logo

Genes within 1Mb (chr12:94853886:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 2.02e-02 0.183 0.0781 0.263 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 3.00e-01 0.0964 0.0927 0.263 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 6.81e-01 0.0287 0.0696 0.263 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 1.67e-01 -0.121 0.0875 0.263 B L1
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00779 0.0802 0.263 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0274 0.0527 0.263 B L1
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 8.57e-01 0.012 0.0665 0.263 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 7.30e-01 0.0277 0.0804 0.263 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0218 0.0383 0.263 B L1
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0383 0.066 0.263 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 4.31e-01 0.0452 0.0573 0.263 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 2.35e-01 0.0758 0.0636 0.263 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 4.66e-01 0.0636 0.0871 0.263 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 5.46e-01 0.0339 0.0561 0.263 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 1.14e-01 0.0927 0.0584 0.263 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 5.22e-04 0.211 0.0599 0.263 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0347 0.0786 0.263 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 7.92e-01 0.014 0.0528 0.263 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 7.03e-01 0.0256 0.0672 0.263 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0291 0.0856 0.263 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 7.88e-01 0.0206 0.0766 0.263 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 7.81e-02 0.128 0.0723 0.263 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00308 0.068 0.263 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 1.80e-01 0.0745 0.0554 0.263 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 3.09e-01 -0.096 0.094 0.261 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 3.16e-01 0.1 0.0997 0.261 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 5.15e-01 0.0644 0.0988 0.261 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 9.70e-01 0.00359 0.0958 0.261 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00662 0.0894 0.261 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 9.21e-01 0.00793 0.0796 0.261 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00618 0.0886 0.261 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 4.76e-03 0.209 0.0732 0.261 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 2.31e-01 -0.103 0.086 0.263 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 1.54e-02 0.162 0.0661 0.263 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0302 0.0687 0.263 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 1.81e-01 0.109 0.0815 0.263 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0629 0.0554 0.263 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 9.08e-02 -0.139 0.0816 0.263 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 1.00e-01 0.12 0.0727 0.263 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 2.75e-05 0.216 0.0504 0.263 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0486 0.0865 0.264 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 8.52e-01 0.0152 0.0816 0.264 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 1.56e-01 0.0971 0.0681 0.264 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0963 0.0808 0.264 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00897 0.0668 0.264 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 2.09e-01 0.0952 0.0756 0.264 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 2.35e-03 0.169 0.0548 0.264 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0577 0.0974 0.263 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 5.96e-01 0.0441 0.083 0.263 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -937266 sc-eQTL 3.28e-01 0.0719 0.0733 0.263 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 8.05e-01 0.0187 0.0758 0.263 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 4.13e-01 0.0775 0.0945 0.263 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0356 0.0768 0.263 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 7.37e-01 0.0291 0.0864 0.263 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 6.11e-02 0.0898 0.0477 0.263 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 9.55e-01 0.00598 0.105 0.276 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0629 0.0895 0.276 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0249 0.11 0.276 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 6.79e-01 0.0436 0.105 0.276 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0257 0.0802 0.276 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0124 0.0847 0.276 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 6.01e-02 0.197 0.104 0.276 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 2.20e-01 0.091 0.0739 0.276 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0235 0.0929 0.276 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 2.80e-01 0.104 0.0956 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 2.04e-01 0.123 0.0966 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0552 0.0884 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0646 0.0969 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 4.41e-01 0.0765 0.0992 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0057 0.0816 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 8.26e-01 0.0199 0.0904 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0466 0.0887 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0982 0.0731 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 2.91e-01 0.106 0.1 0.263 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0135 0.102 0.263 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0166 0.0973 0.263 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 5.24e-03 -0.29 0.103 0.263 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 2.55e-01 0.106 0.093 0.263 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 4.57e-01 0.0587 0.0787 0.263 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 8.38e-01 0.0188 0.0919 0.263 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 3.43e-01 0.088 0.0926 0.263 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0207 0.0746 0.263 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 2.30e-01 0.114 0.0942 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 9.12e-01 0.0106 0.0956 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 9.10e-03 0.208 0.0791 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 5.26e-01 0.0622 0.098 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0467 0.0967 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 7.88e-01 0.0219 0.0812 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0594 0.0838 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 9.75e-01 0.00294 0.0919 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0603 0.0534 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0847 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 1.81e-04 0.343 0.0901 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0804 0.094 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0858 0.103 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 5.31e-01 0.059 0.0941 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 7.42e-02 -0.155 0.0865 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 4.51e-01 0.0693 0.0919 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 8.09e-01 0.0186 0.0771 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0272 0.0758 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00491 0.1 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0027 0.105 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 1.10e-01 0.168 0.104 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0083 0.0834 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 1.44e-01 0.137 0.0932 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 6.64e-01 0.0417 0.0957 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 1.35e-01 0.129 0.0858 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0266 0.0751 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 4.66e-01 0.0475 0.065 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 2.57e-01 0.09 0.0792 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 7.46e-01 0.0297 0.0915 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00435 0.0623 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 5.64e-01 0.0389 0.0673 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 1.97e-03 0.177 0.0566 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0179 0.0786 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 9.04e-01 0.00889 0.0737 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 4.53e-01 0.0645 0.0857 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 6.79e-01 0.0413 0.0998 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 5.67e-01 0.042 0.0734 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 1.31e-01 0.118 0.0779 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 2.27e-03 0.204 0.066 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 4.15e-01 0.0833 0.102 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 3.77e-01 0.0801 0.0904 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0273 0.0951 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 2.24e-01 0.116 0.0953 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 9.07e-02 0.138 0.0811 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 7.90e-01 0.0244 0.0917 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 1.02e-02 0.212 0.0816 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 9.03e-01 0.011 0.0904 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 5.35e-01 0.0495 0.0796 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 1.04e-01 -0.147 0.0899 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 6.90e-01 0.0399 0.1 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 5.59e-01 0.0561 0.0958 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 2.59e-02 0.181 0.0808 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 1.18e-01 0.141 0.0896 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 2.73e-01 0.0777 0.0707 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 5.33e-02 -0.177 0.0911 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 8.55e-02 0.123 0.0713 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 2.28e-01 0.1 0.0829 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0899 0.0921 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 5.50e-01 0.0499 0.0833 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 7.84e-01 0.0232 0.0843 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 4.76e-01 -0.058 0.0812 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 4.64e-01 0.0493 0.0673 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 4.39e-01 0.0784 0.101 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 7.17e-01 0.0283 0.0781 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 4.77e-01 0.0731 0.103 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0721 0.103 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 3.91e-01 0.0796 0.0926 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 4.97e-01 0.0665 0.0977 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 2.09e-01 0.126 0.1 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 8.21e-01 0.0183 0.0808 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00358 0.103 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 2.66e-01 0.0981 0.0879 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 3.80e-02 0.206 0.0985 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 8.33e-01 0.0221 0.105 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 8.64e-01 0.0149 0.0869 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0699 0.0988 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 7.74e-01 0.0293 0.102 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 2.95e-01 0.0912 0.087 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0977 0.102 0.264 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 4.55e-01 0.065 0.0868 0.264 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -937266 sc-eQTL 5.31e-01 0.0497 0.0792 0.264 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 2.25e-01 0.121 0.0995 0.264 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000398 0.0968 0.264 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 1.03e-01 -0.139 0.0846 0.264 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0452 0.0975 0.264 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 8.82e-02 0.145 0.0847 0.264 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 1.50e-01 -0.149 0.103 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 8.02e-01 0.025 0.0994 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 7.58e-01 0.0315 0.102 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 2.37e-01 -0.127 0.107 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 5.19e-01 0.0567 0.0878 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00572 0.089 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 1.91e-01 0.111 0.0849 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0105 0.0971 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 4.84e-01 0.0592 0.0845 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 1.50e-01 0.126 0.0872 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0282 0.0893 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 8.96e-01 0.0103 0.0784 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 4.55e-02 0.181 0.0898 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 1.70e-03 0.196 0.0618 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 6.62e-01 0.0466 0.107 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 1.56e-01 0.134 0.094 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0723 0.0992 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 7.70e-01 0.0306 0.105 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00933 0.0856 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 7.19e-02 -0.176 0.0975 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 2.60e-01 0.0997 0.0882 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0417 0.0903 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0622 0.0926 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 4.26e-01 0.0731 0.0916 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 9.23e-01 0.00923 0.095 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0874 0.082 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0259 0.0944 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 6.75e-02 0.12 0.0653 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 1.21e-01 0.195 0.125 0.263 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0512 0.113 0.263 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 1.10e-01 -0.201 0.124 0.263 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0594 0.119 0.263 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 2.53e-01 -0.129 0.112 0.263 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 3.49e-01 -0.109 0.116 0.263 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0447 0.121 0.263 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 2.59e-01 0.113 0.1 0.263 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 5.99e-01 0.0373 0.0706 0.263 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 1.45e-01 -0.137 0.0938 0.263 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 7.50e-01 0.0268 0.084 0.263 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -937266 sc-eQTL 5.16e-01 0.0445 0.0685 0.263 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 9.73e-01 0.00274 0.0809 0.263 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 1.47e-01 0.141 0.0971 0.263 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 5.31e-01 0.0599 0.0954 0.263 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0822 0.0944 0.263 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0631 0.0589 0.263 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0453 0.0971 0.263 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0943 0.0914 0.263 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 6.37e-01 0.0458 0.097 0.263 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 9.52e-01 0.00528 0.0868 0.263 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0513 0.0894 0.263 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 6.59e-01 0.0423 0.0957 0.263 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 8.39e-02 0.127 0.0729 0.263 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 5.30e-02 -0.186 0.0954 0.261 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0279 0.104 0.261 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 4.06e-01 0.0878 0.105 0.261 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 9.27e-01 0.00934 0.102 0.261 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00525 0.0908 0.261 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 2.30e-01 0.102 0.0848 0.261 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0374 0.0977 0.261 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 1.04e-02 0.212 0.0817 0.261 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0729 0.0952 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 1.87e-02 0.175 0.074 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0156 0.0823 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 9.04e-02 0.147 0.0861 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0635 0.066 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 6.53e-02 -0.166 0.0893 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 5.80e-02 0.145 0.0762 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 8.46e-04 0.18 0.0531 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 7.37e-01 0.0325 0.0967 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 2.15e-01 0.105 0.0844 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 6.92e-01 0.0371 0.0934 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 3.10e-01 0.0935 0.0919 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 1.19e-01 -0.107 0.0687 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 5.95e-01 0.052 0.0976 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 8.19e-01 0.0205 0.0894 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 1.92e-04 0.234 0.0615 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 1.34e-01 0.183 0.121 0.261 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 6.09e-01 0.0479 0.0935 0.261 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -937266 sc-eQTL 1.14e-02 0.233 0.0908 0.261 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 8.86e-02 -0.197 0.115 0.261 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 2.53e-01 0.142 0.124 0.261 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 1.90e-01 0.154 0.117 0.261 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 2.20e-01 0.141 0.115 0.261 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0412 0.1 0.261 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 9.79e-01 0.0028 0.104 0.267 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 8.60e-01 0.0178 0.101 0.267 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0589 0.106 0.267 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0694 0.0986 0.267 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 1.35e-01 -0.127 0.0845 0.267 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 1.35e-01 -0.153 0.102 0.267 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 1.57e-01 0.13 0.0915 0.267 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 1.08e-03 0.212 0.0639 0.267 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 7.32e-01 0.0333 0.0969 0.265 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 6.91e-01 0.0372 0.0935 0.265 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0259 0.102 0.265 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 8.94e-01 0.0135 0.101 0.265 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 1.00e-01 0.106 0.064 0.265 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0144 0.101 0.265 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 3.77e-01 0.0845 0.0955 0.265 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 3.25e-01 0.0837 0.0849 0.265 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 2.66e-01 0.119 0.106 0.277 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 2.08e-01 0.131 0.103 0.277 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 3.64e-01 0.0989 0.109 0.277 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 4.75e-01 0.0769 0.107 0.277 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 7.30e-01 0.0358 0.103 0.277 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 1.01e-01 -0.182 0.11 0.277 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 2.47e-01 0.108 0.0932 0.277 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 2.77e-01 0.1 0.092 0.277 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 9.25e-02 0.16 0.0945 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 6.31e-01 0.0483 0.1 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0238 0.0886 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 1.38e-02 -0.249 0.1 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 7.19e-01 0.034 0.0943 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00394 0.0608 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 3.75e-01 0.0753 0.0847 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 5.94e-01 0.0451 0.0844 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0688 0.0581 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 7.11e-01 0.0332 0.0894 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 9.88e-02 0.149 0.0902 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 4.93e-02 0.146 0.074 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0267 0.0971 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -697590 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00996 0.0862 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 4.23e-01 -0.059 0.0735 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0359 0.0767 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 5.17e-01 0.0613 0.0946 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0477 0.0522 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0883 0.0871 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 5.64e-03 0.19 0.0679 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00837 0.0746 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 4.74e-02 0.16 0.0805 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0854 0.061 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 2.03e-01 -0.106 0.0832 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 6.45e-02 0.139 0.0748 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 5.67e-05 0.205 0.0498 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0415 0.0989 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 5.24e-01 0.0586 0.0917 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0859 0.0905 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0221 0.101 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 5.60e-01 0.0342 0.0585 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 1.88e-01 -0.128 0.0969 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -363596 sc-eQTL 3.69e-02 0.173 0.0822 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 2.05e-02 0.153 0.0654 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -363860 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0207 0.0898 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 203329 sc-eQTL 5.33e-01 0.0522 0.0837 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -619634 sc-eQTL 1.24e-01 0.11 0.0713 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -219742 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00764 0.0813 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 705309 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0312 0.0713 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 393898 sc-eQTL 2.34e-01 0.0954 0.0799 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 sc-eQTL 1.89e-03 0.181 0.0575 0.263 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028203 VEZT -363860 eQTL 0.0306 0.0355 0.0164 0.0 0.0 0.233
ENSG00000111142 METAP2 -619634 pQTL 0.0232 -0.0319 0.014 0.0 0.0 0.238
ENSG00000180263 FGD6 -363596 eQTL 3.58e-07 0.113 0.0221 0.0248 0.0211 0.233
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 eQTL 5.58e-14 0.153 0.0201 0.0 0.0 0.233
ENSG00000278916 CEP83-DT 393883 eQTL 0.0258 0.091 0.0407 0.00113 0.0 0.233

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000180263 FGD6 -363596 1.32e-06 8.33e-07 1.55e-07 3.81e-07 9.23e-08 3.32e-07 6.33e-07 1.62e-07 7.08e-07 2.87e-07 1.08e-06 5.22e-07 1.33e-06 2.1e-07 3.15e-07 3.57e-07 6.67e-07 5.02e-07 2.65e-07 2.78e-07 2.52e-07 5.5e-07 4.01e-07 2.27e-07 1.36e-06 2.56e-07 4.34e-07 4.06e-07 5.42e-07 8.4e-07 4.32e-07 3.8e-08 9.36e-08 2.08e-07 3.41e-07 3.1e-07 1.45e-07 1.02e-07 6.66e-08 1.58e-08 1.03e-07 8.45e-07 6.68e-08 1.25e-08 1.93e-07 4.18e-08 1.24e-07 5.79e-08 6.04e-08
ENSG00000184752 NDUFA12 -149862 4.54e-06 3.92e-06 4.64e-07 1.93e-06 6.1e-07 8.02e-07 2.43e-06 7.94e-07 2.35e-06 1.12e-06 3.25e-06 1.86e-06 5.38e-06 1.24e-06 9.19e-07 2.06e-06 1.74e-06 2.12e-06 1.37e-06 1.28e-06 1.28e-06 3.35e-06 2.71e-06 1.01e-06 4.32e-06 1.09e-06 1.44e-06 1.76e-06 2.76e-06 2.88e-06 1.91e-06 4.33e-07 6.46e-07 1.25e-06 1.72e-06 9.02e-07 7.7e-07 4.75e-07 1.17e-06 3.98e-07 1.52e-07 4.14e-06 5.42e-07 1.87e-07 3.27e-07 3.65e-07 6.27e-07 1.82e-07 2.32e-07
ENSG00000236349 \N 305645 1.31e-06 9.15e-07 3.02e-07 5.92e-07 2.33e-07 4.63e-07 1.07e-06 2.88e-07 1.13e-06 3.24e-07 1.4e-06 5.86e-07 1.99e-06 2.57e-07 4.6e-07 6.57e-07 7.93e-07 5.5e-07 3.71e-07 6.26e-07 2.83e-07 1.01e-06 6.93e-07 4.79e-07 1.93e-06 2.8e-07 6.37e-07 6.46e-07 9.32e-07 1.08e-06 5.66e-07 1.72e-07 2.34e-07 4.04e-07 4.31e-07 4.67e-07 3.81e-07 1.5e-07 1.61e-07 4.15e-08 1.93e-07 1.5e-06 5.81e-08 4.16e-08 1.87e-07 8.76e-08 1.58e-07 8.31e-08 6.51e-08