logo

Genes within 1Mb (chr12:96124103:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 6.95e-01 0.0488 0.124 0.092 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 1.58e-01 -0.109 0.0769 0.092 B L1
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0748 0.109 0.092 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 2.34e-02 0.216 0.0948 0.092 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 5.29e-01 0.0644 0.102 0.092 B L1
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 3.30e-01 -0.123 0.126 0.092 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0318 0.0928 0.092 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 8.71e-02 -0.231 0.135 0.092 B L1
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0465 0.126 0.092 B L1
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 3.30e-01 -0.101 0.104 0.092 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0635 0.0645 0.092 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 5.54e-01 0.0534 0.0901 0.092 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 1.97e-01 -0.114 0.0884 0.092 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0225 0.0961 0.092 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 1.65e-01 0.19 0.137 0.092 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00487 0.0841 0.092 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0037 0.104 0.092 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 3.02e-01 0.128 0.124 0.092 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0213 0.0657 0.092 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 6.02e-01 0.0554 0.106 0.092 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 1.15e-01 0.111 0.0702 0.092 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0298 0.106 0.092 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 6.13e-01 0.0612 0.121 0.092 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 5.47e-01 0.0525 0.087 0.092 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 8.35e-01 0.0242 0.116 0.092 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0288 0.144 0.095 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 2.13e-02 -0.276 0.119 0.095 DC L1
ENSG00000084110 HAL 127738 sc-eQTL 9.97e-03 0.352 0.135 0.095 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 5.04e-01 -0.101 0.151 0.095 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 3.42e-01 0.107 0.112 0.095 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 1.00e+00 2.03e-07 0.138 0.095 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0513 0.114 0.095 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0836 0.147 0.095 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 1.35e-01 0.202 0.135 0.095 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 98780 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0187 0.133 0.095 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 2.81e-01 -0.146 0.135 0.092 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0691 0.0989 0.092 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 127738 sc-eQTL 2.94e-01 0.131 0.124 0.092 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 2.06e-01 -0.136 0.107 0.092 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 6.02e-02 0.264 0.14 0.092 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0292 0.0946 0.092 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0639 0.0891 0.092 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 6.64e-01 0.0596 0.137 0.092 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 3.98e-01 0.097 0.115 0.092 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 98780 sc-eQTL 4.44e-01 0.102 0.133 0.092 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 8.04e-01 0.0348 0.14 0.09 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 3.71e-01 0.0667 0.0745 0.09 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0327 0.11 0.09 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0942 0.127 0.09 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 1.10e-01 -0.192 0.119 0.09 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 4.52e-01 -0.075 0.0996 0.09 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 3.10e-01 -0.128 0.126 0.09 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0399 0.152 0.092 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 2.46e-01 0.0715 0.0615 0.092 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 332951 sc-eQTL 7.79e-01 -0.032 0.114 0.092 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 3.00e-02 -0.255 0.117 0.092 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00838 0.129 0.092 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0506 0.101 0.092 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0365 0.0935 0.092 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 7.30e-01 0.0492 0.142 0.092 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -365468 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00251 0.148 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 3.39e-01 -0.156 0.163 0.094 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0498 0.135 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 1.61e-01 0.238 0.169 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 7.52e-01 0.0484 0.153 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 8.08e-01 0.0394 0.162 0.094 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 3.06e-01 -0.128 0.124 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 6.92e-01 0.0606 0.153 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 3.53e-01 0.148 0.16 0.094 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 3.41e-01 0.11 0.115 0.094 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0278 0.148 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 6.41e-01 0.0558 0.119 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 6.57e-01 -0.061 0.137 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 9.66e-01 0.00491 0.116 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 9.56e-01 0.00718 0.131 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 2.19e-01 -0.189 0.153 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 9.33e-01 0.0109 0.13 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 7.11e-01 0.0564 0.152 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 3.71e-01 -0.123 0.137 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 1.01e-02 0.397 0.153 0.093 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 5.07e-01 -0.077 0.116 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0127 0.151 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 3.77e-01 0.118 0.134 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 2.87e-01 -0.14 0.131 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0199 0.144 0.093 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 6.41e-01 0.065 0.139 0.093 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0644 0.154 0.093 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00387 0.144 0.093 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 7.58e-01 0.0454 0.147 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 8.63e-02 -0.166 0.0962 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 6.37e-02 -0.232 0.124 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 5.24e-03 0.281 0.0996 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 2.95e-01 0.126 0.12 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 4.25e-01 -0.12 0.151 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0348 0.117 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 9.04e-01 -0.018 0.15 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00753 0.143 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0192 0.157 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 8.60e-01 0.0213 0.12 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 4.25e-01 0.116 0.145 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 3.66e-02 0.238 0.113 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 1.58e-01 0.19 0.134 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0285 0.145 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 2.62e-01 -0.15 0.133 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 3.57e-01 -0.147 0.159 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 8.01e-01 0.0301 0.119 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 1.63e-01 -0.218 0.156 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 3.91e-01 0.0981 0.114 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 6.71e-01 0.0696 0.163 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0283 0.161 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 4.29e-01 -0.129 0.163 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 6.48e-01 0.0596 0.13 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 8.44e-01 0.0279 0.142 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0644 0.164 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 1.46e-01 -0.172 0.118 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0515 0.071 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0219 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0213 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0604 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 2.10e-02 0.331 0.142 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00577 0.0914 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 7.72e-01 0.0326 0.112 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 2.61e-01 0.141 0.125 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 5.18e-01 0.0448 0.0691 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 5.14e-01 0.0768 0.118 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 8.45e-02 -0.202 0.116 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 5.55e-01 0.0682 0.115 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 1.81e-01 -0.213 0.159 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0647 0.0945 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 6.28e-01 0.0626 0.129 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 9.93e-01 0.00135 0.158 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 1.92e-01 -0.109 0.0833 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 6.08e-01 0.0717 0.14 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 4.87e-01 0.0899 0.129 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 2.89e-01 -0.127 0.12 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0382 0.148 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 9.94e-01 0.00101 0.126 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 4.73e-01 0.107 0.149 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 9.00e-01 0.0176 0.141 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 2.38e-01 0.0961 0.0812 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 9.70e-01 0.0053 0.141 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 8.83e-01 0.0217 0.147 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 8.16e-02 0.233 0.133 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 5.13e-01 0.0976 0.149 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 8.81e-01 0.0184 0.123 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 4.00e-01 -0.116 0.138 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 8.10e-01 0.0346 0.144 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0203 0.0981 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 1.97e-01 -0.168 0.13 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 8.38e-02 0.203 0.117 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0657 0.124 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 7.35e-01 0.0442 0.13 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 6.85e-02 0.203 0.111 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 2.61e-01 0.15 0.133 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 3.31e-01 0.148 0.151 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 6.68e-01 0.0443 0.103 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 4.89e-01 -0.107 0.154 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0934 0.151 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0269 0.128 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 5.62e-01 0.0806 0.139 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 8.69e-03 -0.385 0.145 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 3.21e-01 -0.143 0.144 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 1.72e-01 0.222 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 1.20e-01 0.209 0.133 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 9.67e-01 0.00652 0.158 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 1.50e-01 0.236 0.164 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0503 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 2.63e-01 0.154 0.137 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0476 0.15 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 1.51e-01 0.234 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0575 0.156 0.093 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 4.74e-01 0.064 0.0893 0.093 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 332951 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0558 0.12 0.093 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 2.63e-01 -0.17 0.151 0.093 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0388 0.138 0.093 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 9.77e-01 0.00341 0.116 0.093 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 4.64e-01 0.0984 0.134 0.093 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 1.33e-01 0.226 0.15 0.093 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -365468 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0797 0.149 0.093 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 1.57e-01 0.222 0.157 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 5.10e-01 0.0604 0.0916 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 2.88e-01 -0.164 0.154 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 3.17e-01 0.136 0.135 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 1.70e-01 -0.197 0.143 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 1.14e-01 -0.238 0.15 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 5.32e-01 0.095 0.152 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0311 0.157 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 4.09e-01 0.0666 0.0805 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0434 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0958 0.146 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 1.77e-01 -0.174 0.128 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 5.44e-01 0.0745 0.123 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 2.58e-01 -0.16 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 7.15e-01 0.0628 0.172 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 3.52e-01 0.118 0.127 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 2.42e-01 0.187 0.159 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 7.65e-01 0.0498 0.166 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0593 0.154 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 2.19e-01 -0.198 0.16 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 4.74e-01 0.109 0.152 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 7.84e-01 -0.039 0.142 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 4.51e-01 0.0655 0.0867 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0565 0.144 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 1.62e-01 -0.205 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 6.18e-02 -0.262 0.139 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 6.99e-01 -0.046 0.119 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 3.10e-01 -0.149 0.147 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0186 0.217 0.074 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 5.20e-01 -0.119 0.185 0.074 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 2.90e-01 -0.229 0.215 0.074 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 5.94e-02 0.306 0.161 0.074 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 1.81e-02 -0.49 0.204 0.074 PB L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 9.73e-01 0.00667 0.194 0.074 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 4.11e-01 0.168 0.204 0.074 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 3.73e-01 -0.216 0.242 0.074 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 4.98e-01 0.117 0.173 0.074 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 1.38e-01 0.218 0.147 0.093 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 1.67e-01 0.132 0.095 0.093 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 332951 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0804 0.107 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 3.21e-01 -0.126 0.126 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 6.10e-02 0.235 0.125 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 1.10e-02 -0.385 0.15 0.093 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 7.71e-01 0.0281 0.0961 0.093 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 4.66e-01 -0.102 0.139 0.093 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -365468 sc-eQTL 3.76e-01 -0.1 0.113 0.093 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 8.08e-01 0.0368 0.151 0.092 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 6.56e-01 0.0467 0.105 0.092 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0441 0.143 0.092 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 2.77e-02 -0.291 0.131 0.092 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 3.63e-01 0.11 0.12 0.092 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 6.72e-01 0.0573 0.135 0.092 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0391 0.139 0.092 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 3.34e-01 -0.15 0.155 0.092 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 3.16e-01 0.145 0.144 0.1 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 2.75e-01 -0.137 0.125 0.1 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 127738 sc-eQTL 1.63e-02 0.312 0.129 0.1 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 3.63e-01 -0.144 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 2.72e-01 0.123 0.112 0.1 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 2.41e-01 0.173 0.147 0.1 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 6.53e-02 -0.227 0.123 0.1 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 3.92e-01 0.129 0.151 0.1 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 8.50e-01 0.0276 0.146 0.1 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 98780 sc-eQTL 6.48e-01 0.0581 0.127 0.1 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 1.82e-01 -0.199 0.149 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0896 0.114 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 127738 sc-eQTL 3.34e-01 0.12 0.124 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 2.93e-01 -0.136 0.129 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 1.32e-01 0.202 0.134 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 3.04e-01 -0.106 0.103 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 4.49e-02 -0.213 0.106 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 8.14e-01 0.0347 0.147 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 1.70e-01 0.165 0.12 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 98780 sc-eQTL 4.61e-01 -0.101 0.137 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0653 0.152 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0592 0.13 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 127738 sc-eQTL 3.68e-01 0.131 0.145 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0959 0.147 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 7.03e-02 0.262 0.144 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0691 0.118 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0209 0.117 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 4.64e-01 0.116 0.158 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 2.24e-01 0.171 0.14 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 98780 sc-eQTL 3.30e-01 0.145 0.148 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 9.08e-01 0.023 0.199 0.1 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 1.61e-01 -0.184 0.131 0.1 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 332951 sc-eQTL 8.15e-02 -0.262 0.15 0.1 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 9.62e-02 -0.314 0.187 0.1 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 6.37e-01 -0.093 0.197 0.1 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 1.19e-01 0.283 0.181 0.1 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0901 0.176 0.1 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0983 0.194 0.1 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -365468 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0506 0.17 0.1 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0534 0.163 0.091 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 1.63e-01 0.202 0.144 0.091 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 127738 sc-eQTL 3.15e-01 0.148 0.146 0.091 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 2.75e-02 -0.365 0.164 0.091 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 1.31e-01 0.227 0.15 0.091 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 1.33e-01 0.201 0.133 0.091 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 6.21e-01 -0.071 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00413 0.149 0.091 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 8.15e-02 -0.251 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 98780 sc-eQTL 8.21e-01 -0.034 0.15 0.091 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 7.19e-01 0.0535 0.149 0.095 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 1.69e-01 0.159 0.115 0.095 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 127738 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00351 0.129 0.095 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 8.28e-01 0.034 0.156 0.095 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 5.77e-02 0.273 0.143 0.095 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 5.33e-01 0.0773 0.124 0.095 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 7.70e-01 0.037 0.126 0.095 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 9.33e-01 0.0113 0.134 0.095 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 3.88e-01 -0.127 0.147 0.095 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 98780 sc-eQTL 2.34e-01 0.182 0.153 0.095 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0648 0.159 0.11 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 1.76e-02 -0.335 0.139 0.11 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 127738 sc-eQTL 5.29e-01 0.0756 0.12 0.11 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 3.58e-01 0.149 0.162 0.11 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 7.34e-01 0.0457 0.134 0.11 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 6.51e-01 0.0745 0.164 0.11 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 4.65e-01 0.105 0.143 0.11 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 4.45e-01 -0.121 0.158 0.11 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 2.22e-01 0.17 0.139 0.11 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 98780 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0549 0.136 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 1.79e-01 0.202 0.15 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0091 0.101 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0185 0.14 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 3.16e-01 0.105 0.104 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0386 0.119 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 3.51e-01 -0.139 0.149 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 6.54e-01 0.0519 0.116 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 7.39e-01 0.0507 0.152 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 3.72e-01 -0.119 0.133 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 5.95e-01 0.0748 0.14 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 1.22e-01 -0.134 0.0862 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 1.73e-01 -0.16 0.117 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 4.34e-03 0.275 0.0954 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 1.26e-01 0.169 0.11 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 572627 sc-eQTL 5.65e-01 -0.078 0.135 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0461 0.111 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 2.20e-01 -0.181 0.147 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 9.15e-01 0.0159 0.149 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 9.26e-02 -0.231 0.137 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 2.14e-01 -0.128 0.103 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 127738 sc-eQTL 3.22e-01 0.124 0.125 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 3.48e-01 -0.111 0.117 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 7.46e-02 0.244 0.136 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 2.84e-01 -0.106 0.0989 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0731 0.0955 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 4.84e-01 0.105 0.15 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 1.95e-01 0.154 0.119 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 98780 sc-eQTL 6.61e-01 0.061 0.139 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 5.27e-01 0.0992 0.156 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 2.50e-01 0.123 0.107 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 127738 sc-eQTL 6.66e-01 0.0547 0.126 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 1.56e-01 -0.203 0.143 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 6.96e-02 0.254 0.139 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 2.40e-01 0.122 0.103 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 7.89e-01 0.0286 0.107 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 9.65e-01 0.00601 0.137 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 906621 sc-eQTL 2.75e-01 -0.143 0.131 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 98780 sc-eQTL 6.50e-01 0.066 0.145 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 906357 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0471 0.145 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -276377 sc-eQTL 4.20e-01 0.0612 0.0758 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 650583 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0299 0.115 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 80583 sc-eQTL 2.03e-01 -0.168 0.132 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -70272 sc-eQTL 7.77e-02 -0.213 0.12 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 265175 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0325 0.103 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 sc-eQTL 3.79e-01 -0.113 0.129 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -783120 eQTL 0.000162 -0.147 0.0389 0.0 0.0 0.0962

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina