logo

Genes within 1Mb (chr12:95761017:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 9.66e-01 0.0069 0.16 0.051 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 2.11e-01 0.125 0.0992 0.051 B L1
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 6.81e-01 0.058 0.141 0.051 B L1
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 3.04e-02 0.267 0.122 0.051 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 9.27e-01 0.0121 0.132 0.051 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0696 0.178 0.051 B L1
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 2.99e-01 -0.169 0.162 0.051 B L1
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 4.17e-01 0.0972 0.119 0.051 B L1
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0393 0.163 0.051 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 8.36e-01 0.016 0.0776 0.051 B L1
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 9.34e-01 -0.011 0.133 0.051 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0426 0.0828 0.051 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 9.10e-01 0.0131 0.116 0.051 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 9.05e-01 0.0136 0.114 0.051 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 3.05e-01 -0.126 0.123 0.051 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0112 0.129 0.051 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0199 0.176 0.051 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 8.07e-01 0.0264 0.108 0.051 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0534 0.124 0.051 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 1.55e-01 0.226 0.158 0.051 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0184 0.0842 0.051 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 6.43e-01 -0.063 0.136 0.051 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 6.91e-01 0.0359 0.0904 0.051 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 1.51e-03 -0.427 0.133 0.051 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 8.17e-01 0.04 0.173 0.051 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0183 0.155 0.051 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0287 0.112 0.051 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 8.71e-01 0.0182 0.112 0.051 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 8.04e-02 -0.307 0.175 0.051 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0812 0.129 0.051 Mono L1
ENSG00000084110 HAL -235348 sc-eQTL 6.98e-01 -0.063 0.162 0.051 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0899 0.14 0.051 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 1.40e-02 0.447 0.18 0.051 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 7.17e-01 0.0446 0.123 0.051 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0651 0.167 0.051 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 8.92e-01 0.0158 0.116 0.051 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0892 0.149 0.051 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0603 0.107 0.051 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 -264306 sc-eQTL 4.08e-01 0.143 0.172 0.051 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 2.02e-01 0.222 0.174 0.052 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 7.30e-02 0.167 0.0924 0.052 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 1.96e-01 -0.178 0.137 0.052 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 4.10e-01 0.13 0.158 0.052 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0456 0.15 0.052 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 8.05e-01 0.0403 0.163 0.052 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 5.61e-01 0.0723 0.124 0.052 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0528 0.113 0.052 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0536 0.194 0.051 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 7.20e-01 0.0283 0.0788 0.051 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -30135 sc-eQTL 7.08e-01 0.0546 0.146 0.051 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 7.07e-01 0.0566 0.15 0.051 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 2.68e-01 0.183 0.164 0.051 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 3.59e-01 -0.118 0.128 0.051 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 8.22e-01 0.0424 0.188 0.051 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0325 0.12 0.051 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 9.51e-01 0.00589 0.0955 0.051 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -728554 sc-eQTL 8.44e-01 0.0371 0.188 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 2.54e-01 0.218 0.191 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00877 0.154 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 5.27e-01 0.112 0.176 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 3.35e-01 0.144 0.149 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0787 0.168 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 7.10e-01 0.072 0.194 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 5.21e-01 -0.127 0.198 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 4.18e-01 0.136 0.167 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0598 0.177 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 9.50e-02 -0.244 0.146 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0456 0.2 0.052 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 6.80e-01 0.0618 0.15 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 1.27e-01 -0.296 0.193 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 6.42e-01 0.0803 0.173 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 1.96e-01 -0.219 0.169 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 3.01e-01 0.216 0.209 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 1.44e-01 -0.272 0.185 0.052 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 6.69e-01 0.0769 0.18 0.052 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 4.71e-01 -0.134 0.185 0.052 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 4.13e-03 0.424 0.146 0.052 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 3.90e-01 0.164 0.19 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 4.52e-01 0.0942 0.125 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 4.04e-01 0.135 0.161 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 7.18e-02 0.235 0.13 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 1.81e-01 0.207 0.154 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 1.91e-01 -0.258 0.196 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 8.98e-01 0.0249 0.195 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0141 0.151 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 3.75e-01 0.164 0.185 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 1.01e-01 -0.176 0.107 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 9.06e-01 0.0238 0.202 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 8.31e-01 0.0331 0.155 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 5.21e-01 0.12 0.187 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 3.95e-02 0.301 0.145 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0788 0.173 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 4.27e-01 -0.162 0.204 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0497 0.187 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 9.95e-01 0.0011 0.172 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 4.87e-01 0.106 0.153 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 6.30e-01 0.0725 0.15 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 6.58e-01 0.0881 0.198 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 5.02e-01 0.0973 0.145 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 6.95e-01 0.0813 0.207 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 6.57e-02 -0.375 0.203 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 2.10e-01 -0.259 0.206 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 5.58e-01 -0.122 0.208 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0624 0.165 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 9.12e-01 0.02 0.18 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 8.46e-01 0.0332 0.171 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0746 0.151 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00535 0.0908 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0383 0.131 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 6.71e-01 0.0558 0.131 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 9.07e-01 0.0154 0.131 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 7.14e-01 0.0587 0.16 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 5.00e-01 0.124 0.184 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0164 0.117 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 3.88e-01 -0.101 0.116 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 9.95e-01 0.000961 0.161 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 1.65e-01 -0.123 0.0882 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 4.92e-01 0.104 0.151 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 4.78e-01 -0.107 0.15 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 1.16e-01 -0.232 0.147 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 3.40e-01 -0.168 0.175 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0677 0.204 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 5.94e-01 0.0647 0.121 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0359 0.138 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0626 0.203 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 1.73e-01 0.147 0.107 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 8.94e-01 -0.024 0.18 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 9.18e-01 0.0171 0.166 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 8.21e-01 -0.035 0.155 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 8.00e-01 0.0479 0.189 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 8.04e-01 0.0472 0.19 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 2.10e-01 -0.203 0.161 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0489 0.165 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 1.65e-01 0.252 0.181 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 4.57e-02 0.209 0.104 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 3.23e-01 -0.18 0.181 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 1.76e-01 0.257 0.189 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 5.12e-01 -0.113 0.173 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 1.92e-01 0.262 0.2 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00252 0.193 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0805 0.159 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 5.11e-01 0.0936 0.142 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 5.35e-01 0.114 0.184 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 9.45e-01 0.00859 0.125 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 3.72e-01 -0.149 0.166 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 5.80e-01 0.0831 0.15 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 1.83e-01 -0.211 0.158 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0263 0.185 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0499 0.167 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 4.63e-01 0.105 0.143 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0929 0.135 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 4.44e-01 0.156 0.204 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 7.18e-01 0.0501 0.139 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0343 0.207 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0109 0.204 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 2.72e-01 -0.19 0.172 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0729 0.208 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 3.42e-01 0.178 0.186 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 1.06e-01 -0.32 0.197 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 1.91e-01 0.212 0.162 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 7.22e-01 0.0713 0.2 0.052 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0478 0.115 0.052 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -30135 sc-eQTL 8.52e-01 0.0289 0.155 0.052 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 3.98e-01 0.165 0.194 0.052 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 9.49e-01 0.0114 0.177 0.052 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 4.36e-01 -0.116 0.149 0.052 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 1.45e-01 0.275 0.188 0.052 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 4.06e-01 0.143 0.172 0.052 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 8.99e-01 0.0211 0.166 0.052 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -728554 sc-eQTL 8.42e-01 0.0383 0.192 0.052 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 2.88e-01 0.215 0.202 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 4.94e-01 0.0806 0.118 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0721 0.199 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 5.49e-01 0.104 0.174 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0934 0.185 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 5.37e-01 -0.129 0.209 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0175 0.193 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 2.57e-01 0.188 0.166 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 2.20e-01 0.24 0.195 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 9.41e-02 0.168 0.1 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 5.12e-01 -0.116 0.176 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 2.80e-01 0.197 0.181 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 4.15e-01 0.131 0.161 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 8.06e-01 0.0441 0.18 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 8.64e-01 0.0263 0.153 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 3.39e-01 -0.122 0.127 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0717 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 2.68e-01 0.177 0.16 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 8.35e-01 0.042 0.202 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 5.01e-01 0.141 0.21 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 7.63e-01 0.0587 0.195 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0751 0.213 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 5.05e-01 -0.135 0.203 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0128 0.18 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 5.89e-01 0.0963 0.178 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 6.78e-01 0.0453 0.109 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 6.87e-01 -0.073 0.181 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 2.91e-01 -0.194 0.184 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 1.07e-01 -0.284 0.175 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 2.51e-01 0.215 0.187 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 6.71e-02 0.273 0.148 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 7.34e-01 0.0442 0.13 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 7.30e-01 0.0848 0.245 0.059 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 9.59e-02 0.347 0.207 0.059 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 4.83e-01 -0.172 0.244 0.059 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 9.22e-01 0.0181 0.185 0.059 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 7.29e-01 0.0822 0.236 0.059 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 2.51e-01 -0.267 0.231 0.059 PB L2
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 3.69e-01 0.197 0.218 0.059 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 3.06e-01 0.236 0.23 0.059 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 3.08e-02 -0.419 0.192 0.059 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 6.55e-01 0.0616 0.137 0.059 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 2.20e-01 0.241 0.196 0.05 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 6.46e-01 0.0585 0.127 0.05 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -30135 sc-eQTL 6.87e-01 0.0575 0.143 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 3.44e-01 0.16 0.168 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 8.71e-01 0.0273 0.168 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 3.81e-01 -0.178 0.203 0.05 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0741 0.203 0.05 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 2.95e-01 -0.134 0.128 0.05 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0101 0.123 0.05 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -728554 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0368 0.151 0.05 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 2.37e-01 0.232 0.196 0.051 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0481 0.136 0.051 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 1.74e-01 -0.252 0.185 0.051 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 5.26e-01 -0.109 0.172 0.051 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 6.32e-02 -0.29 0.155 0.051 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 5.39e-01 0.121 0.196 0.051 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0406 0.175 0.051 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 4.61e-01 0.134 0.181 0.051 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 6.91e-01 0.059 0.148 0.051 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 1.90e-01 -0.25 0.19 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0885 0.146 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL -235348 sc-eQTL 3.55e-01 -0.147 0.159 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0822 0.165 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 3.51e-02 0.36 0.17 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00338 0.132 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 3.03e-01 0.179 0.173 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0667 0.136 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 2.57e-01 -0.174 0.153 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0297 0.109 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 -264306 sc-eQTL 4.05e-01 0.146 0.175 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 5.99e-01 0.103 0.196 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0585 0.167 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL -235348 sc-eQTL 2.75e-01 -0.205 0.187 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0492 0.19 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 7.42e-02 0.333 0.186 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 8.12e-01 0.0364 0.153 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0828 0.187 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 4.96e-01 -0.103 0.151 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 5.88e-01 0.0985 0.181 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 4.34e-01 -0.101 0.129 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 -264306 sc-eQTL 5.38e-01 -0.118 0.191 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 3.23e-01 0.239 0.241 0.052 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 5.46e-01 0.097 0.16 0.052 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -30135 sc-eQTL 6.43e-01 0.0853 0.184 0.052 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 7.94e-01 0.0603 0.23 0.052 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 5.48e-01 0.144 0.239 0.052 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0669 0.222 0.052 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 2.37e-01 -0.291 0.245 0.052 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 2.81e-01 0.231 0.213 0.052 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 2.54e-01 -0.226 0.197 0.052 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -728554 sc-eQTL 2.78e-01 -0.225 0.206 0.052 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 7.85e-01 0.0607 0.222 0.051 pDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 1.29e-01 -0.3 0.197 0.051 pDC L2
ENSG00000084110 HAL -235348 sc-eQTL 3.71e-02 0.347 0.165 0.051 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 4.29e-01 -0.179 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 4.75e-01 0.134 0.187 0.051 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 8.79e-01 -0.035 0.229 0.051 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 9.36e-01 0.018 0.224 0.051 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 9.11e-01 0.0223 0.2 0.051 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0347 0.194 0.051 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 3.89e-01 -0.165 0.191 0.051 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 -264306 sc-eQTL 5.36e-02 0.364 0.187 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 4.71e-01 0.14 0.194 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 7.21e-01 0.0465 0.13 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 3.78e-01 -0.159 0.18 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 2.72e-01 0.148 0.135 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 2.27e-01 -0.186 0.154 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 1.92e-01 0.271 0.207 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 3.42e-01 -0.183 0.192 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 3.80e-01 0.131 0.149 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 3.97e-01 -0.146 0.172 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 7.66e-01 0.0355 0.119 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 5.94e-01 0.0963 0.18 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 8.92e-01 0.015 0.111 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 4.88e-01 0.104 0.15 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 6.67e-02 0.228 0.124 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 4.81e-01 0.1 0.142 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 1.76e-01 -0.265 0.195 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 209541 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0714 0.174 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00897 0.143 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 1.27e-01 0.29 0.19 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0707 0.105 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 4.98e-01 -0.12 0.177 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0652 0.133 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL -235348 sc-eQTL 2.30e-01 -0.193 0.16 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 5.31e-01 -0.095 0.151 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 4.48e-02 0.353 0.175 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 8.31e-01 0.0272 0.127 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 8.56e-01 0.0298 0.165 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 1.51e-01 -0.177 0.122 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0519 0.153 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0466 0.105 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 -264306 sc-eQTL 1.00e+00 1.73e-05 0.179 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 2.71e-01 -0.22 0.199 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 1.63e-01 0.19 0.136 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL -235348 sc-eQTL 1.78e-01 0.217 0.16 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 2.98e-01 -0.19 0.182 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 8.91e-02 0.303 0.177 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 1.60e-01 0.186 0.132 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0291 0.205 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00195 0.136 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 543535 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0275 0.167 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0112 0.134 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 -264306 sc-eQTL 8.71e-01 -0.03 0.185 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 543271 sc-eQTL 2.82e-01 0.193 0.179 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -639463 sc-eQTL 1.40e-01 0.139 0.0937 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 287497 sc-eQTL 3.27e-01 -0.14 0.143 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -282503 sc-eQTL 3.93e-01 0.14 0.164 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -433358 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00674 0.15 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 687389 sc-eQTL 7.40e-01 0.0539 0.162 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -97911 sc-eQTL 4.27e-01 0.102 0.128 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 757269 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0517 0.118 0.052 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000084110 HAL -235348 eQTL 0.0218 0.0705 0.0307 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000111144 LTA4H -282503 eQTL 0.000443 0.159 0.0451 0.0 0.0 0.0491

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111144 LTA4H -282503 1.28e-06 9.03e-07 8.9e-08 4.72e-07 1.12e-07 4.35e-07 7.25e-07 1.78e-07 7.08e-07 3.05e-07 1.09e-06 5.39e-07 1.03e-06 2.09e-07 4.26e-07 3.57e-07 5.92e-07 4.25e-07 2.79e-07 1.78e-07 2.35e-07 5.37e-07 5.21e-07 2.95e-07 1.54e-06 2.74e-07 4.91e-07 3.13e-07 5.43e-07 8.47e-07 4.32e-07 4.21e-08 5.31e-08 2.06e-07 3.93e-07 1.21e-07 1.4e-07 9.33e-08 8.43e-08 1.87e-08 1.14e-07 9.59e-07 6.53e-08 1.1e-08 1.01e-07 5.94e-08 1.18e-07 2.41e-08 5.16e-08