logo

Genes within 1Mb (chr12:94820993:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0982 0.0961 0.16 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 9.90e-03 -0.29 0.111 0.16 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 2.93e-01 -0.089 0.0845 0.16 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 2.95e-01 0.112 0.107 0.16 B L1
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 4.53e-01 0.0733 0.0975 0.16 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00846 0.0641 0.16 B L1
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 4.33e-02 -0.163 0.0802 0.16 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0427 0.0979 0.16 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0608 0.0465 0.16 B L1
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0337 0.08 0.16 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 4.48e-02 -0.139 0.0688 0.16 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0444 0.0773 0.16 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00809 0.106 0.16 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0123 0.068 0.16 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 4.76e-01 0.0508 0.0711 0.16 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 4.09e-02 -0.152 0.0739 0.16 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 3.50e-01 0.0912 0.0974 0.16 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0752 0.0654 0.16 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 7.39e-01 0.0278 0.0834 0.16 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0655 0.106 0.16 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0338 0.095 0.16 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 4.43e-01 0.0693 0.0902 0.16 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 2.50e-01 0.097 0.0841 0.16 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 9.46e-01 0.00465 0.0691 0.16 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 2.17e-01 0.142 0.115 0.162 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 1.47e-01 -0.177 0.122 0.162 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 2.30e-01 0.145 0.121 0.162 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 2.93e-01 -0.123 0.117 0.162 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 9.52e-01 0.00663 0.109 0.162 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0146 0.0974 0.162 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 1.37e-01 -0.161 0.108 0.162 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 7.09e-02 -0.165 0.0906 0.162 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 9.12e-01 0.0116 0.105 0.16 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 2.74e-01 0.0894 0.0815 0.16 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0158 0.0837 0.16 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 1.28e-01 -0.152 0.0992 0.16 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0475 0.0677 0.16 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 4.81e-01 0.0706 0.1 0.16 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 2.09e-01 -0.112 0.0888 0.16 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 2.11e-04 -0.234 0.062 0.16 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 6.46e-01 0.0483 0.105 0.161 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 9.83e-01 0.00217 0.0992 0.161 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 3.06e-01 0.0852 0.083 0.161 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0674 0.0984 0.161 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0848 0.081 0.161 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 1.37e-01 -0.137 0.0918 0.161 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 7.44e-02 -0.121 0.0676 0.161 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 4.30e-02 -0.235 0.115 0.16 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 1.25e-01 -0.152 0.0987 0.16 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -970159 sc-eQTL 2.38e-01 -0.104 0.0875 0.16 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 3.95e-01 0.0771 0.0904 0.16 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 1.88e-01 0.149 0.113 0.16 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 3.02e-01 0.0948 0.0916 0.16 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 9.11e-01 0.0116 0.103 0.16 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 6.26e-03 -0.156 0.0565 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0798 0.135 0.153 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 4.31e-02 -0.232 0.114 0.153 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 3.45e-01 0.133 0.14 0.153 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 1.65e-01 -0.187 0.134 0.153 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 9.30e-01 0.00899 0.103 0.153 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0464 0.109 0.153 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0501 0.135 0.153 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0176 0.0953 0.153 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0517 0.119 0.153 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0993 0.119 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00766 0.121 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 1.63e-02 -0.263 0.108 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 4.25e-02 0.244 0.119 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0242 0.123 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 7.83e-01 -0.028 0.101 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0313 0.112 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0903 0.11 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 2.47e-02 -0.204 0.0902 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 2.61e-01 -0.136 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 7.54e-03 -0.326 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 6.07e-01 0.0606 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00161 0.126 0.162 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 5.32e-01 0.0704 0.113 0.162 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 4.28e-01 0.0756 0.0951 0.162 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 3.43e-01 0.105 0.111 0.162 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0795 0.112 0.162 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0138 0.0902 0.162 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 1.12e-01 -0.184 0.115 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 1.93e-01 -0.153 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0189 0.0986 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00869 0.12 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 4.29e-01 -0.094 0.119 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0998 0.0994 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 4.49e-01 -0.078 0.103 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0824 0.113 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 5.60e-01 0.0384 0.0657 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 1.72e-02 0.299 0.125 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 2.79e-01 -0.125 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 1.29e-01 -0.177 0.116 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0426 0.128 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0328 0.117 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 7.75e-01 0.031 0.108 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0548 0.114 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 8.63e-01 0.0166 0.0957 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00472 0.0941 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 6.97e-01 0.0492 0.126 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0901 0.132 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0349 0.132 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0329 0.105 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0833 0.118 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0724 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 2.87e-02 -0.237 0.107 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 6.59e-01 0.0397 0.09 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 1.54e-01 -0.111 0.0776 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0829 0.0951 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0142 0.11 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00455 0.0747 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 4.78e-01 0.0574 0.0807 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 3.95e-02 -0.142 0.0687 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 2.37e-01 -0.113 0.0956 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 1.69e-01 -0.123 0.0895 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0956 0.104 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 5.06e-01 0.0811 0.122 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 1.63e-01 0.125 0.0892 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0207 0.0955 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 5.73e-02 -0.156 0.0816 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 7.12e-01 0.0467 0.126 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0909 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 4.27e-01 0.0934 0.117 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 9.61e-01 0.00583 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0609 0.101 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 5.28e-01 0.0715 0.113 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0251 0.102 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 3.11e-01 0.113 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 9.69e-01 0.00389 0.0985 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 6.16e-01 0.0561 0.112 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 2.98e-01 -0.129 0.123 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 6.24e-02 -0.22 0.118 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 1.76e-01 0.137 0.101 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 5.54e-01 0.0659 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00373 0.0876 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0374 0.112 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0201 0.0876 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 4.10e-01 0.0836 0.101 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0682 0.112 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 7.00e-01 0.0392 0.102 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0659 0.103 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 5.35e-01 0.0615 0.0991 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0316 0.0821 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 2.81e-01 -0.131 0.121 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 7.84e-01 0.0257 0.0938 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 6.56e-01 0.055 0.123 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0104 0.124 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 9.54e-01 0.00643 0.111 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 3.28e-01 0.115 0.117 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 8.78e-01 0.0185 0.121 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 7.84e-02 -0.17 0.0962 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 8.13e-01 0.0317 0.134 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 4.40e-02 -0.231 0.114 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0869 0.13 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0254 0.137 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 1.63e-01 0.158 0.113 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 8.65e-01 0.0221 0.129 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 3.24e-01 -0.132 0.133 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 9.33e-01 0.0096 0.114 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 1.97e-01 -0.16 0.124 0.158 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 2.54e-02 -0.234 0.104 0.158 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -970159 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0715 0.0957 0.158 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 3.32e-01 0.117 0.12 0.158 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 3.97e-01 0.099 0.117 0.158 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 1.31e-01 0.155 0.102 0.158 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0275 0.118 0.158 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 2.65e-02 -0.228 0.102 0.158 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 9.77e-01 0.00352 0.121 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 7.96e-01 0.03 0.116 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 2.78e-01 0.129 0.119 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 3.12e-01 0.126 0.125 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 4.24e-02 -0.207 0.101 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 8.83e-02 -0.176 0.103 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0925 0.0992 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 3.54e-01 -0.109 0.117 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0491 0.102 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 4.31e-01 0.0833 0.106 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 9.52e-01 0.00653 0.108 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 9.35e-01 0.00776 0.0947 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 4.06e-02 -0.223 0.108 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 3.70e-03 -0.22 0.0748 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 3.29e-02 0.275 0.128 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 8.97e-01 0.0148 0.115 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 6.08e-02 0.226 0.12 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0602 0.127 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0312 0.104 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 3.90e-01 0.103 0.119 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 9.81e-01 0.00258 0.108 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 5.57e-01 0.0638 0.108 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 2.42e-01 0.13 0.111 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0517 0.11 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 1.03e-01 -0.185 0.113 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0148 0.0986 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 8.65e-01 0.0193 0.113 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 9.38e-01 0.00618 0.0789 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 1.84e-01 -0.195 0.146 0.156 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0881 0.132 0.156 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 7.99e-02 0.256 0.145 0.156 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0291 0.14 0.156 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 5.58e-02 0.25 0.129 0.156 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0471 0.136 0.156 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 4.02e-01 -0.118 0.141 0.156 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0651 0.117 0.156 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 5.45e-01 -0.05 0.0823 0.156 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 6.81e-01 0.0463 0.112 0.161 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0982 0.1 0.161 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -970159 sc-eQTL 8.56e-01 0.0148 0.0818 0.161 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0112 0.0966 0.161 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0573 0.116 0.161 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 3.56e-01 -0.105 0.114 0.161 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 5.85e-01 0.0617 0.113 0.161 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 1.50e-01 -0.101 0.0701 0.161 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 9.44e-01 0.00843 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 8.80e-02 0.192 0.112 0.16 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 4.40e-01 0.0924 0.119 0.16 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 4.26e-01 0.0851 0.107 0.16 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0787 0.11 0.16 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0154 0.118 0.16 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 5.58e-02 -0.172 0.0896 0.16 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 6.81e-02 0.219 0.119 0.154 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0748 0.13 0.154 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 1.83e-02 0.31 0.13 0.154 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0463 0.127 0.154 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 7.12e-01 0.0419 0.113 0.154 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0483 0.106 0.154 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 2.65e-02 -0.27 0.12 0.154 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0997 0.104 0.154 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0753 0.116 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 5.18e-01 0.0589 0.0909 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 7.68e-01 0.0295 0.0999 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 6.02e-01 -0.055 0.105 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 5.37e-01 0.0496 0.0802 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 1.90e-01 0.143 0.109 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 2.43e-01 -0.109 0.093 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 4.68e-05 -0.265 0.0637 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00619 0.119 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 3.19e-01 0.104 0.104 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 8.76e-01 0.0179 0.115 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 2.77e-01 -0.123 0.113 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0843 0.0847 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0508 0.12 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0682 0.11 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 1.45e-01 -0.114 0.0778 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 8.33e-03 -0.391 0.146 0.148 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 6.39e-01 0.0539 0.115 0.148 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -970159 sc-eQTL 3.52e-01 -0.106 0.113 0.148 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 4.69e-02 0.282 0.14 0.148 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 9.65e-02 0.252 0.151 0.148 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 5.82e-01 0.0796 0.144 0.148 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0936 0.141 0.148 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 5.74e-01 0.0691 0.123 0.148 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 9.34e-01 0.0107 0.128 0.16 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 6.76e-01 0.0519 0.124 0.16 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0415 0.13 0.16 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 9.57e-01 0.0066 0.122 0.16 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0839 0.105 0.16 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 9.59e-01 0.00657 0.126 0.16 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 4.63e-02 -0.225 0.112 0.16 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 6.46e-02 -0.149 0.0802 0.16 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 4.13e-01 0.0954 0.116 0.163 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 3.95e-01 0.0958 0.112 0.163 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0423 0.122 0.163 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 7.99e-01 -0.031 0.122 0.163 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 5.40e-02 -0.149 0.0768 0.163 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 3.89e-01 -0.104 0.121 0.163 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 9.55e-01 0.00645 0.115 0.163 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 6.89e-02 -0.186 0.102 0.163 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 3.76e-01 -0.124 0.14 0.153 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 3.48e-01 -0.128 0.136 0.153 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 7.65e-01 0.0428 0.143 0.153 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0818 0.141 0.153 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 3.30e-01 0.132 0.136 0.153 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 5.23e-01 0.0935 0.146 0.153 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 7.07e-01 0.0463 0.123 0.153 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0599 0.121 0.153 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 1.77e-01 -0.161 0.119 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 1.16e-01 -0.197 0.125 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0852 0.111 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 6.84e-02 0.232 0.127 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 7.03e-01 0.045 0.118 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0224 0.0761 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 8.43e-01 0.0211 0.106 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 2.48e-01 -0.122 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 1.28e-01 -0.111 0.0726 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 7.22e-01 0.0394 0.111 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 7.95e-02 -0.196 0.112 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 2.05e-01 -0.117 0.0921 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00419 0.12 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -730483 sc-eQTL 7.64e-01 -0.032 0.107 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0473 0.0911 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0894 0.0948 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0609 0.117 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 9.85e-01 0.00124 0.0648 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0183 0.106 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 4.19e-01 0.0683 0.0843 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 6.96e-01 0.0356 0.0911 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 2.31e-01 -0.119 0.0988 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 8.83e-01 -0.011 0.0748 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 7.93e-01 0.0268 0.102 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 1.36e-01 -0.137 0.0916 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 3.87e-04 -0.221 0.0613 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 2.97e-01 0.126 0.121 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 4.83e-01 0.0788 0.112 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0337 0.111 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 3.96e-01 -0.105 0.124 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 4.24e-02 -0.145 0.0708 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 8.74e-01 0.0188 0.119 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -396489 sc-eQTL 2.63e-01 -0.113 0.101 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 2.44e-02 -0.181 0.0799 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -396753 sc-eQTL 8.12e-01 0.0258 0.108 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 170436 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000806 0.101 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -652527 sc-eQTL 3.72e-01 0.0773 0.0864 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -252635 sc-eQTL 1.77e-01 -0.132 0.0977 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 672416 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0316 0.0861 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 361005 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0965 0.0966 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 sc-eQTL 4.97e-02 -0.139 0.0705 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111142 METAP2 -652527 eQTL 0.00877 0.0276 0.0105 0.0 0.0 0.203
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 eQTL 2.87e-06 -0.0981 0.0208 0.0 0.0 0.203

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111142 METAP2 -652527 3.02e-07 1.42e-07 5.72e-08 2.2e-07 1.03e-07 8.33e-08 1.99e-07 5.85e-08 1.5e-07 7.6e-08 1.62e-07 1.2e-07 2.05e-07 8.13e-08 5.69e-08 7.89e-08 4.31e-08 1.56e-07 7.18e-08 5.33e-08 1.27e-07 1.39e-07 1.62e-07 3.49e-08 1.98e-07 1.23e-07 1.17e-07 1.04e-07 1.34e-07 1.1e-07 1.06e-07 3.72e-08 3.68e-08 9.81e-08 3.71e-08 3.22e-08 4.62e-08 8.89e-08 6.49e-08 5.56e-08 4.47e-08 1.55e-07 5.22e-08 1.43e-08 3.07e-08 1.65e-08 8.74e-08 1.95e-09 4.8e-08
ENSG00000184752 NDUFA12 -182755 1.97e-06 2.09e-06 2.4e-07 1.48e-06 4.25e-07 7.23e-07 1.31e-06 4.33e-07 1.72e-06 7.13e-07 1.91e-06 1.29e-06 2.84e-06 7.47e-07 3.63e-07 1.03e-06 1.07e-06 1.27e-06 5.52e-07 5.47e-07 6.58e-07 1.95e-06 1.56e-06 8.71e-07 2.59e-06 9.19e-07 1.06e-06 1.01e-06 1.74e-06 1.68e-06 7.46e-07 2.42e-07 3.35e-07 9.68e-07 8.75e-07 5.24e-07 6.72e-07 3.48e-07 6.93e-07 2.17e-07 2.88e-07 2.83e-06 3.67e-07 1.75e-07 3.3e-07 2.47e-07 2.79e-07 1.16e-07 1.71e-07