logo

Genes within 1Mb (chr12:94834510:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 4.22e-02 0.163 0.0797 0.276 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 3.63e-01 0.086 0.0944 0.276 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 5.61e-01 0.0412 0.0708 0.276 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 1.62e-01 -0.125 0.089 0.276 B L1
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00515 0.0816 0.276 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00264 0.0536 0.276 B L1
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 7.25e-01 0.0238 0.0676 0.276 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 4.71e-01 0.059 0.0817 0.276 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0336 0.0389 0.276 B L1
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 4.37e-01 -0.052 0.0668 0.276 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 4.39e-01 0.0449 0.058 0.276 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 1.51e-01 0.0927 0.0643 0.276 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 3.16e-01 0.0885 0.0881 0.276 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 5.59e-01 0.0332 0.0568 0.276 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 7.37e-02 0.106 0.0591 0.276 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 4.12e-03 0.177 0.0612 0.276 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 8.93e-01 0.0107 0.0795 0.276 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 7.65e-01 0.016 0.0534 0.276 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 7.16e-01 0.0247 0.068 0.276 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0527 0.0864 0.276 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 8.46e-01 0.015 0.0774 0.276 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 1.01e-01 0.12 0.0731 0.276 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00123 0.0687 0.276 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 2.92e-01 0.0593 0.0561 0.276 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 2.51e-01 -0.109 0.0946 0.275 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 3.22e-01 0.0995 0.1 0.275 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 4.17e-01 0.0809 0.0994 0.275 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 9.08e-01 0.0112 0.0965 0.275 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00453 0.09 0.275 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 9.21e-01 -0.008 0.0802 0.275 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0166 0.0893 0.275 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 1.16e-02 0.188 0.074 0.275 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 1.23e-01 -0.134 0.0864 0.276 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 1.20e-02 0.168 0.0665 0.276 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0139 0.0692 0.276 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 1.28e-01 0.125 0.082 0.276 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0582 0.0559 0.276 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 1.56e-01 -0.117 0.0824 0.276 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 2.28e-01 0.0889 0.0734 0.276 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 3.23e-04 0.188 0.0513 0.276 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0375 0.0871 0.277 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 8.55e-01 0.015 0.0822 0.277 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 1.25e-01 0.106 0.0686 0.277 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0884 0.0814 0.277 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 9.38e-01 0.00526 0.0673 0.277 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 8.38e-02 0.132 0.0759 0.277 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 1.43e-02 0.137 0.0556 0.277 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 2.33e-01 -0.117 0.0981 0.276 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 5.30e-01 0.0526 0.0837 0.276 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -956642 sc-eQTL 2.95e-01 0.0776 0.0739 0.276 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 6.16e-01 0.0384 0.0764 0.276 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 2.93e-01 0.1 0.0952 0.276 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 9.13e-01 0.00846 0.0775 0.276 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 9.83e-01 0.00183 0.0872 0.276 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 6.76e-02 0.0885 0.0482 0.276 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00741 0.107 0.288 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0933 0.0912 0.288 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0752 0.112 0.288 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 4.57e-01 0.0799 0.107 0.288 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0493 0.0817 0.288 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0211 0.0864 0.288 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 5.56e-02 0.205 0.106 0.288 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 2.88e-01 0.0804 0.0755 0.288 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0335 0.0947 0.288 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 3.31e-01 0.0951 0.0976 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 1.60e-01 0.139 0.0985 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0211 0.0903 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 1.77e-01 -0.134 0.0986 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 2.04e-01 0.129 0.101 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 8.49e-01 0.0159 0.0833 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 6.09e-01 0.0472 0.0923 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0569 0.0905 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0871 0.0747 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 5.68e-01 0.0583 0.102 0.276 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 7.55e-01 0.0323 0.103 0.276 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 9.68e-01 0.00399 0.0989 0.276 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 3.56e-02 -0.223 0.105 0.276 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 3.23e-01 0.0936 0.0945 0.276 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 8.98e-01 0.0103 0.0801 0.276 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 7.75e-01 0.0267 0.0934 0.276 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 1.68e-01 0.13 0.0938 0.276 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0443 0.0758 0.276 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 2.27e-01 0.116 0.0958 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0163 0.0972 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 3.11e-02 0.175 0.0808 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 3.53e-01 0.0926 0.0995 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0384 0.0983 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 4.11e-01 0.068 0.0824 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0494 0.0852 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 9.35e-01 0.00764 0.0934 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 1.54e-01 -0.0776 0.0542 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 1.93e-01 -0.135 0.103 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 1.30e-03 0.301 0.0923 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0297 0.0957 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0957 0.105 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 6.06e-01 0.0494 0.0956 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0913 0.0883 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 4.97e-01 0.0636 0.0934 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 4.46e-01 0.0598 0.0783 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0537 0.0769 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0466 0.101 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 7.90e-01 0.0282 0.106 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 1.17e-01 0.166 0.105 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 5.70e-01 0.0478 0.084 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 2.20e-01 0.116 0.0941 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 8.58e-01 0.0172 0.0965 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 1.96e-01 0.112 0.0866 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0465 0.0759 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 5.01e-01 0.0443 0.0658 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 1.43e-01 0.118 0.0799 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 4.96e-01 0.0631 0.0924 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 7.84e-01 0.0173 0.063 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 3.97e-01 0.0577 0.068 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 8.65e-03 0.153 0.0576 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0125 0.0796 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 8.29e-01 0.0161 0.0746 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 4.52e-01 0.0653 0.0867 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 6.56e-01 0.045 0.101 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 7.55e-01 0.0232 0.0743 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 1.67e-01 0.109 0.0789 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 8.83e-03 0.177 0.0671 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 2.92e-01 0.109 0.103 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 5.14e-01 0.0596 0.0912 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 9.99e-01 9.31e-05 0.0959 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 2.71e-01 0.106 0.0961 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 1.16e-01 0.129 0.0818 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 5.66e-01 0.0531 0.0923 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 5.19e-02 0.162 0.0828 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 7.27e-01 0.0319 0.0912 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 4.94e-01 0.055 0.0803 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 1.71e-01 -0.125 0.0908 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00728 0.101 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 5.28e-01 0.061 0.0966 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 2.97e-02 0.179 0.0816 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 1.27e-01 0.138 0.0904 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 5.45e-01 0.0433 0.0715 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 8.61e-02 -0.158 0.0918 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 1.55e-01 0.103 0.0718 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 2.53e-01 0.0955 0.0834 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0683 0.0926 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 6.23e-01 0.0413 0.0837 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 7.99e-01 0.0216 0.0847 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0467 0.0817 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 4.24e-01 0.0541 0.0676 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 3.68e-01 0.0914 0.101 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 8.51e-01 0.0147 0.0783 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 5.20e-01 0.0663 0.103 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0865 0.103 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 2.29e-01 0.112 0.0926 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 9.05e-01 0.0118 0.098 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 9.26e-02 0.169 0.0999 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 9.27e-01 0.00739 0.081 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 9.67e-01 0.00426 0.103 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 1.75e-01 0.12 0.088 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 2.47e-02 0.223 0.0986 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 7.35e-01 0.0356 0.105 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 7.07e-01 0.0329 0.0872 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0469 0.0993 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 9.47e-01 0.00685 0.102 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 7.33e-01 0.0299 0.0875 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 2.94e-01 -0.108 0.103 0.277 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 3.79e-01 0.0767 0.0869 0.277 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -956642 sc-eQTL 4.56e-01 0.0593 0.0793 0.277 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 2.45e-01 0.116 0.0997 0.277 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 8.05e-01 0.024 0.097 0.277 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 1.37e-01 -0.127 0.0849 0.277 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0672 0.0976 0.277 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 9.22e-02 0.144 0.0849 0.277 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 3.16e-01 -0.104 0.103 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0168 0.0993 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 9.46e-01 0.00694 0.102 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 2.54e-01 -0.122 0.107 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00252 0.0878 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000675 0.0889 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 4.56e-01 0.0635 0.0851 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00335 0.0977 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 4.78e-01 0.0605 0.085 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 1.29e-01 0.134 0.0877 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 7.81e-01 -0.025 0.0898 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 6.36e-01 0.0374 0.0789 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 1.99e-02 0.211 0.0901 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 3.77e-03 0.183 0.0624 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 8.73e-01 0.0172 0.107 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 1.67e-01 0.131 0.0947 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0237 0.1 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 7.31e-01 0.0363 0.105 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 6.70e-01 0.0368 0.0862 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 1.04e-01 -0.161 0.0983 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 8.56e-01 0.0162 0.0891 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0423 0.0907 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0623 0.0929 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 4.57e-01 0.0686 0.092 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 9.93e-01 0.00083 0.0953 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0598 0.0824 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 8.98e-01 0.0121 0.0947 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 2.78e-01 0.0716 0.0659 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 1.60e-01 0.179 0.126 0.27 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0579 0.115 0.27 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 6.51e-02 -0.234 0.125 0.27 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 5.04e-01 -0.081 0.121 0.27 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 2.00e-01 -0.146 0.113 0.27 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0343 0.118 0.27 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00217 0.122 0.27 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 4.65e-01 0.0744 0.102 0.27 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 7.93e-01 0.0188 0.0715 0.27 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 9.59e-02 -0.158 0.0944 0.276 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 4.80e-01 0.0598 0.0846 0.276 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -956642 sc-eQTL 6.84e-01 0.0282 0.0691 0.276 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 6.51e-01 0.0369 0.0816 0.276 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 4.76e-02 0.194 0.0975 0.276 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 1.58e-01 0.136 0.0959 0.276 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 3.45e-01 -0.09 0.0952 0.276 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0527 0.0595 0.276 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0746 0.0978 0.276 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 4.30e-01 -0.073 0.0923 0.276 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 4.05e-01 0.0815 0.0976 0.276 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00394 0.0875 0.276 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0411 0.0901 0.276 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 4.13e-01 0.0791 0.0963 0.276 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 1.99e-01 0.095 0.0737 0.276 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 7.81e-02 -0.172 0.0968 0.276 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0284 0.105 0.276 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 4.11e-01 0.0881 0.107 0.276 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 8.49e-01 0.0196 0.103 0.276 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0171 0.0919 0.276 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 2.91e-01 0.0909 0.086 0.276 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0374 0.099 0.276 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 2.97e-02 0.182 0.0832 0.276 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0854 0.0957 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 5.80e-03 0.206 0.074 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 6.54e-01 0.0371 0.0827 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 6.27e-02 0.162 0.0865 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0559 0.0664 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 1.26e-01 -0.138 0.0901 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 1.27e-01 0.118 0.0769 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 2.45e-03 0.165 0.0537 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0165 0.0975 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 2.39e-01 0.1 0.0851 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 8.65e-01 0.0161 0.0942 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 3.54e-01 0.086 0.0927 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 1.06e-01 -0.112 0.0692 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 4.25e-01 0.0786 0.0983 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 9.36e-01 0.00721 0.0901 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 9.76e-04 0.209 0.0625 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 2.54e-01 0.14 0.122 0.273 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 6.61e-01 0.0412 0.094 0.273 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -956642 sc-eQTL 1.86e-02 0.218 0.0915 0.273 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 6.06e-02 -0.218 0.115 0.273 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 2.00e-01 0.16 0.124 0.273 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 9.36e-02 0.198 0.117 0.273 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 2.30e-01 0.139 0.115 0.273 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0457 0.101 0.273 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0225 0.105 0.28 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 7.65e-01 0.0303 0.101 0.28 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 3.24e-01 -0.105 0.106 0.28 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0709 0.0993 0.28 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0803 0.0854 0.28 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 1.32e-01 -0.155 0.103 0.28 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 1.92e-01 0.121 0.0922 0.28 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 1.37e-02 0.162 0.0651 0.28 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 7.40e-01 0.0326 0.098 0.278 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 6.96e-01 0.0371 0.0946 0.278 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 9.09e-01 0.0117 0.103 0.278 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 6.76e-01 0.0428 0.102 0.278 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 1.01e-01 0.107 0.0647 0.278 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0267 0.102 0.278 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 7.56e-01 0.0302 0.0968 0.278 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 3.77e-01 0.0761 0.0859 0.278 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 2.77e-01 0.118 0.108 0.294 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 2.65e-01 0.117 0.105 0.294 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 2.73e-01 0.121 0.11 0.294 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 5.07e-01 0.0724 0.109 0.294 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 6.11e-01 0.0534 0.105 0.294 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 4.88e-02 -0.221 0.111 0.294 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 3.66e-01 0.0857 0.0946 0.294 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 3.41e-01 0.0889 0.0932 0.294 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 2.12e-01 0.121 0.0964 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 4.84e-01 0.0715 0.102 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0026 0.0901 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 1.52e-02 -0.25 0.102 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 5.17e-01 0.0621 0.0958 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0272 0.0618 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 2.74e-01 0.0943 0.086 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 4.25e-01 0.0685 0.0857 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0726 0.059 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 8.52e-01 0.017 0.091 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 2.30e-01 0.111 0.092 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 6.10e-02 0.142 0.0753 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00207 0.0988 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -716966 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00923 0.0876 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 9.97e-01 0.000322 0.0749 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0231 0.0781 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 3.54e-01 0.0893 0.0961 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0688 0.053 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 1.58e-01 -0.124 0.0874 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 2.87e-03 0.206 0.0681 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 8.46e-01 0.0146 0.0751 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 3.74e-02 0.169 0.0809 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 1.73e-01 -0.084 0.0614 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 3.79e-01 -0.074 0.0839 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 1.35e-01 0.113 0.0755 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 3.60e-04 0.183 0.0506 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 5.89e-01 -0.054 0.0997 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 5.55e-01 0.0546 0.0924 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0732 0.0912 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00993 0.102 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 4.39e-01 0.0457 0.0589 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 1.16e-01 -0.154 0.0975 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -382972 sc-eQTL 1.16e-01 0.131 0.0832 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 6.92e-02 0.121 0.0662 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -383236 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0187 0.0903 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 183953 sc-eQTL 6.01e-01 0.0441 0.0842 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -639010 sc-eQTL 8.74e-02 0.123 0.0716 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -239118 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000195 0.0817 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 685933 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00219 0.0717 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 374522 sc-eQTL 9.04e-02 0.136 0.0801 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 sc-eQTL 1.07e-02 0.15 0.0583 0.276 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111142 METAP2 -639010 pQTL 0.0355 -0.0295 0.014 0.0 0.0 0.249
ENSG00000180263 FGD6 -382972 eQTL 1.58e-06 0.106 0.022 0.00442 0.0039 0.246
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 eQTL 1.34e-15 0.162 0.0199 0.00254 0.0 0.246
ENSG00000278916 CEP83-DT 374507 eQTL 0.0292 0.0887 0.0406 0.00107 0.0 0.246

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074527 \N -956642 1.31e-06 9.34e-07 2.56e-07 3.2e-07 2.28e-07 4.12e-07 1.08e-06 2.64e-07 1.08e-06 3.82e-07 1.35e-06 5.86e-07 1.75e-06 2.96e-07 5.58e-07 5.81e-07 8.37e-07 5.36e-07 8.35e-07 6.25e-07 7.95e-07 1.04e-06 7.78e-07 5.98e-07 1.59e-06 2.9e-07 6.16e-07 5.61e-07 7.61e-07 1.22e-06 5.77e-07 1.88e-07 2.85e-07 3.28e-07 3e-07 3.95e-07 6.86e-07 3.38e-07 3.48e-07 1.92e-07 1.85e-07 1.12e-06 4.9e-07 1.93e-07 2.62e-07 2.14e-07 2.17e-07 2.19e-07 1.9e-07
ENSG00000180263 FGD6 -382972 4.46e-06 5.32e-06 7.43e-07 2.76e-06 1.71e-06 1.56e-06 5.13e-06 1.05e-06 4.91e-06 2.78e-06 6.99e-06 2.98e-06 8.17e-06 2.66e-06 1.03e-06 3.74e-06 2.94e-06 3.79e-06 1.44e-06 1.14e-06 2.89e-06 5.09e-06 4.73e-06 1.71e-06 5.99e-06 1.81e-06 2.35e-06 1.53e-06 4.48e-06 4.6e-06 2.73e-06 4.44e-07 7.26e-07 1.71e-06 2.03e-06 1.17e-06 1.23e-06 1.14e-06 9.13e-07 5.33e-07 4.59e-07 7e-06 2.39e-06 1.33e-07 8.03e-07 8.98e-07 1.01e-06 7.8e-07 6.14e-07
ENSG00000184752 NDUFA12 -169238 1.11e-05 1.55e-05 2.53e-06 7.89e-06 2.48e-06 6.12e-06 1.64e-05 2.9e-06 1.45e-05 6.86e-06 1.88e-05 7.68e-06 2.44e-05 6.39e-06 4.5e-06 9e-06 8.12e-06 1.04e-05 3.63e-06 3.2e-06 7.18e-06 1.32e-05 1.31e-05 4.37e-06 2.1e-05 4.71e-06 7.46e-06 5.79e-06 1.33e-05 1.15e-05 1.03e-05 9.64e-07 1.33e-06 3.59e-06 6.33e-06 2.85e-06 1.79e-06 2.38e-06 2.42e-06 1.41e-06 1.1e-06 1.92e-05 2.7e-06 2.52e-07 9.39e-07 2.34e-06 2.18e-06 1.26e-06 6.33e-07
ENSG00000236349 \N 286269 5.77e-06 9.64e-06 1.23e-06 4.03e-06 2.17e-06 3.53e-06 9.72e-06 1.69e-06 6.96e-06 4.62e-06 1.06e-05 5.31e-06 1.2e-05 3.77e-06 2.45e-06 5.83e-06 4.36e-06 4.4e-06 2.56e-06 2.23e-06 4.96e-06 7.89e-06 6.79e-06 2.83e-06 9.94e-06 2.45e-06 4.34e-06 3.11e-06 6.87e-06 7.71e-06 4.81e-06 8.91e-07 1.1e-06 2.53e-06 3.31e-06 2.1e-06 1.76e-06 1.83e-06 1.6e-06 9.55e-07 8.23e-07 1.15e-05 2.66e-06 1.92e-07 6.86e-07 1.68e-06 1.28e-06 6.17e-07 4.77e-07