logo

Genes within 1Mb (chr12:94854943:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0934 0.103 0.126 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0664 0.121 0.126 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 3.27e-01 0.0888 0.0904 0.126 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 3.60e-01 0.105 0.114 0.126 B L1
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 3.80e-01 0.0917 0.104 0.126 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 8.94e-01 0.00917 0.0686 0.126 B L1
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 7.64e-02 0.153 0.0859 0.126 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 5.88e-01 0.0568 0.105 0.126 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 2.41e-01 0.0586 0.0498 0.126 B L1
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 4.72e-01 0.0603 0.0836 0.126 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 9.14e-01 0.00788 0.0727 0.126 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0375 0.0809 0.126 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 2.15e-01 0.137 0.11 0.126 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0143 0.0711 0.126 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 8.93e-01 -0.01 0.0745 0.126 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 5.42e-01 0.0476 0.078 0.126 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0849 0.102 0.126 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00155 0.0688 0.126 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0166 0.0875 0.126 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 8.30e-01 0.024 0.111 0.126 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 4.14e-01 0.0815 0.0995 0.126 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0631 0.0946 0.126 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0621 0.0884 0.126 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 6.89e-01 -0.029 0.0724 0.126 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 2.72e-01 -0.129 0.117 0.131 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 6.68e-01 0.0532 0.124 0.131 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00285 0.123 0.131 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 1.62e-01 0.166 0.118 0.131 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 1.60e-01 -0.156 0.11 0.131 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0151 0.0989 0.131 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 4.06e-01 0.0916 0.11 0.131 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0417 0.0927 0.131 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 1.45e-01 0.162 0.111 0.126 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 2.42e-02 -0.194 0.0856 0.126 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 4.77e-01 0.0632 0.0886 0.126 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00167 0.106 0.126 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0841 0.0716 0.126 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 3.01e-01 0.11 0.106 0.126 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0109 0.0945 0.126 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 4.63e-01 0.0498 0.0678 0.126 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0448 0.111 0.127 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 3.02e-01 -0.108 0.105 0.127 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 8.98e-02 -0.149 0.0874 0.127 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 4.78e-01 0.074 0.104 0.127 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 8.20e-01 0.0196 0.0858 0.127 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 5.62e-01 0.0566 0.0975 0.127 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 3.31e-01 0.07 0.0718 0.127 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 9.80e-01 0.00309 0.124 0.126 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00766 0.105 0.126 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -936209 sc-eQTL 5.11e-01 0.0613 0.0931 0.126 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 1.56e-01 -0.136 0.0958 0.126 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 1.17e-02 -0.301 0.118 0.126 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 9.97e-01 0.000322 0.0975 0.126 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 5.46e-01 0.0662 0.11 0.126 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 4.05e-01 0.0508 0.0609 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0762 0.14 0.13 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 3.64e-01 0.108 0.119 0.13 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0913 0.146 0.13 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0751 0.14 0.13 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 6.21e-01 0.0528 0.107 0.13 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 5.55e-01 0.0665 0.113 0.13 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 2.61e-02 -0.31 0.138 0.13 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 7.89e-01 0.0265 0.0988 0.13 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 3.81e-01 -0.108 0.123 0.13 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0234 0.123 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 3.90e-01 -0.107 0.124 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 1.87e-01 0.149 0.113 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0992 0.124 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 9.41e-01 0.00939 0.127 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0214 0.105 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 2.17e-01 0.143 0.115 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 3.09e-02 0.244 0.112 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 1.15e-02 0.236 0.0927 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 8.55e-01 -0.023 0.126 0.127 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 3.01e-01 0.132 0.127 0.127 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 6.49e-01 0.0555 0.122 0.127 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 1.15e-01 0.207 0.13 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0319 0.117 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 6.85e-01 0.0402 0.0988 0.127 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 4.83e-01 0.0808 0.115 0.127 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 