logo

Genes within 1Mb (chr12:96087314:G:GA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 6.95e-01 0.0488 0.124 0.092 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 1.58e-01 -0.109 0.0769 0.092 B L1
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0748 0.109 0.092 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 2.34e-02 0.216 0.0948 0.092 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 5.29e-01 0.0644 0.102 0.092 B L1
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 3.30e-01 -0.123 0.126 0.092 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0318 0.0928 0.092 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 8.71e-02 -0.231 0.135 0.092 B L1
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0465 0.126 0.092 B L1
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 3.30e-01 -0.101 0.104 0.092 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0635 0.0645 0.092 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 5.54e-01 0.0534 0.0901 0.092 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 1.97e-01 -0.114 0.0884 0.092 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0225 0.0961 0.092 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 1.65e-01 0.19 0.137 0.092 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00487 0.0841 0.092 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0037 0.104 0.092 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 3.02e-01 0.128 0.124 0.092 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0213 0.0657 0.092 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 6.02e-01 0.0554 0.106 0.092 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 1.15e-01 0.111 0.0702 0.092 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0298 0.106 0.092 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 6.13e-01 0.0612 0.121 0.092 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 5.47e-01 0.0525 0.087 0.092 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 8.35e-01 0.0242 0.116 0.092 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0288 0.144 0.095 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 2.13e-02 -0.276 0.119 0.095 DC L1
ENSG00000084110 HAL 90949 sc-eQTL 9.97e-03 0.352 0.135 0.095 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 5.04e-01 -0.101 0.151 0.095 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 3.42e-01 0.107 0.112 0.095 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 1.00e+00 2.03e-07 0.138 0.095 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0513 0.114 0.095 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0836 0.147 0.095 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 1.35e-01 0.202 0.135 0.095 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 61991 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0187 0.133 0.095 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 2.81e-01 -0.146 0.135 0.092 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0691 0.0989 0.092 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 90949 sc-eQTL 2.94e-01 0.131 0.124 0.092 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 2.06e-01 -0.136 0.107 0.092 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 6.02e-02 0.264 0.14 0.092 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0292 0.0946 0.092 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0639 0.0891 0.092 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 6.64e-01 0.0596 0.137 0.092 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 3.98e-01 0.097 0.115 0.092 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 61991 sc-eQTL 4.44e-01 0.102 0.133 0.092 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 8.04e-01 0.0348 0.14 0.09 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 3.71e-01 0.0667 0.0745 0.09 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0327 0.11 0.09 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0942 0.127 0.09 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 1.10e-01 -0.192 0.119 0.09 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 4.52e-01 -0.075 0.0996 0.09 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 3.10e-01 -0.128 0.126 0.09 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0399 0.152 0.092 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 2.46e-01 0.0715 0.0615 0.092 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 296162 sc-eQTL 7.79e-01 -0.032 0.114 0.092 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 3.00e-02 -0.255 0.117 0.092 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00838 0.129 0.092 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0506 0.101 0.092 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0365 0.0935 0.092 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 7.30e-01 0.0492 0.142 0.092 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -402257 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00251 0.148 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 3.39e-01 -0.156 0.163 0.094 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0498 0.135 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 1.61e-01 0.238 0.169 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 7.52e-01 0.0484 0.153 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 8.08e-01 0.0394 0.162 0.094 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 3.06e-01 -0.128 0.124 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 6.92e-01 0.0606 0.153 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 3.53e-01 0.148 0.16 0.094 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 3.41e-01 0.11 0.115 0.094 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0278 0.148 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 6.41e-01 0.0558 0.119 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 6.57e-01 -0.061 0.137 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 9.66e-01 0.00491 0.116 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 9.56e-01 0.00718 0.131 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 2.19e-01 -0.189 0.153 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 9.33e-01 0.0109 0.13 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 7.11e-01 0.0564 0.152 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 3.71e-01 -0.123 0.137 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 1.01e-02 0.397 0.153 0.093 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 5.07e-01 -0.077 0.116 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0127 0.151 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 3.77e-01 0.118 0.134 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 2.87e-01 -0.14 0.131 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0199 0.144 0.093 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 6.41e-01 0.065 0.139 0.093 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0644 0.154 0.093 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00387 0.144 0.093 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 7.58e-01 0.0454 0.147 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 8.63e-02 -0.166 0.0962 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 6.37e-02 -0.232 0.124 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 5.24e-03 0.281 0.0996 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 2.95e-01 0.126 0.12 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 4.25e-01 -0.12 0.151 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0348 0.117 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 9.04e-01 -0.018 0.15 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00753 0.143 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0192 0.157 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 8.60e-01 0.0213 0.12 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 4.25e-01 0.116 0.145 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 3.66e-02 0.238 0.113 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 1.58e-01 0.19 0.134 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0285 0.145 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 2.62e-01 -0.15 0.133 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 3.57e-01 -0.147 0.159 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 8.01e-01 0.0301 0.119 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 1.63e-01 -0.218 0.156 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 3.91e-01 0.0981 0.114 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 6.71e-01 0.0696 0.163 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0283 0.161 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 4.29e-01 -0.129 0.163 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 6.48e-01 0.0596 0.13 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 8.44e-01 0.0279 0.142 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0644 0.164 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 1.46e-01 -0.172 0.118 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0515 0.071 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0219 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0213 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0604 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 2.10e-02 0.331 0.142 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00577 0.0914 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 7.72e-01 0.0326 0.112 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 2.61e-01 0.141 0.125 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 5.18e-01 0.0448 0.0691 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 5.14e-01 0.0768 0.118 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 8.45e-02 -0.202 0.116 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 5.55e-01 0.0682 0.115 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 1.81e-01 -0.213 0.159 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0647 0.0945 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 6.28e-01 0.0626 0.129 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 9.93e-01 0.00135 0.158 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 1.92e-01 -0.109 0.0833 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 6.08e-01 0.0717 0.14 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 4.87e-01 0.0899 0.129 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 2.89e-01 -0.127 0.12 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0382 0.148 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 9.94e-01 0.00101 0.126 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 4.73e-01 0.107 0.149 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 9.00e-01 0.0176 0.141 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 2.38e-01 0.0961 0.0812 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 9.70e-01 0.0053 0.141 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 8.83e-01 0.0217 0.147 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 8.16e-02 0.233 0.133 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 5.13e-01 0.0976 0.149 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 8.81e-01 0.0184 0.123 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 4.00e-01 -0.116 0.138 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 8.10e-01 0.0346 0.144 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0203 0.0981 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 1.97e-01 -0.168 0.13 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 8.38e-02 0.203 0.117 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0657 0.124 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 7.35e-01 0.0442 0.13 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 6.85e-02 0.203 0.111 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 2.61e-01 0.15 0.133 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 3.31e-01 0.148 0.151 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 6.68e-01 0.0443 0.103 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 4.89e-01 -0.107 0.154 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0934 0.151 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0269 0.128 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 5.62e-01 0.0806 0.139 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 8.69e-03 -0.385 0.145 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 3.21e-01 -0.143 0.144 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 1.72e-01 0.222 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 1.20e-01 0.209 0.133 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 9.67e-01 0.00652 0.158 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 1.50e-01 0.236 0.164 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0503 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 2.63e-01 0.154 0.137 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0476 0.15 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 1.51e-01 0.234 0.162 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0575 0.156 0.093 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 4.74e-01 0.064 0.0893 0.093 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 296162 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0558 0.12 0.093 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 2.63e-01 -0.17 0.151 0.093 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0388 0.138 0.093 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 9.77e-01 0.00341 0.116 0.093 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 4.64e-01 0.0984 0.134 0.093 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 1.33e-01 0.226 0.15 0.093 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -402257 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0797 0.149 0.093 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 1.57e-01 0.222 0.157 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 5.10e-01 0.0604 0.0916 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 2.88e-01 -0.164 0.154 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 3.17e-01 0.136 0.135 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 1.70e-01 -0.197 0.143 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 1.14e-01 -0.238 0.15 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 5.32e-01 0.095 0.152 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0311 0.157 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 4.09e-01 0.0666 0.0805 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0434 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0958 0.146 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 1.77e-01 -0.174 0.128 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 5.44e-01 0.0745 0.123 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 2.58e-01 -0.16 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 7.15e-01 0.0628 0.172 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 3.52e-01 0.118 0.127 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 2.42e-01 0.187 0.159 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 7.65e-01 0.0498 0.166 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0593 0.154 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 2.19e-01 -0.198 0.16 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 4.74e-01 0.109 0.152 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 7.84e-01 -0.039 0.142 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 4.51e-01 0.0655 0.0867 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0565 0.144 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 1.62e-01 -0.205 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 6.18e-02 -0.262 0.139 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 6.99e-01 -0.046 0.119 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 3.10e-01 -0.149 0.147 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0186 0.217 0.074 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 5.20e-01 -0.119 0.185 0.074 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 2.90e-01 -0.229 0.215 0.074 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 5.94e-02 0.306 0.161 0.074 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 1.81e-02 -0.49 0.204 0.074 PB L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 9.73e-01 0.00667 0.194 0.074 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 4.11e-01 0.168 0.204 0.074 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 3.73e-01 -0.216 0.242 0.074 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 4.98e-01 0.117 0.173 0.074 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 1.38e-01 0.218 0.147 0.093 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 1.67e-01 0.132 0.095 0.093 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 296162 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0804 0.107 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 3.21e-01 -0.126 0.126 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 6.10e-02 0.235 0.125 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 1.10e-02 -0.385 0.15 0.093 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 7.71e-01 0.0281 0.0961 0.093 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 4.66e-01 -0.102 0.139 0.093 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -402257 sc-eQTL 3.76e-01 -0.1 0.113 0.093 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 8.08e-01 0.0368 0.151 0.092 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 6.56e-01 0.0467 0.105 0.092 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0441 0.143 0.092 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 2.77e-02 -0.291 0.131 0.092 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 3.63e-01 0.11 0.12 0.092 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 6.72e-01 0.0573 0.135 0.092 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0391 0.139 0.092 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 3.34e-01 -0.15 0.155 0.092 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 3.16e-01 0.145 0.144 0.1 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 2.75e-01 -0.137 0.125 0.1 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 90949 sc-eQTL 1.63e-02 0.312 0.129 0.1 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 3.63e-01 -0.144 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 2.72e-01 0.123 0.112 0.1 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 2.41e-01 0.173 0.147 0.1 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 6.53e-02 -0.227 0.123 0.1 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 3.92e-01 0.129 0.151 0.1 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 8.50e-01 0.0276 0.146 0.1 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 61991 sc-eQTL 6.48e-01 0.0581 0.127 0.1 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 1.82e-01 -0.199 0.149 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0896 0.114 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 90949 sc-eQTL 3.34e-01 0.12 0.124 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 2.93e-01 -0.136 0.129 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 1.32e-01 0.202 0.134 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 3.04e-01 -0.106 0.103 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 4.49e-02 -0.213 0.106 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 8.14e-01 0.0347 0.147 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 1.70e-01 0.165 0.12 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 61991 sc-eQTL 4.61e-01 -0.101 0.137 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0653 0.152 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0592 0.13 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 90949 sc-eQTL 3.68e-01 0.131 0.145 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0959 0.147 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 7.03e-02 0.262 0.144 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0691 0.118 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0209 0.117 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 4.64e-01 0.116 0.158 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 2.24e-01 0.171 0.14 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 61991 sc-eQTL 3.30e-01 0.145 0.148 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 9.08e-01 0.023 0.199 0.1 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 1.61e-01 -0.184 0.131 0.1 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 296162 sc-eQTL 8.15e-02 -0.262 0.15 0.1 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 9.62e-02 -0.314 0.187 0.1 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 6.37e-01 -0.093 0.197 0.1 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 1.19e-01 0.283 0.181 0.1 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0901 0.176 0.1 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0983 0.194 0.1 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -402257 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0506 0.17 0.1 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0534 0.163 0.091 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 1.63e-01 0.202 0.144 0.091 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 90949 sc-eQTL 3.15e-01 0.148 0.146 0.091 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 2.75e-02 -0.365 0.164 0.091 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 1.31e-01 0.227 0.15 0.091 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 1.33e-01 0.201 0.133 0.091 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 6.21e-01 -0.071 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00413 0.149 0.091 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 8.15e-02 -0.251 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 61991 sc-eQTL 8.21e-01 -0.034 0.15 0.091 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 7.19e-01 0.0535 0.149 0.095 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 1.69e-01 0.159 0.115 0.095 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 90949 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00351 0.129 0.095 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 8.28e-01 0.034 0.156 0.095 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 5.77e-02 0.273 0.143 0.095 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 5.33e-01 0.0773 0.124 0.095 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 7.70e-01 0.037 0.126 0.095 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 9.33e-01 0.0113 0.134 0.095 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 3.88e-01 -0.127 0.147 0.095 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 61991 sc-eQTL 2.34e-01 0.182 0.153 0.095 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0648 0.159 0.11 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 1.76e-02 -0.335 0.139 0.11 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 90949 sc-eQTL 5.29e-01 0.0756 0.12 0.11 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 3.58e-01 0.149 0.162 0.11 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 7.34e-01 0.0457 0.134 0.11 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 6.51e-01 0.0745 0.164 0.11 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 4.65e-01 0.105 0.143 0.11 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 4.45e-01 -0.121 0.158 0.11 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 2.22e-01 0.17 0.139 0.11 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 61991 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0549 0.136 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 1.79e-01 0.202 0.15 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0091 0.101 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0185 0.14 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 3.16e-01 0.105 0.104 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0386 0.119 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 3.51e-01 -0.139 0.149 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 6.54e-01 0.0519 0.116 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 7.39e-01 0.0507 0.152 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 3.72e-01 -0.119 0.133 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 5.95e-01 0.0748 0.14 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 1.22e-01 -0.134 0.0862 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 1.73e-01 -0.16 0.117 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 4.34e-03 0.275 0.0954 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 1.26e-01 0.169 0.11 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 535838 sc-eQTL 5.65e-01 -0.078 0.135 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0461 0.111 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 2.20e-01 -0.181 0.147 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 9.15e-01 0.0159 0.149 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 9.26e-02 -0.231 0.137 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 2.14e-01 -0.128 0.103 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 90949 sc-eQTL 3.22e-01 0.124 0.125 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 3.48e-01 -0.111 0.117 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 7.46e-02 0.244 0.136 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 2.84e-01 -0.106 0.0989 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0731 0.0955 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 4.84e-01 0.105 0.15 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 1.95e-01 0.154 0.119 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 61991 sc-eQTL 6.61e-01 0.061 0.139 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 5.27e-01 0.0992 0.156 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 2.50e-01 0.123 0.107 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 90949 sc-eQTL 6.66e-01 0.0547 0.126 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 1.56e-01 -0.203 0.143 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 6.96e-02 0.254 0.139 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 2.40e-01 0.122 0.103 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 7.89e-01 0.0286 0.107 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 9.65e-01 0.00601 0.137 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 869832 sc-eQTL 2.75e-01 -0.143 0.131 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 61991 sc-eQTL 6.50e-01 0.066 0.145 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 869568 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0471 0.145 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -313166 sc-eQTL 4.20e-01 0.0612 0.0758 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 613794 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0299 0.115 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 43794 sc-eQTL 2.03e-01 -0.168 0.132 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -107061 sc-eQTL 7.77e-02 -0.213 0.12 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 228386 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0325 0.103 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 sc-eQTL 3.79e-01 -0.113 0.129 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -819909 eQTL 0.000458 -0.134 0.0382 0.0 0.0 0.103

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina