logo

Genes within 1Mb (chr12:96117253:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0394 0.0858 0.218 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0315 0.0534 0.218 B L1
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 6.30e-01 0.0364 0.0755 0.218 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0365 0.0663 0.218 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0343 0.0706 0.218 B L1
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 2.31e-01 0.104 0.0868 0.218 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0378 0.0641 0.218 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 1.40e-01 0.138 0.0932 0.218 B L1
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0455 0.0873 0.218 B L1
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 4.82e-01 0.0503 0.0714 0.218 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 2.07e-01 0.0561 0.0443 0.218 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0882 0.0618 0.218 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000133 0.0611 0.218 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0173 0.0662 0.218 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0348 0.0944 0.218 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00407 0.0579 0.218 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 3.65e-01 0.0645 0.0711 0.218 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0649 0.0862 0.218 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 8.69e-01 -0.00755 0.0458 0.218 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 9.10e-01 0.00836 0.0739 0.218 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00475 0.0492 0.218 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 4.69e-01 0.0536 0.0739 0.218 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 3.46e-01 0.0794 0.084 0.218 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 9.92e-01 0.00062 0.0606 0.218 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 1.17e-01 0.126 0.0801 0.218 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 6.78e-01 0.0418 0.1 0.214 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 1.64e-02 0.2 0.0828 0.214 DC L1
ENSG00000084110 HAL 120888 sc-eQTL 9.82e-02 -0.158 0.0949 0.214 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 8.55e-02 0.181 0.105 0.214 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 2.20e-01 0.0958 0.0779 0.214 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 2.59e-01 0.108 0.0954 0.214 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0842 0.0794 0.214 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 3.77e-01 0.0903 0.102 0.214 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00186 0.0944 0.214 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 91930 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0487 0.0922 0.214 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 7.12e-01 0.0346 0.0935 0.218 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 2.30e-01 0.082 0.0682 0.218 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 120888 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0232 0.0862 0.218 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 3.25e-01 0.0732 0.0743 0.218 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 2.89e-01 0.103 0.0971 0.218 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 6.41e-01 0.0305 0.0653 0.218 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0313 0.0616 0.218 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 4.51e-01 0.0714 0.0945 0.218 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0567 0.0792 0.218 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 91930 sc-eQTL 8.30e-01 0.0198 0.0917 0.218 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 2.97e-01 0.0997 0.0954 0.217 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 9.40e-01 0.00387 0.0511 0.217 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 3.73e-01 0.0674 0.0756 0.217 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 3.59e-02 0.181 0.0859 0.217 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 9.22e-01 0.00809 0.0823 0.217 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 7.09e-01 0.0255 0.0683 0.217 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0325 0.0864 0.217 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 4.94e-01 0.0732 0.107 0.218 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 3.89e-01 0.0375 0.0435 0.218 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 326101 sc-eQTL 2.55e-01 0.0916 0.0803 0.218 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 2.97e-01 0.0867 0.083 0.218 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 8.78e-01 0.014 0.0911 0.218 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 3.99e-01 0.0599 0.0709 0.218 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0116 0.066 0.218 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 1.36e-01 0.15 0.1 0.218 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -372318 sc-eQTL 2.88e-01 0.111 0.104 0.218 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 6.56e-01 0.0513 0.115 0.222 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 6.20e-02 -0.178 0.0945 0.222 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 3.76e-01 -0.106 0.12 0.222 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 1.14e-03 -0.347 0.105 0.222 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0873 0.114 0.222 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0462 0.0878 0.222 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0806 0.108 0.222 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0235 0.113 0.222 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 3.48e-01 0.0764 0.0812 0.222 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0756 0.104 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 5.80e-01 0.0465 0.0841 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0735 0.0964 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 1.83e-01 0.108 0.0811 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 2.19e-01 0.113 0.0916 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 4.20e-01 0.0873 0.108 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 5.93e-01 -0.049 0.0915 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0792 0.107 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0331 0.0968 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 2.82e-01 -0.115 0.106 0.218 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 9.91e-01 0.000909 0.0797 0.218 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00341 0.104 0.218 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0238 0.0919 0.218 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0202 0.0904 0.218 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0525 0.0991 0.218 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 3.71e-01 0.0858 0.0956 0.218 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 1.26e-01 0.162 0.105 0.218 