3.78e-01 0.103 0.116 0.127 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 2.73e-02 0.206 0.0925 0.127 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 6.59e-01 0.0536 0.121 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 1.84e-01 -0.163 0.122 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 8.51e-01 0.0195 0.103 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 5.10e-01 0.0831 0.126 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 9.22e-01 0.0121 0.124 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0764 0.104 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 2.35e-02 0.243 0.107 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00531 0.118 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 7.55e-01 0.0215 0.0688 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 3.95e-01 -0.109 0.128 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 9.34e-01 0.00963 0.117 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 8.79e-01 -0.018 0.118 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 2.42e-01 0.151 0.129 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0563 0.118 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 8.79e-01 0.0166 0.109 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 6.38e-01 0.0543 0.115 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0417 0.0966 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 3.11e-01 0.0961 0.0948 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0857 0.126 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 3.29e-01 -0.128 0.131 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0273 0.132 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 3.69e-01 -0.094 0.104 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0173 0.118 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 6.18e-01 -0.06 0.12 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 1.39e-02 0.265 0.107 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 4.91e-01 0.0659 0.0956 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 9.10e-01 0.00937 0.0828 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00647 0.101 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 3.86e-01 0.101 0.116 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0628 0.0792 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0195 0.0858 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 4.33e-01 0.0578 0.0736 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00701 0.102 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 3.08e-01 0.0973 0.0953 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 9.78e-01 0.00301 0.111 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 4.22e-01 0.104 0.129 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00717 0.0952 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0206 0.101 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 4.27e-01 0.0695 0.0873 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 4.41e-01 -0.1 0.13 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 6.48e-01 0.0526 0.115 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 7.14e-01 0.0443 0.121 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 8.53e-02 0.209 0.121 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 3.00e-01 0.107 0.103 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0381 0.116 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 3.74e-01 0.0937 0.105 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 6.84e-02 -0.207 0.113 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 7.47e-01 0.0324 0.1 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 3.13e-01 0.115 0.114 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 2.46e-01 -0.146 0.125 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0662 0.121 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 1.67e-01 -0.142 0.102 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 2.74e-01 -0.124 0.113 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 6.34e-01 0.0425 0.0891 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 4.04e-01 0.0979 0.117 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0235 0.0917 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0937 0.106 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 6.60e-01 0.0519 0.118 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 4.40e-01 0.0822 0.106 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0598 0.108 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0213 0.104 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00442 0.086 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0679 0.132 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 9.03e-02 0.172 0.101 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 6.80e-01 0.0552 0.134 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 4.41e-01 0.104 0.134 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0419 0.121 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 7.97e-01 0.0328 0.127 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 8.30e-02 -0.226 0.13 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 6.47e-01 0.0482 0.105 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 7.74e-01 0.0369 0.128 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000719 0.11 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0566 0.125 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 9.33e-01 0.0111 0.131 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 1.90e-01 -0.142 0.108 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 6.46e-01 0.0569 0.124 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0934 0.128 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 3.86e-02 -0.225 0.108 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0666 0.127 0.126 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0848 0.107 0.126 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -936209 sc-eQTL 8.43e-01 0.0194 0.0982 0.126 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0962 0.123 0.126 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 2.88e-01 -0.127 0.12 0.126 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 6.35e-01 0.0501 0.105 0.126 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 6.43e-01 0.0561 0.121 0.126 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 9.00e-01 0.0133 0.106 0.126 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 9.85e-01 0.00233 0.128 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 2.95e-01 -0.128 0.122 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 6.57e-01 0.0559 0.126 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00228 0.132 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 1.28e-01 0.165 0.108 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 9.74e-01 0.00357 0.11 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 6.84e-01 0.0428 0.105 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 1.38e-01 -0.187 0.125 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 4.99e-01 0.0742 0.11 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 1.30e-01 -0.172 0.113 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 6.08e-01 0.0594 0.116 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 9.61e-01 0.00497 0.102 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 3.06e-01 0.12 0.117 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 9.81e-02 0.135 0.0815 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 2.35e-01 -0.164 0.138 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 3.40e-03 -0.356 0.12 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 1.74e-01 -0.175 0.128 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0128 0.136 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 8.94e-01 0.0148 0.111 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 2.50e-01 -0.147 0.127 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 5.56e-01 0.0677 0.115 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 2.06e-01 0.144 0.113 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 4.99e-01 -0.079 0.117 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 7.37e-02 0.206 0.115 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00352 0.12 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0302 0.104 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 3.06e-01 0.122 0.119 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0543 0.0829 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 5.01e-01 -0.113 0.168 0.111 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0305 0.151 0.111 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 5.40e-01 0.103 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0174 0.159 0.111 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 3.37e-01 0.144 0.149 0.111 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 6.29e-01 0.075 0.155 0.111 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 4.94e-02 0.315 0.158 0.111 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 2.83e-01 0.144 0.133 0.111 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 3.85e-01 0.0818 0.0938 0.111 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0389 0.123 0.124 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 7.13e-01 0.0403 0.109 0.124 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -936209 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00539 0.0892 0.124 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0931 0.105 0.124 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 2.34e-01 -0.151 0.127 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 5.04e-01 -0.083 0.124 0.124 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 4.09e-01 0.102 0.123 0.124 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00222 0.0769 0.124 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 9.86e-02 0.204 0.123 0.126 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 3.78e-01 -0.103 0.117 0.126 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 6.83e-02 -0.225 0.123 0.126 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 5.71e-01 0.0628 0.111 0.126 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 3.50e-01 -0.107 0.114 0.126 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 9.09e-01 0.0139 0.122 0.126 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 7.77e-01 0.0265 0.0937 0.126 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0673 0.119 0.139 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 6.49e-01 0.0583 0.128 0.139 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 8.25e-01 0.0288 0.13 0.139 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 9.90e-02 0.206 0.125 0.139 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 7.43e-01 0.0368 0.112 0.139 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 1.95e-01 -0.136 0.104 0.139 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 2.23e-01 0.147 0.12 0.139 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00138 0.103 0.139 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 1.46e-01 0.177 0.121 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 1.80e-01 -0.128 0.0955 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 1.04e-01 0.171 0.105 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 1.53e-01 -0.158 0.11 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0594 0.0845 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 3.84e-01 0.1 0.115 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0614 0.0983 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 1.97e-01 0.0901 0.0695 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0471 0.125 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 7.13e-02 -0.197 0.109 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 8.66e-01 0.0204 0.121 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 6.06e-01 0.0615 0.119 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 1.09e-01 -0.143 0.0888 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 5.66e-02 0.24 0.125 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 3.14e-01 -0.116 0.115 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 7.38e-01 0.0276 0.0823 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000638 0.162 0.133 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 4.06e-01 -0.103 0.124 0.133 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -936209 sc-eQTL 7.77e-01 -0.035 0.123 0.133 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0547 0.154 0.133 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 1.06e-02 -0.417 0.161 0.133 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 4.83e-02 -0.307 0.154 0.133 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 6.68e-01 0.0656 0.153 0.133 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 4.63e-01 0.0977 0.133 0.133 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 9.91e-01 0.00149 0.134 0.127 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 4.00e-01 -0.109 0.13 0.127 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 9.67e-01 -0.0057 0.136 0.127 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 5.02e-01 0.0855 0.127 0.127 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 3.27e-01 -0.107 0.109 0.127 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 8.51e-01 0.0248 0.132 0.127 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 8.69e-01 0.0195 0.118 0.127 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 7.50e-01 -0.027 0.0845 0.127 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 3.46e-01 0.115 0.122 0.127 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 2.94e-01 -0.124 0.118 0.127 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 2.94e-01 0.134 0.128 0.127 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 4.86e-01 0.0888 0.127 0.127 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 1.87e-01 -0.107 0.0808 0.127 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 4.19e-01 0.103 0.127 0.127 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 8.93e-01 0.0162 0.121 0.127 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 2.45e-01 0.125 0.107 0.127 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 3.84e-01 -0.113 0.129 0.138 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 8.24e-01 0.028 0.126 0.138 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 3.76e-01 -0.117 0.132 0.138 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 3.81e-01 0.114 0.13 0.138 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 7.04e-02 -0.226 0.124 0.138 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 1.74e-01 0.183 0.134 0.138 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0915 0.113 0.138 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0734 0.112 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 6.63e-01 -0.054 0.124 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 6.83e-01 0.0534 0.131 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 2.13e-01 0.144 0.115 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 6.30e-01 0.0639 0.132 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 6.85e-01 0.0498 0.123 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 6.37e-01 0.0374 0.079 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 9.10e-01 0.0125 0.11 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 7.66e-02 0.194 0.109 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 7.14e-03 0.202 0.0745 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0221 0.116 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0783 0.117 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0276 0.0964 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 3.91e-01 0.108 0.125 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -696533 sc-eQTL 6.03e-01 0.0579 0.111 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0645 0.095 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 2.06e-02 0.228 0.0979 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 4.07e-01 -0.102 0.122 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 6.68e-01 0.029 0.0676 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 2.59e-01 0.127 0.113 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 2.17e-02 -0.204 0.0883 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 5.52e-01 0.0574 0.0965 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0971 0.105 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0682 0.0792 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 2.48e-01 0.125 0.108 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 5.46e-01 -0.059 0.0975 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 4.20e-01 0.054 0.0669 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 5.59e-01 0.0749 0.128 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 3.16e-01 -0.119 0.118 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 4.31e-01 0.0923 0.117 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 5.53e-01 0.0778 0.131 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 6.68e-02 -0.138 0.0751 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 9.29e-01 0.0112 0.126 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -362539 sc-eQTL 6.20e-01 0.0534 0.107 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 8.50e-01 0.0163 0.0856 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -362803 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0309 0.115 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 204386 sc-eQTL 3.30e-01 -0.105 0.107 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -618577 sc-eQTL 9.31e-02 -0.154 0.0911 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -218685 sc-eQTL 6.56e-01 0.0463 0.104 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 706366 sc-eQTL 9.66e-01 0.00392 0.0912 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 394955 sc-eQTL 3.13e-01 0.103 0.102 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -148805 sc-eQTL 3.61e-01 0.0688 0.0752 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000173588 \N 394955 1.38e-06 1.58e-06 2.53e-07 1.32e-06 2.66e-07 6.06e-07 1.53e-06 3.98e-07 1.66e-06 4.65e-07 2.02e-06 8.37e-07 2.67e-06 2.89e-07 5.4e-07 9.27e-07 9.17e-07 9.05e-07 8.21e-07 6.36e-07 7.72e-07 1.97e-06 8.31e-07 6.28e-07 2.42e-06 6.58e-07 9.89e-07 9.25e-07 1.39e-06 1.16e-06 8.46e-07 1.91e-07 2.62e-07 5.67e-07 5.34e-07 4.75e-07 5.53e-07 2.26e-07 4.82e-07 2.03e-07 1.38e-07 1.66e-06 3.5e-07 1.06e-07 1.82e-07 1.23e-07 2.3e-07 4.82e-08 2.62e-07
ENSG00000258365 \N 572099 9.83e-07 7.58e-07 1.76e-07 4.27e-07 1.08e-07 3.11e-07 5.76e-07 1.11e-07 5.3e-07 2.14e-07 1.02e-06 3.84e-07 1.05e-06 1.41e-07 2.26e-07 2.23e-07 3.35e-07 4.11e-07 2.13e-07 1.41e-07 2.05e-07 5.11e-07 3.19e-07 1.06e-07 9.82e-07 2.6e-07 3.37e-07 2.83e-07 3e-07 6.42e-07 3.93e-07 7.33e-08 4.35e-08 1.15e-07 3.4e-07 6.83e-08 1.08e-07 7.64e-08 6.49e-08 8.59e-09 4.58e-08 6.19e-07 5.38e-08 1.04e-08 8.59e-08 1.22e-08 1.26e-07 1.22e-08 5.94e-08