logo

Genes within 1Mb (chr12:94797035:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 3.03e-01 0.127 0.123 0.096 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 1.98e-01 0.186 0.144 0.096 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 5.45e-01 0.0656 0.108 0.096 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000827 0.137 0.096 B L1
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0294 0.125 0.096 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0587 0.082 0.096 B L1
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 6.20e-01 0.0514 0.104 0.096 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 3.95e-01 0.106 0.125 0.096 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0427 0.0597 0.096 B L1
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0129 0.102 0.096 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 2.36e-01 -0.105 0.0883 0.096 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 1.37e-02 0.242 0.0972 0.096 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 5.21e-01 0.0865 0.135 0.096 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0252 0.0867 0.096 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 2.97e-01 0.0947 0.0906 0.096 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 2.13e-02 0.218 0.094 0.096 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 3.60e-02 0.254 0.121 0.096 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 9.46e-02 0.137 0.0813 0.096 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0356 0.104 0.096 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0279 0.133 0.096 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 9.41e-01 0.0088 0.119 0.096 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 5.00e-01 0.0762 0.113 0.096 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 8.71e-02 -0.18 0.105 0.096 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 5.17e-01 0.0559 0.0861 0.096 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 3.08e-02 -0.314 0.144 0.097 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 2.91e-01 0.163 0.154 0.097 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 2.85e-01 0.164 0.153 0.097 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 1.17e-01 0.232 0.148 0.097 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0658 0.138 0.097 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 2.83e-01 0.132 0.123 0.097 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00975 0.137 0.097 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 2.11e-01 0.144 0.115 0.097 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0189 0.133 0.096 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 9.06e-01 0.0123 0.104 0.096 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 9.03e-01 0.0129 0.106 0.096 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 8.40e-01 0.0255 0.127 0.096 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 5.25e-02 -0.166 0.0853 0.096 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 4.53e-02 -0.254 0.126 0.096 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 2.88e-01 0.12 0.113 0.096 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 6.21e-02 0.151 0.0807 0.096 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 3.35e-01 -0.131 0.136 0.097 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 1.59e-01 0.18 0.128 0.097 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0418 0.108 0.097 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0162 0.128 0.097 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 4.99e-01 0.071 0.105 0.097 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 7.31e-01 0.0411 0.119 0.097 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 3.55e-01 0.0816 0.088 0.097 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0017 0.151 0.096 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 1.34e-01 0.192 0.128 0.096 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -994117 sc-eQTL 4.89e-01 0.0786 0.113 0.096 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 4.74e-01 -0.084 0.117 0.096 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 1.48e-01 -0.211 0.145 0.096 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 7.63e-01 0.0358 0.119 0.096 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0571 0.134 0.096 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 2.99e-01 0.0772 0.0742 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 6.24e-01 0.0834 0.17 0.097 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0545 0.145 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 1.82e-01 0.236 0.176 0.097 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 7.26e-01 0.0597 0.17 0.097 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 2.19e-01 0.159 0.129 0.097 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0308 0.137 0.097 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 2.67e-01 -0.189 0.17 0.097 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 9.62e-02 0.199 0.119 0.097 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 1.15e-01 -0.237 0.149 0.097 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0307 0.147 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 2.48e-01 0.172 0.148 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 6.27e-01 0.0661 0.136 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0424 0.149 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0346 0.152 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 1.07e-01 -0.201 0.124 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 3.33e-02 0.294 0.137 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0256 0.136 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 3.16e-01 0.113 0.112 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 9.47e-02 0.26 0.155 0.097 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 4.19e-01 -0.128 0.158 0.097 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 1.76e-01 0.204 0.151 0.097 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 4.52e-01 0.122 0.162 0.097 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 4.78e-02 0.286 0.143 0.097 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 6.07e-01 0.0631 0.122 0.097 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 6.23e-02 -0.265 0.142 0.097 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 2.35e-01 0.171 0.144 0.097 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0282 0.116 0.097 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 3.77e-01 0.129 0.146 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 3.56e-01 0.137 0.148 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 8.35e-01 0.0259 0.124 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 6.26e-01 -0.074 0.152 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 1.02e-01 -0.244 0.149 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00147 0.126 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 3.48e-01 0.122 0.13 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 5.01e-01 0.0959 0.142 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 9.80e-01 0.00207 0.0829 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 1.00e-01 -0.261 0.158 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 1.86e-01 0.192 0.145 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0418 0.147 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 8.31e-01 0.0343 0.161 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0833 0.147 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 2.92e-01 -0.143 0.136 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0763 0.143 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 7.30e-01 0.0416 0.12 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 7.55e-01 0.0369 0.118 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0505 0.155 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 2.68e-01 -0.18 0.162 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 3.68e-01 0.147 0.163 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 7.57e-01 -0.04 0.129 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 8.31e-01 0.0311 0.145 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 2.02e-01 0.189 0.148 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 7.59e-03 0.354 0.131 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0352 0.117 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0663 0.101 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 6.04e-02 0.231 0.122 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 6.19e-01 0.0707 0.142 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0501 0.0967 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 5.36e-01 0.0649 0.105 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 3.69e-02 0.187 0.089 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0907 0.124 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 1.59e-01 -0.163 0.116 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 1.78e-01 0.182 0.135 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 9.68e-01 0.00632 0.157 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 9.27e-01 0.0106 0.116 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0243 0.123 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 5.66e-02 0.202 0.105 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 1.22e-01 0.246 0.159 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0988 0.141 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0923 0.148 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 9.08e-01 0.0172 0.149 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 3.65e-01 0.116 0.127 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 4.33e-01 0.112 0.143 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 1.10e-01 0.206 0.129 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 4.04e-01 0.116 0.139 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 2.85e-02 0.268 0.121 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 7.96e-01 0.0361 0.139 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 8.21e-01 0.0349 0.154 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 9.77e-01 0.00424 0.148 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 8.62e-01 0.0219 0.126 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 6.09e-01 0.0711 0.139 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 9.67e-01 0.00449 0.109 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 1.11e-01 0.228 0.143 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 9.86e-01 -0.002 0.112 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 6.04e-01 0.0675 0.13 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 9.64e-01 0.00656 0.144 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0844 0.13 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 8.55e-01 -0.024 0.132 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 1.13e-01 -0.201 0.126 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0204 0.105 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 8.13e-02 0.272 0.155 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 2.64e-02 0.266 0.119 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 9.86e-01 0.00271 0.159 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0334 0.16 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 7.39e-01 0.0477 0.143 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 4.46e-01 0.115 0.151 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 3.32e-01 -0.15 0.155 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 1.17e-01 0.195 0.124 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 8.63e-01 0.0276 0.16 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 8.96e-01 0.018 0.138 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0481 0.155 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 2.99e-01 -0.17 0.163 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 3.27e-01 0.133 0.135 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 4.50e-02 0.309 0.153 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 3.04e-01 -0.164 0.159 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 6.56e-01 0.0607 0.136 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 8.44e-01 0.0304 0.154 0.097 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 6.02e-01 0.068 0.13 0.097 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -994117 sc-eQTL 6.74e-01 0.05 0.119 0.097 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 2.79e-01 -0.162 0.149 0.097 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 3.04e-01 -0.149 0.145 0.097 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 6.15e-01 0.0643 0.127 0.097 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 4.30e-01 -0.115 0.146 0.097 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 1.12e-01 0.203 0.127 0.097 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 4.49e-02 -0.317 0.157 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 1.76e-01 0.205 0.151 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 4.35e-01 0.122 0.156 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 6.94e-01 0.0645 0.164 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 5.54e-01 0.0795 0.134 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0861 0.136 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00579 0.13 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 1.36e-01 -0.227 0.152 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 2.88e-03 0.393 0.13 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 7.71e-01 0.0403 0.138 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 7.08e-01 0.0527 0.14 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 6.97e-01 0.048 0.123 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 9.00e-01 -0.018 0.143 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 2.04e-01 0.126 0.0991 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 5.33e-01 -0.105 0.167 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 7.90e-01 0.0396 0.149 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 1.57e-01 -0.221 0.155 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 5.13e-01 0.108 0.165 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 7.10e-01 0.0501 0.135 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0402 0.155 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 6.82e-01 0.057 0.139 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 7.53e-01 0.0443 0.141 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 2.84e-01 -0.155 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 4.47e-01 0.109 0.143 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0974 0.148 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 8.19e-01 0.0294 0.128 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 7.07e-02 0.265 0.146 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 6.03e-01 0.0534 0.103 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0683 0.209 0.089 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 4.84e-01 -0.132 0.188 0.089 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 4.61e-01 -0.154 0.208 0.089 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 3.98e-01 0.168 0.197 0.089 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 2.11e-01 0.233 0.185 0.089 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0733 0.192 0.089 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 5.20e-01 -0.129 0.2 0.089 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 1.79e-01 0.223 0.165 0.089 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 9.45e-01 0.00806 0.117 0.089 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 7.47e-02 -0.265 0.148 0.096 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 2.83e-01 -0.142 0.132 0.096 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -994117 sc-eQTL 6.96e-01 0.0424 0.108 0.096 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 5.25e-01 0.0813 0.128 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 2.47e-02 0.345 0.152 0.096 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 9.04e-01 0.0183 0.151 0.096 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00851 0.149 0.096 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0922 0.0931 0.096 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 4.49e-01 -0.114 0.151 0.096 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 8.18e-01 0.0328 0.142 0.096 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 5.80e-01 0.0834 0.151 0.096 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0361 0.135 0.096 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 2.38e-02 -0.312 0.137 0.096 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 2.12e-01 0.185 0.148 0.096 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 4.08e-01 0.0943 0.114 0.096 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 2.70e-03 -0.438 0.144 0.102 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 1.62e-01 0.222 0.158 0.102 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 7.83e-01 0.0445 0.162 0.102 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 4.48e-01 0.118 0.156 0.102 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 8.73e-01 0.0222 0.139 0.102 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 7.57e-01 0.0404 0.13 0.102 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0187 0.15 0.102 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 2.08e-01 0.16 0.127 0.102 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 6.48e-01 0.0679 0.149 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 9.96e-01 0.000516 0.117 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 3.59e-01 0.118 0.128 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0281 0.135 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 1.60e-01 -0.145 0.103 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 1.67e-02 -0.334 0.138 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 5.42e-01 0.0732 0.12 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 3.20e-01 0.0845 0.0848 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 5.42e-01 -0.092 0.151 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 8.41e-01 0.0266 0.132 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0315 0.146 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0934 0.143 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 1.42e-03 -0.34 0.105 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 7.17e-01 0.0552 0.152 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 9.19e-01 0.0142 0.139 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 4.47e-02 0.198 0.0982 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0216 0.189 0.1 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 1.56e-01 0.205 0.144 0.1 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -994117 sc-eQTL 2.10e-02 0.329 0.141 0.1 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00271 0.18 0.1 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0392 0.192 0.1 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 2.08e-01 -0.229 0.181 0.1 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0106 0.178 0.1 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 4.07e-01 -0.129 0.155 0.1 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 2.41e-01 0.191 0.162 0.098 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 3.35e-01 -0.152 0.157 0.098 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0722 0.166 0.098 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 7.33e-01 0.0527 0.155 0.098 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 2.35e-01 -0.158 0.133 0.098 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 3.69e-01 -0.144 0.16 0.098 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 3.40e-01 0.138 0.144 0.098 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 1.62e-02 0.246 0.101 0.098 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00272 0.152 0.1 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 3.86e-01 0.127 0.147 0.1 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 7.66e-01 0.0475 0.16 0.1 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 2.11e-01 0.199 0.158 0.1 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 2.71e-01 0.111 0.101 0.1 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 7.59e-01 0.0485 0.158 0.1 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 6.35e-01 0.0714 0.15 0.1 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0175 0.134 0.1 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 6.15e-01 0.0818 0.162 0.11 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 5.74e-01 0.0891 0.158 0.11 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 2.88e-01 0.176 0.165 0.11 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 2.45e-02 0.366 0.161 0.11 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 8.01e-01 0.0398 0.157 0.11 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 1.04e-01 0.274 0.168 0.11 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 6.74e-01 0.06 0.142 0.11 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 1.61e-01 0.196 0.14 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 3.65e-01 0.136 0.149 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 6.25e-01 0.0774 0.158 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 1.28e-01 0.212 0.139 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 3.99e-01 0.135 0.16 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 4.27e-01 0.118 0.148 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0553 0.0955 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 7.77e-01 0.0379 0.133 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 5.53e-01 0.0788 0.133 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 8.91e-01 0.0126 0.0916 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 7.44e-01 0.0454 0.139 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 1.81e-01 0.189 0.14 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 9.42e-01 0.00849 0.116 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 4.42e-01 -0.116 0.151 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -754441 sc-eQTL 1.69e-01 -0.184 0.133 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0624 0.114 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 4.39e-01 0.0923 0.119 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 9.62e-01 0.00705 0.147 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0343 0.0813 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0505 0.136 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 7.01e-01 0.0413 0.108 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 5.42e-01 0.0709 0.116 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0523 0.126 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 2.10e-02 -0.219 0.0943 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 5.74e-02 -0.246 0.129 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 4.70e-01 0.0849 0.117 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 7.83e-02 0.142 0.0801 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 5.90e-01 0.0841 0.156 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 8.06e-01 0.0356 0.145 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0425 0.143 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 3.25e-01 0.158 0.16 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 9.00e-01 0.0116 0.0923 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0678 0.153 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -420447 sc-eQTL 2.96e-01 0.137 0.131 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 2.65e-01 0.116 0.104 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -420711 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0857 0.141 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 146478 sc-eQTL 1.06e-01 0.212 0.131 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -676485 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0671 0.112 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 sc-eQTL 9.50e-01 0.00804 0.127 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 648458 sc-eQTL 7.31e-01 0.0384 0.112 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 337047 sc-eQTL 3.35e-01 0.121 0.125 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 sc-eQTL 2.89e-01 0.0979 0.092 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 eQTL 0.0233 0.0464 0.0204 0.00144 0.0 0.0785
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 eQTL 3.08e-05 0.134 0.032 0.0 0.0 0.0785

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120798 NR2C1 -276593 1.59e-06 1.81e-06 2.97e-07 1.29e-06 4.75e-07 6.58e-07 1.21e-06 4.02e-07 1.72e-06 7.25e-07 1.86e-06 1.29e-06 2.69e-06 4.46e-07 3.86e-07 9.88e-07 1.12e-06 1.29e-06 5.56e-07 6.49e-07 6.15e-07 1.92e-06 1.42e-06 8.07e-07 2.48e-06 9.36e-07 1.03e-06 1.01e-06 1.67e-06 1.61e-06 7.6e-07 2.66e-07 3.84e-07 6.21e-07 5.93e-07 6.03e-07 6.89e-07 3.66e-07 5.39e-07 2.03e-07 2.58e-07 2.41e-06 3.73e-07 1.32e-07 3.38e-07 2.73e-07 2.6e-07 1.96e-07 3.12e-07
ENSG00000184752 NDUFA12 -206713 2.78e-06 2.6e-06 4.9e-07 1.68e-06 8e-07 7.7e-07 2.03e-06 8.37e-07 2.13e-06 1.21e-06 2.57e-06 1.53e-06 4.14e-06 1.36e-06 9.17e-07 1.7e-06 1.59e-06 2.21e-06 1.48e-06 1.39e-06 1.32e-06 3.15e-06 2.51e-06 1.24e-06 3.92e-06 1.02e-06 1.39e-06 1.81e-06 2.54e-06 2.61e-06 1.97e-06 3.79e-07 6.21e-07 1.24e-06 1.23e-06 9.09e-07 9.41e-07 4.46e-07 1.21e-06 3.96e-07 1.52e-07 3.96e-06 5.89e-07 1.89e-07 3.45e-07 3.27e-07 7.71e-07 1.95e-07 1.58e-07