logo

Genes within 1Mb (chr12:95773386:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 4.38e-01 -0.129 0.166 0.053 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 8.52e-01 0.0193 0.103 0.053 B L1
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 4.26e-01 -0.116 0.146 0.053 B L1
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0135 0.128 0.053 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 2.98e-01 0.142 0.136 0.053 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 2.42e-01 -0.216 0.184 0.053 B L1
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0447 0.168 0.053 B L1
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0467 0.124 0.053 B L1
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 1.93e-01 0.219 0.168 0.053 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0582 0.0804 0.053 B L1
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 5.40e-01 0.0858 0.14 0.053 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 5.53e-01 0.0516 0.0869 0.053 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 9.82e-01 0.00267 0.121 0.053 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 7.65e-01 0.0358 0.119 0.053 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 9.48e-01 0.00842 0.129 0.053 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 6.90e-01 -0.054 0.135 0.053 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 6.01e-01 0.0966 0.184 0.053 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 7.51e-01 0.0359 0.113 0.053 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 8.08e-01 0.0317 0.13 0.053 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0836 0.166 0.053 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 8.31e-01 0.0188 0.0883 0.053 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 1.28e-01 0.216 0.142 0.053 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 2.89e-01 -0.1 0.0945 0.053 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 1.18e-01 0.223 0.142 0.053 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 7.53e-02 -0.322 0.18 0.053 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 4.88e-01 -0.112 0.162 0.053 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 7.01e-01 0.0449 0.117 0.053 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0517 0.118 0.053 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 6.31e-01 0.0869 0.181 0.053 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 7.54e-01 0.0416 0.132 0.053 Mono L1
ENSG00000084110 HAL -222979 sc-eQTL 4.33e-01 -0.131 0.166 0.053 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 1.12e-01 0.228 0.143 0.053 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 9.37e-01 0.0148 0.188 0.053 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 4.73e-01 0.0907 0.126 0.053 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0503 0.172 0.053 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 3.91e-01 0.102 0.119 0.053 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 8.61e-01 0.027 0.153 0.053 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0385 0.11 0.053 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 -251937 sc-eQTL 2.05e-01 0.224 0.177 0.053 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 9.05e-01 0.0224 0.186 0.054 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 6.67e-01 0.0429 0.0996 0.054 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 7.35e-02 0.263 0.146 0.054 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 2.92e-01 -0.178 0.169 0.054 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 4.27e-01 0.128 0.16 0.054 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 1.55e-01 0.248 0.174 0.054 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 9.61e-02 0.221 0.132 0.054 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00226 0.121 0.054 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0113 0.204 0.053 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 6.77e-02 0.151 0.0824 0.053 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -17766 sc-eQTL 6.75e-01 0.0645 0.153 0.053 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 1.70e-01 0.217 0.158 0.053 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 2.49e-01 -0.2 0.173 0.053 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 7.10e-01 0.0503 0.135 0.053 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 8.33e-01 0.0418 0.198 0.053 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 5.51e-01 0.0751 0.126 0.053 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 7.27e-01 0.0352 0.101 0.053 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -716185 sc-eQTL 3.18e-01 0.198 0.198 0.053 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0771 0.225 0.056 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 3.61e-01 -0.171 0.186 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 3.96e-01 -0.199 0.235 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 5.34e-01 0.132 0.211 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0804 0.224 0.056 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 4.96e-01 -0.153 0.225 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 3.16e-01 0.172 0.171 0.056 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 4.27e-01 0.168 0.211 0.056 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 1.78e-01 0.214 0.158 0.056 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 3.28e-02 -0.423 0.197 0.056 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0826 0.198 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 5.78e-01 0.0885 0.159 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 3.10e-01 0.185 0.182 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0405 0.154 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 4.40e-01 0.134 0.174 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 8.41e-02 -0.345 0.199 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 3.72e-01 -0.183 0.204 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0194 0.173 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 8.71e-01 0.0298 0.183 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 1.99e-01 -0.195 0.151 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0321 0.211 0.054 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 3.93e-01 0.135 0.157 0.054 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 1.62e-01 -0.286 0.204 0.054 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 5.25e-01 0.116 0.182 0.054 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00333 0.179 0.054 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0517 0.22 0.054 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 1.01e-01 0.321 0.195 0.054 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 2.27e-03 -0.573 0.185 0.054 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 6.71e-01 0.0831 0.195 0.054 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0943 0.157 0.054 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 3.43e-01 -0.188 0.198 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 4.35e-01 -0.102 0.13 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0633 0.169 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 7.82e-01 0.0378 0.137 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 4.38e-01 0.125 0.161 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 5.54e-02 -0.393 0.204 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0377 0.203 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 2.62e-01 0.176 0.157 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0143 0.193 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 8.12e-01 0.0268 0.112 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 8.53e-01 0.0393 0.212 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 8.86e-01 0.0234 0.163 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 1.97e-01 -0.253 0.196 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 7.85e-01 -0.042 0.154 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 2.87e-01 0.193 0.181 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 2.24e-01 0.261 0.214 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0969 0.196 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 4.66e-01 -0.132 0.18 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 3.47e-01 0.151 0.16 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 2.82e-01 -0.17 0.158 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 3.83e-01 -0.138 0.158 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 8.89e-01 0.0133 0.0949 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0344 0.137 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0208 0.137 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 9.91e-01 0.00162 0.137 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0431 0.167 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 9.75e-01 0.00614 0.192 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0409 0.122 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 4.35e-01 0.0951 0.122 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 8.69e-02 0.292 0.17 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 2.09e-01 0.118 0.0938 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 2.11e-01 0.2 0.16 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 5.06e-01 0.106 0.16 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 1.00e+00 -5.43e-05 0.157 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 2.68e-01 0.207 0.186 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 1.64e-01 -0.302 0.216 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 5.85e-01 0.0705 0.129 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 1.17e-01 -0.229 0.146 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 8.16e-01 0.0499 0.214 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 9.74e-01 0.00371 0.113 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 4.92e-01 -0.13 0.189 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 9.78e-01 0.00478 0.175 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 1.78e-01 0.219 0.162 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0343 0.199 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 8.44e-01 0.0394 0.2 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 5.63e-01 0.0985 0.17 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 6.30e-01 0.0837 0.173 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 6.94e-01 -0.078 0.198 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0226 0.115 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 4.54e-02 0.395 0.196 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 5.04e-01 0.139 0.207 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0183 0.189 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 6.82e-01 0.0901 0.219 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 3.57e-01 -0.194 0.21 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 3.11e-01 0.176 0.173 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0439 0.155 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 1.81e-01 -0.258 0.192 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 2.62e-01 0.147 0.131 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 4.54e-01 0.131 0.174 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0543 0.157 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 4.49e-02 0.333 0.165 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 1.12e-02 -0.488 0.191 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 7.88e-01 0.047 0.175 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 7.82e-01 0.0414 0.15 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0192 0.141 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 5.61e-01 0.127 0.217 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 4.70e-02 -0.356 0.178 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0224 0.211 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0391 0.22 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 5.24e-01 0.138 0.216 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 5.90e-01 -0.12 0.222 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 5.30e-01 0.116 0.184 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0401 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 9.85e-01 0.00348 0.185 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 7.32e-01 -0.073 0.212 0.052 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 2.57e-01 0.138 0.121 0.052 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -17766 sc-eQTL 8.18e-01 0.0378 0.164 0.052 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 1.89e-01 0.271 0.206 0.052 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0438 0.188 0.052 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 7.74e-01 0.0453 0.158 0.052 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0866 0.2 0.052 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 4.09e-01 0.151 0.183 0.052 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 6.10e-01 0.0901 0.176 0.052 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -716185 sc-eQTL 6.23e-01 0.1 0.203 0.052 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 7.93e-01 0.058 0.22 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 2.96e-01 -0.134 0.128 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 7.96e-01 0.056 0.217 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0293 0.19 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 7.76e-01 0.0576 0.202 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0668 0.228 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 5.96e-01 0.112 0.211 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 6.99e-01 0.0701 0.181 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 9.11e-01 0.0233 0.209 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0308 0.107 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 6.12e-01 0.0956 0.188 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0121 0.194 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 3.61e-02 0.359 0.17 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 2.63e-01 0.215 0.191 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 3.88e-02 0.337 0.162 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 8.11e-01 0.0325 0.136 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 4.35e-01 0.179 0.229 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 1.78e-01 0.229 0.169 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 6.07e-01 0.11 0.214 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0298 0.223 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0282 0.207 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00774 0.226 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 2.65e-02 0.475 0.213 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 3.30e-01 -0.186 0.19 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 2.49e-01 -0.224 0.194 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0138 0.119 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 6.24e-03 0.536 0.194 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 8.16e-02 -0.349 0.2 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0253 0.192 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 7.16e-01 0.0744 0.204 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 1.90e-02 0.38 0.161 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 4.66e-01 0.103 0.141 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 3.11e-01 0.223 0.219 0.07 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 9.35e-01 0.0153 0.188 0.07 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 5.05e-01 -0.146 0.219 0.07 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 3.85e-01 -0.144 0.165 0.07 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 3.84e-01 0.185 0.212 0.07 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 4.78e-01 -0.148 0.208 0.07 PB L2
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 9.22e-02 0.33 0.194 0.07 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 2.11e-01 0.259 0.206 0.07 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00439 0.176 0.07 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 2.22e-01 0.151 0.123 0.07 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 6.44e-01 0.0942 0.204 0.052 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 9.28e-01 0.012 0.132 0.052 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -17766 sc-eQTL 3.44e-02 0.312 0.147 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0239 0.175 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 5.39e-01 -0.107 0.174 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 9.65e-01 0.00932 0.211 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 6.04e-01 -0.109 0.211 0.052 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 3.33e-01 0.129 0.133 0.052 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 8.78e-01 0.0196 0.128 0.052 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -716185 sc-eQTL 4.15e-01 0.127 0.156 0.052 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 1.73e-02 0.489 0.204 0.053 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 3.80e-01 -0.126 0.143 0.053 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 6.11e-01 0.0992 0.195 0.053 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 5.42e-01 0.111 0.181 0.053 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 3.85e-01 0.143 0.164 0.053 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 5.35e-01 0.128 0.206 0.053 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 3.62e-01 0.169 0.184 0.053 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 1.24e-01 0.292 0.189 0.053 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 5.86e-01 0.0851 0.156 0.053 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 7.89e-01 0.0534 0.199 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0118 0.152 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL -222979 sc-eQTL 1.84e-01 -0.22 0.165 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 8.25e-02 0.298 0.171 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 6.22e-01 0.0883 0.179 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 3.97e-01 0.117 0.138 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 9.71e-01 0.00661 0.181 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 6.10e-01 0.0727 0.142 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 2.94e-01 -0.169 0.16 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0146 0.114 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 -251937 sc-eQTL 2.18e-01 0.225 0.182 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0735 0.203 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 5.89e-01 0.0936 0.173 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL -222979 sc-eQTL 4.68e-01 0.141 0.194 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 7.63e-01 0.0594 0.196 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0954 0.194 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0027 0.158 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 7.24e-01 0.0685 0.194 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0274 0.156 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 1.89e-01 0.247 0.187 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 6.15e-01 0.0673 0.134 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 -251937 sc-eQTL 4.56e-01 0.148 0.198 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 5.95e-01 -0.119 0.223 0.051 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 4.90e-01 -0.137 0.198 0.051 intMono L2
ENSG00000084110 HAL -222979 sc-eQTL 6.04e-01 0.104 0.2 0.051 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0141 0.227 0.051 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 2.02e-01 0.262 0.205 0.051 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0885 0.183 0.051 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 9.10e-02 -0.357 0.21 0.051 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 4.18e-01 0.159 0.195 0.051 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0259 0.197 0.051 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 3.25e-01 0.139 0.141 0.051 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 -251937 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0502 0.205 0.051 intMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 4.55e-01 -0.149 0.2 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 5.77e-01 0.0747 0.134 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0726 0.186 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 6.69e-01 0.0595 0.139 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 5.15e-01 0.103 0.159 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 8.09e-02 -0.372 0.212 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 4.87e-01 0.138 0.198 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 2.87e-01 -0.164 0.154 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 6.66e-01 0.0766 0.177 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 2.81e-01 -0.132 0.122 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 5.21e-01 -0.121 0.189 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 2.95e-01 -0.122 0.116 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 5.25e-01 -0.1 0.158 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 8.07e-01 -0.032 0.131 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 3.19e-01 0.148 0.149 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 2.66e-01 -0.228 0.205 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 221910 sc-eQTL 3.66e-01 -0.165 0.182 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 4.30e-01 0.119 0.15 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 5.15e-01 0.131 0.2 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0318 0.111 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0107 0.184 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 6.27e-01 0.067 0.138 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL -222979 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0849 0.167 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 1.79e-01 0.211 0.157 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 9.32e-01 0.0156 0.183 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 5.70e-01 0.0752 0.132 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 7.86e-01 0.0465 0.171 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 8.00e-01 0.0324 0.128 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 8.40e-01 0.0322 0.159 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0306 0.109 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 -251937 sc-eQTL 2.17e-01 0.229 0.185 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 9.82e-01 0.00469 0.211 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 2.03e-01 -0.183 0.144 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL -222979 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0399 0.17 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 5.36e-01 0.12 0.193 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 4.43e-01 0.145 0.189 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 4.92e-01 0.0962 0.14 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 2.43e-02 -0.485 0.214 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 4.59e-01 0.107 0.144 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 555904 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0503 0.177 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 8.81e-01 0.0212 0.141 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 -251937 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00843 0.196 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 555640 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0125 0.191 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -627094 sc-eQTL 5.47e-01 0.0605 0.1 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 299866 sc-eQTL 6.76e-02 0.278 0.151 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -270134 sc-eQTL 1.43e-01 -0.255 0.174 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -420989 sc-eQTL 2.52e-01 0.183 0.159 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 699758 sc-eQTL 2.15e-01 0.214 0.172 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -85542 sc-eQTL 2.02e-02 0.316 0.135 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 769638 sc-eQTL 9.43e-01 0.00897 0.125 0.054 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000074527 NTN4 -17766 eQTL 9.12e-06 0.28 0.0627 0.0 0.0 0.0643
ENSG00000084110 HAL -222979 eQTL 2.3e-09 0.154 0.0256 0.0 0.0 0.0643
ENSG00000111144 LTA4H -270134 pQTL 0.0399 -0.0716 0.0348 0.0 0.0 0.0567
ENSG00000111144 LTA4H -270134 eQTL 0.00708 0.103 0.0383 0.0 0.0 0.0643

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000059758 \N -627094 3.77e-07 2.4e-07 6.41e-08 2.49e-07 1.06e-07 1.08e-07 3.25e-07 5.89e-08 1.89e-07 1.11e-07 2.62e-07 1.72e-07 3.95e-07 8.55e-08 6.2e-08 1.01e-07 8.42e-08 2.66e-07 9.69e-08 6.58e-08 1.23e-07 1.98e-07 2e-07 4.91e-08 4.27e-07 1.56e-07 1.29e-07 1.42e-07 1.54e-07 2.97e-07 1.52e-07 4.51e-08 4.86e-08 1.01e-07 6.98e-08 3.94e-08 6.29e-08 5.71e-08 4.83e-08 7.9e-08 4.78e-08 2.74e-07 3.19e-08 1.26e-08 4.91e-08 9.44e-09 9.23e-08 0.0 4.61e-08
ENSG00000074527 NTN4 -17766 1.1e-05 1.38e-05 2.46e-06 8.36e-06 2.42e-06 5.6e-06 1.64e-05 2.08e-06 1.26e-05 6.27e-06 1.82e-05 7.03e-06 2.5e-05 5.17e-06 4.1e-06 7.85e-06 8.06e-06 1.17e-05 3.58e-06 3.25e-06 6.76e-06 1.24e-05 1.34e-05 4.74e-06 2.44e-05 4.32e-06 6.74e-06 5.24e-06 1.49e-05 1.64e-05 8.75e-06 1.08e-06 1.43e-06 4.05e-06 5.85e-06 3.74e-06 1.77e-06 2.14e-06 2.94e-06 1.73e-06 1.25e-06 1.9e-05 1.49e-06 2.62e-07 9.19e-07 2.2e-06 2.03e-06 8.94e-07 5.68e-07
ENSG00000084110 HAL -222979 1.41e-06 1.91e-06 2.74e-07 1.28e-06 3.79e-07 6.28e-07 1.27e-06 3.99e-07 1.74e-06 6.36e-07 1.97e-06 1.13e-06 2.69e-06 5.76e-07 5.01e-07 9.92e-07 1.04e-06 1.18e-06 5.93e-07 4.81e-07 7.96e-07 1.92e-06 1.4e-06 6.41e-07 2.61e-06 6.9e-07 1.04e-06 9.36e-07 1.67e-06 1.72e-06 8.83e-07 2.06e-07 2.76e-07 6.11e-07 6.8e-07 5.32e-07 7.1e-07 3.43e-07 5.19e-07 2.05e-07 3.18e-07 2.62e-06 1.08e-07 1.87e-07 2.25e-07 2.15e-07 2.41e-07 6.02e-08 1.63e-07
ENSG00000111144 LTA4H -270134 1.21e-06 1.09e-06 3.58e-07 1.15e-06 3.37e-07 5.63e-07 1.52e-06 3.5e-07 1.42e-06 4.31e-07 1.85e-06 7.48e-07 2.45e-06 2.59e-07 4.95e-07 8.35e-07 9.23e-07 7.83e-07 8.83e-07 6.83e-07 4.44e-07 1.45e-06 9.11e-07 5.74e-07 2.43e-06 3.87e-07 8.36e-07 7.2e-07 1.46e-06 1.3e-06 7.1e-07 7.37e-08 2.19e-07 6.24e-07 5.38e-07 4.23e-07 5.93e-07 2.39e-07 4.52e-07 2.88e-07 2.92e-07 1.73e-06 5.41e-08 1.96e-07 1.86e-07 1.28e-07 2.29e-07 8.31e-08 9.42e-08