logo

Genes within 1Mb (chr12:96093764:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0187 0.0859 0.218 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0404 0.0534 0.218 B L1
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 7.26e-01 0.0265 0.0756 0.218 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0205 0.0664 0.218 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0526 0.0706 0.218 B L1
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 2.81e-01 0.0939 0.0869 0.218 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0506 0.0641 0.218 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 1.82e-01 0.125 0.0933 0.218 B L1
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0596 0.0873 0.218 B L1
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 5.27e-01 0.0454 0.0716 0.218 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 3.22e-01 0.0442 0.0445 0.218 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0854 0.0619 0.218 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00486 0.0612 0.218 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0149 0.0663 0.218 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0306 0.0946 0.218 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00914 0.058 0.218 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 3.85e-01 0.062 0.0713 0.218 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0636 0.0861 0.218 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 8.72e-01 -0.00735 0.0457 0.218 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00452 0.0738 0.218 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 9.99e-01 -7.17e-05 0.0491 0.218 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 4.90e-01 0.051 0.0738 0.218 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 3.99e-01 0.0709 0.0839 0.218 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0122 0.0605 0.218 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 1.62e-01 0.112 0.0801 0.218 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 6.09e-01 0.0514 0.1 0.212 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 1.59e-02 0.201 0.0828 0.212 DC L1
ENSG00000084110 HAL 97399 sc-eQTL 1.08e-01 -0.153 0.0951 0.212 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 7.13e-02 0.19 0.105 0.212 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 2.65e-01 0.0872 0.078 0.212 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 3.17e-01 0.0959 0.0956 0.212 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 2.03e-01 -0.101 0.0794 0.212 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 2.97e-01 0.107 0.102 0.212 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 9.16e-01 -0.01 0.0945 0.212 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 68441 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0388 0.0923 0.212 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 5.45e-01 0.0566 0.0933 0.218 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 2.25e-01 0.0829 0.0681 0.218 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 97399 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00159 0.0861 0.218 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 2.86e-01 0.0794 0.0742 0.218 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 2.11e-01 0.122 0.0969 0.218 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 7.99e-01 0.0167 0.0653 0.218 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0604 0.0614 0.218 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 4.58e-01 0.0702 0.0944 0.218 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0616 0.0791 0.218 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 68441 sc-eQTL 8.81e-01 0.0137 0.0916 0.218 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 2.27e-01 0.116 0.0954 0.217 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00247 0.0512 0.217 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 4.35e-01 0.0592 0.0756 0.217 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 4.54e-02 0.173 0.086 0.217 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 9.78e-01 0.00232 0.0824 0.217 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 7.90e-01 0.0183 0.0683 0.217 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0349 0.0865 0.217 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 3.88e-01 0.0927 0.107 0.218 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 4.30e-01 0.0345 0.0436 0.218 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 302612 sc-eQTL 2.22e-01 0.0985 0.0805 0.218 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 2.94e-01 0.0874 0.0831 0.218 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 9.21e-01 0.00911 0.0913 0.218 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 4.77e-01 0.0507 0.0711 0.218 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00414 0.0662 0.218 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 2.01e-01 0.129 0.1 0.218 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -395807 sc-eQTL 2.50e-01 0.12 0.104 0.218 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 6.11e-01 0.0587 0.115 0.222 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 6.62e-02 -0.175 0.0945 0.222 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0877 0.12 0.222 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 1.68e-03 -0.335 0.105 0.222 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0904 0.114 0.222 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0495 0.0878 0.222 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0571 0.108 0.222 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0356 0.113 0.222 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 4.11e-01 0.067 0.0812 0.222 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0946 0.104 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 6.60e-01 0.037 0.0841 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0833 0.0963 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 1.54e-01 0.116 0.0811 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 4.63e-01 0.0675 0.0918 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 3.70e-01 0.0971 0.108 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0606 0.0914 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0693 0.107 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0454 0.0968 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0926 0.107 0.218 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00188 0.0797 0.218 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00961 0.104 0.218 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0126 0.092 0.218 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0161 0.0905 0.218 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0629 0.0992 0.218 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 3.86e-01 0.0831 0.0957 0.218 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 1.02e-01 0.173 0.105 0.218 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 1.95e-01 0.128 0.0984 0.218 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 9.39e-01 0.00778 0.102 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0132 0.0669 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0201 0.0865 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0278 0.07 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0885 0.0825 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 7.46e-01 0.0338 0.104 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0414 0.0805 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 9.25e-01 0.00972 0.103 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 3.82e-02 -0.204 0.0979 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 6.46e-01 0.0505 0.11 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 1.37e-01 -0.125 0.0837 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 1.74e-01 0.138 0.101 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0524 0.0796 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0833 0.0938 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 1.60e-01 0.143 0.101 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 3.09e-01 -0.095 0.0931 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 6.49e-01 0.0506 0.111 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 7.37e-01 0.028 0.0831 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 3.45e-01 0.104 0.11 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 4.79e-02 -0.159 0.0798 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 1.21e-01 -0.179 0.115 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 2.99e-01 -0.118 0.113 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0324 0.115 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 5.27e-01 0.0582 0.0918 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 9.77e-02 -0.165 0.0994 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 1.52e-01 0.165 0.115 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 4.54e-01 0.0613 0.0816 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 5.42e-01 0.03 0.0491 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0428 0.0707 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0226 0.071 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 4.14e-01 0.058 0.0709 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0132 0.0995 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0253 0.0631 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 5.79e-01 0.0432 0.0776 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 1.43e-01 0.127 0.0863 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 1.99e-02 0.11 0.0471 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 1.33e-01 -0.122 0.0808 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 3.62e-01 0.0738 0.0808 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0506 0.0796 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 8.18e-01 0.0253 0.11 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 1.01e-01 -0.107 0.0649 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0126 0.0892 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0558 0.112 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0635 0.0591 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 2.69e-01 -0.109 0.0988 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 6.27e-01 0.0446 0.0915 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0296 0.085 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0195 0.105 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 2.83e-01 0.0956 0.0888 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00306 0.106 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0794 0.0995 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0455 0.0576 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 9.04e-01 0.0121 0.0997 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0837 0.104 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0447 0.0948 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 2.54e-01 0.12 0.105 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 9.32e-01 0.00741 0.0872 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 2.87e-01 0.104 0.0975 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 1.56e-01 -0.142 0.0994 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 8.95e-01 0.00901 0.068 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0198 0.0904 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0685 0.0814 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 7.01e-01 0.0332 0.0862 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 4.05e-01 0.0754 0.0904 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0976 0.0772 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 9.19e-02 0.155 0.0917 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 3.60e-01 0.104 0.113 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0346 0.077 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 1.12e-01 0.182 0.114 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 1.21e-01 0.175 0.112 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 8.15e-01 0.0225 0.0958 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 5.24e-01 0.0662 0.104 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 3.92e-01 0.0946 0.11 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 5.37e-01 0.0668 0.108 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0757 0.114 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 6.57e-01 0.0421 0.0946 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 8.24e-01 0.0248 0.111 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 7.83e-01 0.032 0.116 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 9.84e-01 0.00231 0.114 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00106 0.097 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 2.70e-01 0.117 0.106 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0449 0.115 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 5.95e-01 0.0582 0.109 0.219 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 1.28e-01 0.0954 0.0623 0.219 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 302612 sc-eQTL 1.22e-01 0.131 0.084 0.219 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 2.30e-01 0.128 0.106 0.219 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 7.19e-01 0.0349 0.0968 0.219 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0371 0.0812 0.219 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 7.72e-01 0.0274 0.0941 0.219 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 1.93e-01 0.137 0.105 0.219 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -395807 sc-eQTL 4.81e-01 0.0739 0.105 0.219 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 3.59e-01 -0.104 0.114 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 7.49e-01 0.0212 0.0663 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 7.99e-03 0.295 0.11 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 8.99e-01 0.0125 0.0981 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 6.16e-01 0.0522 0.104 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 1.15e-01 0.171 0.108 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 6.23e-01 0.054 0.11 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 1.32e-01 0.159 0.105 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 7.40e-01 -0.018 0.0544 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0851 0.0952 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 9.15e-02 0.165 0.0976 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0153 0.087 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 9.99e-01 9.21e-05 0.0828 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0862 0.0952 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 7.87e-01 0.0327 0.121 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 7.08e-01 0.0335 0.0894 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 1.19e-01 0.175 0.112 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 9.84e-01 0.00238 0.117 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 4.66e-01 0.0793 0.109 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 7.69e-01 0.0333 0.113 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 5.89e-01 0.058 0.107 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 2.02e-01 0.126 0.0988 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0143 0.0606 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 7.38e-01 0.0337 0.101 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 7.04e-01 0.039 0.102 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 9.90e-01 0.00117 0.0982 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 8.61e-01 0.0146 0.0831 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 7.93e-01 0.027 0.103 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0666 0.123 0.23 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 8.54e-01 0.0195 0.105 0.23 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 4.90e-02 0.241 0.121 0.23 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 5.28e-01 0.0587 0.0927 0.23 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 7.93e-01 0.0313 0.119 0.23 PB L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0224 0.11 0.23 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 4.59e-01 0.086 0.116 0.23 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0967 0.138 0.23 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 2.93e-01 0.103 0.0979 0.23 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 4.02e-01 0.0868 0.103 0.217 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00864 0.0671 0.217 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 302612 sc-eQTL 4.76e-01 0.0537 0.0752 0.217 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0456 0.0889 0.217 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0379 0.0885 0.217 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 3.95e-02 0.22 0.106 0.217 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00542 0.0675 0.217 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 4.15e-01 0.08 0.098 0.217 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -395807 sc-eQTL 8.70e-01 -0.013 0.0793 0.217 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 8.68e-01 0.018 0.108 0.218 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0922 0.0744 0.218 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 4.73e-01 0.073 0.102 0.218 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 1.45e-01 -0.138 0.0941 0.218 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 1.22e-02 0.214 0.0845 0.218 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0772 0.0961 0.218 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0926 0.0991 0.218 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 4.18e-01 0.0897 0.111 0.218 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 6.60e-01 -0.045 0.102 0.212 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 5.74e-01 0.0503 0.0892 0.212 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 97399 sc-eQTL 9.95e-02 -0.153 0.0921 0.212 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 1.74e-01 0.152 0.111 0.212 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 9.46e-02 0.133 0.0789 0.212 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0375 0.105 0.212 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 1.97e-01 -0.113 0.0875 0.212 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0128 0.107 0.212 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0857 0.103 0.212 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 68441 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0477 0.0902 0.212 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 9.94e-01 0.000795 0.103 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 1.38e-01 0.117 0.0786 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 97399 sc-eQTL 7.58e-01 0.0265 0.0861 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 4.48e-01 0.0678 0.0892 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 2.67e-01 0.103 0.0928 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 7.67e-01 0.0213 0.0717 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 8.13e-01 0.0176 0.0739 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 4.10e-01 0.0839 0.102 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0528 0.0833 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 68441 sc-eQTL 3.99e-01 0.0802 0.0949 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 6.22e-01 0.0516 0.105 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00408 0.089 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 97399 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0121 0.0999 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 1.78e-01 0.136 0.101 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 1.16e-01 0.156 0.0992 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 6.98e-01 0.0316 0.0813 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0774 0.0802 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 7.04e-01 0.0413 0.108 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 9.07e-01 0.0113 0.0967 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 68441 sc-eQTL 5.26e-01 0.0648 0.102 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0733 0.149 0.191 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 3.55e-01 0.0911 0.0983 0.191 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 302612 sc-eQTL 3.04e-01 0.116 0.113 0.191 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 5.28e-01 0.0894 0.141 0.191 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 