logo

Genes within 1Mb (chr12:94932290:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0706 0.162 0.053 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 2.78e-01 -0.207 0.19 0.053 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0407 0.143 0.053 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0821 0.18 0.053 B L1
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0585 0.164 0.053 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 2.46e-01 -0.125 0.108 0.053 B L1
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 2.26e-01 0.146 0.121 0.053 B L1
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0128 0.136 0.053 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 7.51e-02 -0.292 0.164 0.053 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0616 0.0785 0.053 B L1
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 3.64e-01 0.12 0.131 0.053 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 8.34e-01 -0.024 0.114 0.053 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 5.83e-01 0.07 0.127 0.053 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0945 0.174 0.053 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 8.99e-01 0.0142 0.112 0.053 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0143 0.107 0.053 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 2.83e-01 -0.126 0.117 0.053 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 3.21e-02 -0.262 0.122 0.053 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 2.81e-01 0.172 0.159 0.053 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 9.17e-01 0.0112 0.107 0.053 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 3.33e-01 -0.132 0.136 0.053 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 1.46e-03 0.546 0.169 0.053 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 2.65e-02 -0.343 0.154 0.053 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 1.39e-01 -0.218 0.147 0.053 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 1.85e-01 -0.148 0.111 0.053 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 1.16e-01 0.217 0.137 0.053 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 7.59e-02 -0.2 0.112 0.053 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0229 0.172 0.053 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 6.68e-02 -0.244 0.132 0.053 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0842 0.137 0.053 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 5.27e-01 0.103 0.163 0.053 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 2.31e-04 0.402 0.107 0.053 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0689 0.113 0.053 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 9.20e-01 0.0165 0.164 0.053 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 8.95e-02 -0.247 0.145 0.053 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 5.16e-04 -0.359 0.102 0.053 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 1.66e-01 0.245 0.176 0.054 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 8.10e-01 0.0402 0.167 0.054 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 4.58e-01 -0.104 0.14 0.054 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 3.08e-01 0.169 0.165 0.054 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 4.39e-01 0.106 0.136 0.054 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 9.27e-01 0.0116 0.126 0.054 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 2.31e-01 0.186 0.155 0.054 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 1.80e-02 -0.27 0.113 0.054 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 4.75e-01 0.141 0.197 0.053 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 5.31e-01 0.105 0.168 0.053 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -858862 sc-eQTL 5.69e-01 0.0846 0.148 0.053 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 4.20e-01 0.124 0.153 0.053 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 4.02e-02 0.391 0.189 0.053 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 9.05e-01 0.0186 0.155 0.053 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 3.48e-01 -0.114 0.121 0.053 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0244 0.175 0.053 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 3.59e-02 -0.203 0.0962 0.053 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 5.69e-01 -0.124 0.216 0.051 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 9.11e-01 0.0207 0.185 0.051 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 9.39e-01 0.0174 0.226 0.051 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 9.03e-01 0.0265 0.217 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 4.08e-01 0.137 0.165 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 4.95e-01 0.119 0.174 0.051 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 4.57e-01 -0.151 0.203 0.051 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 9.10e-01 0.0245 0.217 0.051 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 1.63e-01 -0.213 0.152 0.051 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 1.31e-01 -0.288 0.19 0.051 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 7.99e-01 0.0485 0.19 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 2.52e-01 -0.22 0.192 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 7.25e-01 0.0618 0.176 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 2.46e-01 0.223 0.192 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0631 0.197 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 8.19e-01 -0.037 0.162 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0328 0.167 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 4.35e-01 -0.14 0.179 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 2.60e-01 -0.198 0.176 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 1.91e-01 -0.191 0.145 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 7.09e-01 -0.076 0.204 0.052 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0203 0.207 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 6.17e-01 -0.099 0.198 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 8.18e-01 -0.049 0.213 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 1.66e-01 -0.262 0.188 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 8.56e-01 -0.029 0.16 0.052 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0666 0.183 0.052 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 2.02e-01 -0.238 0.186 0.052 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 2.78e-01 -0.204 0.188 0.052 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 8.34e-01 0.0319 0.152 0.052 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 5.86e-01 -0.103 0.189 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 2.39e-01 -0.225 0.191 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0723 0.161 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 6.12e-02 -0.367 0.195 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 2.55e-01 0.22 0.193 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 2.82e-01 -0.175 0.162 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0324 0.15 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0257 0.168 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 8.99e-01 0.0235 0.184 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 2.91e-01 -0.113 0.107 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 4.78e-01 0.145 0.203 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 4.76e-01 -0.132 0.186 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 5.56e-01 -0.111 0.188 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0269 0.206 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 8.03e-01 0.0469 0.188 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0789 0.174 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0775 0.173 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 7.87e-01 0.0496 0.183 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 1.60e-01 0.216 0.153 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 3.28e-01 -0.148 0.151 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 6.05e-01 0.104 0.2 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 9.53e-01 0.0124 0.21 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 5.04e-01 0.141 0.21 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 6.57e-02 0.306 0.165 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 7.17e-01 0.0681 0.187 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 5.00e-01 -0.122 0.181 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 1.98e-01 0.246 0.191 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 3.40e-01 -0.165 0.172 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 8.61e-01 0.0266 0.151 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00766 0.131 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0018 0.16 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 5.37e-01 -0.114 0.184 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 8.55e-01 0.0229 0.125 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0531 0.117 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 5.72e-01 0.0768 0.136 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 2.15e-02 -0.267 0.115 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 6.85e-02 0.288 0.158 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00457 0.149 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 4.44e-01 0.133 0.173 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 8.75e-01 0.0318 0.202 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0878 0.148 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 5.80e-01 0.0662 0.119 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 1.98e-01 -0.203 0.157 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 7.11e-02 -0.245 0.135 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 5.89e-01 0.109 0.201 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0362 0.178 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 8.82e-01 0.0277 0.187 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 3.06e-01 -0.193 0.187 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 2.33e-01 -0.191 0.16 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 3.31e-01 -0.156 0.16 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 1.57e-01 -0.255 0.179 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 2.51e-01 -0.187 0.162 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 3.95e-01 0.153 0.179 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 4.37e-01 -0.123 0.158 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 5.22e-02 -0.347 0.178 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 2.22e-02 0.451 0.196 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 2.09e-01 0.239 0.189 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 2.61e-01 -0.182 0.162 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 2.07e-01 -0.198 0.156 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 1.49e-01 0.257 0.178 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 1.16e-01 -0.221 0.14 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 2.31e-01 0.219 0.182 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0995 0.143 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0799 0.166 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 5.07e-02 0.358 0.182 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 5.05e-02 -0.323 0.164 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0843 0.168 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 2.68e-01 -0.157 0.142 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 1.00e-01 0.265 0.161 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 8.35e-02 -0.231 0.133 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 4.97e-01 -0.136 0.2 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0186 0.154 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 5.77e-01 0.113 0.202 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 3.31e-01 0.198 0.203 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 4.66e-02 -0.363 0.181 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 9.24e-01 0.0185 0.193 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 6.20e-02 -0.362 0.193 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 4.53e-01 0.149 0.198 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 7.73e-02 -0.281 0.158 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 2.51e-01 0.231 0.2 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 6.46e-01 0.0794 0.173 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 8.69e-02 -0.333 0.194 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 7.79e-01 0.0577 0.205 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0447 0.17 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 6.56e-01 0.0863 0.194 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 5.70e-01 -0.106 0.186 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00211 0.2 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 6.15e-01 -0.086 0.171 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 6.04e-01 0.103 0.198 0.054 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 1.93e-01 0.218 0.167 0.054 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -858862 sc-eQTL 3.64e-01 0.139 0.153 0.054 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 6.06e-01 0.0994 0.192 0.054 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 1.69e-01 0.256 0.186 0.054 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 6.29e-01 0.0795 0.164 0.054 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 5.24e-01 -0.109 0.17 0.054 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 4.96e-01 0.128 0.188 0.054 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 1.11e-01 -0.262 0.163 0.054 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 8.34e-01 0.0418 0.199 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0576 0.173 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 9.89e-01 0.0024 0.18 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 2.25e-02 0.416 0.181 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 8.22e-01 0.0361 0.161 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00258 0.156 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 7.82e-01 0.0514 0.186 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 3.99e-02 -0.265 0.128 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 6.40e-01 0.103 0.219 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 3.84e-01 0.169 0.194 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 9.58e-01 0.0109 0.205 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 2.05e-01 -0.273 0.215 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 5.70e-02 0.334 0.175 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0727 0.206 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 2.23e-01 0.247 0.202 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 1.39e-01 -0.269 0.181 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 5.79e-01 0.101 0.182 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0331 0.186 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 5.75e-01 -0.104 0.184 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 8.01e-01 0.0483 0.191 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 5.31e-01 0.103 0.165 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0604 0.152 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 7.66e-01 0.0566 0.19 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 4.43e-02 -0.265 0.131 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 4.84e-01 -0.158 0.225 0.074 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 2.58e-01 0.23 0.202 0.074 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 6.31e-02 0.416 0.222 0.074 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 3.76e-01 0.189 0.213 0.074 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 3.56e-02 -0.42 0.198 0.074 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 4.39e-01 0.161 0.208 0.074 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0594 0.212 0.074 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 3.53e-02 -0.452 0.212 0.074 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 9.51e-01 0.0112 0.18 0.074 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 4.06e-01 0.105 0.126 0.074 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 1.85e-01 0.259 0.195 0.052 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0596 0.174 0.052 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -858862 sc-eQTL 2.44e-01 -0.166 0.142 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 1.46e-02 0.408 0.166 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 3.93e-01 0.173 0.202 0.052 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 1.80e-01 0.266 0.197 0.052 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00337 0.128 0.052 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 7.93e-01 0.0515 0.196 0.052 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 8.33e-01 0.0259 0.123 0.052 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0201 0.192 0.053 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 2.65e-01 -0.202 0.181 0.053 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 8.71e-02 -0.328 0.191 0.053 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 8.30e-01 -0.037 0.172 0.053 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 4.12e-02 0.36 0.175 0.053 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 8.39e-01 0.0361 0.177 0.053 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0446 0.19 0.053 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 2.57e-02 -0.323 0.144 0.053 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 9.90e-01 0.00235 0.189 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 9.28e-03 -0.384 0.146 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 3.26e-01 -0.16 0.163 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 4.85e-01 0.12 0.172 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 1.14e-02 0.329 0.129 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 3.54e-01 -0.125 0.135 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 8.21e-02 -0.309 0.177 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 1.45e-01 -0.221 0.151 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 6.52e-03 -0.292 0.106 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 3.02e-01 0.203 0.196 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 9.22e-01 0.0169 0.172 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 5.58e-01 -0.111 0.19 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 9.02e-01 0.0231 0.187 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 9.57e-05 0.539 0.135 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0606 0.151 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 4.56e-01 -0.148 0.198 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 8.00e-01 0.0462 0.182 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 1.14e-04 -0.491 0.125 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 4.64e-02 0.465 0.231 0.055 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 6.43e-01 0.0833 0.18 0.055 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -858862 sc-eQTL 6.07e-01 0.0919 0.178 0.055 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 3.54e-01 -0.207 0.222 0.055 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 1.67e-02 -0.566 0.234 0.055 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 7.81e-01 0.0631 0.226 0.055 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 5.46e-01 -0.126 0.207 0.055 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 1.31e-01 -0.334 0.219 0.055 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 1.13e-01 -0.304 0.191 0.055 gdT L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 8.46e-01 0.0371 0.191 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 4.36e-01 -0.157 0.201 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 9.75e-01 0.00549 0.178 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 5.97e-01 0.108 0.204 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0743 0.189 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 5.10e-01 0.0802 0.122 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 8.68e-01 0.0244 0.147 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 2.26e-01 -0.205 0.169 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 8.36e-02 -0.292 0.168 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 1.39e-01 -0.172 0.116 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 6.25e-01 -0.089 0.182 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 2.43e-01 -0.215 0.184 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 4.63e-01 -0.111 0.151 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 2.22e-01 -0.241 0.197 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -619186 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00276 0.175 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 1.26e-01 -0.229 0.149 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 9.59e-01 0.00742 0.144 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 9.89e-01 0.00221 0.156 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 4.42e-01 0.148 0.192 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0618 0.106 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 4.28e-01 0.139 0.175 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 4.75e-02 -0.274 0.138 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 4.32e-01 -0.118 0.15 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 4.30e-01 0.129 0.163 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 1.57e-04 0.458 0.119 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 3.23e-01 -0.12 0.122 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0763 0.168 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 4.01e-01 -0.127 0.151 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 8.22e-04 -0.344 0.101 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 2.25e-01 -0.242 0.199 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0784 0.185 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 1.32e-01 -0.275 0.182 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 4.85e-01 0.143 0.205 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 2.12e-02 0.271 0.117 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00697 0.137 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 6.93e-02 0.356 0.195 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -285192 sc-eQTL 2.01e-02 -0.388 0.166 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 1.78e-02 -0.315 0.132 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -285456 sc-eQTL 4.99e-01 0.124 0.183 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 281733 sc-eQTL 9.52e-01 0.0103 0.171 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -541230 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0463 0.146 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -141338 sc-eQTL 4.17e-02 0.336 0.164 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 783713 sc-eQTL 2.53e-01 0.166 0.145 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -926638 sc-eQTL 8.97e-01 -0.017 0.131 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 472302 sc-eQTL 4.98e-01 0.111 0.163 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 sc-eQTL 3.49e-02 -0.252 0.119 0.052 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000180263 FGD6 -285192 eQTL 1.49e-07 -0.201 0.0381 0.0 0.0 0.0658
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 eQTL 9.99e-11 -0.228 0.0349 0.0 0.0 0.0658

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000180263 FGD6 -285192 1.31e-06 9.82e-07 3.12e-07 6.49e-07 3.48e-07 4.73e-07 1.38e-06 3.69e-07 1.42e-06 4.31e-07 1.5e-06 6.43e-07 1.97e-06 2.7e-07 5.17e-07 8.79e-07 8.37e-07 6.8e-07 7.76e-07 6.33e-07 6.17e-07 1.38e-06 8.93e-07 6.33e-07 2.05e-06 4.17e-07 8.75e-07 7.27e-07 1.29e-06 1.27e-06 6.02e-07 1.85e-07 2.19e-07 6.74e-07 5.32e-07 4.44e-07 5.22e-07 1.66e-07 3.89e-07 3.24e-07 2.87e-07 1.53e-06 5.04e-08 2.71e-08 2.11e-07 1.26e-07 2.36e-07 8.48e-08 1.34e-07
ENSG00000184752 NDUFA12 -71458 6.46e-06 6.84e-06 1.04e-06 3.85e-06 2.22e-06 2.58e-06 9.22e-06 1.54e-06 5.38e-06 3.77e-06 8.89e-06 3.63e-06 1.12e-05 2.81e-06 1.58e-06 5.1e-06 3.66e-06 4.08e-06 2.26e-06 2.64e-06 3.64e-06 7.55e-06 5.89e-06 2.84e-06 9.79e-06 2.8e-06 3.68e-06 2.3e-06 7.12e-06 7.74e-06 3.46e-06 7.91e-07 1.14e-06 2.97e-06 2.54e-06 2.04e-06 1.71e-06 1.45e-06 1.62e-06 1.02e-06 9.48e-07 8.15e-06 8.75e-07 1.88e-07 7.78e-07 1.01e-06 9.95e-07 7.58e-07 4.54e-07