logo

Genes within 1Mb (chr12:96097920:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 6.95e-01 0.0488 0.124 0.092 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 1.58e-01 -0.109 0.0769 0.092 B L1
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0748 0.109 0.092 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 2.34e-02 0.216 0.0948 0.092 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 5.29e-01 0.0644 0.102 0.092 B L1
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 3.30e-01 -0.123 0.126 0.092 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0318 0.0928 0.092 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 8.71e-02 -0.231 0.135 0.092 B L1
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0465 0.126 0.092 B L1
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 3.30e-01 -0.101 0.104 0.092 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0635 0.0645 0.092 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 5.54e-01 0.0534 0.0901 0.092 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 1.97e-01 -0.114 0.0884 0.092 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0225 0.0961 0.092 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 1.65e-01 0.19 0.137 0.092 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00487 0.0841 0.092 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0037 0.104 0.092 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 3.02e-01 0.128 0.124 0.092 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0213 0.0657 0.092 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 6.02e-01 0.0554 0.106 0.092 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 1.15e-01 0.111 0.0702 0.092 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0298 0.106 0.092 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 6.13e-01 0.0612 0.121 0.092 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 5.47e-01 0.0525 0.087 0.092 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 8.35e-01 0.0242 0.116 0.092 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0288 0.144 0.095 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 2.13e-02 -0.276 0.119 0.095 DC L1
ENSG00000084110 HAL 101555 sc-eQTL 9.97e-03 0.352 0.135 0.095 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 5.04e-01 -0.101 0.151 0.095 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 3.42e-01 0.107 0.112 0.095 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 1.00e+00 2.03e-07 0.138 0.095 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0513 0.114 0.095 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0836 0.147 0.095 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 1.35e-01 0.202 0.135 0.095 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 72597 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0187 0.133 0.095 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 2.81e-01 -0.146 0.135 0.092 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0691 0.0989 0.092 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 101555 sc-eQTL 2.94e-01 0.131 0.124 0.092 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 2.06e-01 -0.136 0.107 0.092 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 6.02e-02 0.264 0.14 0.092 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0292 0.0946 0.092 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0639 0.0891 0.092 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 6.64e-01 0.0596 0.137 0.092 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 3.98e-01 0.097 0.115 0.092 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 72597 sc-eQTL 4.44e-01 0.102 0.133 0.092 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 8.04e-01 0.0348 0.14 0.09 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 3.71e-01 0.0667 0.0745 0.09 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0327 0.11 0.09 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0942 0.127 0.09 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 1.10e-01 -0.192 0.119 0.09 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 4.52e-01 -0.075 0.0996 0.09 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 3.10e-01 -0.128 0.126 0.09 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0399 0.152 0.092 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 2.46e-01 0.0715 0.0615 0.092 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 306768 sc-eQTL 7.79e-01 -0.032 0.114 0.092 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 3.00e-02 -0.255 0.117 0.092 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00838 0.129 0.092 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0506 0.101 0.092 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0365 0.0935 0.092 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 7.30e-01 0.0492 0.142 0.092 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -391651 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00251 0.148 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 3.39e-01 -0.156 0.163 0.094 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0498 0.135 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 1.61e-01 0.238 0.169 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 7.52e-01 0.0484 0.153 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 8.08e-01 0.0394 0.162 0.094 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 3.06e-01 -0.128 0.124 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 6.92e-01 0.0606 0.153 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 3.53e-01 0.148 0.16 0.094 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 3.41e-01 0.11 0.115 0.094 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0278 0.148 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 6.41e-01 0.0558 0.119 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 6.57e-01 -0.061 0.137 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 9.66e-01 0.00491 0.116 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 9.56e-01 0.00718 0.131 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 2.19e-01 -0.189 0.153 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 9.33e-01 0.0109 0.13 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 7.11e-01 0.0564 0.152 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 3.71e-01 -0.123 0.137 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 1.01e-02 0.397 0.153 0.093 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 5.07e-01 -0.077 0.116 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0127 0.151 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 3.77e-01 0.118 0.134 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 2.87e-01 -0.14 0.131 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0199 0.144 0.093 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 6.41e-01 0.065 0.139 0.093 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0644 0.154 0.093 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00387 0.144 0.093 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 7.58e-01 0.0454 0.147 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 8.63e-02 -0.166 0.0962 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 6.37e-02 -0.232 0.124 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 5.24e-03 0.281 0.0996 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 2.95e-01 0.126 0.12 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 4.25e-01 -0.12 0.151 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0348 0.117 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 9.04e-01 -0.018 0.15 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00753 0.143 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0192 0.157 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 8.60e-01 0.0213 0.12 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 4.25e-01 0.116 0.145 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 3.66e-02 0.238 0.113 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 1.58e-01 0.19 0.134 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0285 0.145 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 2.62e-01 -0.15 0.133 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 3.57e-01 -0.147 0.159 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 8.01e-01 0.0301 0.119 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 1.63e-01 -0.218 0.156 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 3.91e-01 0.0981 0.114 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 6.71e-01 0.0696 0.163 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0283 0.161 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 4.29e-01 -0.129 0.163 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 6.48e-01 0.0596 0.13 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 8.44e-01 0.0279 0.142 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0644 0.164 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 1.46e-01 -0.172 0.118 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0515 0.071 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0219 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0213 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0604 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 2.10e-02 0.331 0.142 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00577 0.0914 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 7.72e-01 0.0326 0.112 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 2.61e-01 0.141 0.125 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 5.18e-01 0.0448 0.0691 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 5.14e-01 0.0768 0.118 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 8.45e-02 -0.202 0.116 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 5.55e-01 0.0682 0.115 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 1.81e-01 -0.213 0.159 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0647 0.0945 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 6.28e-01 0.0626 0.129 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 9.93e-01 0.00135 0.158 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 1.92e-01 -0.109 0.0833 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 6.08e-01 0.0717 0.14 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 4.87e-01 0.0899 0.129 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 2.89e-01 -0.127 0.12 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0382 0.148 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 9.94e-01 0.00101 0.126 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 4.73e-01 0.107 0.149 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 9.00e-01 0.0176 0.141 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 2.38e-01 0.0961 0.0812 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 9.70e-01 0.0053 0.141 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 8.83e-01 0.0217 0.147 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 8.16e-02 0.233 0.133 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 5.13e-01 0.0976 0.149 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 8.81e-01 0.0184 0.123 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 4.00e-01 -0.116 0.138 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 8.10e-01 0.0346 0.144 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0203 0.0981 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 1.97e-01 -0.168 0.13 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 8.38e-02 0.203 0.117 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0657 0.124 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 7.35e-01 0.0442 0.13 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 6.85e-02 0.203 0.111 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 2.61e-01 0.15 0.133 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 3.31e-01 0.148 0.151 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 6.68e-01 0.0443 0.103 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 4.89e-01 -0.107 0.154 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0934 0.151 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0269 0.128 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 5.62e-01 0.0806 0.139 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 8.69e-03 -0.385 0.145 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 3.21e-01 -0.143 0.144 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 1.72e-01 0.222 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 1.20e-01 0.209 0.133 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 9.67e-01 0.00652 0.158 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 1.50e-01 0.236 0.164 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0503 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 2.63e-01 0.154 0.137 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0476 0.15 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 1.51e-01 0.234 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0575 0.156 0.093 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 4.74e-01 0.064 0.0893 0.093 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 306768 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0558 0.12 0.093 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 2.63e-01 -0.17 0.151 0.093 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0388 0.138 0.093 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 9.77e-01 0.00341 0.116 0.093 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 4.64e-01 0.0984 0.134 0.093 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 1.33e-01 0.226 0.15 0.093 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -391651 