3.32e-01 0.143 0.147 0.191 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 4.90e-01 0.0943 0.136 0.191 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 1.11e-01 -0.209 0.131 0.191 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 8.37e-01 0.0299 0.145 0.191 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -395807 sc-eQTL 7.06e-01 0.0482 0.127 0.191 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0862 0.113 0.22 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 2.68e-01 0.112 0.1 0.22 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 97399 sc-eQTL 8.60e-01 -0.018 0.102 0.22 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 3.12e-01 -0.117 0.115 0.22 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 1.79e-01 0.14 0.104 0.22 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 5.35e-01 0.0577 0.093 0.22 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 2.08e-03 -0.303 0.0971 0.22 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 5.31e-01 0.0648 0.103 0.22 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 4.23e-01 0.0804 0.1 0.22 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 68441 sc-eQTL 2.03e-01 -0.132 0.104 0.22 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 1.82e-02 0.242 0.102 0.222 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 2.24e-01 0.0977 0.08 0.222 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 97399 sc-eQTL 1.03e-01 0.146 0.089 0.222 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 1.62e-01 0.151 0.108 0.222 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 8.12e-01 0.0238 0.0999 0.222 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 7.78e-01 0.0242 0.0858 0.222 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 1.20e-01 0.136 0.0871 0.222 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 9.22e-01 0.00911 0.093 0.222 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0811 0.102 0.222 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 68441 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0257 0.106 0.222 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 4.87e-01 0.0818 0.117 0.218 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 1.17e-02 0.263 0.103 0.218 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 97399 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0168 0.0888 0.218 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 4.51e-02 0.239 0.118 0.218 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 8.98e-01 0.0128 0.0994 0.218 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0295 0.122 0.218 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0639 0.106 0.218 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 8.45e-01 0.023 0.117 0.218 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 6.61e-01 0.0453 0.103 0.218 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 68441 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0955 0.1 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 1.53e-01 -0.148 0.103 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0502 0.0693 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 6.69e-01 0.0413 0.0964 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 9.07e-01 0.00847 0.0721 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0102 0.0823 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0282 0.103 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 5.28e-01 0.0505 0.0797 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 7.23e-01 0.0372 0.105 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 5.74e-01 0.0516 0.0918 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 8.42e-01 0.0192 0.0967 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0355 0.0595 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 4.93e-01 0.0554 0.0806 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0325 0.0669 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0585 0.076 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 542288 sc-eQTL 3.21e-01 0.0924 0.0929 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0741 0.0765 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 6.60e-01 0.0446 0.101 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 1.58e-01 -0.144 0.102 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 7.62e-01 0.0287 0.0949 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 3.93e-01 0.0609 0.071 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 97399 sc-eQTL 8.30e-01 0.0185 0.0862 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 8.59e-02 0.139 0.0806 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 1.02e-01 0.155 0.094 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 7.92e-01 0.018 0.0684 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0253 0.066 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 5.74e-01 0.0582 0.103 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0595 0.0819 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 68441 sc-eQTL 2.96e-01 0.1 0.0956 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 3.18e-01 0.107 0.107 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 2.35e-01 0.0866 0.0728 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 97399 sc-eQTL 5.97e-01 0.0457 0.0863 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00068 0.098 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 3.98e-01 0.081 0.0956 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 4.38e-01 0.0549 0.0708 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0744 0.0729 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 7.56e-01 0.0292 0.0937 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 876282 sc-eQTL 9.99e-01 -8.38e-05 0.0898 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 68441 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0834 0.099 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 876018 sc-eQTL 1.03e-01 0.161 0.0981 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -306716 sc-eQTL 8.36e-01 0.0107 0.0518 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 620244 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00501 0.0789 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 50244 sc-eQTL 1.03e-01 0.147 0.0896 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -100611 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0103 0.0825 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 234836 sc-eQTL 7.11e-01 0.0262 0.0706 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0757 0.0879 0.216 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111144 LTA4H 50244 eQTL 0.00336 0.0749 0.0255 0.0 0.0 0.195
ENSG00000111145 ELK3 -100611 eQTL 0.00874 0.0567 0.0216 0.00121 0.0 0.195
ENSG00000139350 NEDD1 -813459 eQTL 0.032 0.0644 0.03 0.0 0.0 0.195

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina