logo

Genes within 1Mb (chr12:94929996:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 5.39e-01 0.103 0.168 0.051 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 5.10e-01 0.13 0.197 0.051 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 6.62e-02 0.271 0.147 0.051 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 2.94e-01 0.196 0.186 0.051 B L1
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0585 0.17 0.051 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0152 0.112 0.051 B L1
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 8.57e-01 0.0227 0.126 0.051 B L1
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 4.70e-01 -0.102 0.141 0.051 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 9.79e-01 0.0046 0.171 0.051 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 2.75e-02 -0.179 0.0806 0.051 B L1
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 5.49e-01 0.0831 0.138 0.051 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0182 0.12 0.051 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0497 0.134 0.051 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 3.12e-01 0.185 0.182 0.051 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00905 0.118 0.051 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00327 0.112 0.051 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 1.87e-01 -0.162 0.123 0.051 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 5.87e-02 -0.243 0.128 0.051 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 6.13e-02 0.31 0.165 0.051 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 2.50e-01 -0.128 0.111 0.051 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0452 0.142 0.051 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00448 0.181 0.051 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 1.61e-01 -0.226 0.161 0.051 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 2.72e-01 0.169 0.153 0.051 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 3.60e-01 0.107 0.116 0.051 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 6.46e-02 -0.264 0.142 0.051 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 2.69e-01 -0.13 0.117 0.051 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0836 0.189 0.054 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 6.69e-01 -0.086 0.201 0.054 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 2.88e-01 0.211 0.198 0.054 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 2.40e-01 -0.226 0.192 0.054 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 4.28e-01 -0.142 0.179 0.054 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00189 0.15 0.054 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0343 0.16 0.054 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 4.19e-01 0.144 0.178 0.054 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 2.72e-01 -0.165 0.15 0.054 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 7.97e-01 0.0477 0.185 0.051 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 1.54e-01 -0.205 0.143 0.051 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0146 0.147 0.051 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 6.42e-01 0.0817 0.176 0.051 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 1.82e-01 -0.159 0.119 0.051 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 2.14e-01 -0.152 0.121 0.051 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 1.85e-01 0.234 0.175 0.051 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 1.75e-01 0.213 0.156 0.051 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0656 0.113 0.051 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 9.62e-01 0.00875 0.183 0.052 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 6.42e-01 -0.08 0.172 0.052 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 6.38e-01 0.068 0.144 0.052 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 4.21e-01 -0.138 0.171 0.052 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0111 0.141 0.052 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0639 0.13 0.052 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 3.41e-01 -0.152 0.16 0.052 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 1.89e-01 -0.155 0.118 0.052 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 8.63e-02 0.35 0.203 0.051 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 8.07e-01 0.0425 0.174 0.051 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -861156 sc-eQTL 5.92e-02 -0.289 0.153 0.051 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0863 0.159 0.051 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 1.93e-01 -0.257 0.197 0.051 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 3.91e-01 -0.138 0.161 0.051 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 3.73e-01 -0.112 0.126 0.051 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 3.50e-01 0.169 0.181 0.051 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0934 0.101 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0903 0.223 0.054 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 2.67e-01 0.212 0.19 0.054 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 4.71e-01 -0.168 0.233 0.054 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 7.43e-01 0.0732 0.223 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0688 0.17 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 3.87e-01 0.156 0.18 0.054 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00219 0.209 0.054 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 3.50e-02 -0.47 0.221 0.054 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 9.61e-01 0.0078 0.158 0.054 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 1.70e-01 -0.27 0.196 0.054 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 4.44e-01 -0.156 0.203 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 7.47e-01 0.0665 0.206 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 7.58e-01 0.058 0.188 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 5.43e-01 0.125 0.206 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 5.28e-01 0.133 0.211 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 4.89e-01 -0.12 0.173 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 7.08e-01 0.0669 0.178 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 7.59e-01 -0.059 0.192 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 1.42e-01 0.277 0.188 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 1.36e-01 -0.232 0.155 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00104 0.209 0.052 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 5.66e-01 -0.122 0.212 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0789 0.203 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 3.48e-01 0.205 0.218 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 5.84e-01 -0.106 0.194 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 7.47e-01 0.053 0.164 0.052 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 7.06e-01 0.0709 0.188 0.052 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 6.78e-02 -0.349 0.19 0.052 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 7.74e-02 -0.34 0.192 0.052 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 2.35e-01 -0.184 0.155 0.052 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 4.86e-02 0.389 0.196 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 1.45e-01 0.291 0.199 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 3.02e-01 0.174 0.168 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0483 0.205 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 7.27e-01 0.0708 0.202 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 8.37e-01 0.0349 0.17 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 9.79e-01 0.00403 0.157 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 9.45e-01 0.0121 0.176 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 2.68e-01 0.213 0.192 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 3.07e-01 -0.114 0.112 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 4.75e-01 -0.155 0.216 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 2.12e-01 -0.247 0.197 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 3.05e-01 0.205 0.2 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 1.78e-01 0.294 0.218 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 5.52e-01 -0.119 0.2 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 6.98e-01 0.0718 0.185 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00696 0.184 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0363 0.195 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 4.41e-01 0.126 0.164 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 9.20e-02 -0.271 0.16 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 3.17e-02 0.457 0.211 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 6.18e-01 -0.111 0.223 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 5.72e-02 -0.425 0.222 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 3.94e-01 0.151 0.177 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 6.75e-02 0.364 0.198 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 5.95e-01 0.103 0.193 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 9.74e-01 0.00667 0.204 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 4.41e-01 0.142 0.183 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0417 0.158 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0677 0.136 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0104 0.167 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 4.89e-01 0.133 0.192 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 9.89e-01 0.00172 0.131 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 6.91e-01 0.0483 0.122 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 2.67e-01 -0.157 0.141 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 1.66e-01 -0.168 0.121 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 4.06e-01 0.139 0.166 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0517 0.156 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 5.10e-01 -0.12 0.182 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 1.93e-02 0.492 0.209 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 7.79e-01 0.0437 0.156 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0834 0.125 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 4.46e-01 -0.126 0.166 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 1.83e-01 -0.19 0.142 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 9.01e-01 0.027 0.218 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 2.94e-01 0.203 0.193 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 2.78e-01 -0.22 0.202 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 3.64e-01 -0.185 0.203 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0162 0.174 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 2.38e-01 -0.205 0.173 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0792 0.195 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 1.88e-01 -0.232 0.176 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 6.63e-02 0.354 0.192 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 8.19e-01 -0.039 0.171 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 3.85e-01 0.168 0.193 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 8.90e-01 0.0296 0.214 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 2.46e-01 -0.238 0.205 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 8.64e-02 0.299 0.174 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 9.48e-02 0.282 0.168 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0374 0.193 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 4.97e-01 -0.103 0.152 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 4.89e-01 0.136 0.196 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 1.52e-01 -0.219 0.153 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0794 0.178 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 3.74e-01 0.175 0.197 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 3.58e-01 -0.164 0.178 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 4.52e-01 -0.136 0.18 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 8.49e-01 0.0291 0.152 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 1.09e-01 -0.278 0.173 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 2.93e-01 -0.151 0.144 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 6.43e-02 0.386 0.207 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 4.76e-01 0.115 0.161 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0045 0.212 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 4.99e-02 -0.417 0.211 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 9.91e-01 0.00218 0.192 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 3.98e-01 0.171 0.202 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 3.58e-01 -0.187 0.203 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 4.99e-01 -0.14 0.207 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 2.32e-02 0.376 0.165 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 1.96e-01 0.281 0.217 0.052 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 9.25e-01 0.0174 0.184 0.052 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -861156 sc-eQTL 5.12e-02 -0.327 0.167 0.052 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 3.27e-02 -0.451 0.21 0.052 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000297 0.205 0.052 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 3.85e-01 -0.157 0.18 0.052 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 4.79e-02 -0.37 0.186 0.052 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 5.73e-01 -0.117 0.207 0.052 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 3.68e-01 -0.163 0.181 0.052 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 4.61e-01 0.156 0.211 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0148 0.202 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 2.50e-01 -0.239 0.207 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 1.16e-01 -0.343 0.217 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 7.24e-01 0.0633 0.179 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 6.02e-01 0.106 0.202 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 3.10e-01 -0.184 0.181 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0732 0.174 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 9.26e-01 0.0192 0.206 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 3.90e-01 0.154 0.179 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 4.11e-01 0.153 0.186 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 1.84e-02 -0.444 0.187 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0999 0.166 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 3.50e-01 -0.151 0.161 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 4.56e-01 -0.144 0.192 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 2.75e-01 -0.147 0.134 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 2.61e-01 0.21 0.186 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 2.62e-03 -0.571 0.187 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 7.82e-01 0.0525 0.189 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 1.37e-01 0.291 0.195 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 3.35e-01 0.164 0.169 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 4.07e-01 -0.13 0.156 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 5.75e-01 0.109 0.195 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0522 0.136 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0407 0.241 0.059 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 9.10e-01 0.0247 0.217 0.059 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 1.49e-01 0.345 0.238 0.059 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 6.70e-01 0.0974 0.228 0.059 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 2.76e-01 0.234 0.214 0.059 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0377 0.222 0.059 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 5.98e-01 -0.119 0.226 0.059 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 1.34e-01 -0.345 0.229 0.059 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 3.10e-01 -0.195 0.191 0.059 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0186 0.135 0.059 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0418 0.203 0.052 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 3.72e-01 0.161 0.18 0.052 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -861156 sc-eQTL 4.80e-01 0.104 0.147 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 4.73e-01 0.125 0.174 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 3.65e-01 0.19 0.209 0.052 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 9.28e-01 0.0185 0.205 0.052 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0508 0.132 0.052 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0283 0.203 0.052 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 5.18e-01 0.0822 0.127 0.052 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0129 0.208 0.051 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 8.53e-02 -0.336 0.195 0.051 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 3.07e-01 -0.212 0.207 0.051 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 6.10e-01 0.0948 0.185 0.051 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0716 0.191 0.051 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 4.47e-01 -0.146 0.191 0.051 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0639 0.205 0.051 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 4.19e-01 -0.127 0.157 0.051 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 5.98e-01 -0.101 0.191 0.056 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 8.92e-01 0.0281 0.206 0.056 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 5.98e-01 -0.111 0.209 0.056 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 2.44e-01 -0.235 0.201 0.056 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0447 0.18 0.056 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 8.06e-01 0.0404 0.164 0.056 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 1.13e-01 0.267 0.168 0.056 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 8.97e-01 0.0251 0.194 0.056 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 1.24e-01 -0.253 0.164 0.056 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 9.20e-01 0.0208 0.206 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 3.72e-02 -0.336 0.16 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 5.84e-02 -0.336 0.176 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 3.40e-01 0.179 0.187 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 1.69e-01 -0.196 0.142 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 1.47e-01 -0.213 0.147 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 9.87e-01 0.00324 0.195 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 2.66e-01 0.185 0.166 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 3.39e-01 -0.113 0.118 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 7.51e-01 0.0664 0.209 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 3.25e-01 -0.18 0.183 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 7.21e-01 0.0722 0.202 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 6.60e-01 0.0879 0.199 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 3.61e-01 -0.137 0.149 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0567 0.161 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 9.54e-02 0.352 0.21 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 6.52e-01 0.0874 0.193 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 8.90e-01 0.019 0.138 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00831 0.219 0.051 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 6.72e-01 0.0899 0.212 0.051 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0473 0.223 0.051 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 5.32e-01 -0.13 0.208 0.051 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 3.33e-01 0.173 0.178 0.051 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 9.92e-01 -0.002 0.192 0.051 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0425 0.215 0.051 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0459 0.193 0.051 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00439 0.138 0.051 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 7.35e-01 0.0687 0.203 0.054 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 9.34e-01 0.0161 0.196 0.054 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 1.45e-01 0.31 0.212 0.054 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 3.32e-01 -0.205 0.211 0.054 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 4.37e-01 -0.105 0.135 0.054 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 1.19e-01 -0.268 0.171 0.054 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 6.02e-01 -0.11 0.211 0.054 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 4.70e-01 0.145 0.2 0.054 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 3.03e-01 -0.183 0.178 0.054 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0198 0.226 0.056 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 3.34e-01 -0.213 0.219 0.056 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0591 0.23 0.056 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0294 0.228 0.056 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 5.35e-01 -0.136 0.219 0.056 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 4.73e-01 -0.146 0.204 0.056 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 4.15e-02 -0.478 0.232 0.056 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 4.13e-01 -0.162 0.198 0.056 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 4.92e-01 -0.134 0.195 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 6.77e-01 -0.085 0.204 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0805 0.215 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0634 0.19 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 7.69e-01 0.0641 0.218 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 9.02e-01 0.025 0.202 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 8.00e-01 0.033 0.13 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 4.13e-01 0.129 0.157 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 1.45e-01 -0.264 0.181 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0797 0.181 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 1.92e-02 -0.291 0.123 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 2.52e-01 0.217 0.189 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 3.87e-01 0.166 0.192 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 9.85e-02 0.26 0.157 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 5.59e-01 0.12 0.205 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -621480 sc-eQTL 5.65e-01 -0.105 0.182 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 5.81e-01 0.0861 0.156 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0217 0.15 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 8.65e-01 0.0276 0.162 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 2.54e-01 0.228 0.2 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 1.41e-01 -0.163 0.11 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 7.18e-01 0.0686 0.19 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 6.75e-02 -0.274 0.149 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 4.98e-01 -0.11 0.162 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 2.98e-01 0.184 0.176 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 1.08e-01 -0.214 0.133 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 2.77e-01 -0.144 0.132 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 2.09e-01 0.228 0.181 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 3.24e-01 0.162 0.164 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0669 0.113 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 4.86e-01 0.145 0.208 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 8.03e-01 0.0482 0.193 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 5.92e-01 0.102 0.19 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 3.50e-01 -0.199 0.213 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0189 0.123 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0678 0.142 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0825 0.204 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -287486 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00318 0.175 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0685 0.139 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -287750 sc-eQTL 8.72e-01 0.0303 0.188 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 279439 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0933 0.175 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -543524 sc-eQTL 5.54e-01 0.089 0.15 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -143632 sc-eQTL 3.90e-01 -0.147 0.17 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 781419 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0539 0.149 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF -928932 sc-eQTL 4.36e-01 -0.105 0.134 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 470008 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0794 0.168 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 sc-eQTL 3.15e-01 -0.124 0.123 0.052 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136014 USP44 -621480 eQTL 0.0441 0.109 0.0542 0.0 0.0 0.0682
ENSG00000139343 SNRPF -928932 eQTL 0.0188 -0.0391 0.0166 0.00162 0.0 0.0682
ENSG00000180263 FGD6 -287486 eQTL 2.73e-05 -0.155 0.0367 0.0 0.0 0.0682
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 eQTL 2.2e-05 -0.145 0.0339 0.0 0.0 0.0682

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000180263 FGD6 -287486 1.43e-06 1.19e-06 5.62e-07 1.85e-06 4.65e-07 6.96e-07 1.33e-06 3.54e-07 1.7e-06 7.73e-07 2e-06 1.45e-06 3.3e-06 1.34e-06 9.11e-07 1.27e-06 1e-06 1.44e-06 1.46e-06 1.37e-06 1.12e-06 2.71e-06 1.86e-06 9.37e-07 2.56e-06 7.75e-07 1.14e-06 1.12e-06 1.66e-06 1.85e-06 1.15e-06 5.58e-07 7.53e-07 1.75e-06 1.27e-06 9.47e-07 9.28e-07 4.82e-07 9.23e-07 3.99e-07 7.88e-07 1.47e-06 4.01e-07 1.74e-07 3.56e-07 1.21e-06 4.03e-07 7.13e-07 3.23e-07
ENSG00000184752 NDUFA12 -73752 1.33e-05 1.24e-05 4.54e-06 9.71e-06 2.91e-06 5.72e-06 2.08e-05 2.23e-06 1.49e-05 8.48e-06 1.79e-05 8.05e-06 2.44e-05 7.44e-06 5.09e-06 1.03e-05 5.51e-06 1.44e-05 6.85e-06 4.75e-06 8.49e-06 1.55e-05 1.42e-05 6.86e-06 2.46e-05 5.05e-06 7.98e-06 7.72e-06 1.51e-05 1.85e-05 1.14e-05 1.58e-06 2.29e-06 4.85e-06 6.33e-06 4.59e-06 2.56e-06 3.05e-06 3.4e-06 1.34e-06 1.77e-06 1.3e-05 2.83e-06 4.21e-07 2.06e-06 4.53e-06 2.9e-06 1.49e-06 1.36e-06