logo

Genes within 1Mb (chr12:95746356:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 3.69e-01 -0.152 0.169 0.051 B L1
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0328 0.105 0.051 B L1
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0921 0.149 0.051 B L1
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0352 0.131 0.051 B L1
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 2.49e-01 0.16 0.139 0.051 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0397 0.188 0.051 B L1
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 5.29e-01 -0.108 0.171 0.051 B L1
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0671 0.126 0.051 B L1
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 7.40e-02 0.306 0.171 0.051 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0719 0.0819 0.051 B L1
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 4.31e-01 0.112 0.142 0.051 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00231 0.0887 0.051 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0385 0.124 0.051 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 4.46e-01 0.0929 0.122 0.051 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00431 0.132 0.051 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0424 0.138 0.051 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 7.55e-01 0.0589 0.188 0.051 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 6.99e-01 0.0446 0.115 0.051 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 4.55e-01 0.0994 0.133 0.051 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0815 0.169 0.051 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0315 0.0897 0.051 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 1.22e-01 0.224 0.144 0.051 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0535 0.0962 0.051 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 1.35e-01 0.216 0.144 0.051 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 1.85e-02 -0.432 0.182 0.051 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0957 0.165 0.051 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00371 0.119 0.051 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0635 0.12 0.051 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 7.49e-01 0.06 0.187 0.051 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00616 0.137 0.051 Mono L1
ENSG00000084110 HAL -250009 sc-eQTL 2.53e-01 -0.197 0.172 0.051 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 3.00e-01 0.154 0.149 0.051 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0531 0.195 0.051 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 4.39e-01 0.101 0.131 0.051 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0851 0.178 0.051 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 4.24e-01 0.0986 0.123 0.051 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 9.84e-01 0.00324 0.159 0.051 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0526 0.114 0.051 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 -278967 sc-eQTL 2.89e-01 0.195 0.183 0.051 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 8.41e-01 0.0381 0.189 0.052 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0254 0.101 0.052 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 8.28e-02 0.259 0.149 0.052 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 3.62e-01 -0.157 0.171 0.052 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 7.52e-01 0.0516 0.163 0.052 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 6.94e-01 0.0699 0.177 0.052 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 3.75e-01 0.12 0.135 0.052 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 7.48e-01 0.0395 0.123 0.052 NK L1
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0898 0.207 0.051 Other_T L1
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 1.17e-01 0.132 0.0838 0.051 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -44796 sc-eQTL 5.81e-01 0.086 0.156 0.051 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 3.03e-01 0.166 0.16 0.051 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 8.59e-02 -0.302 0.175 0.051 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 2.53e-01 0.157 0.137 0.051 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 6.55e-01 0.0898 0.201 0.051 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 9.02e-01 0.0157 0.128 0.051 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 5.17e-01 0.0662 0.102 0.051 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 -743215 sc-eQTL 1.32e-01 0.303 0.2 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 5.79e-01 -0.125 0.224 0.056 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 3.55e-01 -0.172 0.185 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 5.21e-01 -0.15 0.234 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 7.73e-01 0.0608 0.21 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 8.75e-01 -0.035 0.223 0.056 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 4.51e-01 -0.169 0.224 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 2.79e-01 0.185 0.171 0.056 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 3.84e-01 0.183 0.21 0.056 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 1.23e-01 0.244 0.157 0.056 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 4.67e-02 -0.393 0.196 0.056 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 8.02e-01 0.0506 0.201 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 7.03e-01 0.0617 0.162 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 7.69e-02 0.328 0.184 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0387 0.157 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 3.94e-01 0.151 0.177 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 9.68e-02 -0.337 0.202 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 4.30e-01 -0.165 0.208 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 6.83e-01 0.072 0.176 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 7.87e-01 0.0504 0.186 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 7.06e-02 -0.278 0.153 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 8.26e-01 -0.047 0.214 0.052 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 4.30e-01 0.126 0.159 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 2.22e-01 -0.253 0.207 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 6.51e-01 0.0835 0.184 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0518 0.181 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 5.92e-01 0.12 0.223 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 1.21e-01 0.307 0.197 0.052 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 2.96e-02 -0.415 0.19 0.052 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 4.06e-01 0.164 0.197 0.052 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0247 0.159 0.052 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 5.88e-01 -0.109 0.2 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 3.89e-01 -0.114 0.132 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 8.85e-01 0.0246 0.17 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 9.16e-01 0.0145 0.138 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 1.59e-01 0.229 0.162 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 4.03e-01 -0.174 0.208 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 5.82e-01 -0.113 0.205 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 4.47e-01 0.121 0.158 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 7.50e-01 0.0621 0.195 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00447 0.114 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00552 0.215 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0733 0.165 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 2.47e-01 -0.23 0.198 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0376 0.156 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 4.09e-01 0.152 0.184 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 1.78e-01 0.293 0.217 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0892 0.199 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 2.41e-01 -0.214 0.182 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 1.38e-01 0.241 0.162 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 2.55e-01 -0.182 0.16 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 3.75e-01 -0.196 0.221 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 6.95e-01 0.0633 0.161 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 2.27e-01 0.279 0.23 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0892 0.227 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0552 0.23 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 2.48e-01 -0.268 0.231 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 4.04e-01 0.153 0.184 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 5.11e-01 0.132 0.2 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0806 0.19 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 4.31e-01 -0.127 0.161 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0315 0.0966 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0649 0.139 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00283 0.14 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0331 0.14 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0215 0.17 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0478 0.196 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00604 0.124 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 2.96e-01 0.129 0.124 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 3.46e-02 0.368 0.173 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 4.24e-01 0.077 0.0961 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 2.58e-01 0.185 0.163 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 1.49e-01 0.235 0.162 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 7.39e-01 0.0535 0.161 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 4.65e-01 0.14 0.191 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 4.01e-01 -0.186 0.222 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 8.94e-01 0.0175 0.132 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 3.27e-01 -0.147 0.15 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0786 0.216 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 7.80e-01 0.032 0.114 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 5.32e-01 -0.119 0.191 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 9.64e-01 0.00794 0.177 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 1.24e-01 0.252 0.163 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 9.74e-01 0.00664 0.201 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 6.56e-01 0.09 0.202 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 9.34e-01 0.0143 0.172 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 4.86e-01 0.122 0.175 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 4.97e-01 -0.135 0.198 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0517 0.115 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 1.62e-02 0.474 0.195 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 3.49e-01 0.194 0.206 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0544 0.188 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 5.05e-01 -0.146 0.219 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 4.70e-01 -0.152 0.21 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 5.88e-01 0.0938 0.173 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0719 0.155 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 1.57e-01 -0.276 0.195 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 8.05e-01 0.033 0.133 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0313 0.177 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 7.86e-01 0.0433 0.16 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 4.60e-02 0.336 0.167 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 4.09e-02 -0.4 0.194 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0136 0.177 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0577 0.152 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 7.93e-01 0.0377 0.143 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 5.81e-01 0.123 0.222 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 2.73e-02 -0.403 0.181 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 7.56e-01 0.0669 0.215 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0672 0.224 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 2.01e-01 0.282 0.22 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0332 0.226 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0647 0.188 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 6.45e-01 0.0946 0.205 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 7.80e-01 0.0526 0.188 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 9.35e-01 0.0171 0.211 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 6.06e-01 -0.056 0.108 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 7.31e-01 0.0653 0.19 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 8.60e-01 0.0346 0.196 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 6.00e-02 0.325 0.172 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 6.20e-01 0.0961 0.193 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 3.91e-01 0.142 0.165 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 5.01e-01 0.0922 0.137 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 8.13e-01 0.0556 0.234 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 2.55e-01 0.197 0.173 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 9.33e-01 0.0184 0.218 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 9.93e-01 0.0019 0.227 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 5.45e-01 -0.128 0.211 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 9.07e-01 0.0268 0.23 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 2.09e-02 0.505 0.217 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 4.31e-01 -0.153 0.194 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 4.26e-01 -0.157 0.197 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0876 0.12 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 6.31e-03 0.542 0.196 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 1.64e-01 -0.283 0.202 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 8.22e-01 -0.044 0.195 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0828 0.207 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 8.35e-02 0.285 0.164 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 6.65e-01 0.0622 0.143 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 4.85e-01 0.159 0.227 0.067 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0248 0.194 0.067 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 5.94e-01 -0.121 0.227 0.067 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 4.08e-01 -0.142 0.171 0.067 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 6.06e-01 0.113 0.219 0.067 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 5.46e-01 -0.13 0.215 0.067 PB L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 9.29e-02 0.34 0.201 0.067 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 1.51e-01 0.307 0.212 0.067 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0385 0.181 0.067 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 2.63e-01 0.143 0.127 0.067 PB L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 6.40e-01 0.0977 0.209 0.05 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0133 0.135 0.05 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -44796 sc-eQTL 2.36e-02 0.342 0.15 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0861 0.179 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 5.09e-01 -0.118 0.179 0.05 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 7.42e-01 0.0713 0.216 0.05 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 5.15e-01 -0.141 0.216 0.05 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 5.84e-01 0.0747 0.136 0.05 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 8.35e-01 0.0274 0.131 0.05 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 -743215 sc-eQTL 5.10e-01 0.106 0.16 0.05 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 5.76e-02 0.401 0.21 0.051 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 3.11e-01 -0.149 0.147 0.051 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000903 0.2 0.051 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 3.67e-01 0.168 0.186 0.051 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 1.24e-01 0.259 0.168 0.051 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 7.75e-01 0.0605 0.212 0.051 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 6.54e-01 0.085 0.189 0.051 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 1.34e-01 0.292 0.194 0.051 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 6.06e-01 0.0827 0.16 0.051 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 4.35e-01 0.166 0.213 0.051 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 5.69e-01 0.106 0.186 0.051 cDC L2
ENSG00000084110 HAL -250009 sc-eQTL 8.75e-01 0.0304 0.193 0.051 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 3.18e-01 0.233 0.233 0.051 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 7.47e-01 0.0534 0.166 0.051 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 1.30e-01 0.331 0.217 0.051 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 8.09e-01 0.0545 0.225 0.051 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 9.67e-01 0.00762 0.183 0.051 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 6.11e-01 0.11 0.216 0.051 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0263 0.184 0.051 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 -278967 sc-eQTL 3.18e-01 -0.188 0.188 0.051 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 1.00e+00 1.21e-05 0.204 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0863 0.156 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL -250009 sc-eQTL 1.66e-01 -0.235 0.169 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 9.50e-02 0.294 0.175 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 9.64e-01 0.00819 0.184 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 5.32e-01 0.0885 0.141 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0962 0.186 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 6.80e-01 0.0604 0.146 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 1.69e-01 -0.226 0.164 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 7.34e-01 0.0398 0.117 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 -278967 sc-eQTL 4.20e-01 0.152 0.187 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0403 0.212 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 4.31e-01 0.142 0.18 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL -250009 sc-eQTL 6.94e-01 0.0795 0.202 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0206 0.205 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 5.23e-01 -0.129 0.202 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0383 0.165 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 8.08e-01 0.049 0.202 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 4.94e-01 -0.111 0.162 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 3.29e-01 0.191 0.195 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 8.97e-01 0.0181 0.139 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 -278967 sc-eQTL 5.64e-01 0.119 0.206 0.051 cMono_S100A L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 5.99e-01 -0.108 0.204 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 8.29e-01 0.0295 0.137 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 7.99e-01 0.0484 0.19 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 6.17e-01 0.0711 0.142 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 6.06e-01 0.0838 0.162 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 1.90e-01 -0.286 0.217 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 4.45e-01 0.154 0.202 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0183 0.157 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 3.86e-01 0.157 0.181 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 2.69e-01 -0.138 0.125 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0861 0.191 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 2.32e-01 -0.141 0.117 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0303 0.159 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0362 0.132 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 2.04e-01 0.191 0.15 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0286 0.207 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 194880 sc-eQTL 2.79e-01 -0.199 0.184 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 8.15e-01 0.0356 0.152 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 2.87e-01 0.215 0.202 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0612 0.112 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0448 0.19 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 7.55e-01 0.0446 0.143 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL -250009 sc-eQTL 4.08e-01 -0.143 0.173 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 5.57e-01 0.0958 0.163 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0428 0.19 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 5.69e-01 0.0781 0.137 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0299 0.177 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0158 0.132 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 528874 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0347 0.165 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 7.98e-01 -0.029 0.113 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 -278967 sc-eQTL 4.61e-01 0.142 0.192 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT 528610 sc-eQTL 8.10e-01 0.0466 0.194 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 -654124 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0107 0.102 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 272836 sc-eQTL 8.62e-02 0.265 0.154 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H -297164 sc-eQTL 2.14e-01 -0.219 0.176 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 -448019 sc-eQTL 5.66e-01 0.093 0.162 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 672728 sc-eQTL 8.23e-01 0.0392 0.175 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -112572 sc-eQTL 1.92e-01 0.181 0.138 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 742608 sc-eQTL 5.99e-01 0.0669 0.127 0.052 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000059758 \N -654124 2.69e-07 1.16e-07 3.56e-08 1.82e-07 9.24e-08 9.8e-08 1.61e-07 5.4e-08 1.45e-07 6.75e-08 1.62e-07 8.68e-08 1.52e-07 6.56e-08 5.99e-08 7.5e-08 3.9e-08 1.21e-07 5.19e-08 4.2e-08 1.13e-07 1.28e-07 1.34e-07 4.05e-08 1.55e-07 1.13e-07 1.07e-07 9.57e-08 1.05e-07 1.07e-07 1.06e-07 3.64e-08 3.26e-08 8.49e-08 8.74e-08 3.76e-08 5.06e-08 9.62e-08 6.78e-08 3.01e-08 3.82e-08 1.33e-07 5.08e-08 1.7e-08 5.43e-08 1.71e-08 1.26e-07 1.98e-09 4.91e-08
ENSG00000074527 \N -44796 1.54e-05 1.48e-05 2.86e-06 1.1e-05 2.48e-06 7.51e-06 1.75e-05 2.78e-06 1.55e-05 6.86e-06 1.88e-05 8.05e-06 2.57e-05 6.06e-06 3.95e-06 9.83e-06 8.2e-06 1.41e-05 3.42e-06 4.11e-06 7.19e-06 1.36e-05 1.37e-05 4.48e-06 2.43e-05 4.5e-06 7.6e-06 6.14e-06 1.44e-05 1.4e-05 9.55e-06 1.03e-06 1.48e-06 4.05e-06 7.21e-06 3.76e-06 2.29e-06 2.13e-06 3.01e-06 2.38e-06 1.29e-06 2.19e-05 2.47e-06 2.1e-07 7.68e-07 2.34e-06 2.53e-06 9.11e-07 9.21e-07
ENSG00000084110 \N -250009 1.24e-06 1.01e-06 3.21e-07 1.26e-06 2.95e-07 6.06e-07 1.6e-06 3.81e-07 1.73e-06 7.25e-07 2.05e-06 8.93e-07 2.46e-06 3.36e-07 5.5e-07 1.01e-06 8.43e-07 6.8e-07 3.77e-07 6.7e-07 6.36e-07 1.72e-06 8.89e-07 5.6e-07 2.32e-06 2.64e-07 9.54e-07 6.93e-07 1.07e-06 1.23e-06 7.54e-07 1.57e-07 2.29e-07 5.18e-07 5.82e-07 4.59e-07 5.31e-07 1.58e-07 3.2e-07 9.13e-08 3.05e-07 1.65e-06 3.77e-07 1.99e-07 1.59e-07 3.26e-07 1.9e-07 1.43e-07 5.81e-08
ENSG00000111144 \N -297164 1.2e-06 8.47e-07 2.15e-07 5.11e-07 1.4e-07 4.39e-07 9.92e-07 3.33e-07 1.35e-06 5.11e-07 1.79e-06 5.93e-07 1.68e-06 2.68e-07 4.01e-07 8.48e-07 5.55e-07 5.31e-07 2.25e-07 2.25e-07 2.8e-07 9.14e-07 5.87e-07 2.92e-07 1.95e-06 2.32e-07 6.75e-07 4.75e-07 5.9e-07 1.13e-06 6.68e-07 4.31e-08 4.92e-08 2.1e-07 3.18e-07 2.54e-07 1.83e-07 1.1e-07 7.56e-08 2.28e-08 1.92e-07 1.43e-06 1.24e-07 1.57e-07 1.81e-07 1.23e-07 1.23e-07 7e-08 5.44e-08