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0797 0.149 0.093 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 1.57e-01 0.222 0.157 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 5.10e-01 0.0604 0.0916 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 2.88e-01 -0.164 0.154 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 3.17e-01 0.136 0.135 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 1.70e-01 -0.197 0.143 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 1.14e-01 -0.238 0.15 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 5.32e-01 0.095 0.152 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0311 0.157 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 4.09e-01 0.0666 0.0805 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0434 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0958 0.146 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 1.77e-01 -0.174 0.128 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 5.44e-01 0.0745 0.123 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 2.58e-01 -0.16 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 7.15e-01 0.0628 0.172 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 3.52e-01 0.118 0.127 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 2.42e-01 0.187 0.159 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 7.65e-01 0.0498 0.166 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0593 0.154 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 2.19e-01 -0.198 0.16 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 4.74e-01 0.109 0.152 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 7.84e-01 -0.039 0.142 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 4.51e-01 0.0655 0.0867 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0565 0.144 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 1.62e-01 -0.205 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 6.18e-02 -0.262 0.139 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 6.99e-01 -0.046 0.119 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 3.10e-01 -0.149 0.147 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0186 0.217 0.074 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 5.20e-01 -0.119 0.185 0.074 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 2.90e-01 -0.229 0.215 0.074 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 5.94e-02 0.306 0.161 0.074 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 1.81e-02 -0.49 0.204 0.074 PB L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 9.73e-01 0.00667 0.194 0.074 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 4.11e-01 0.168 0.204 0.074 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 3.73e-01 -0.216 0.242 0.074 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 4.98e-01 0.117 0.173 0.074 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 1.38e-01 0.218 0.147 0.093 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 1.67e-01 0.132 0.095 0.093 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 306768 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0804 0.107 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 3.21e-01 -0.126 0.126 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 6.10e-02 0.235 0.125 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 1.10e-02 -0.385 0.15 0.093 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 7.71e-01 0.0281 0.0961 0.093 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 4.66e-01 -0.102 0.139 0.093 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -391651 sc-eQTL 3.76e-01 -0.1 0.113 0.093 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 8.08e-01 0.0368 0.151 0.092 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 6.56e-01 0.0467 0.105 0.092 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0441 0.143 0.092 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 2.77e-02 -0.291 0.131 0.092 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 3.63e-01 0.11 0.12 0.092 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 6.72e-01 0.0573 0.135 0.092 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0391 0.139 0.092 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 3.34e-01 -0.15 0.155 0.092 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 3.16e-01 0.145 0.144 0.1 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 2.75e-01 -0.137 0.125 0.1 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 101555 sc-eQTL 1.63e-02 0.312 0.129 0.1 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 3.63e-01 -0.144 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 2.72e-01 0.123 0.112 0.1 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 2.41e-01 0.173 0.147 0.1 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 6.53e-02 -0.227 0.123 0.1 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 3.92e-01 0.129 0.151 0.1 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 8.50e-01 0.0276 0.146 0.1 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 72597 sc-eQTL 6.48e-01 0.0581 0.127 0.1 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 1.82e-01 -0.199 0.149 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0896 0.114 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 101555 sc-eQTL 3.34e-01 0.12 0.124 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 2.93e-01 -0.136 0.129 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 1.32e-01 0.202 0.134 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 3.04e-01 -0.106 0.103 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 4.49e-02 -0.213 0.106 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 8.14e-01 0.0347 0.147 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 1.70e-01 0.165 0.12 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 72597 sc-eQTL 4.61e-01 -0.101 0.137 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0653 0.152 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0592 0.13 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 101555 sc-eQTL 3.68e-01 0.131 0.145 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0959 0.147 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 7.03e-02 0.262 0.144 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0691 0.118 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0209 0.117 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 4.64e-01 0.116 0.158 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 2.24e-01 0.171 0.14 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 72597 sc-eQTL 3.30e-01 0.145 0.148 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 9.08e-01 0.023 0.199 0.1 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 1.61e-01 -0.184 0.131 0.1 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 306768 sc-eQTL 8.15e-02 -0.262 0.15 0.1 