0.0696 0.113 0.098 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 6.18e-01 0.0618 0.124 0.098 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 4.61e-01 0.0712 0.0964 0.098 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 4.76e-01 0.064 0.0896 0.098 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 1.04e-01 -0.221 0.136 0.098 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -359166 sc-eQTL 6.70e-02 0.258 0.14 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00591 0.151 0.102 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 1.07e-01 -0.201 0.124 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 5.98e-01 0.083 0.157 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 1.03e-01 -0.23 0.14 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0711 0.15 0.102 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 9.59e-01 0.00597 0.115 0.102 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 3.85e-01 -0.123 0.141 0.102 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 1.79e-01 -0.198 0.147 0.102 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 2.70e-01 0.118 0.106 0.102 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 3.53e-02 -0.29 0.137 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 3.51e-01 -0.104 0.111 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 8.47e-01 0.0247 0.128 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 1.58e-01 0.152 0.107 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 6.71e-01 0.0518 0.122 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 2.91e-01 0.151 0.143 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0146 0.121 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0347 0.142 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0601 0.128 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00928 0.146 0.099 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 3.53e-01 0.101 0.108 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 4.95e-01 0.0966 0.141 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0161 0.125 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0248 0.123 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0832 0.135 0.099 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 5.11e-01 0.0859 0.131 0.099 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 5.81e-01 0.0798 0.144 0.099 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 5.39e-01 0.0828 0.134 0.099 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00386 0.135 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0941 0.0884 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 7.01e-01 0.0441 0.115 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 5.22e-01 0.0594 0.0927 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0424 0.11 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0107 0.138 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 9.28e-02 0.179 0.106 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 6.84e-01 0.0558 0.137 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 3.99e-01 -0.111 0.131 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0804 0.148 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0181 0.114 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 2.88e-01 0.146 0.137 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 8.21e-01 0.0243 0.108 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 9.21e-01 0.0125 0.127 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 2.32e-01 0.164 0.137 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 7.75e-01 0.0361 0.126 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0561 0.15 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0926 0.112 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 4.93e-01 0.101 0.147 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 2.49e-01 -0.124 0.107 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 3.48e-01 -0.144 0.153 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 3.21e-01 -0.15 0.151 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 2.77e-01 -0.167 0.153 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 6.37e-01 0.0578 0.122 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 7.87e-01 0.0361 0.133 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 3.87e-01 0.134 0.154 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 8.91e-01 0.0148 0.108 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 6.54e-01 0.0291 0.065 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 9.79e-01 0.00242 0.0937 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0645 0.0939 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0182 0.094 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 6.58e-01 0.0584 0.132 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0402 0.0835 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 5.27e-01 0.0652 0.103 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 7.71e-01 0.0339 0.116 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 1.85e-01 0.0846 0.0635 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0219 0.109 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 7.97e-01 0.0278 0.108 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 5.90e-01 0.0574 0.106 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 7.71e-01 0.0428 0.147 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 2.07e-01 -0.11 0.087 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 8.39e-01 0.0243 0.119 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 5.44e-01 0.0897 0.148 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0145 0.0783 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0201 0.131 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 8.00e-01 0.0306 0.121 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 2.34e-02 -0.254 0.111 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 5.13e-01 0.0905 0.138 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 8.51e-01 0.0221 0.118 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 4.27e-01 -0.111 0.139 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 5.01e-02 -0.257 0.13 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 9.33e-01 0.00642 0.076 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 4.92e-01 0.0903 0.131 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 3.30e-01 -0.134 0.137 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 3.93e-01 0.107 0.125 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 7.13e-01 0.0513 0.139 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0542 0.115 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 6.43e-01 0.0598 0.129 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 3.48e-01 -0.125 0.133 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0191 0.091 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 1.66e-01 0.167 0.12 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 2.21e-01 0.133 0.109 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 1.57e-01 0.163 0.115 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0756 0.121 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0313 0.104 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 7.97e-01 0.0318 0.123 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 1.14e-01 0.23 0.145 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 9.25e-01 0.00937 0.0988 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 3.03e-02 0.318 0.146 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0249 0.145 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 8.68e-01 0.0205 0.123 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 5.88e-01 0.0722 0.133 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 9.50e-02 0.236 0.141 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 4.32e-01 -0.109 0.138 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 1.54e-01 -0.22 0.154 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 9.97e-01 0.000484 0.128 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0448 0.15 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 9.18e-01 0.0161 0.156 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 1.91e-01 0.201 0.153 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 4.12e-01 0.107 0.131 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 4.30e-02 0.288 0.141 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0348 0.155 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 8.65e-02 -0.251 0.146 0.1 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 6.14e-01 0.0425 0.0842 0.1 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 339253 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0963 0.113 0.1 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 1.31e-01 0.216 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 3.69e-01 0.117 0.13 0.1 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0922 0.109 0.1 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0834 0.126 0.1 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 7.11e-01 0.0527 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -359166 sc-eQTL 7.85e-01 0.0384 0.141 0.1 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 9.80e-01 0.00388 0.151 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 3.37e-01 0.0843 0.0877 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 2.68e-02 0.327 0.147 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 3.89e-01 0.112 0.13 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 1.24e-01 0.212 0.137 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 7.61e-02 0.255 0.143 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 6.99e-01 0.0563 0.146 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 3.45e-01 0.135 0.142 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 8.98e-01 0.00945 0.0734 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 3.82e-01 0.112 0.128 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 2.80e-01 0.143 0.132 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 3.75e-01 0.104 0.117 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 5.11e-01 0.0734 0.112 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 9.51e-02 -0.214 0.128 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0668 0.161 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 9.63e-01 0.00547 0.119 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0388 0.15 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 1.59e-01 -0.22 0.156 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 8.26e-01 0.032 0.145 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 7.83e-01 0.0417 0.151 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 9.04e-01 0.0173 0.143 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 2.31e-02 0.295 0.129 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 6.60e-01 0.0351 0.0798 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 6.85e-01 0.0538 0.133 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 8.46e-01 0.0263 0.135 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 3.78e-01 0.114 0.129 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0473 0.109 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 5.47e-01 0.0816 0.135 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00426 0.163 0.096 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 7.66e-01 0.0416 0.139 0.096 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 2.84e-01 0.174 0.162 0.096 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0661 0.123 0.096 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 9.73e-01 0.00533 0.157 0.096 PB L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0285 0.146 0.096 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 4.95e-01 0.105 0.153 0.096 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 2.88e-01 -0.194 0.182 0.096 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 6.27e-01 0.0634 0.13 0.096 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 2.14e-01 0.17 0.136 0.098 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0751 0.0883 0.098 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 339253 sc-eQTL 2.70e-01 0.109 0.099 0.098 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0945 0.117 0.098 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 2.16e-01 -0.144 0.116 0.098 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 3.38e-01 0.135 0.141 0.098 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 5.52e-01 0.053 0.089 0.098 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0726 0.129 0.098 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -359166 sc-eQTL 6.72e-01 0.0443 0.105 0.098 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 3.27e-01 -0.143 0.146 0.098 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 7.50e-01 0.0322 0.101 0.098 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 6.23e-01 0.0677 0.138 0.098 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 7.71e-01 0.0374 0.128 0.098 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 3.46e-01 0.11 0.116 0.098 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0764 0.13 0.098 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 7.56e-02 0.238 0.134 0.098 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 4.62e-01 0.11 0.15 0.098 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 7.44e-01 0.0451 0.138 0.095 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 4.92e-01 0.0829 0.12 0.095 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 134040 sc-eQTL 7.57e-02 -0.222 0.124 0.095 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 7.06e-02 0.273 0.15 0.095 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 1.01e-02 0.274 0.105 0.095 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 8.64e-01 0.0243 0.142 0.095 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0706 0.119 0.095 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0328 0.145 0.095 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 2.52e-01 -0.16 0.14 0.095 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 105082 sc-eQTL 1.22e-01 -0.188 0.121 0.095 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 1.31e-01 -0.208 0.137 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 5.27e-01 0.0668 0.105 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 134040 sc-eQTL 7.27e-01 0.0402 0.115 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 8.79e-01 0.0181 0.119 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 4.16e-02 0.252 0.123 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 1.74e-01 0.13 0.0952 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 2.46e-01 -0.115 0.0984 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 8.86e-01 0.0196 0.136 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 2.56e-01 -0.126 0.111 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 105082 sc-eQTL 3.84e-01 0.11 0.127 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 7.36e-01 0.047 0.139 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 5.09e-01 0.0784 0.118 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 134040 sc-eQTL 1.52e-01 0.19 0.132 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 3.94e-02 0.276 0.133 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 1.29e-02 0.328 0.131 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 3.31e-01 0.105 0.108 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 6.01e-02 -0.2 0.106 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 9.06e-01 0.0171 0.144 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0411 0.129 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 105082 sc-eQTL 4.62e-01 0.0999 0.136 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0797 0.193 0.085 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 3.65e-01 0.116 0.128 0.085 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 339253 sc-eQTL 7.98e-01 0.0377 0.147 0.085 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 3.60e-01 0.168 0.183 0.085 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 1.95e-01 0.248 0.191 0.085 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 4.31e-02 0.357 0.175 0.085 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0865 0.171 0.085 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0218 0.189 0.085 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -359166 sc-eQTL 5.53e-02 0.316 0.164 0.085 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 9.98e-01 0.000302 0.152 0.096 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 1.83e-01 0.18 0.135 0.096 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 134040 sc-eQTL 9.97e-01 0.000587 0.137 0.096 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 4.67e-01 0.113 0.155 0.096 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 2.02e-02 0.324 0.138 0.096 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 8.61e-01 0.022 0.125 0.096 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 5.86e-04 -0.453 0.13 0.096 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 4.36e-01 -0.108 0.139 0.096 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 6.73e-01 0.0568 0.135 0.096 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 105082 sc-eQTL 4.90e-01 0.0966 0.139 0.096 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 3.99e-03 0.407 0.14 0.095 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 2.08e-01 0.14 0.111 0.095 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 134040 sc-eQTL 8.50e-01 0.0235 0.124 0.095 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 1.17e-01 0.235 0.149 0.095 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 2.31e-01 0.166 0.138 0.095 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 1.19e-01 0.185 0.118 0.095 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 1.93e-01 0.158 0.121 0.095 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 9.29e-01 0.0114 0.129 0.095 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 1.03e-01 -0.23 0.14 0.095 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 105082 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0714 0.147 0.095 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 1.24e-01 0.262 0.169 0.096 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 5.93e-02 0.287 0.151 0.096 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 134040 sc-eQTL 8.64e-01 0.0221 0.129 0.096 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 1.50e-02 0.42 0.171 0.096 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 8.61e-01 0.0254 0.144 0.096 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 8.89e-01 0.0248 0.177 0.096 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 8.48e-01 0.0296 0.154 0.096 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 4.45e-01 -0.13 0.17 0.096 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 8.61e-01 0.0262 0.15 0.096 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 105082 sc-eQTL 1.87e-01 -0.192 0.145 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 9.69e-02 -0.235 0.141 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 2.15e-01 -0.118 0.0946 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 1.84e-01 0.175 0.131 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 7.84e-01 0.027 0.0986 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0103 0.113 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 9.27e-01 -0.013 0.14 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 8.60e-01 0.0193 0.109 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 9.13e-01 0.0157 0.143 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 8.86e-01 0.0181 0.126 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 6.04e-01 -0.067 0.129 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 2.05e-01 -0.101 0.0793 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 3.05e-01 0.111 0.108 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 9.03e-01 0.0109 0.0894 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0144 0.102 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 578929 sc-eQTL 9.61e-01 0.00607 0.124 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 1.89e-01 0.134 0.102 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 9.71e-01 0.00493 0.136 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 3.25e-01 -0.135 0.136 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 2.71e-01 -0.14 0.127 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 7.29e-01 0.033 0.0952 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 134040 sc-eQTL 2.90e-01 0.122 0.115 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 5.16e-02 0.211 0.108 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 1.06e-02 0.321 0.125 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 4.82e-02 0.18 0.0906 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 1.07e-01 -0.142 0.0877 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 9.04e-01 0.0167 0.138 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 2.59e-01 -0.124 0.109 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 105082 sc-eQTL 1.97e-01 0.165 0.128 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 1.21e-01 0.222 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 2.82e-01 0.105 0.0977 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 134040 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0774 0.116 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 3.36e-01 0.126 0.131 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 1.61e-01 0.18 0.128 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 5.79e-01 0.0528 0.095 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 1.74e-01 -0.133 0.0976 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 5.72e-01 -0.071 0.126 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 912923 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0186 0.12 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 105082 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0571 0.133 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 912659 sc-eQTL 1.26e-01 0.201 0.131 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -270075 sc-eQTL 8.26e-01 0.0152 0.0692 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 656885 sc-eQTL 3.12e-01 0.106 0.105 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 86885 sc-eQTL 7.44e-01 0.0394 0.12 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -63970 sc-eQTL 4.21e-01 0.0886 0.11 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 271477 sc-eQTL 6.10e-01 0.0481 0.0942 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -776818 sc-eQTL 2.01e-01 -0.15 0.117 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111144 LTA4H 86885 eQTL 0.048 0.0763 0.0386 0.0 0.0 0.077

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina