logo

Genes within 1Mb (chr12:94815896:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 2.13e-01 -0.122 0.0972 0.154 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 6.34e-03 -0.311 0.113 0.154 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0993 0.0856 0.154 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 3.65e-01 0.0983 0.108 0.154 B L1
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 3.16e-01 0.0992 0.0987 0.154 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 8.42e-01 -0.013 0.065 0.154 B L1
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 7.06e-02 -0.148 0.0814 0.154 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0214 0.0992 0.154 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0646 0.0471 0.154 B L1
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0304 0.0808 0.154 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 2.13e-02 -0.161 0.0693 0.154 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0476 0.078 0.154 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0222 0.107 0.154 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 8.08e-01 0.0167 0.0686 0.154 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 4.91e-01 0.0496 0.0718 0.154 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 2.36e-02 -0.17 0.0745 0.154 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 6.14e-01 0.0496 0.0984 0.154 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0624 0.066 0.154 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 8.57e-01 0.0151 0.0842 0.154 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0363 0.107 0.154 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0366 0.0959 0.154 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 2.85e-01 0.0975 0.0909 0.154 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 2.35e-01 0.101 0.0848 0.154 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0258 0.0696 0.154 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 1.56e-01 0.165 0.115 0.155 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 1.92e-01 -0.16 0.122 0.155 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 2.72e-01 0.134 0.121 0.155 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 2.35e-01 -0.14 0.118 0.155 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 8.29e-01 0.0238 0.11 0.155 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0267 0.098 0.155 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 1.07e-01 -0.175 0.108 0.155 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 5.54e-02 -0.175 0.091 0.155 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 9.59e-01 0.0054 0.106 0.154 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 3.95e-01 0.07 0.082 0.154 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0209 0.0842 0.154 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 1.83e-01 -0.133 0.0999 0.154 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 3.47e-01 -0.064 0.068 0.154 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 3.32e-01 0.0978 0.1 0.154 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 1.38e-01 -0.133 0.0892 0.154 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 5.58e-05 -0.255 0.062 0.154 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 6.78e-01 0.0441 0.106 0.155 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 8.13e-01 0.0237 0.1 0.155 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 4.24e-01 0.0671 0.0838 0.155 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0219 0.0993 0.155 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0976 0.0816 0.155 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 2.12e-01 -0.116 0.0927 0.155 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 5.80e-02 -0.13 0.0681 0.155 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 5.76e-02 -0.223 0.117 0.154 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 1.68e-01 -0.138 0.0999 0.154 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -975256 sc-eQTL 2.59e-01 -0.1 0.0885 0.154 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 1.91e-01 0.12 0.0913 0.154 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 1.21e-01 0.177 0.114 0.154 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 2.63e-01 0.104 0.0926 0.154 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0161 0.104 0.154 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 4.44e-03 -0.164 0.057 0.154 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0784 0.136 0.151 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 5.23e-02 -0.224 0.115 0.151 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 3.74e-01 0.126 0.141 0.151 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 1.88e-01 -0.179 0.135 0.151 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 8.74e-01 0.0164 0.104 0.151 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0679 0.109 0.151 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0629 0.136 0.151 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0193 0.096 0.151 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0833 0.12 0.151 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 3.63e-01 -0.11 0.12 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0307 0.122 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 3.67e-02 -0.232 0.11 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 5.18e-02 0.237 0.121 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 9.75e-01 0.0039 0.125 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0324 0.103 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0892 0.114 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0521 0.112 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 5.39e-02 -0.178 0.0917 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 2.42e-01 -0.143 0.122 0.155 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 1.30e-02 -0.307 0.122 0.155 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 7.20e-01 0.0427 0.119 0.155 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 8.76e-01 -0.02 0.128 0.155 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 5.40e-01 0.0697 0.114 0.155 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 5.07e-01 0.0639 0.0961 0.155 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 1.65e-01 0.156 0.112 0.155 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0895 0.113 0.155 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0192 0.0911 0.155 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 5.13e-02 -0.227 0.116 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 1.34e-01 -0.177 0.118 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0482 0.0995 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0429 0.121 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0672 0.12 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0841 0.1 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 4.89e-01 -0.072 0.104 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 6.99e-01 -0.044 0.114 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 5.66e-01 0.0381 0.0663 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 1.19e-02 0.318 0.126 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 2.78e-01 -0.126 0.116 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 2.04e-01 -0.149 0.117 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0464 0.129 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0456 0.118 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 5.55e-01 0.0645 0.109 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0452 0.115 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 7.43e-01 0.0316 0.0965 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0268 0.0948 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 3.24e-01 0.126 0.127 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 4.25e-01 -0.107 0.133 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 4.49e-01 -0.102 0.134 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0539 0.106 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0962 0.119 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0565 0.122 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 9.05e-03 -0.285 0.108 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 6.34e-01 0.0433 0.0908 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 9.08e-02 -0.133 0.0781 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0842 0.0958 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0304 0.111 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 7.71e-01 0.0219 0.0753 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 4.88e-01 0.0565 0.0813 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 2.08e-02 -0.161 0.069 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 2.01e-01 -0.124 0.0965 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 1.37e-01 -0.135 0.0903 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 2.74e-01 -0.116 0.105 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 3.60e-01 0.113 0.123 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 1.64e-01 0.126 0.09 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 9.97e-01 0.000333 0.0964 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 5.03e-02 -0.162 0.0823 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 8.28e-01 0.0276 0.127 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0991 0.113 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 2.65e-01 0.132 0.118 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00523 0.119 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0244 0.102 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 6.12e-01 0.0579 0.114 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0571 0.103 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 3.78e-01 0.0994 0.113 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 7.63e-01 0.0301 0.0995 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 6.26e-01 0.0551 0.113 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 3.52e-01 -0.116 0.125 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 1.04e-01 -0.194 0.119 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 1.27e-01 0.156 0.102 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 5.59e-01 0.0657 0.112 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0472 0.0884 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 5.78e-01 -0.063 0.113 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 9.77e-01 0.00254 0.0883 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 4.93e-01 0.0702 0.102 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0501 0.113 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 7.49e-01 0.0329 0.102 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0488 0.104 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 5.58e-01 0.0585 0.0999 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0465 0.0827 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 1.23e-01 -0.189 0.122 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 6.63e-01 0.0413 0.0947 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 4.28e-01 0.0988 0.124 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 9.45e-01 0.00867 0.125 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 9.74e-01 0.00363 0.113 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 3.63e-01 0.108 0.118 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 9.56e-01 0.00671 0.122 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 9.03e-02 -0.166 0.0973 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 6.79e-01 0.0563 0.136 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 1.55e-02 -0.281 0.115 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 3.71e-01 -0.118 0.132 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0599 0.139 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 1.42e-01 0.169 0.115 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00849 0.131 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 3.60e-01 -0.124 0.135 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 9.72e-01 0.00409 0.116 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 2.36e-01 -0.149 0.125 0.152 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 2.77e-02 -0.233 0.105 0.152 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -975256 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0654 0.0967 0.152 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 1.14e-01 0.192 0.121 0.152 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 2.77e-01 0.128 0.118 0.152 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 1.10e-01 0.166 0.103 0.152 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0478 0.119 0.152 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 3.04e-02 -0.225 0.103 0.152 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00414 0.122 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 6.45e-01 0.054 0.117 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 2.24e-01 0.146 0.12 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 3.21e-01 0.125 0.126 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 1.44e-02 -0.252 0.102 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 7.64e-02 -0.185 0.104 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0451 0.1 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 3.19e-01 -0.118 0.118 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0327 0.103 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 6.25e-01 0.0522 0.107 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 5.24e-01 0.0692 0.109 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00133 0.0954 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 6.32e-02 -0.204 0.109 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 2.99e-03 -0.226 0.0753 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 4.38e-02 0.263 0.129 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 7.31e-01 0.04 0.116 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 3.23e-02 0.26 0.12 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0326 0.129 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0294 0.105 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 3.58e-01 0.111 0.12 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 9.99e-01 -9.69e-05 0.109 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 5.14e-01 0.0714 0.109 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 1.75e-01 0.152 0.112 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0428 0.111 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 9.42e-02 -0.192 0.114 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 9.82e-01 0.00221 0.0994 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 7.62e-01 0.0346 0.114 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00934 0.0796 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 2.25e-01 -0.179 0.147 0.152 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0961 0.133 0.152 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 1.31e-01 0.222 0.146 0.152 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 7.06e-01 -0.053 0.14 0.152 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 3.18e-02 0.281 0.129 0.152 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0151 0.136 0.152 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 5.36e-01 -0.088 0.142 0.152 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 7.67e-01 -0.035 0.118 0.152 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0515 0.0828 0.152 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 8.94e-01 0.0152 0.114 0.154 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 4.24e-01 -0.081 0.101 0.154 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -975256 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0107 0.0825 0.154 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0234 0.0975 0.154 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0686 0.117 0.154 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 4.34e-01 -0.09 0.115 0.154 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 6.29e-01 0.055 0.114 0.154 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0919 0.0709 0.154 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 9.87e-01 0.00192 0.121 0.154 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 6.45e-02 0.21 0.113 0.154 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 4.91e-01 0.0829 0.12 0.154 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 4.83e-01 0.0757 0.108 0.154 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0582 0.111 0.154 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0343 0.119 0.154 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 3.89e-02 -0.187 0.0902 0.154 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 3.85e-02 0.25 0.12 0.146 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 7.72e-01 -0.038 0.131 0.146 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 8.16e-03 0.35 0.131 0.146 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0624 0.128 0.146 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 5.60e-01 0.0667 0.114 0.146 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0597 0.107 0.146 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 3.17e-02 -0.264 0.122 0.146 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 3.00e-01 -0.109 0.105 0.146 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0744 0.116 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 6.17e-01 0.0458 0.0916 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 7.13e-01 0.037 0.101 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0204 0.106 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 7.90e-01 0.0216 0.0808 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 1.66e-01 0.152 0.11 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 1.86e-01 -0.124 0.0936 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 2.59e-05 -0.275 0.064 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00023 0.12 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 4.33e-01 0.0823 0.105 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 8.25e-01 0.0256 0.116 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 3.65e-01 -0.103 0.114 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0914 0.0853 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0144 0.121 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0997 0.111 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 9.10e-02 -0.133 0.0782 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 1.23e-02 -0.376 0.148 0.142 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 5.78e-01 0.0647 0.116 0.142 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -975256 sc-eQTL 2.46e-01 -0.134 0.115 0.142 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 3.31e-02 0.305 0.142 0.142 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 7.97e-02 0.269 0.152 0.142 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 6.60e-01 0.0645 0.146 0.142 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 5.07e-01 -0.095 0.143 0.142 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 7.02e-01 0.0476 0.124 0.142 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00525 0.129 0.153 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 8.25e-01 0.0276 0.125 0.153 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0218 0.131 0.153 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0197 0.123 0.153 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 5.07e-01 -0.07 0.105 0.153 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00275 0.127 0.153 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 3.45e-02 -0.24 0.113 0.153 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 2.88e-02 -0.177 0.0805 0.153 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 4.38e-01 0.0911 0.117 0.156 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 5.77e-01 0.0633 0.113 0.156 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0976 0.123 0.156 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0815 0.122 0.156 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 4.26e-02 -0.158 0.0773 0.156 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0995 0.122 0.156 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0182 0.116 0.156 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 3.77e-02 -0.214 0.102 0.156 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 4.06e-01 -0.117 0.141 0.144 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 3.33e-01 -0.133 0.137 0.144 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0231 0.144 0.144 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0875 0.142 0.144 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 3.02e-01 0.141 0.136 0.144 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 6.93e-01 0.0582 0.147 0.144 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0244 0.124 0.144 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0558 0.122 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 1.43e-01 -0.177 0.12 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 1.24e-01 -0.195 0.127 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0813 0.112 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 5.68e-02 0.245 0.128 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 5.84e-01 0.0655 0.119 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0371 0.077 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 8.88e-01 0.0152 0.108 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 2.85e-01 -0.114 0.107 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 1.39e-01 -0.109 0.0735 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 9.32e-01 0.00962 0.112 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 6.94e-02 -0.206 0.113 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 1.71e-01 -0.128 0.093 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0408 0.121 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -735580 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0193 0.108 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0318 0.0921 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0802 0.0959 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0147 0.118 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00522 0.0655 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0165 0.107 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 5.52e-01 0.0505 0.0849 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 6.33e-01 0.0439 0.0917 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 4.41e-01 -0.077 0.0996 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 6.62e-01 -0.033 0.0753 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 5.74e-01 0.0578 0.103 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 9.10e-02 -0.156 0.0921 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 1.47e-04 -0.238 0.0615 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 3.34e-01 0.117 0.121 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 6.14e-01 0.0569 0.113 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0819 0.111 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 2.12e-01 -0.155 0.124 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 3.99e-02 -0.147 0.0712 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 8.28e-01 0.026 0.12 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -401586 sc-eQTL 2.11e-01 -0.128 0.102 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 9.06e-03 -0.211 0.0801 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -401850 sc-eQTL 8.41e-01 0.0219 0.109 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 165339 sc-eQTL 8.49e-01 0.0194 0.102 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -657624 sc-eQTL 5.29e-01 0.055 0.0872 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -257732 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0848 0.0987 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 667319 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0295 0.0867 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 355908 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0705 0.0975 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 sc-eQTL 3.40e-02 -0.151 0.0709 0.155 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111142 METAP2 -657624 eQTL 0.0109 0.027 0.0106 0.0 0.0 0.201
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 eQTL 8.59e-06 -0.0942 0.0211 0.0 0.0 0.201

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111142 METAP2 -657624 2.91e-07 1.19e-07 5.14e-08 1.8e-07 9.21e-08 9.8e-08 1.49e-07 5.19e-08 1.4e-07 4.57e-08 1.6e-07 8.14e-08 1.45e-07 6.38e-08 5.99e-08 7.37e-08 3.87e-08 1.26e-07 5.97e-08 4.31e-08 1.19e-07 1.28e-07 1.34e-07 3.42e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.08e-07 9.61e-08 1.08e-07 1.02e-07 9.64e-08 2.99e-08 3.96e-08 8.68e-08 8.96e-08 3.62e-08 5.29e-08 9.61e-08 6.56e-08 3.76e-08 3.57e-08 1.36e-07 3.99e-08 1.18e-08 3.83e-08 1.99e-08 1.22e-07 3.8e-09 4.88e-08
ENSG00000180263 \N -401586 8.85e-07 2.5e-07 8.51e-08 2.54e-07 1.07e-07 1.44e-07 3.42e-07 5.84e-08 1.86e-07 1.15e-07 2.68e-07 1.59e-07 4.54e-07 8.54e-08 7.35e-08 1.13e-07 1.01e-07 2.9e-07 1.27e-07 8.41e-08 1.52e-07 2.3e-07 2e-07 4.81e-08 3.14e-07 1.86e-07 1.31e-07 1.77e-07 1.54e-07 2.26e-07 1.71e-07 7.6e-08 5.55e-08 9.98e-08 6.78e-08 5.04e-08 7.86e-08 7.25e-08 5.8e-08 8.2e-08 4.53e-08 2.8e-07 5.51e-08 1.8e-08 8.01e-08 8.24e-09 9.19e-08 0.0 4.68e-08
ENSG00000184752 NDUFA12 -187852 2.91e-06 1.58e-06 2.88e-07 1.26e-06 3.83e-07 6.95e-07 1.21e-06 3.65e-07 1.5e-06 5.86e-07 2.07e-06 8.77e-07 2.74e-06 3.34e-07 5.18e-07 9.45e-07 1.12e-06 1.13e-06 5.78e-07 5.49e-07 7.61e-07 1.98e-06 1.12e-06 5.65e-07 2.46e-06 7.38e-07 1.04e-06 8.75e-07 1.64e-06 1.3e-06 8.27e-07 2.86e-07 3.35e-07 6.89e-07 5.64e-07 4.45e-07 6.89e-07 2.39e-07 4.67e-07 2.94e-07 2.82e-07 2.5e-06 4.37e-07 1.06e-07 3.07e-07 1.97e-07 2.6e-07 3.77e-08 1.18e-07