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 1.83e-01 0.131 0.0983 0.218 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0161 0.102 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0011 0.0669 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0126 0.0865 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0475 0.07 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0703 0.0826 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 6.26e-01 0.0507 0.104 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0305 0.0805 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 7.60e-01 0.0316 0.103 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 5.12e-02 -0.192 0.098 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 6.41e-01 0.0513 0.11 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 2.25e-01 -0.102 0.0839 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 1.45e-01 0.148 0.101 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0547 0.0797 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0744 0.0939 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 1.17e-01 0.159 0.101 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0873 0.0932 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 5.71e-01 0.063 0.111 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 8.21e-01 0.0188 0.0832 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 3.45e-01 0.104 0.109 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 1.25e-01 -0.123 0.0796 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 2.56e-01 -0.13 0.114 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 3.05e-01 -0.116 0.113 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0771 0.114 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 5.44e-01 0.0554 0.0912 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 1.21e-01 -0.154 0.0988 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 1.06e-01 0.185 0.114 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 3.85e-01 0.0709 0.0814 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 5.83e-01 0.0269 0.0489 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0519 0.0705 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00832 0.0708 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 4.97e-01 0.0481 0.0708 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0305 0.0993 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0213 0.0629 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 4.18e-01 0.0628 0.0774 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 1.64e-01 0.12 0.0862 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 1.38e-02 0.117 0.047 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 1.82e-01 -0.108 0.0808 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 3.45e-01 0.0764 0.0807 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0453 0.0795 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 7.80e-01 0.0308 0.11 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0999 0.0649 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0127 0.0892 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0588 0.112 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0445 0.0592 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 3.02e-01 -0.102 0.0988 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 7.52e-01 0.029 0.0915 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0388 0.085 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 9.01e-01 -0.013 0.105 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 2.85e-01 0.0951 0.0888 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 9.98e-01 0.000263 0.106 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0647 0.0991 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0304 0.0574 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 9.45e-01 0.00692 0.0993 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0919 0.104 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0495 0.0944 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 2.78e-01 0.114 0.105 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00846 0.0868 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 2.16e-01 0.12 0.097 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 1.82e-01 -0.133 0.0991 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 8.22e-01 0.0153 0.0677 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00224 0.09 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0602 0.0811 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 7.53e-01 0.027 0.0858 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 3.04e-01 0.0928 0.09 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0821 0.077 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 5.95e-02 0.173 0.0911 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 4.25e-01 0.0903 0.113 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0413 0.0768 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 9.65e-02 0.19 0.114 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 1.14e-01 0.178 0.112 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 7.21e-01 0.0342 0.0956 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 4.59e-01 0.0767 0.103 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 4.05e-01 0.0917 0.11 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 5.75e-01 0.0604 0.108 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0491 0.114 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 7.90e-01 0.0252 0.0946 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 4.95e-01 0.0758 0.111 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 8.91e-01 0.0159 0.116 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 9.93e-01 0.00103 0.114 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0273 0.0969 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 2.04e-01 0.134 0.105 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0236 0.115 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 6.61e-01 0.048 0.109 0.219 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 9.20e-02 0.105 0.0622 0.219 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 326101 sc-eQTL 1.46e-01 0.123 0.084 0.219 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 1.96e-01 0.137 0.106 0.219 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 6.83e-01 0.0396 0.0968 0.219 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0148 0.0812 0.219 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 7.53e-01 0.0297 0.0941 0.219 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 1.40e-01 0.156 0.105 0.219 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -372318 sc-eQTL 4.33e-01 0.0822 0.105 0.219 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 3.45e-01 -0.107 0.113 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 5.89e-01 0.0358 0.0661 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 4.59e-03 0.314 0.109 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 7.39e-01 0.0327 0.0978 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 5.13e-01 0.0679 0.104 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 1.03e-01 0.176 0.108 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 7.02e-01 0.042 0.11 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 1.44e-01 0.154 0.105 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0106 0.0543 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0789 0.0951 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 8.47e-02 0.169 0.0975 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0231 0.0869 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 9.41e-01 0.00609 0.0827 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0781 0.0951 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 8.20e-01 0.0275 0.121 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 6.04e-01 0.0464 0.0893 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 1.26e-01 0.172 0.112 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 9.33e-01 0.00983 0.117 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 4.95e-01 0.0743 0.109 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 8.23e-01 0.0254 0.113 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 5.51e-01 0.0639 0.107 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 3.45e-01 0.0935 0.0988 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00503 0.0605 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 8.61e-01 0.0176 0.101 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 8.13e-01 0.0243 0.102 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 8.30e-01 0.0211 0.098 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 8.93e-01 0.0112 0.083 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 9.05e-01 0.0123 0.103 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0776 0.123 0.226 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 8.32e-01 0.0223 0.105 0.226 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 6.96e-02 0.222 0.121 0.226 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 4.87e-01 0.0645 0.0926 0.226 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 8.56e-01 0.0217 0.119 0.226 PB L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0265 0.11 0.226 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 4.30e-01 0.0917 0.116 0.226 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0916 0.138 0.226 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 3.22e-01 0.0973 0.0979 0.226 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 4.68e-01 0.075 0.103 0.217 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00066 0.0668 0.217 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 326101 sc-eQTL 4.76e-01 0.0535 0.0749 0.217 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0655 0.0884 0.217 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0386 0.0881 0.217 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 4.95e-02 0.209 0.106 0.217 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0175 0.0672 0.217 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 3.37e-01 0.0938 0.0975 0.217 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -372318 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0205 0.079 0.217 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 8.39e-01 0.0219 0.108 0.218 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0771 0.0744 0.218 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 4.82e-01 0.0714 0.101 0.218 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 9.90e-02 -0.156 0.0939 0.218 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 1.18e-02 0.214 0.0844 0.218 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0843 0.096 0.218 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0695 0.0991 0.218 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 5.43e-01 0.0674 0.111 0.218 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0482 0.102 0.215 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 6.58e-01 0.0395 0.0891 0.215 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 120888 sc-eQTL 9.01e-02 -0.157 0.0919 0.215 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 1.66e-01 0.155 0.111 0.215 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 1.06e-01 0.128 0.0788 0.215 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0304 0.105 0.215 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 2.94e-01 -0.092 0.0875 0.215 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0264 0.107 0.215 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0717 0.103 0.215 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 91930 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0569 0.09 0.215 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 8.09e-01 -0.025 0.103 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 1.21e-01 0.122 0.0784 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 120888 sc-eQTL 9.27e-01 0.00788 0.086 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 4.03e-01 0.0746 0.089 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 3.21e-01 0.0922 0.0927 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 7.05e-01 0.0271 0.0715 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 5.71e-01 0.0419 0.0738 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 3.34e-01 0.0982 0.101 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0579 0.0832 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 91930 sc-eQTL 3.24e-01 0.0935 0.0946 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 6.85e-01 0.0425 0.104 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 9.58e-01 0.00469 0.089 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 120888 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0194 0.0998 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 2.20e-01 0.124 0.101 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 1.67e-01 0.138 0.0993 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 4.57e-01 0.0604 0.0811 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0373 0.0802 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 5.12e-01 0.0711 0.108 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 9.24e-01 0.00917 0.0966 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 91930 sc-eQTL 4.99e-01 0.069 0.102 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 3.66e-01 -0.134 0.148 0.191 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 2.37e-01 0.116 0.0976 0.191 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 326101 sc-eQTL 3.69e-01 0.101 0.112 0.191 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 4.86e-01 0.0981 0.141 0.191 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 2.54e-01 0.167 0.146 0.191 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 6.46e-01 0.0624 0.136 0.191 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 8.36e-02 -0.226 0.13 0.191 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 7.76e-01 0.0411 0.145 0.191 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -372318 sc-eQTL 9.56e-01 0.00697 0.127 0.191 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 3.16e-01 -0.113 0.113 0.22 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 4.93e-01 0.0689 0.1 0.22 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 120888 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0474 0.101 0.22 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 5.03e-01 -0.077 0.115 0.22 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 2.33e-01 0.124 0.104 0.22 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 6.60e-01 0.0409 0.0927 0.22 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 2.29e-03 -0.299 0.0969 0.22 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 7.55e-01 0.0322 0.103 0.22 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 3.55e-01 0.0925 0.0997 0.22 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 91930 sc-eQTL 1.65e-01 -0.144 0.103 0.22 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 1.68e-02 0.245 0.102 0.222 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 3.83e-01 0.0701 0.0802 0.222 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 120888 sc-eQTL 1.38e-01 0.133 0.0892 0.222 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 2.07e-01 0.137 0.108 0.222 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 9.01e-01 0.0124 0.1 0.222 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 6.50e-01 0.0391 0.0858 0.222 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 9.60e-02 0.146 0.0871 0.222 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 8.98e-01 -0.012 0.0932 0.222 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0595 0.102 0.222 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 91930 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0311 0.106 0.222 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 4.87e-01 0.0818 0.117 0.218 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 1.17e-02 0.263 0.103 0.218 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 120888 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0168 0.0888 0.218 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 4.51e-02 0.239 0.118 0.218 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 8.98e-01 0.0128 0.0994 0.218 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0295 0.122 0.218 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0639 0.106 0.218 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 8.45e-01 0.023 0.117 0.218 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 6.61e-01 0.0453 0.103 0.218 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 91930 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0955 0.1 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 1.44e-01 -0.151 0.103 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0462 0.0693 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 5.94e-01 0.0515 0.0964 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0038 0.0721 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 8.52e-01 0.0154 0.0824 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0292 0.103 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 4.92e-01 0.0549 0.0797 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 8.37e-01 0.0216 0.105 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 4.74e-01 0.0658 0.0918 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00432 0.0967 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0243 0.0596 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 4.27e-01 0.0641 0.0806 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0521 0.0668 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0447 0.0761 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 565777 sc-eQTL 2.54e-01 0.106 0.0929 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0656 0.0766 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 5.32e-01 0.0635 0.101 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 1.89e-01 -0.134 0.102 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 9.40e-01 0.00716 0.0949 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 3.69e-01 0.064 0.0711 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 120888 sc-eQTL 9.39e-01 0.00657 0.0862 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 8.65e-02 0.139 0.0806 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 1.37e-01 0.14 0.0942 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 5.96e-01 0.0363 0.0683 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 8.14e-01 0.0156 0.066 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 4.29e-01 0.0818 0.103 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0609 0.082 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 91930 sc-eQTL 2.28e-01 0.116 0.0955 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 3.53e-01 0.0993 0.107 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 4.66e-01 0.0532 0.0728 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 120888 sc-eQTL 8.86e-01 0.0123 0.0862 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 9.65e-01 0.00429 0.0978 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 4.99e-01 0.0646 0.0955 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 4.91e-01 0.0487 0.0706 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0678 0.0728 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0135 0.0935 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 899771 sc-eQTL 8.02e-01 0.0225 0.0896 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 91930 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0944 0.0988 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 899507 sc-eQTL 1.54e-01 0.141 0.0982 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -283227 sc-eQTL 7.51e-01 0.0165 0.0518 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 643733 sc-eQTL 9.53e-01 0.00466 0.0789 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 73733 sc-eQTL 9.16e-02 0.152 0.0895 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -77122 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00675 0.0825 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 258325 sc-eQTL 6.43e-01 0.0328 0.0705 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -789970 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0748 0.0879 0.216 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000180263 \N 899771 2.95e-07 1.36e-07 6.26e-08 1.9e-07 1.03e-07 8.33e-08 1.81e-07 5.68e-08 1.59e-07 8.53e-08 1.59e-07 1.22e-07 1.87e-07 7.95e-08 5.82e-08 8.08e-08 4.45e-08 1.64e-07 7.09e-08 4.95e-08 1.22e-07 1.42e-07 1.58e-07 2.68e-08 1.68e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.04e-07 1.31e-07 1.03e-07 1.07e-07 2.99e-08 3.51e-08 9.78e-08 3.52e-08 2.68e-08 5.74e-08 8.68e-08 6.67e-08 3.67e-08 5.34e-08 1.46e-07 5.08e-08 1.97e-08 3.83e-08 1.8e-08 9.96e-08 1.9e-09 4.81e-08