logo

Genes within 1Mb (chr12:94796569:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 4.08e-01 0.105 0.127 0.09 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 2.11e-01 0.187 0.149 0.09 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 6.04e-01 0.0581 0.112 0.09 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 9.31e-01 0.0122 0.141 0.09 B L1
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00265 0.129 0.09 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0495 0.0846 0.09 B L1
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 6.16e-01 0.0537 0.107 0.09 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 2.86e-01 0.138 0.129 0.09 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0422 0.0615 0.09 B L1
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0147 0.105 0.09 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 2.35e-01 -0.109 0.0911 0.09 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 1.18e-02 0.255 0.1 0.09 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 5.33e-01 0.0868 0.139 0.09 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0634 0.0894 0.09 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 1.96e-01 0.121 0.0934 0.09 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 8.79e-03 0.256 0.0967 0.09 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 3.30e-02 0.266 0.124 0.09 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 6.30e-02 0.156 0.0836 0.09 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0143 0.107 0.09 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0856 0.136 0.09 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 8.87e-01 0.0174 0.122 0.09 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 5.61e-01 0.0677 0.116 0.09 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 1.75e-01 -0.147 0.108 0.09 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 4.55e-01 0.0664 0.0887 0.09 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 2.66e-02 -0.332 0.149 0.09 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 5.10e-01 0.105 0.159 0.09 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 2.35e-01 0.188 0.157 0.09 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 1.69e-01 0.21 0.152 0.09 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0877 0.143 0.09 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 1.59e-01 0.179 0.126 0.09 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00499 0.141 0.09 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 2.77e-01 0.129 0.119 0.09 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0398 0.137 0.09 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0203 0.106 0.09 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 7.87e-01 0.0295 0.109 0.09 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 5.50e-01 0.0777 0.13 0.09 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 7.02e-02 -0.159 0.0875 0.09 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 7.35e-02 -0.233 0.129 0.09 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 2.31e-01 0.139 0.116 0.09 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 2.95e-02 0.181 0.0825 0.09 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 1.59e-01 -0.198 0.14 0.09 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 1.59e-01 0.186 0.132 0.09 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0688 0.111 0.09 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00925 0.132 0.09 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 5.29e-01 0.0684 0.108 0.09 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 8.19e-01 0.0282 0.123 0.09 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 3.31e-01 0.0885 0.0908 0.09 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0398 0.156 0.09 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 2.46e-01 0.154 0.132 0.09 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -994583 sc-eQTL 4.10e-01 0.0967 0.117 0.09 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0711 0.121 0.09 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 1.83e-01 -0.201 0.151 0.09 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 9.19e-01 0.0125 0.123 0.09 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0769 0.138 0.09 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 2.56e-01 0.0874 0.0767 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00591 0.177 0.089 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 9.84e-01 0.00311 0.151 0.089 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 4.08e-01 0.153 0.184 0.089 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 4.39e-01 0.137 0.176 0.089 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 2.35e-01 0.16 0.134 0.089 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0371 0.142 0.089 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 3.07e-01 -0.181 0.177 0.089 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 5.62e-02 0.238 0.124 0.089 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 1.44e-01 -0.228 0.155 0.089 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0568 0.151 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 1.56e-01 0.216 0.152 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 3.93e-01 0.119 0.139 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 4.44e-01 -0.117 0.153 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 8.94e-01 -0.021 0.157 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 1.47e-01 -0.186 0.128 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 3.01e-02 0.308 0.141 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 9.95e-01 0.000807 0.14 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 4.67e-01 0.0842 0.116 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 9.14e-02 0.27 0.159 0.091 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 4.53e-01 -0.122 0.162 0.091 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 1.14e-01 0.245 0.154 0.091 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 3.68e-01 0.15 0.167 0.091 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 3.24e-02 0.317 0.147 0.091 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 5.10e-01 0.0829 0.126 0.091 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 9.80e-02 -0.242 0.146 0.091 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 1.24e-01 0.227 0.147 0.091 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0356 0.119 0.091 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 4.09e-01 0.125 0.15 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 3.15e-01 0.153 0.152 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 8.11e-01 0.0307 0.128 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0704 0.156 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 1.42e-01 -0.226 0.153 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 9.03e-01 0.0158 0.129 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 3.73e-01 0.119 0.133 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 4.84e-01 0.103 0.146 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00979 0.0853 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 7.39e-02 -0.291 0.162 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 3.51e-01 0.139 0.149 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0444 0.151 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 9.39e-01 0.0127 0.165 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 4.29e-01 -0.119 0.151 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 2.04e-01 -0.177 0.139 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 4.57e-01 -0.11 0.147 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 8.50e-01 0.0234 0.124 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 4.07e-01 0.101 0.121 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0592 0.159 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 2.80e-01 -0.179 0.166 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 4.00e-01 0.141 0.167 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0349 0.132 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0398 0.149 