logo

Genes within 1Mb (chr12:96079327:T:TC):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 3.57e-01 0.114 0.124 0.092 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 6.16e-01 0.0388 0.0773 0.092 B L1
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 1.88e-01 -0.144 0.109 0.092 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 9.42e-03 0.248 0.0945 0.092 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 3.33e-01 0.0989 0.102 0.092 B L1
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 5.77e-02 -0.238 0.125 0.092 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0575 0.0928 0.092 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 4.20e-01 -0.109 0.135 0.092 B L1
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 7.40e-01 0.0419 0.126 0.092 B L1
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 3.72e-01 0.094 0.105 0.092 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 5.75e-01 0.0368 0.0655 0.092 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 8.88e-01 0.0128 0.0914 0.092 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0751 0.0898 0.092 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 1.47e-01 0.141 0.097 0.092 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 5.59e-01 0.0813 0.139 0.092 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 7.06e-01 0.0321 0.0852 0.092 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 5.94e-01 0.056 0.105 0.092 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 8.40e-01 0.0251 0.125 0.092 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 7.08e-01 0.0248 0.0661 0.092 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 8.37e-01 0.022 0.107 0.092 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 1.05e-01 0.115 0.0706 0.092 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0801 0.107 0.092 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 7.89e-01 0.0325 0.122 0.092 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 5.09e-01 0.0579 0.0875 0.092 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 3.95e-01 -0.099 0.116 0.092 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 1.53e-01 -0.206 0.143 0.097 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 3.34e-01 -0.116 0.12 0.097 DC L1
ENSG00000084110 HAL 82962 sc-eQTL 2.02e-01 0.175 0.137 0.097 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0116 0.151 0.097 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 1.87e-01 0.148 0.112 0.097 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 8.04e-01 0.0341 0.137 0.097 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00826 0.114 0.097 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 9.36e-01 0.0117 0.147 0.097 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 4.01e-01 0.114 0.135 0.097 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 54004 sc-eQTL 6.68e-01 0.0569 0.132 0.097 DC L1
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 4.02e-01 -0.114 0.135 0.092 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 1.77e-01 -0.134 0.0988 0.092 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 82962 sc-eQTL 4.83e-01 0.0877 0.125 0.092 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 2.23e-01 -0.131 0.108 0.092 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 2.73e-02 0.31 0.139 0.092 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 2.19e-01 -0.116 0.0944 0.092 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0197 0.0893 0.092 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 5.49e-01 0.0822 0.137 0.092 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0217 0.115 0.092 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 54004 sc-eQTL 2.09e-02 0.306 0.131 0.092 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0121 0.138 0.092 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 1.47e-01 0.107 0.0736 0.092 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0143 0.11 0.092 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0205 0.126 0.092 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 8.31e-01 0.0254 0.119 0.092 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 8.08e-01 -0.024 0.0988 0.092 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 4.49e-02 -0.25 0.124 0.092 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 9.71e-02 -0.25 0.15 0.092 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 5.02e-01 0.0414 0.0615 0.092 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 288175 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0997 0.114 0.092 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 1.32e-01 -0.177 0.117 0.092 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 9.63e-02 -0.214 0.128 0.092 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 9.63e-01 0.00464 0.1 0.092 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0565 0.0933 0.092 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 6.53e-01 -0.064 0.142 0.092 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -410244 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0688 0.147 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0335 0.164 0.097 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 8.23e-01 0.0305 0.136 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 4.06e-01 0.142 0.171 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 8.79e-01 0.0234 0.154 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 1.08e-02 0.412 0.16 0.097 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0123 0.125 0.097 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 9.93e-01 -0.0014 0.154 0.097 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 2.57e-01 0.182 0.16 0.097 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 7.72e-01 0.0336 0.116 0.097 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 3.80e-01 -0.13 0.148 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 3.49e-01 0.112 0.119 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0784 0.137 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 6.41e-01 0.0538 0.115 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 5.09e-01 0.086 0.13 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 7.15e-02 -0.276 0.152 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 6.99e-01 0.0501 0.13 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 5.76e-01 0.0849 0.152 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 5.25e-02 -0.265 0.136 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 8.15e-03 0.406 0.152 0.093 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 3.71e-01 0.103 0.115 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0434 0.15 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 3.66e-01 0.12 0.133 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 9.11e-01 0.0146 0.131 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0334 0.143 0.093 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00425 0.139 0.093 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000187 0.153 0.093 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 1.39e-01 0.211 0.142 0.093 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 7.23e-01 0.0521 0.147 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 2.72e-01 -0.106 0.0965 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 7.81e-03 -0.331 0.123 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 4.79e-03 0.284 0.0994 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 7.47e-01 0.0386 0.12 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 1.44e-01 -0.22 0.15 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00263 0.117 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0588 0.149 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 4.72e-01 0.103 0.143 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 1.47e-01 0.227 0.156 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 4.78e-01 0.0852 0.12 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 9.46e-02 0.242 0.144 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 6.73e-02 0.208 0.113 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 4.38e-01 0.104 0.134 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 4.72e-01 -0.104 0.145 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 2.08e-01 -0.168 0.133 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 5.96e-01 0.0839 0.158 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0472 0.119 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0452 0.154 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 7.19e-01 0.0405 0.112 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 5.63e-01 -0.093 0.161 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 1.00e+00 -6.35e-05 0.158 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 2.03e-01 0.204 0.16 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 1.72e-01 0.174 0.127 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 7.21e-01 0.0498 0.139 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 2.87e-01 -0.172 0.161 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 8.84e-01 0.0174 0.119 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 1.86e-01 0.0946 0.0713 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0593 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 7.11e-01 0.0384 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 5.83e-01 0.0569 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 1.22e-01 0.224 0.144 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 5.03e-01 0.0616 0.0919 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 9.84e-01 0.00223 0.113 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 1.15e-01 0.201 0.127 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 6.80e-01 0.029 0.0701 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 4.55e-01 0.0893 0.119 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 2.35e-01 -0.141 0.119 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 5.38e-02 0.225 0.116 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 4.74e-02 -0.32 0.16 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0665 0.0959 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 1.28e-01 0.2 0.13 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 1.99e-01 0.205 0.159 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0174 0.0846 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 7.94e-01 0.0369 0.141 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 8.76e-02 0.223 0.13 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00599 0.121 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 2.90e-01 -0.158 0.149 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0225 0.127 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 7.66e-01 0.0449 0.151 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 4.99e-01 -0.095 0.14 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 4.37e-01 0.0632 0.0812 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 2.61e-01 -0.158 0.14 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 9.69e-01 0.00564 0.147 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 3.47e-02 0.281 0.132 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0478 0.149 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0978 0.123 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0042 0.138 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 7.88e-01 0.0388 0.144 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 5.70e-01 0.0559 0.0982 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0199 0.131 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 4.81e-01 0.083 0.118 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0432 0.124 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 2.57e-01 0.148 0.13 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 2.56e-01 0.127 0.112 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 8.48e-01 0.0255 0.133 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 7.62e-01 0.0471 0.155 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 9.80e-03 0.27 0.104 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0395 0.157 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 1.63e-01 -0.216 0.154 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 2.19e-01 -0.161 0.131 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0717 0.142 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 2.92e-02 -0.328 0.149 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 1.60e-01 -0.208 0.147 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 9.95e-02 0.263 0.159 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 1.27e-01 0.202 0.132 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0263 0.155 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 1.19e-01 0.252 0.161 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0995 0.159 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 7.28e-01 0.0473 0.136 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 1.36e-01 0.22 0.147 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 4.19e-01 0.13 0.16 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 2.48e-01 -0.18 0.155 0.093 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 8.93e-01 0.012 0.0892 0.093 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 288175 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0593 0.12 0.093 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 1.76e-01 -0.205 0.151 0.093 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 2.14e-01 -0.171 0.137 0.093 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 6.65e-01 0.0501 0.116 0.093 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 5.85e-01 0.0732 0.134 0.093 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0731 0.15 0.093 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -410244 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0597 0.149 0.093 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 1.46e-01 0.228 0.156 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 6.55e-01 0.041 0.0915 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 3.49e-01 -0.145 0.154 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 7.59e-01 0.0416 0.135 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 5.69e-01 0.0819 0.144 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 2.54e-01 -0.172 0.15 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 9.57e-01 0.00828 0.152 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 2.91e-01 -0.162 0.153 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 1.20e-01 0.123 0.0784 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 2.92e-01 0.146 0.138 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 5.99e-01 -0.075 0.142 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 3.40e-01 -0.12 0.126 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 1.62e-01 0.168 0.12 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 1.32e-02 -0.341 0.136 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 5.08e-01 -0.112 0.169 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 4.21e-01 0.101 0.125 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 4.91e-01 0.108 0.157 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 6.72e-01 0.0693 0.164 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0165 0.152 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 7.50e-02 -0.281 0.157 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 7.30e-01 0.0518 0.15 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 9.61e-01 0.00691 0.141 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 1.48e-01 0.125 0.0858 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 6.78e-02 -0.261 0.142 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 9.75e-01 0.00456 0.146 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 6.21e-01 -0.069 0.139 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00595 0.118 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 1.13e-01 -0.231 0.145 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 5.74e-01 -0.126 0.223 0.063 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 2.36e-01 -0.226 0.189 0.063 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 9.68e-01 0.00895 0.223 0.063 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 5.91e-02 0.315 0.165 0.063 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 2.51e-01 -0.247 0.214 0.063 PB L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 5.26e-01 0.126 0.199 0.063 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 4.43e-01 -0.161 0.209 0.063 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 1.76e-01 0.337 0.248 0.063 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 5.89e-01 0.0964 0.178 0.063 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0245 0.146 0.093 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 1.79e-01 0.127 0.0943 0.093 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 288175 sc-eQTL 7.86e-01 -0.029 0.106 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0885 0.125 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 2.70e-01 0.138 0.125 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 1.97e-01 -0.195 0.151 0.093 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0518 0.0954 0.093 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0853 0.138 0.093 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -410244 sc-eQTL 3.69e-01 -0.101 0.112 0.093 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 5.77e-01 0.0862 0.154 0.092 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 8.27e-02 0.185 0.106 0.092 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 1.71e-01 -0.199 0.145 0.092 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 4.01e-02 -0.277 0.134 0.092 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 3.75e-01 0.109 0.123 0.092 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 2.79e-01 0.149 0.138 0.092 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 9.95e-01 0.000865 0.142 0.092 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 6.09e-01 0.0813 0.159 0.092 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 4.35e-01 -0.111 0.142 0.105 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 9.39e-01 0.00953 0.124 0.105 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 82962 sc-eQTL 2.43e-02 0.289 0.127 0.105 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0889 0.156 0.105 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 1.03e-01 0.18 0.11 0.105 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 4.86e-01 0.102 0.146 0.105 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 4.52e-02 -0.244 0.121 0.105 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 6.64e-01 0.0647 0.149 0.105 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 7.55e-01 0.0449 0.144 0.105 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 54004 sc-eQTL 1.03e-01 0.204 0.125 0.105 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 3.40e-01 -0.144 0.151 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 1.06e-01 -0.186 0.115 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 82962 sc-eQTL 4.12e-01 0.103 0.126 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0457 0.131 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 5.34e-02 0.262 0.135 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0489 0.105 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 1.54e-01 -0.154 0.108 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 4.02e-01 0.125 0.149 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 3.50e-01 0.114 0.122 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 54004 sc-eQTL 2.94e-01 0.146 0.139 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 7.43e-01 0.05 0.152 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 1.20e-01 -0.201 0.129 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 82962 sc-eQTL 4.16e-01 0.119 0.145 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 6.87e-01 0.0595 0.147 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 1.35e-02 0.357 0.143 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0973 0.118 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 6.92e-01 0.0465 0.117 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 5.63e-01 0.0915 0.158 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 8.45e-01 0.0277 0.141 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 54004 sc-eQTL 8.67e-02 0.254 0.148 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00317 0.184 0.109 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 3.32e-01 -0.118 0.122 0.109 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 288175 sc-eQTL 2.92e-03 -0.411 0.136 0.109 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 3.44e-01 -0.166 0.175 0.109 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 3.77e-01 -0.161 0.182 0.109 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 4.99e-01 0.114 0.169 0.109 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 9.63e-01 0.00761 0.163 0.109 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0165 0.18 0.109 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -410244 sc-eQTL 4.98e-01 0.107 0.157 0.109 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 4.15e-01 0.133 0.162 0.096 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 6.91e-01 0.0575 0.145 0.096 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 82962 sc-eQTL 5.92e-01 0.0785 0.146 0.096 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 7.21e-02 -0.297 0.164 0.096 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 1.18e-01 0.234 0.149 0.096 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 8.07e-01 0.0327 0.134 0.096 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 2.19e-01 -0.175 0.142 0.096 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0432 0.148 0.096 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 2.02e-01 -0.184 0.143 0.096 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 54004 sc-eQTL 4.59e-01 0.111 0.149 0.096 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0115 0.148 0.097 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 7.03e-01 0.044 0.115 0.097 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 82962 sc-eQTL 4.22e-01 0.103 0.128 0.097 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 3.03e-01 -0.16 0.155 0.097 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 6.41e-02 0.265 0.142 0.097 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0738 0.123 0.097 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 4.02e-01 0.105 0.126 0.097 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 3.98e-01 -0.113 0.133 0.097 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0763 0.146 0.097 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 54004 sc-eQTL 1.81e-02 0.358 0.15 0.097 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 4.08e-01 -0.13 0.157 0.116 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 1.21e-01 -0.218 0.14 0.116 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 82962 sc-eQTL 5.36e-01 0.0738 0.119 0.116 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 3.94e-01 0.137 0.161 0.116 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 9.07e-01 0.0155 0.133 0.116 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 6.58e-01 0.0724 0.163 0.116 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 1.80e-01 0.191 0.142 0.116 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 7.50e-01 0.0501 0.157 0.116 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 5.79e-01 0.0769 0.138 0.116 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 54004 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0178 0.135 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 2.76e-01 0.164 0.15 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 2.95e-01 0.106 0.101 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0385 0.14 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 1.34e-01 0.157 0.104 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 2.22e-01 0.146 0.119 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 2.81e-01 -0.161 0.149 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 7.38e-01 0.0389 0.116 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 6.27e-01 0.0741 0.152 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0172 0.134 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 1.93e-01 0.183 0.14 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0509 0.0869 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 1.60e-01 -0.165 0.117 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 1.71e-03 0.303 0.0953 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 6.91e-01 0.0442 0.111 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 527851 sc-eQTL 1.43e-01 -0.199 0.135 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0483 0.112 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 6.22e-01 -0.073 0.148 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 8.64e-01 0.0256 0.149 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 2.13e-01 -0.172 0.138 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 4.24e-02 -0.21 0.103 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 82962 sc-eQTL 4.17e-01 0.102 0.125 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0256 0.118 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 2.55e-02 0.306 0.136 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 2.74e-01 -0.109 0.0993 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0334 0.096 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 2.61e-01 0.169 0.15 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 5.43e-01 0.0727 0.119 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 54004 sc-eQTL 5.82e-02 0.264 0.138 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 4.24e-01 0.125 0.156 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 6.88e-01 0.0428 0.107 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 82962 sc-eQTL 3.09e-01 0.128 0.126 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 2.99e-02 -0.309 0.141 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 8.07e-02 0.243 0.139 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0349 0.103 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 9.67e-01 0.00437 0.107 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 3.94e-01 -0.116 0.136 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 861845 sc-eQTL 3.43e-01 -0.124 0.131 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 54004 sc-eQTL 3.16e-02 0.31 0.143 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 861581 sc-eQTL 4.73e-01 -0.103 0.143 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -321153 sc-eQTL 1.31e-01 0.113 0.0747 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 605807 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00159 0.114 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 35807 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0407 0.131 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -115048 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0634 0.119 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 220399 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00522 0.102 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 sc-eQTL 5.00e-02 -0.249 0.126 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 eQTL 0.0109 -0.0951 0.0373 0.0 0.0 0.104
ENSG00000258177 AC008149.1 -144646 eQTL 0.0436 -0.121 0.0597 0.0 0.0 0.104

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -827896 1.55e-06 1.55e-06 6.72e-08 4.4e-07 9.01e-08 5.15e-07 6.23e-07 5.68e-08 6.03e-07 9.35e-08 1.89e-06 6.07e-07 1.98e-06 3.9e-07 2.57e-07 2.89e-07 6.63e-08 4.4e-07 5.39e-08 4.2e-08 1.8e-07 1.17e-06 3.04e-07 2.83e-08 1.28e-06 1.31e-07 1.23e-07 1.06e-07 3.83e-07 1.39e-07 6.96e-07 3.19e-08 2.74e-08 1.19e-07 3.29e-07 4.02e-08 5.54e-08 9.06e-08 6.78e-08 3.05e-08 3.58e-08 3.89e-06 5.21e-08 0.0 5.15e-08 1.87e-08 1.26e-07 4.82e-09 4.72e-08