logo

Genes within 1Mb (chr12:94804960:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 3.36e-01 0.124 0.128 0.092 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 2.07e-01 0.191 0.151 0.092 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 5.65e-01 0.0651 0.113 0.092 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 9.33e-01 -0.012 0.143 0.092 B L1
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00797 0.13 0.092 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0403 0.0857 0.092 B L1
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 7.60e-01 0.033 0.108 0.092 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 6.24e-01 0.0641 0.131 0.092 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0451 0.0623 0.092 B L1
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0752 0.106 0.092 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 4.23e-01 -0.074 0.0922 0.092 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 8.84e-02 0.175 0.102 0.092 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 5.26e-01 0.0891 0.14 0.092 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 9.18e-01 0.00928 0.0904 0.092 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 3.61e-01 0.0864 0.0945 0.092 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 1.26e-02 0.246 0.0978 0.092 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 1.37e-01 0.188 0.126 0.092 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 2.77e-01 0.0927 0.0851 0.092 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0828 0.108 0.092 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0662 0.138 0.092 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 9.10e-01 -0.014 0.124 0.092 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 4.70e-01 0.0849 0.117 0.092 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 1.27e-01 -0.167 0.109 0.092 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 4.39e-01 0.0695 0.0897 0.092 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 5.25e-02 -0.295 0.151 0.092 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 2.17e-01 0.199 0.161 0.092 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 2.84e-01 0.171 0.16 0.092 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 6.71e-02 0.283 0.154 0.092 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 6.63e-01 -0.063 0.145 0.092 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 2.43e-01 0.15 0.128 0.092 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0378 0.143 0.092 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 3.76e-01 0.107 0.12 0.092 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0158 0.139 0.092 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 8.64e-01 0.0186 0.108 0.092 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00512 0.111 0.092 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 9.38e-01 0.0103 0.132 0.092 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 2.56e-02 -0.199 0.0885 0.092 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 8.81e-02 -0.225 0.131 0.092 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 3.79e-01 0.104 0.118 0.092 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 4.91e-02 0.166 0.0839 0.092 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 3.59e-01 -0.129 0.141 0.092 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 3.11e-01 0.135 0.133 0.092 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0412 0.111 0.092 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0535 0.132 0.092 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 7.45e-01 0.0353 0.109 0.092 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 7.34e-01 0.042 0.124 0.092 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 2.38e-01 0.108 0.0909 0.092 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 9.44e-01 0.0111 0.157 0.092 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 2.77e-01 0.145 0.134 0.092 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -986192 sc-eQTL 5.23e-01 0.0758 0.118 0.092 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 2.71e-01 -0.135 0.122 0.092 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 2.07e-01 -0.192 0.152 0.092 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 8.29e-01 0.0268 0.124 0.092 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0237 0.139 0.092 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 5.07e-01 0.0515 0.0775 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 5.10e-01 0.117 0.177 0.092 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0136 0.151 0.092 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 1.13e-01 0.293 0.184 0.092 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 9.10e-01 0.0201 0.178 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 2.38e-01 0.16 0.135 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 9.80e-01 0.00366 0.143 0.092 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 3.33e-01 -0.172 0.178 0.092 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 3.70e-01 0.113 0.125 0.092 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 7.34e-02 -0.28 0.156 0.092 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 6.66e-01 -0.066 0.153 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 2.85e-01 0.165 0.154 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 6.67e-01 0.0607 0.141 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0605 0.155 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0197 0.158 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 6.73e-02 -0.238 0.129 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 6.00e-02 0.27 0.143 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0763 0.142 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 3.41e-01 0.112 0.117 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 6.31e-02 0.301 0.161 0.093 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 4.04e-01 -0.138 0.164 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 2.83e-01 0.169 0.157 0.093 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 4.74e-01 0.121 0.169 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 4.50e-02 0.301 0.149 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 6.29e-01 0.0616 0.127 0.093 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 2.63e-02 -0.329 0.147 0.093 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 2.09e-01 0.188 0.149 0.093 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00152 0.121 0.093 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 5.49e-01 0.0916 0.152 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 4.90e-01 0.107 0.154 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0132 0.13 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0723 0.158 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 1.44e-01 -0.228 0.155 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0247 0.131 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 4.08e-01 0.112 0.135 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 8.87e-01 0.0211 0.148 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 9.12e-01 0.00958 0.0864 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 1.03e-01 -0.271 0.165 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 1.24e-01 0.233 0.151 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0131 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 6.02e-01 0.0877 0.168 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0753 0.153 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0995 0.142 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 9.45e-01 0.0104 0.15 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0361 0.126 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 7.31e-01 0.0425 0.124 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0836 0.162 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 4.08e-01 -0.141 0.169 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 4.31e-01 0.134 0.17 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0252 0.135 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 5.63e-01 0.088 0.152 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 3.02e-01 0.16 0.155 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 5.85e-03 0.382 0.137 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 5.16e-01 -0.079 0.121 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0149 0.105 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 2.35e-01 0.152 0.128 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 6.11e-01 0.0754 0.148 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0292 0.101 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 5.54e-01 0.0647 0.109 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 2.25e-02 0.213 0.0925 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 2.12e-01 -0.161 0.129 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 1.50e-01 -0.174 0.12 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 2.51e-01 0.162 0.14 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000507 0.164 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 6.88e-01 0.0485 0.12 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 8.28e-01 -0.028 0.129 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 2.80e-02 0.242 0.109 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 1.72e-01 0.227 0.165 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0705 0.147 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0742 0.154 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0129 0.155 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 3.27e-01 0.13 0.132 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 5.94e-01 0.0793 0.149 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 6.67e-02 0.246 0.133 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 6.72e-01 0.0616 0.145 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 9.72e-02 0.212 0.127 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0172 0.145 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 8.00e-01 0.0407 0.161 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 9.96e-01 0.000722 0.154 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00306 0.131 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 7.59e-01 0.0444 0.145 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 9.49e-01 0.00731 0.114 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 2.01e-01 0.191 0.149 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 6.14e-01 -0.059 0.117 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 6.98e-01 0.0526 0.135 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0325 0.15 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 4.75e-01 -0.097 0.136 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0316 0.137 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 2.48e-01 -0.153 0.132 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 9.04e-01 0.0133 0.11 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 1.50e-01 0.232 0.16 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 1.97e-02 0.288 0.123 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 8.54e-01 0.03 0.164 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0647 0.165 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 8.63e-01 0.0255 0.148 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 4.60e-01 0.115 0.156 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 3.76e-01 -0.142 0.16 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 1.16e-01 0.202 0.128 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 7.67e-01 0.0499 0.168 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 6.43e-01 0.067 0.144 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0836 0.163 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 2.72e-01 -0.189 0.171 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 3.71e-01 0.127 0.142 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 6.38e-02 0.3 0.161 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 3.16e-01 -0.168 0.167 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 6.92e-01 0.0568 0.143 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 9.10e-01 0.0181 0.16 0.093 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 8.05e-01 0.0335 0.136 0.093 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -986192 sc-eQTL 8.81e-01 0.0185 0.124 0.093 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 1.63e-01 -0.217 0.155 0.093 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 5.17e-01 -0.098 0.151 0.093 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 6.14e-01 0.0671 0.133 0.093 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0597 0.152 0.093 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 1.06e-01 0.215 0.132 0.093 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 4.82e-02 -0.322 0.162 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 2.82e-01 0.169 0.156 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 4.95e-01 0.11 0.161 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 5.19e-01 0.109 0.169 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 4.61e-01 0.102 0.138 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0717 0.14 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 9.80e-01 0.00332 0.134 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 1.58e-01 -0.223 0.157 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 3.25e-03 0.401 0.135 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 6.49e-01 0.0649 0.142 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 8.06e-01 0.0357 0.145 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 8.26e-01 0.0281 0.128 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0413 0.147 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 1.73e-01 0.14 0.102 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 3.83e-01 -0.153 0.175 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 6.93e-01 0.0614 0.155 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 2.50e-01 -0.188 0.163 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 5.73e-01 0.0971 0.172 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 8.30e-01 0.0303 0.141 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0317 0.162 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 7.36e-01 0.049 0.145 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 6.25e-01 0.0712 0.146 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 2.98e-01 -0.155 0.149 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 5.37e-01 0.0913 0.148 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 4.76e-01 -0.109 0.153 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 8.76e-01 0.0208 0.132 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 1.51e-01 0.218 0.151 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 6.92e-01 0.0421 0.106 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0503 0.228 0.081 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 5.65e-01 -0.118 0.205 0.081 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 7.26e-01 -0.08 0.228 0.081 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 2.77e-01 0.235 0.215 0.081 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 4.49e-01 0.154 0.203 0.081 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 9.90e-01 0.00264 0.21 0.081 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 5.04e-01 -0.146 0.219 0.081 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 1.14e-01 0.287 0.18 0.081 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0256 0.128 0.081 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 9.75e-02 -0.254 0.152 0.093 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 3.49e-01 -0.128 0.136 0.093 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -986192 sc-eQTL 9.40e-01 0.00837 0.112 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 4.76e-01 0.094 0.132 0.093 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 2.81e-02 0.347 0.157 0.093 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 8.35e-01 0.0323 0.156 0.093 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0116 0.154 0.093 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0842 0.096 0.093 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 2.52e-01 -0.18 0.157 0.092 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 8.63e-01 0.0256 0.148 0.092 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 8.32e-01 0.0334 0.157 0.092 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0102 0.14 0.092 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 3.62e-02 -0.302 0.143 0.092 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 2.95e-01 0.162 0.155 0.092 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 3.01e-01 0.123 0.118 0.092 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 4.37e-03 -0.434 0.15 0.098 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 8.67e-02 0.283 0.164 0.098 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 8.25e-01 0.0372 0.169 0.098 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 3.14e-01 0.163 0.162 0.098 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 7.72e-01 0.042 0.145 0.098 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 7.45e-01 0.0443 0.136 0.098 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0241 0.156 0.098 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 3.13e-01 0.134 0.132 0.098 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 6.83e-01 0.0634 0.155 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 7.61e-01 0.0371 0.122 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 4.61e-01 0.0988 0.134 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0142 0.141 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 1.00e-01 -0.177 0.107 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 4.03e-02 -0.3 0.145 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 5.42e-01 0.0764 0.125 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 3.22e-01 0.0879 0.0886 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 4.79e-01 -0.111 0.157 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00367 0.138 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0131 0.152 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 3.16e-01 -0.15 0.149 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 3.93e-04 -0.392 0.109 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 5.96e-01 0.0842 0.159 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00156 0.145 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 2.12e-02 0.237 0.102 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0216 0.189 0.1 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 1.56e-01 0.205 0.144 0.1 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -986192 sc-eQTL 2.10e-02 0.329 0.141 0.1 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00271 0.18 0.1 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0392 0.192 0.1 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 2.08e-01 -0.229 0.181 0.1 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0106 0.178 0.1 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 4.07e-01 -0.129 0.155 0.1 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 1.46e-01 0.246 0.169 0.093 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 2.31e-01 -0.197 0.164 0.093 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 5.37e-01 -0.107 0.173 0.093 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 7.11e-01 0.0598 0.161 0.093 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 1.37e-01 -0.206 0.138 0.093 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 4.78e-01 -0.119 0.167 0.093 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 4.90e-01 0.104 0.15 0.093 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 1.65e-02 0.255 0.106 0.093 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 8.78e-01 0.0239 0.155 0.095 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 5.51e-01 0.0895 0.15 0.095 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 5.14e-01 0.107 0.163 0.095 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 2.47e-01 0.188 0.162 0.095 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 2.38e-01 0.122 0.103 0.095 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 6.82e-01 0.0662 0.162 0.095 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 7.69e-01 0.0452 0.153 0.095 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0496 0.136 0.095 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 5.63e-01 0.0965 0.166 0.105 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 6.63e-01 0.0707 0.162 0.105 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 3.70e-01 0.152 0.169 0.105 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 1.27e-02 0.415 0.165 0.105 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0154 0.161 0.105 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 2.02e-01 0.222 0.173 0.105 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 8.81e-01 0.022 0.146 0.105 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 2.91e-01 0.152 0.143 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 3.50e-01 0.145 0.155 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 6.73e-01 0.0693 0.164 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 1.32e-01 0.217 0.144 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 5.67e-01 0.0953 0.166 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 4.28e-01 0.122 0.154 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0577 0.0992 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 9.11e-01 0.0154 0.139 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 7.62e-01 0.0417 0.138 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 8.52e-01 0.0178 0.0951 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 9.92e-01 0.00148 0.145 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 1.69e-01 0.202 0.146 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00522 0.121 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 4.91e-01 -0.108 0.157 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -746516 sc-eQTL 2.53e-01 -0.159 0.139 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0561 0.119 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 3.94e-01 0.106 0.124 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0671 0.153 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0354 0.0847 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0593 0.142 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 6.39e-01 0.0527 0.112 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 6.17e-01 0.0607 0.121 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0738 0.132 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 7.79e-03 -0.263 0.0979 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 1.09e-01 -0.217 0.135 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 5.37e-01 0.0758 0.122 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 6.15e-02 0.157 0.0834 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 3.49e-01 0.152 0.162 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00429 0.151 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0172 0.149 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 3.02e-01 0.172 0.166 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00636 0.0961 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0309 0.16 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -412522 sc-eQTL 4.68e-01 0.099 0.136 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 3.58e-01 0.1 0.109 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -412786 sc-eQTL 6.71e-01 -0.062 0.146 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 154403 sc-eQTL 2.07e-01 0.172 0.136 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -668560 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0641 0.116 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0183 0.132 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 656383 sc-eQTL 8.65e-01 0.0197 0.116 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 344972 sc-eQTL 4.28e-01 0.103 0.13 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 sc-eQTL 2.08e-01 0.12 0.0953 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 eQTL 0.0226 0.0466 0.0204 0.00147 0.0 0.0785
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 eQTL 3.26e-05 0.133 0.0319 0.0 0.0 0.0785

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120798 NR2C1 -268668 1.27e-06 1.01e-06 2.91e-07 1.3e-06 2.69e-07 6.09e-07 1.64e-06 3.43e-07 1.41e-06 4.36e-07 1.76e-06 6.55e-07 2.25e-06 2.89e-07 5.31e-07 8.28e-07 7.93e-07 6.5e-07 6.18e-07 6.44e-07 4.39e-07 1.28e-06 9.28e-07 6.31e-07 2.19e-06 3.59e-07 7.31e-07 7.59e-07 1.24e-06 1.24e-06 6.97e-07 2.06e-07 1.95e-07 6.58e-07 5.49e-07 4.34e-07 4.79e-07 1.58e-07 4.74e-07 2.8e-07 2.87e-07 1.58e-06 8.31e-08 7.3e-08 1.84e-07 1.29e-07 2.33e-07 9.04e-08 5.84e-08
ENSG00000184752 NDUFA12 -198788 2.69e-06 2.43e-06 2.43e-07 1.84e-06 4.27e-07 8.27e-07 1.33e-06 3.78e-07 1.76e-06 6.77e-07 1.88e-06 1.36e-06 3.24e-06 9.33e-07 4.4e-07 1.06e-06 1.07e-06 1.35e-06 5.59e-07 4.69e-07 6.34e-07 1.93e-06 1.63e-06 8.71e-07 2.69e-06 8.55e-07 1e-06 1.07e-06 1.73e-06 1.68e-06 8.88e-07 2.74e-07 3e-07 1.14e-06 9e-07 5.42e-07 7.02e-07 3.5e-07 9.25e-07 3.47e-07 2.89e-07 2.84e-06 4.34e-07 1.91e-07 2.99e-07 3.44e-07 2.8e-07 1.41e-07 1.57e-07