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 9.62e-02 -0.314 0.187 0.1 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 6.37e-01 -0.093 0.197 0.1 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 1.19e-01 0.283 0.181 0.1 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0901 0.176 0.1 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0983 0.194 0.1 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -391651 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0506 0.17 0.1 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0534 0.163 0.091 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 1.63e-01 0.202 0.144 0.091 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 101555 sc-eQTL 3.15e-01 0.148 0.146 0.091 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 2.75e-02 -0.365 0.164 0.091 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 1.31e-01 0.227 0.15 0.091 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 1.33e-01 0.201 0.133 0.091 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 6.21e-01 -0.071 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00413 0.149 0.091 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 8.15e-02 -0.251 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 72597 sc-eQTL 8.21e-01 -0.034 0.15 0.091 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 7.19e-01 0.0535 0.149 0.095 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 1.69e-01 0.159 0.115 0.095 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 101555 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00351 0.129 0.095 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 8.28e-01 0.034 0.156 0.095 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 5.77e-02 0.273 0.143 0.095 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 5.33e-01 0.0773 0.124 0.095 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 7.70e-01 0.037 0.126 0.095 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 9.33e-01 0.0113 0.134 0.095 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 3.88e-01 -0.127 0.147 0.095 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 72597 sc-eQTL 2.34e-01 0.182 0.153 0.095 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0648 0.159 0.11 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 1.76e-02 -0.335 0.139 0.11 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 101555 sc-eQTL 5.29e-01 0.0756 0.12 0.11 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 3.58e-01 0.149 0.162 0.11 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 7.34e-01 0.0457 0.134 0.11 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 6.51e-01 0.0745 0.164 0.11 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 4.65e-01 0.105 0.143 0.11 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 4.45e-01 -0.121 0.158 0.11 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 2.22e-01 0.17 0.139 0.11 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 72597 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0549 0.136 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 1.79e-01 0.202 0.15 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0091 0.101 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0185 0.14 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 3.16e-01 0.105 0.104 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0386 0.119 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 3.51e-01 -0.139 0.149 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 6.54e-01 0.0519 0.116 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 7.39e-01 0.0507 0.152 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 3.72e-01 -0.119 0.133 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 5.95e-01 0.0748 0.14 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 1.22e-01 -0.134 0.0862 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 1.73e-01 -0.16 0.117 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 4.34e-03 0.275 0.0954 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 1.26e-01 0.169 0.11 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 546444 sc-eQTL 5.65e-01 -0.078 0.135 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0461 0.111 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 2.20e-01 -0.181 0.147 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 9.15e-01 0.0159 0.149 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 9.26e-02 -0.231 0.137 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 2.14e-01 -0.128 0.103 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 101555 sc-eQTL 3.22e-01 0.124 0.125 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 3.48e-01 -0.111 0.117 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 7.46e-02 0.244 0.136 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 2.84e-01 -0.106 0.0989 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0731 0.0955 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 4.84e-01 0.105 0.15 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 1.95e-01 0.154 0.119 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 72597 sc-eQTL 6.61e-01 0.061 0.139 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 5.27e-01 0.0992 0.156 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 2.50e-01 0.123 0.107 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 101555 sc-eQTL 6.66e-01 0.0547 0.126 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 1.56e-01 -0.203 0.143 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 6.96e-02 0.254 0.139 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 2.40e-01 0.122 0.103 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 7.89e-01 0.0286 0.107 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 9.65e-01 0.00601 0.137 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 880438 sc-eQTL 2.75e-01 -0.143 0.131 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 72597 sc-eQTL 6.50e-01 0.066 0.145 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 880174 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0471 0.145 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -302560 sc-eQTL 4.20e-01 0.0612 0.0758 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 624400 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0299 0.115 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 54400 sc-eQTL 2.03e-01 -0.168 0.132 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -96455 sc-eQTL 7.77e-02 -0.213 0.12 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 238992 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0325 0.103 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 sc-eQTL 3.79e-01 -0.113 0.129 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -809303 eQTL 0.00034 -0.138 0.0384 0.0 0.0 0.101

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina