logo

Genes within 1Mb (chr12:96127728:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 6.95e-01 0.0488 0.124 0.092 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 1.58e-01 -0.109 0.0769 0.092 B L1
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0748 0.109 0.092 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 2.34e-02 0.216 0.0948 0.092 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 5.29e-01 0.0644 0.102 0.092 B L1
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 3.30e-01 -0.123 0.126 0.092 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0318 0.0928 0.092 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 8.71e-02 -0.231 0.135 0.092 B L1
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0465 0.126 0.092 B L1
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 3.30e-01 -0.101 0.104 0.092 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0635 0.0645 0.092 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 5.54e-01 0.0534 0.0901 0.092 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 1.97e-01 -0.114 0.0884 0.092 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0225 0.0961 0.092 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 1.65e-01 0.19 0.137 0.092 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00487 0.0841 0.092 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0037 0.104 0.092 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 3.02e-01 0.128 0.124 0.092 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0213 0.0657 0.092 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 6.02e-01 0.0554 0.106 0.092 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 1.15e-01 0.111 0.0702 0.092 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0298 0.106 0.092 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 6.13e-01 0.0612 0.121 0.092 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 5.47e-01 0.0525 0.087 0.092 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 8.35e-01 0.0242 0.116 0.092 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0288 0.144 0.095 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 2.13e-02 -0.276 0.119 0.095 DC L1
ENSG00000084110 HAL 131363 sc-eQTL 9.97e-03 0.352 0.135 0.095 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 5.04e-01 -0.101 0.151 0.095 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 3.42e-01 0.107 0.112 0.095 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 1.00e+00 2.03e-07 0.138 0.095 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0513 0.114 0.095 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0836 0.147 0.095 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 1.35e-01 0.202 0.135 0.095 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 102405 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0187 0.133 0.095 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 2.81e-01 -0.146 0.135 0.092 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0691 0.0989 0.092 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 131363 sc-eQTL 2.94e-01 0.131 0.124 0.092 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 2.06e-01 -0.136 0.107 0.092 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 6.02e-02 0.264 0.14 0.092 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0292 0.0946 0.092 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0639 0.0891 0.092 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 6.64e-01 0.0596 0.137 0.092 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 3.98e-01 0.097 0.115 0.092 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 102405 sc-eQTL 4.44e-01 0.102 0.133 0.092 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 8.04e-01 0.0348 0.14 0.09 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 3.71e-01 0.0667 0.0745 0.09 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0327 0.11 0.09 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0942 0.127 0.09 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 1.10e-01 -0.192 0.119 0.09 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 4.52e-01 -0.075 0.0996 0.09 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 3.10e-01 -0.128 0.126 0.09 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0399 0.152 0.092 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 2.46e-01 0.0715 0.0615 0.092 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 336576 sc-eQTL 7.79e-01 -0.032 0.114 0.092 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 3.00e-02 -0.255 0.117 0.092 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00838 0.129 0.092 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0506 0.101 0.092 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0365 0.0935 0.092 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 7.30e-01 0.0492 0.142 0.092 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -361843 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00251 0.148 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 3.39e-01 -0.156 0.163 0.094 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0498 0.135 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 1.61e-01 0.238 0.169 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 7.52e-01 0.0484 0.153 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 8.08e-01 0.0394 0.162 0.094 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 3.06e-01 -0.128 0.124 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 6.92e-01 0.0606 0.153 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 3.53e-01 0.148 0.16 0.094 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 3.41e-01 0.11 0.115 0.094 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0278 0.148 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 6.41e-01 0.0558 0.119 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 6.57e-01 -0.061 0.137 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 9.66e-01 0.00491 0.116 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 9.56e-01 0.00718 0.131 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 2.19e-01 -0.189 0.153 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 9.33e-01 0.0109 0.13 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 7.11e-01 0.0564 0.152 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 3.71e-01 -0.123 0.137 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 1.01e-02 0.397 0.153 0.093 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 5.07e-01 -0.077 0.116 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0127 0.151 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 3.77e-01 0.118 0.134 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 2.87e-01 -0.14 0.131 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0199 0.144 0.093 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 6.41e-01 0.065 0.139 0.093 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0644 0.154 0.093 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00387 0.144 0.093 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 7.58e-01 0.0454 0.147 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 8.63e-02 -0.166 0.0962 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 6.37e-02 -0.232 0.124 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 5.24e-03 0.281 0.0996 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 2.95e-01 0.126 0.12 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 4.25e-01 -0.12 0.151 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0348 0.117 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 9.04e-01 -0.018 0.15 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00753 0.143 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0192 0.157 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 8.60e-01 0.0213 0.12 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 4.25e-01 0.116 0.145 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 3.66e-02 0.238 0.113 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 1.58e-01 0.19 0.134 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0285 0.145 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 2.62e-01 -0.15 0.133 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 3.57e-01 -0.147 0.159 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 8.01e-01 0.0301 0.119 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 1.63e-01 -0.218 0.156 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 3.91e-01 0.0981 0.114 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 6.71e-01 0.0696 0.163 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0283 0.161 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 4.29e-01 -0.129 0.163 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 6.48e-01 0.0596 0.13 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 8.44e-01 0.0279 0.142 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0644 0.164 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 1.46e-01 -0.172 0.118 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0515 0.071 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0219 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0213 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0604 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 2.10e-02 0.331 0.142 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00577 0.0914 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 7.72e-01 0.0326 0.112 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 2.61e-01 0.141 0.125 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 5.18e-01 0.0448 0.0691 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 5.14e-01 0.0768 0.118 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 8.45e-02 -0.202 0.116 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 5.55e-01 0.0682 0.115 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 1.81e-01 -0.213 0.159 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0647 0.0945 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 6.28e-01 0.0626 0.129 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 9.93e-01 0.00135 0.158 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 1.92e-01 -0.109 0.0833 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 6.08e-01 0.0717 0.14 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 4.87e-01 0.0899 0.129 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 2.89e-01 -0.127 0.12 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0382 0.148 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 9.94e-01 0.00101 0.126 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 4.73e-01 0.107 0.149 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 9.00e-01 0.0176 0.141 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 2.38e-01 0.0961 0.0812 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 9.70e-01 0.0053 0.141 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 8.83e-01 0.0217 0.147 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 8.16e-02 0.233 0.133 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 5.13e-01 0.0976 0.149 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 8.81e-01 0.0184 0.123 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 4.00e-01 -0.116 0.138 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 8.10e-01 0.0346 0.144 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0203 0.0981 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 1.97e-01 -0.168 0.13 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 8.38e-02 0.203 0.117 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0657 0.124 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 7.35e-01 0.0442 0.13 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 6.85e-02 0.203 0.111 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 2.61e-01 0.15 0.133 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 3.31e-01 0.148 0.151 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 6.68e-01 0.0443 0.103 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 4.89e-01 -0.107 0.154 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0934 0.151 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0269 0.128 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 5.62e-01 0.0806 0.139 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 8.69e-03 -0.385 0.145 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 3.21e-01 -0.143 0.144 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 1.72e-01 0.222 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 1.20e-01 0.209 0.133 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 9.67e-01 0.00652 0.158 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 1.50e-01 0.236 0.164 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0503 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 2.63e-01 0.154 0.137 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0476 0.15 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 1.51e-01 0.234 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0575 0.156 0.093 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 4.74e-01 0.064 0.0893 0.093 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 336576 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0558 0.12 0.093 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 2.63e-01 -0.17 0.151 0.093 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0388 0.138 0.093 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 9.77e-01 0.00341 0.116 0.093 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 4.64e-01 0.0984 0.134 0.093 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 1.33e-01 0.226 0.15 0.093 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -361843 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0797 0.149 0.093 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 1.57e-01 0.222 0.157 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 5.10e-01 0.0604 0.0916 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 2.88e-01 -0.164 0.154 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 3.17e-01 0.136 0.135 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 1.70e-01 -0.197 0.143 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 1.14e-01 -0.238 0.15 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 5.32e-01 0.095 0.152 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0311 0.157 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 4.09e-01 0.0666 0.0805 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0434 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0958 0.146 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 1.77e-01 -0.174 0.128 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 5.44e-01 0.0745 0.123 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 2.58e-01 -0.16 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 7.15e-01 0.0628 0.172 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 3.52e-01 0.118 0.127 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 2.42e-01 0.187 0.159 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 7.65e-01 0.0498 0.166 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0593 0.154 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 2.19e-01 -0.198 0.16 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 4.74e-01 0.109 0.152 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 7.84e-01 -0.039 0.142 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 4.51e-01 0.0655 0.0867 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0565 0.144 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 1.62e-01 -0.205 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 6.18e-02 -0.262 0.139 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 6.99e-01 -0.046 0.119 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 3.10e-01 -0.149 0.147 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0186 0.217 0.074 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 5.20e-01 -0.119 0.185 0.074 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 2.90e-01 -0.229 0.215 0.074 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 5.94e-02 0.306 0.161 0.074 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 1.81e-02 -0.49 0.204 0.074 PB L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 9.73e-01 0.00667 0.194 0.074 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 4.11e-01 0.168 0.204 0.074 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 3.73e-01 -0.216 0.242 0.074 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 4.98e-01 0.117 0.173 0.074 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 1.38e-01 0.218 0.147 0.093 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 1.67e-01 0.132 0.095 0.093 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 336576 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0804 0.107 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 3.21e-01 -0.126 0.126 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 6.10e-02 0.235 0.125 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 1.10e-02 -0.385 0.15 0.093 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 7.71e-01 0.0281 0.0961 0.093 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 4.66e-01 -0.102 0.139 0.093 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -361843 sc-eQTL 3.76e-01 -0.1 0.113 0.093 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 8.08e-01 0.0368 0.151 0.092 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 6.56e-01 0.0467 0.105 0.092 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0441 0.143 0.092 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 2.77e-02 -0.291 0.131 0.092 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 3.63e-01 0.11 0.12 0.092 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 6.72e-01 0.0573 0.135 0.092 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0391 0.139 0.092 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 3.34e-01 -0.15 0.155 0.092 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 3.16e-01 0.145 0.144 0.1 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 2.75e-01 -0.137 0.125 0.1 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 131363 sc-eQTL 1.63e-02 0.312 0.129 0.1 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 3.63e-01 -0.144 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 2.72e-01 0.123 0.112 0.1 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 2.41e-01 0.173 0.147 0.1 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 6.53e-02 -0.227 0.123 0.1 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 3.92e-01 0.129 0.151 0.1 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 8.50e-01 0.0276 0.146 0.1 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 102405 sc-eQTL 6.48e-01 0.0581 0.127 0.1 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 1.82e-01 -0.199 0.149 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0896 0.114 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 131363 sc-eQTL 3.34e-01 0.12 0.124 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 2.93e-01 -0.136 0.129 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 1.32e-01 0.202 0.134 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 3.04e-01 -0.106 0.103 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 4.49e-02 -0.213 0.106 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 8.14e-01 0.0347 0.147 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 1.70e-01 0.165 0.12 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 102405 sc-eQTL 4.61e-01 -0.101 0.137 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0653 0.152 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0592 0.13 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 131363 sc-eQTL 3.68e-01 0.131 0.145 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0959 0.147 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 7.03e-02 0.262 0.144 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0691 0.118 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0209 0.117 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 4.64e-01 0.116 0.158 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 2.24e-01 0.171 0.14 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 102405 sc-eQTL 3.30e-01 0.145 0.148 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 9.08e-01 0.023 0.199 0.1 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 1.61e-01 -0.184 0.131 0.1 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 336576 sc-eQTL 8.15e-02 -0.262 0.15 0.1 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 9.62e-02 -0.314 0.187 0.1 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 6.37e-01 -0.093 0.197 0.1 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 1.19e-01 0.283 0.181 0.1 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0901 0.176 0.1 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0983 0.194 0.1 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -361843 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0506 0.17 0.1 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0534 0.163 0.091 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 1.63e-01 0.202 0.144 0.091 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 131363 sc-eQTL 3.15e-01 0.148 0.146 0.091 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 2.75e-02 -0.365 0.164 0.091 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 1.31e-01 0.227 0.15 0.091 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 1.33e-01 0.201 0.133 0.091 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 6.21e-01 -0.071 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00413 0.149 0.091 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 8.15e-02 -0.251 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 102405 sc-eQTL 8.21e-01 -0.034 0.15 0.091 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 7.19e-01 0.0535 0.149 0.095 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 1.69e-01 0.159 0.115 0.095 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 131363 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00351 0.129 0.095 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 8.28e-01 0.034 0.156 0.095 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 5.77e-02 0.273 0.143 0.095 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 5.33e-01 0.0773 0.124 0.095 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 7.70e-01 0.037 0.126 0.095 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 9.33e-01 0.0113 0.134 0.095 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 3.88e-01 -0.127 0.147 0.095 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 102405 sc-eQTL 2.34e-01 0.182 0.153 0.095 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0648 0.159 0.11 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 1.76e-02 -0.335 0.139 0.11 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 131363 sc-eQTL 5.29e-01 0.0756 0.12 0.11 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 3.58e-01 0.149 0.162 0.11 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 7.34e-01 0.0457 0.134 0.11 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 6.51e-01 0.0745 0.164 0.11 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 4.65e-01 0.105 0.143 0.11 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 4.45e-01 -0.121 0.158 0.11 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 2.22e-01 0.17 0.139 0.11 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 102405 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0549 0.136 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 1.79e-01 0.202 0.15 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0091 0.101 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0185 0.14 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 3.16e-01 0.105 0.104 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0386 0.119 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 3.51e-01 -0.139 0.149 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 6.54e-01 0.0519 0.116 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 7.39e-01 0.0507 0.152 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 3.72e-01 -0.119 0.133 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 5.95e-01 0.0748 0.14 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 1.22e-01 -0.134 0.0862 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 1.73e-01 -0.16 0.117 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 4.34e-03 0.275 0.0954 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 1.26e-01 0.169 0.11 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 576252 sc-eQTL 5.65e-01 -0.078 0.135 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0461 0.111 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 2.20e-01 -0.181 0.147 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 9.15e-01 0.0159 0.149 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 9.26e-02 -0.231 0.137 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 2.14e-01 -0.128 0.103 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 131363 sc-eQTL 3.22e-01 0.124 0.125 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 3.48e-01 -0.111 0.117 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 7.46e-02 0.244 0.136 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 2.84e-01 -0.106 0.0989 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0731 0.0955 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 4.84e-01 0.105 0.15 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 1.95e-01 0.154 0.119 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 102405 sc-eQTL 6.61e-01 0.061 0.139 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 5.27e-01 0.0992 0.156 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 2.50e-01 0.123 0.107 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 131363 sc-eQTL 6.66e-01 0.0547 0.126 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 1.56e-01 -0.203 0.143 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 6.96e-02 0.254 0.139 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 2.40e-01 0.122 0.103 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 7.89e-01 0.0286 0.107 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 9.65e-01 0.00601 0.137 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 910246 sc-eQTL 2.75e-01 -0.143 0.131 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 102405 sc-eQTL 6.50e-01 0.066 0.145 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 909982 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0471 0.145 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -272752 sc-eQTL 4.20e-01 0.0612 0.0758 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 654208 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0299 0.115 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 84208 sc-eQTL 2.03e-01 -0.168 0.132 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -66647 sc-eQTL 7.77e-02 -0.213 0.12 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 268800 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0325 0.103 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 sc-eQTL 3.79e-01 -0.113 0.129 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -779495 eQTL 0.000129 -0.149 0.0389 0.0 0.0 0.0962

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina