logo

Genes within 1Mb (chr12:94812692:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 2.21e-01 -0.135 0.11 0.124 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 1.29e-03 -0.413 0.126 0.124 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 1.66e-01 -0.134 0.0967 0.124 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 9.55e-01 0.00692 0.123 0.124 B L1
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 7.38e-02 0.2 0.111 0.124 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00567 0.0735 0.124 B L1
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 1.50e-01 -0.133 0.0923 0.124 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 9.38e-01 0.00876 0.112 0.124 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 1.14e-01 -0.0844 0.0532 0.124 B L1
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 2.04e-01 -0.116 0.0915 0.124 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 1.04e-02 -0.203 0.0785 0.124 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0534 0.0887 0.124 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 2.17e-01 -0.15 0.121 0.124 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00251 0.078 0.124 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 4.12e-01 0.067 0.0816 0.124 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 1.25e-01 -0.131 0.0852 0.124 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0391 0.114 0.124 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0125 0.0764 0.124 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 6.98e-01 0.0377 0.0972 0.124 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0338 0.124 0.124 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0813 0.111 0.124 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 1.03e-01 0.171 0.105 0.124 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 6.84e-01 0.04 0.0983 0.124 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0191 0.0804 0.124 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 4.24e-01 0.105 0.132 0.124 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 2.12e-01 -0.174 0.139 0.124 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 4.42e-01 0.106 0.138 0.124 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 3.70e-01 -0.12 0.134 0.124 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 7.37e-01 0.0421 0.125 0.124 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 4.76e-01 0.0794 0.111 0.124 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 1.19e-02 -0.31 0.122 0.124 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 7.16e-02 -0.188 0.104 0.124 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 8.99e-01 0.0153 0.12 0.124 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 5.53e-01 0.0555 0.0933 0.124 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 8.13e-01 0.0227 0.0957 0.124 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 3.04e-01 -0.117 0.114 0.124 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0852 0.0772 0.124 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 4.78e-01 0.0812 0.114 0.124 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0483 0.102 0.124 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 2.18e-04 -0.267 0.0709 0.124 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 9.40e-01 0.00906 0.121 0.124 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0201 0.114 0.124 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 8.70e-01 0.0157 0.0959 0.124 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 6.70e-01 0.0485 0.114 0.124 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 1.65e-01 -0.13 0.0932 0.124 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 8.32e-02 -0.184 0.106 0.124 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 2.02e-01 -0.1 0.0782 0.124 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 9.73e-02 -0.221 0.133 0.124 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 1.41e-01 -0.168 0.113 0.124 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -978460 sc-eQTL 1.74e-01 -0.137 0.1 0.124 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 4.69e-01 0.0754 0.104 0.124 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 3.99e-01 0.11 0.13 0.124 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 3.23e-01 0.104 0.105 0.124 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 9.37e-01 0.00938 0.119 0.124 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 1.15e-03 -0.212 0.0644 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 1.77e-01 -0.219 0.161 0.115 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 3.25e-02 -0.294 0.136 0.115 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 1.12e-01 0.268 0.168 0.115 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 4.59e-01 -0.12 0.162 0.115 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 3.38e-01 0.118 0.123 0.115 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 1.01e-01 -0.214 0.13 0.115 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 4.84e-01 -0.114 0.162 0.115 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0725 0.114 0.115 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 6.64e-01 0.0624 0.143 0.115 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 3.40e-01 -0.132 0.138 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 4.45e-01 -0.107 0.14 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 5.72e-02 -0.242 0.127 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 2.23e-01 0.171 0.14 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 2.70e-01 0.158 0.143 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0187 0.118 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0649 0.131 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0789 0.128 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 8.66e-02 -0.181 0.105 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 2.55e-01 -0.159 0.139 0.125 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 2.12e-02 -0.325 0.14 0.125 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 4.04e-01 0.113 0.135 0.125 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 6.25e-01 0.0714 0.146 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 5.80e-01 0.072 0.13 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 5.25e-01 0.0698 0.11 0.125 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 4.67e-02 0.254 0.127 0.125 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000639 0.129 0.125 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0606 0.104 0.125 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 1.38e-01 -0.196 0.131 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 9.34e-02 -0.223 0.133 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 1.60e-01 -0.157 0.112 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 3.31e-01 -0.133 0.137 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0496 0.135 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0511 0.113 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0285 0.117 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 9.38e-01 -0.01 0.128 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 5.34e-01 0.0466 0.0747 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 2.74e-02 0.322 0.145 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 1.20e-01 -0.208 0.133 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 1.39e-01 -0.201 0.135 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0894 0.148 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0306 0.136 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 4.02e-01 0.105 0.125 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0406 0.132 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 1.46e-01 -0.161 0.111 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 3.33e-01 -0.106 0.109 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0288 0.145 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 2.95e-01 -0.158 0.151 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0169 0.152 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 5.67e-01 -0.069 0.12 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0972 0.135 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0949 0.138 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 2.62e-02 -0.276 0.123 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0598 0.103 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 5.31e-02 -0.172 0.0885 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0818 0.109 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 3.62e-01 -0.115 0.125 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000414 0.0855 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 4.13e-01 0.0758 0.0924 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 9.62e-02 -0.132 0.0789 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 1.41e-01 -0.162 0.11 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 1.36e-01 -0.154 0.103 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0537 0.12 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 4.54e-01 -0.105 0.14 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 3.06e-01 0.105 0.103 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0415 0.11 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 9.21e-02 -0.159 0.094 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 3.21e-01 0.143 0.144 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 4.20e-01 -0.103 0.128 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 5.66e-01 0.0771 0.134 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 6.20e-01 -0.067 0.135 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 6.23e-01 0.0567 0.115 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 2.45e-01 0.151 0.129 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0864 0.117 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0793 0.129 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 3.79e-01 0.1 0.113 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 2.76e-01 0.14 0.128 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 2.64e-01 -0.159 0.142 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 5.00e-02 -0.267 0.135 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 1.41e-01 0.171 0.116 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 8.64e-01 0.0219 0.128 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 5.07e-01 -0.067 0.101 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 3.30e-01 -0.126 0.129 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 7.23e-01 0.0358 0.101 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 2.83e-01 0.125 0.116 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0373 0.129 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 7.30e-01 0.0404 0.117 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0505 0.118 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 8.36e-01 0.0237 0.114 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0388 0.0945 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 3.60e-01 -0.13 0.142 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 9.20e-01 -0.011 0.11 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 4.72e-01 0.104 0.144 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 6.63e-01 0.0634 0.145 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 6.09e-01 0.0666 0.13 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 4.48e-01 0.104 0.137 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 2.83e-01 0.151 0.141 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 8.74e-02 -0.193 0.113 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 6.68e-01 0.0662 0.154 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 1.39e-01 -0.196 0.132 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 3.95e-01 -0.127 0.149 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0775 0.157 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 6.20e-01 0.0649 0.131 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 7.95e-01 0.0387 0.149 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 5.58e-02 -0.293 0.152 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 7.27e-01 0.0458 0.131 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 1.22e-01 -0.222 0.143 0.121 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 3.37e-02 -0.257 0.12 0.121 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -978460 sc-eQTL 2.71e-01 -0.122 0.111 0.121 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 2.46e-01 0.162 0.139 0.121 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 4.99e-01 0.0917 0.135 0.121 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 2.03e-01 0.152 0.119 0.121 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0765 0.136 0.121 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 1.33e-02 -0.294 0.118 0.121 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0416 0.14 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 4.42e-01 -0.103 0.134 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 3.78e-01 0.121 0.138 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 2.22e-01 0.177 0.144 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 1.05e-02 -0.301 0.117 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 7.25e-02 -0.215 0.119 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0974 0.115 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0815 0.135 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0359 0.118 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0365 0.122 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 3.32e-01 0.12 0.124 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0613 0.109 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 2.04e-02 -0.291 0.124 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 2.71e-02 -0.193 0.0869 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 1.83e-01 0.197 0.148 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0251 0.131 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 2.99e-02 0.299 0.137 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0331 0.146 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 3.89e-01 -0.103 0.119 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 5.85e-01 0.0746 0.137 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 9.35e-01 0.00998 0.123 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 9.93e-01 0.00103 0.124 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 1.37e-01 0.189 0.127 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 9.56e-01 0.00703 0.126 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 1.51e-01 -0.187 0.13 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 6.73e-01 0.0478 0.113 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 6.45e-01 0.0599 0.13 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00147 0.0905 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 5.35e-01 -0.11 0.177 0.107 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0895 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 2.05e-01 0.224 0.176 0.107 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 6.39e-01 0.079 0.168 0.107 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 1.47e-01 0.229 0.157 0.107 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0467 0.163 0.107 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 4.77e-01 -0.121 0.17 0.107 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 9.21e-01 -0.014 0.141 0.107 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0603 0.0992 0.107 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 7.13e-01 0.0476 0.129 0.124 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 3.81e-01 -0.101 0.115 0.124 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -978460 sc-eQTL 6.60e-01 0.0414 0.094 0.124 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0541 0.111 0.124 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 2.75e-01 -0.146 0.134 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0895 0.131 0.124 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 8.89e-01 0.0182 0.13 0.124 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 1.00e-01 -0.133 0.0806 0.124 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0753 0.137 0.124 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 6.76e-02 0.236 0.128 0.124 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 2.60e-02 0.304 0.135 0.124 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 3.63e-01 0.112 0.122 0.124 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0717 0.126 0.124 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 9.64e-01 0.00619 0.135 0.124 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0842 0.104 0.124 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 4.57e-01 0.104 0.14 0.117 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0248 0.151 0.117 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 6.63e-02 0.281 0.152 0.117 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0347 0.148 0.117 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 7.22e-01 0.047 0.132 0.117 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 9.47e-01 0.00828 0.124 0.117 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 1.51e-02 -0.343 0.14 0.117 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 4.09e-01 -0.1 0.121 0.117 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0433 0.133 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 9.15e-01 0.0111 0.104 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 1.96e-01 0.148 0.114 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0016 0.121 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 8.37e-01 -0.019 0.0919 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 2.01e-01 0.16 0.125 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0518 0.107 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 1.31e-03 -0.241 0.074 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 9.74e-01 0.00448 0.136 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 2.61e-01 0.134 0.119 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 5.63e-01 0.076 0.131 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 2.58e-01 -0.147 0.129 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 2.07e-01 -0.122 0.0967 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 8.23e-01 0.0306 0.137 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 9.45e-01 0.00864 0.126 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 2.75e-02 -0.196 0.0883 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 4.97e-02 -0.347 0.175 0.109 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 4.25e-01 0.109 0.136 0.109 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -978460 sc-eQTL 2.32e-01 -0.161 0.134 0.109 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 6.80e-02 0.307 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 1.65e-01 0.25 0.179 0.109 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 8.38e-01 -0.035 0.171 0.109 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 9.44e-01 0.0118 0.168 0.109 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 3.41e-01 0.139 0.145 0.109 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0235 0.146 0.124 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 3.39e-01 0.136 0.142 0.124 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 5.68e-01 0.0851 0.149 0.124 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0365 0.139 0.124 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0685 0.12 0.124 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 2.85e-01 -0.154 0.144 0.124 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 1.67e-01 -0.179 0.129 0.124 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 7.43e-03 -0.246 0.0909 0.124 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0261 0.135 0.124 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 8.27e-01 0.0284 0.13 0.124 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 1.39e-01 -0.209 0.141 0.124 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0755 0.14 0.124 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 5.32e-02 -0.173 0.0887 0.124 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 3.60e-01 -0.128 0.14 0.124 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 7.34e-01 0.0452 0.133 0.124 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 2.48e-02 -0.264 0.117 0.124 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 2.86e-01 -0.173 0.161 0.116 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 2.04e-01 -0.2 0.157 0.116 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 8.97e-01 0.0214 0.165 0.116 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 5.29e-01 -0.103 0.163 0.116 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 2.66e-01 0.175 0.157 0.116 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 8.73e-01 0.027 0.169 0.116 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 7.73e-01 -0.041 0.142 0.116 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0564 0.14 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 1.11e-01 -0.219 0.137 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 8.79e-02 -0.247 0.144 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0535 0.128 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 3.53e-02 0.309 0.146 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 8.13e-02 0.237 0.135 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0658 0.0878 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 5.50e-01 0.0734 0.123 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0714 0.122 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 1.47e-01 -0.122 0.0839 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 8.78e-01 0.0194 0.127 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 2.22e-02 -0.292 0.127 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 4.82e-02 -0.208 0.105 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 2.62e-01 -0.154 0.137 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -738784 sc-eQTL 7.88e-01 0.0328 0.122 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 8.68e-01 0.0174 0.104 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0391 0.109 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 2.87e-01 -0.143 0.134 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0281 0.074 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 7.91e-01 0.0323 0.122 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 8.30e-01 0.0207 0.0964 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 2.39e-01 0.122 0.104 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0808 0.113 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0723 0.0853 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 5.06e-01 0.0775 0.116 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0734 0.105 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 7.78e-04 -0.24 0.0703 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0104 0.138 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 3.27e-01 0.126 0.128 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0877 0.126 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 2.02e-01 -0.18 0.141 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 6.54e-02 -0.15 0.081 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0181 0.136 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -404790 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0663 0.116 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 3.98e-03 -0.264 0.0905 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -405054 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00998 0.125 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 162135 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00394 0.117 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -660828 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00527 0.0999 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -260936 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0322 0.113 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 664115 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0469 0.0993 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 352704 sc-eQTL 2.31e-01 -0.134 0.111 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 sc-eQTL 1.47e-01 -0.119 0.0816 0.125 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111142 METAP2 -660828 eQTL 0.0161 0.0295 0.0122 0.0 0.0 0.147
ENSG00000184752 NDUFA12 -191056 eQTL 0.00122 -0.0793 0.0245 0.0 0.0 0.147

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111142 METAP2 -660828 3.07e-07 1.3e-07 4.08e-08 2.15e-07 9.02e-08 8.33e-08 1.49e-07 5.49e-08 1.41e-07 4.57e-08 1.56e-07 7.78e-08 1.47e-07 6.76e-08 6.04e-08 7.26e-08 3.88e-08 1.21e-07 5.97e-08 4.04e-08 1.08e-07 1.23e-07 1.34e-07 4.05e-08 1.37e-07 1.16e-07 1.06e-07 9.32e-08 1.08e-07 1.12e-07 9.91e-08 2.93e-08 3.61e-08 8.25e-08 5.64e-08 3.93e-08 5.59e-08 8.93e-08 6.54e-08 3.92e-08 5.45e-08 1.33e-07 5.22e-08 1.13e-08 4.92e-08 1.84e-08 1.22e-07 3.83e-09 5e-08