logo

Genes within 1Mb (chr12:95760344:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 4.38e-01 -0.129 0.166 0.053 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 8.52e-01 0.0193 0.103 0.053 B L1
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 4.26e-01 -0.116 0.146 0.053 B L1
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0135 0.128 0.053 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 2.98e-01 0.142 0.136 0.053 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 2.42e-01 -0.216 0.184 0.053 B L1
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0447 0.168 0.053 B L1
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0467 0.124 0.053 B L1
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 1.93e-01 0.219 0.168 0.053 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0582 0.0804 0.053 B L1
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 5.40e-01 0.0858 0.14 0.053 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 5.53e-01 0.0516 0.0869 0.053 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 9.82e-01 0.00267 0.121 0.053 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 7.65e-01 0.0358 0.119 0.053 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 9.48e-01 0.00842 0.129 0.053 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 6.90e-01 -0.054 0.135 0.053 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 6.01e-01 0.0966 0.184 0.053 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 7.51e-01 0.0359 0.113 0.053 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 8.08e-01 0.0317 0.13 0.053 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0836 0.166 0.053 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 8.31e-01 0.0188 0.0883 0.053 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 1.28e-01 0.216 0.142 0.053 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 2.89e-01 -0.1 0.0945 0.053 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 1.18e-01 0.223 0.142 0.053 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 7.53e-02 -0.322 0.18 0.053 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 4.88e-01 -0.112 0.162 0.053 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 7.01e-01 0.0449 0.117 0.053 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0517 0.118 0.053 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 6.31e-01 0.0869 0.181 0.053 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 7.54e-01 0.0416 0.132 0.053 Mono L1
ENSG00000084110 HAL -236021 sc-eQTL 4.33e-01 -0.131 0.166 0.053 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 1.12e-01 0.228 0.143 0.053 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 9.37e-01 0.0148 0.188 0.053 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 4.73e-01 0.0907 0.126 0.053 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0503 0.172 0.053 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 3.91e-01 0.102 0.119 0.053 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 8.61e-01 0.027 0.153 0.053 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0385 0.11 0.053 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 -264979 sc-eQTL 2.05e-01 0.224 0.177 0.053 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 9.05e-01 0.0224 0.186 0.054 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 6.67e-01 0.0429 0.0996 0.054 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 7.35e-02 0.263 0.146 0.054 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 2.92e-01 -0.178 0.169 0.054 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 4.27e-01 0.128 0.16 0.054 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 1.55e-01 0.248 0.174 0.054 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 9.61e-02 0.221 0.132 0.054 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00226 0.121 0.054 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0113 0.204 0.053 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 6.77e-02 0.151 0.0824 0.053 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -30808 sc-eQTL 6.75e-01 0.0645 0.153 0.053 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 1.70e-01 0.217 0.158 0.053 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 2.49e-01 -0.2 0.173 0.053 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 7.10e-01 0.0503 0.135 0.053 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 8.33e-01 0.0418 0.198 0.053 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 5.51e-01 0.0751 0.126 0.053 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 7.27e-01 0.0352 0.101 0.053 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -729227 sc-eQTL 3.18e-01 0.198 0.198 0.053 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0771 0.225 0.056 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 3.61e-01 -0.171 0.186 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 3.96e-01 -0.199 0.235 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 5.34e-01 0.132 0.211 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0804 0.224 0.056 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 4.96e-01 -0.153 0.225 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 3.16e-01 0.172 0.171 0.056 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 4.27e-01 0.168 0.211 0.056 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 1.78e-01 0.214 0.158 0.056 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 3.28e-02 -0.423 0.197 0.056 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0826 0.198 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 5.78e-01 0.0885 0.159 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 3.10e-01 0.185 0.182 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0405 0.154 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 4.40e-01 0.134 0.174 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 8.41e-02 -0.345 0.199 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 3.72e-01 -0.183 0.204 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0194 0.173 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 8.71e-01 0.0298 0.183 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 1.99e-01 -0.195 0.151 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0321 0.211 0.054 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 3.93e-01 0.135 0.157 0.054 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 1.62e-01 -0.286 0.204 0.054 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 5.25e-01 0.116 0.182 0.054 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00333 0.179 0.054 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0517 0.22 0.054 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 1.01e-01 0.321 0.195 0.054 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 2.27e-03 -0.573 0.185 0.054 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 6.71e-01 0.0831 0.195 0.054 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0943 0.157 0.054 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 3.43e-01 -0.188 0.198 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 4.35e-01 -0.102 0.13 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0633 0.169 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 7.82e-01 0.0378 0.137 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 4.38e-01 0.125 0.161 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 5.54e-02 -0.393 0.204 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0377 0.203 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 2.62e-01 0.176 0.157 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0143 0.193 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 8.12e-01 0.0268 0.112 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 8.53e-01 0.0393 0.212 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 8.86e-01 0.0234 0.163 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 1.97e-01 -0.253 0.196 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 7.85e-01 -0.042 0.154 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 2.87e-01 0.193 0.181 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 2.24e-01 0.261 0.214 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0969 0.196 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 4.66e-01 -0.132 0.18 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 3.47e-01 0.151 0.16 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 2.82e-01 -0.17 0.158 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 3.83e-01 -0.138 0.158 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 8.89e-01 0.0133 0.0949 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0344 0.137 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0208 0.137 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 9.91e-01 0.00162 0.137 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0431 0.167 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 9.75e-01 0.00614 0.192 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0409 0.122 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 4.35e-01 0.0951 0.122 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 8.69e-02 0.292 0.17 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 2.09e-01 0.118 0.0938 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 2.11e-01 0.2 0.16 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 5.06e-01 0.106 0.16 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 1.00e+00 -5.43e-05 0.157 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 2.68e-01 0.207 0.186 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 1.64e-01 -0.302 0.216 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 5.85e-01 0.0705 0.129 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 1.17e-01 -0.229 0.146 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 8.16e-01 0.0499 0.214 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 9.74e-01 0.00371 0.113 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 4.92e-01 -0.13 0.189 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 9.78e-01 0.00478 0.175 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 1.78e-01 0.219 0.162 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0343 0.199 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 8.44e-01 0.0394 0.2 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 5.63e-01 0.0985 0.17 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 6.30e-01 0.0837 0.173 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 6.94e-01 -0.078 0.198 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0226 0.115 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 4.54e-02 0.395 0.196 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 5.04e-01 0.139 0.207 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0183 0.189 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 6.82e-01 0.0901 0.219 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 3.57e-01 -0.194 0.21 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 3.11e-01 0.176 0.173 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0439 0.155 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 1.81e-01 -0.258 0.192 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 2.62e-01 0.147 0.131 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 4.54e-01 0.131 0.174 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0543 0.157 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 4.49e-02 0.333 0.165 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 1.12e-02 -0.488 0.191 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 7.88e-01 0.047 0.175 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 7.82e-01 0.0414 0.15 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0192 0.141 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 5.61e-01 0.127 0.217 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 4.70e-02 -0.356 0.178 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0224 0.211 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0391 0.22 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 5.24e-01 0.138 0.216 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 5.90e-01 -0.12 0.222 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 5.30e-01 0.116 0.184 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0401 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 9.85e-01 0.00348 0.185 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 7.32e-01 -0.073 0.212 0.052 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 2.57e-01 0.138 0.121 0.052 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -30808 sc-eQTL 8.18e-01 0.0378 0.164 0.052 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 1.89e-01 0.271 0.206 0.052 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0438 0.188 0.052 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 7.74e-01 0.0453 0.158 0.052 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0866 0.2 0.052 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 4.09e-01 0.151 0.183 0.052 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 6.10e-01 0.0901 0.176 0.052 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 -729227 sc-eQTL 6.23e-01 0.1 0.203 0.052 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 7.93e-01 0.058 0.22 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 2.96e-01 -0.134 0.128 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 7.96e-01 0.056 0.217 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0293 0.19 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 7.76e-01 0.0576 0.202 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0668 0.228 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 5.96e-01 0.112 0.211 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 6.99e-01 0.0701 0.181 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 9.11e-01 0.0233 0.209 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0308 0.107 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 6.12e-01 0.0956 0.188 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0121 0.194 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 3.61e-02 0.359 0.17 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 2.63e-01 0.215 0.191 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 3.88e-02 0.337 0.162 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 8.11e-01 0.0325 0.136 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 4.35e-01 0.179 0.229 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 1.78e-01 0.229 0.169 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 6.07e-01 0.11 0.214 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0298 0.223 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0282 0.207 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00774 0.226 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 2.65e-02 0.475 0.213 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 3.30e-01 -0.186 0.19 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 2.49e-01 -0.224 0.194 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0138 0.119 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 6.24e-03 0.536 0.194 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 8.16e-02 -0.349 0.2 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0253 0.192 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 7.16e-01 0.0744 0.204 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 1.90e-02 0.38 0.161 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 4.66e-01 0.103 0.141 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 3.11e-01 0.223 0.219 0.07 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 9.35e-01 0.0153 0.188 0.07 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 5.05e-01 -0.146 0.219 0.07 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 3.85e-01 -0.144 0.165 0.07 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 3.84e-01 0.185 0.212 0.07 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 4.78e-01 -0.148 0.208 0.07 PB L2
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 9.22e-02 0.33 0.194 0.07 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 2.11e-01 0.259 0.206 0.07 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00439 0.176 0.07 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 2.22e-01 0.151 0.123 0.07 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 6.44e-01 0.0942 0.204 0.052 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 9.28e-01 0.012 0.132 0.052 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -30808 sc-eQTL 3.44e-02 0.312 0.147 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0239 0.175 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 5.39e-01 -0.107 0.174 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 9.65e-01 0.00932 0.211 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 6.04e-01 -0.109 0.211 0.052 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 3.33e-01 0.129 0.133 0.052 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 8.78e-01 0.0196 0.128 0.052 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -729227 sc-eQTL 4.15e-01 0.127 0.156 0.052 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 1.73e-02 0.489 0.204 0.053 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 3.80e-01 -0.126 0.143 0.053 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 6.11e-01 0.0992 0.195 0.053 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 5.42e-01 0.111 0.181 0.053 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 3.85e-01 0.143 0.164 0.053 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 5.35e-01 0.128 0.206 0.053 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 3.62e-01 0.169 0.184 0.053 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 1.24e-01 0.292 0.189 0.053 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 5.86e-01 0.0851 0.156 0.053 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 7.89e-01 0.0534 0.199 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0118 0.152 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL -236021 sc-eQTL 1.84e-01 -0.22 0.165 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 8.25e-02 0.298 0.171 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 6.22e-01 0.0883 0.179 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 3.97e-01 0.117 0.138 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 9.71e-01 0.00661 0.181 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 6.10e-01 0.0727 0.142 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 2.94e-01 -0.169 0.16 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0146 0.114 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 -264979 sc-eQTL 2.18e-01 0.225 0.182 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0735 0.203 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 5.89e-01 0.0936 0.173 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL -236021 sc-eQTL 4.68e-01 0.141 0.194 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 7.63e-01 0.0594 0.196 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0954 0.194 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0027 0.158 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 7.24e-01 0.0685 0.194 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0274 0.156 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 1.89e-01 0.247 0.187 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 6.15e-01 0.0673 0.134 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 -264979 sc-eQTL 4.56e-01 0.148 0.198 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 5.95e-01 -0.119 0.223 0.051 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 4.90e-01 -0.137 0.198 0.051 intMono L2
ENSG00000084110 HAL -236021 sc-eQTL 6.04e-01 0.104 0.2 0.051 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0141 0.227 0.051 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 2.02e-01 0.262 0.205 0.051 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0885 0.183 0.051 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 9.10e-02 -0.357 0.21 0.051 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 4.18e-01 0.159 0.195 0.051 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0259 0.197 0.051 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 3.25e-01 0.139 0.141 0.051 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 -264979 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0502 0.205 0.051 intMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 4.55e-01 -0.149 0.2 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 5.77e-01 0.0747 0.134 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0726 0.186 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 6.69e-01 0.0595 0.139 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 5.15e-01 0.103 0.159 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 8.09e-02 -0.372 0.212 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 4.87e-01 0.138 0.198 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 2.87e-01 -0.164 0.154 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 6.66e-01 0.0766 0.177 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 2.81e-01 -0.132 0.122 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 5.21e-01 -0.121 0.189 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 2.95e-01 -0.122 0.116 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 5.25e-01 -0.1 0.158 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 8.07e-01 -0.032 0.131 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 3.19e-01 0.148 0.149 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 2.66e-01 -0.228 0.205 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 208868 sc-eQTL 3.66e-01 -0.165 0.182 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 4.30e-01 0.119 0.15 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 5.15e-01 0.131 0.2 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0318 0.111 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0107 0.184 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 6.27e-01 0.067 0.138 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL -236021 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0849 0.167 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 1.79e-01 0.211 0.157 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 9.32e-01 0.0156 0.183 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 5.70e-01 0.0752 0.132 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 7.86e-01 0.0465 0.171 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 8.00e-01 0.0324 0.128 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 8.40e-01 0.0322 0.159 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0306 0.109 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 -264979 sc-eQTL 2.17e-01 0.229 0.185 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 9.82e-01 0.00469 0.211 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 2.03e-01 -0.183 0.144 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL -236021 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0399 0.17 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 5.36e-01 0.12 0.193 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 4.43e-01 0.145 0.189 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 4.92e-01 0.0962 0.14 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 2.43e-02 -0.485 0.214 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 4.59e-01 0.107 0.144 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 542862 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0503 0.177 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 8.81e-01 0.0212 0.141 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 -264979 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00843 0.196 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 542598 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0125 0.191 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -640136 sc-eQTL 5.47e-01 0.0605 0.1 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 286824 sc-eQTL 6.76e-02 0.278 0.151 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -283176 sc-eQTL 1.43e-01 -0.255 0.174 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -434031 sc-eQTL 2.52e-01 0.183 0.159 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 686716 sc-eQTL 2.15e-01 0.214 0.172 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -98584 sc-eQTL 2.02e-02 0.316 0.135 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 756596 sc-eQTL 9.43e-01 0.00897 0.125 0.054 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000074527 NTN4 -30808 eQTL 1.73e-05 0.265 0.0613 0.0 0.0 0.0672
ENSG00000084110 HAL -236021 eQTL 8.66e-09 0.145 0.025 0.0 0.0 0.0672
ENSG00000111144 LTA4H -283176 eQTL 0.00335 0.11 0.0374 0.0 0.0 0.0672

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000059758 \N -640136 2.91e-07 1.33e-07 5.72e-08 2.41e-07 9.87e-08 7.75e-08 1.9e-07 5.78e-08 1.5e-07 7.6e-08 1.63e-07 1.2e-07 1.87e-07 8.55e-08 5.94e-08 7.89e-08 4.12e-08 1.64e-07 7.29e-08 6.29e-08 1.26e-07 1.31e-07 1.58e-07 3.07e-08 1.98e-07 1.22e-07 1.19e-07 1.17e-07 1.34e-07 9.88e-08 1.06e-07 4.51e-08 3.46e-08 1.01e-07 6.35e-08 2.79e-08 6.14e-08 7.25e-08 6.5e-08 5.24e-08 5.3e-08 1.46e-07 1.21e-08 1.79e-08 3.55e-08 1.05e-08 9.23e-08 0.0 4.8e-08
ENSG00000074527 NTN4 -30808 1.59e-05 2.06e-05 2.65e-06 1.13e-05 2.95e-06 8.25e-06 2.34e-05 3.42e-06 1.64e-05 8.22e-06 2.22e-05 9.35e-06 2.89e-05 9.38e-06 4.98e-06 1.04e-05 8.68e-06 1.52e-05 4.2e-06 4.21e-06 8.02e-06 1.62e-05 1.77e-05 4.85e-06 3.29e-05 5.29e-06 8.02e-06 7.29e-06 1.73e-05 1.4e-05 1.15e-05 1.05e-06 1.23e-06 4.94e-06 8.46e-06 2.85e-06 1.71e-06 2.38e-06 2.61e-06 1.89e-06 1.12e-06 2.26e-05 2.68e-06 2.22e-07 1.38e-06 2.47e-06 3.18e-06 9.83e-07 4.43e-07
ENSG00000084110 HAL -236021 1.89e-06 2.37e-06 2.19e-07 1.76e-06 4.41e-07 8.16e-07 1.31e-06 4.42e-07 1.78e-06 7.98e-07 1.97e-06 1.47e-06 2.88e-06 1.38e-06 3.66e-07 1.22e-06 1.07e-06 1.36e-06 5.54e-07 7.6e-07 7.19e-07 1.9e-06 1.56e-06 6.91e-07 2.86e-06 8.08e-07 1.15e-06 1.4e-06 1.72e-06 1.31e-06 7.64e-07 3.05e-07 2.85e-07 1.25e-06 1.06e-06 5.46e-07 7.53e-07 3.46e-07 4.96e-07 2.29e-07 2.85e-07 2.22e-06 4.77e-07 1.81e-07 3.76e-07 3.1e-07 8.28e-07 2.23e-07 1.83e-07
ENSG00000111144 LTA4H -283176 1.28e-06 1.07e-06 3.43e-07 1.25e-06 3.17e-07 6.47e-07 1.55e-06 3.95e-07 1.52e-06 6.23e-07 2.01e-06 7.92e-07 2.34e-06 4.99e-07 5.28e-07 9.37e-07 8.37e-07 7.94e-07 8.04e-07 5.21e-07 7.96e-07 1.6e-06 9.18e-07 6.44e-07 2.38e-06 4.36e-07 9.45e-07 9.17e-07 1.48e-06 1.22e-06 7.1e-07 2.54e-07 2.14e-07 5.53e-07 6.8e-07 4.37e-07 6.97e-07 2.88e-07 4.12e-07 3.1e-07 2.44e-07 1.46e-06 4.6e-07 1.74e-07 2.22e-07 3.08e-07 4.02e-07 1.41e-07 8.44e-08