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 1.54e-01 0.216 0.151 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 1.81e-02 0.322 0.135 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0586 0.121 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0647 0.104 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 4.60e-02 0.253 0.126 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 6.52e-01 0.0663 0.147 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0762 0.0998 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 4.68e-01 0.0785 0.108 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 1.86e-02 0.217 0.0917 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 3.43e-01 -0.121 0.127 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 1.88e-01 -0.158 0.119 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 1.53e-01 0.199 0.139 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0453 0.162 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00976 0.119 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 9.31e-01 0.011 0.127 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 4.81e-02 0.216 0.109 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 2.40e-01 0.193 0.164 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0638 0.146 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 2.00e-01 -0.196 0.152 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 6.96e-01 0.06 0.154 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 3.58e-01 0.121 0.131 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 2.15e-01 0.183 0.147 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 8.78e-02 0.227 0.132 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 3.13e-01 0.144 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 3.36e-02 0.265 0.124 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 6.70e-01 0.0608 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 7.70e-01 0.0461 0.157 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0558 0.151 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 6.89e-01 0.0515 0.129 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 6.97e-01 0.0552 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 8.82e-01 0.0166 0.112 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 1.25e-01 0.227 0.147 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 9.89e-01 0.0016 0.116 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 4.14e-01 0.109 0.134 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 6.57e-01 -0.066 0.148 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0481 0.134 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0299 0.136 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 1.66e-01 -0.181 0.13 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 9.19e-01 -0.011 0.108 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 1.02e-01 0.263 0.16 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 2.29e-02 0.281 0.123 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 7.69e-01 0.0481 0.163 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 4.70e-01 -0.119 0.164 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0184 0.148 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 5.57e-01 0.0915 0.155 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 5.10e-01 -0.105 0.16 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 1.27e-01 0.196 0.128 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 5.86e-01 0.0891 0.164 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0237 0.141 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0114 0.159 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 3.68e-01 -0.151 0.167 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 5.06e-01 0.0923 0.139 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 8.30e-02 0.273 0.157 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 2.82e-01 -0.175 0.163 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 5.67e-01 0.0798 0.139 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 8.79e-01 0.0241 0.158 0.091 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 8.59e-01 0.0237 0.133 0.091 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -994583 sc-eQTL 6.52e-01 0.0548 0.122 0.091 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 3.67e-01 -0.138 0.153 0.091 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 3.67e-01 -0.134 0.148 0.091 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 7.06e-01 0.0494 0.131 0.091 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 2.01e-01 -0.191 0.149 0.091 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 2.49e-01 0.151 0.13 0.091 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 8.13e-02 -0.284 0.162 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 2.38e-01 0.184 0.156 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 3.94e-01 0.137 0.16 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 9.66e-01 0.00713 0.169 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 3.90e-01 0.119 0.138 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0352 0.14 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0171 0.134 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 5.91e-02 -0.297 0.157 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 4.17e-03 0.391 0.135 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 7.92e-01 0.0375 0.142 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 6.40e-01 0.0679 0.145 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 8.93e-01 0.0171 0.128 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0736 0.147 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 2.39e-01 0.121 0.102 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 4.26e-01 -0.136 0.17 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 7.57e-01 0.0468 0.151 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 1.82e-01 -0.212 0.158 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 4.90e-01 0.116 0.167 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 7.22e-01 0.0488 0.137 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0205 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 6.04e-01 0.0734 0.141 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0218 0.145 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 3.90e-01 -0.128 0.149 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 5.05e-01 0.0984 0.147 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 4.70e-01 -0.11 0.153 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 5.63e-01 0.0765 0.132 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 5.97e-02 0.285 0.15 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 5.37e-01 0.0654 0.106 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0555 0.212 0.081 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0453 0.191 0.081 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 3.34e-01 -0.204 0.211 0.081 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 7.89e-01 0.0539 0.201 0.081 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 4.05e-01 0.158 0.189 0.081 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0994 0.196 0.081 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 2.74e-01 -0.223 0.203 0.081 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 2.60e-01 0.191 0.168 0.081 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00741 0.119 0.081 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 2.38e-02 -0.346 0.152 0.089 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 2.51e-01 -0.157 0.136 0.089 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -994583 sc-eQTL 8.29e-01 0.0242 0.112 0.089 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 6.96e-01 0.0516 0.132 0.089 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 6.82e-02 0.289 0.158 0.089 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0169 0.156 0.089 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0438 0.154 0.089 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0839 0.0961 0.089 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 9.58e-01 0.00825 0.155 0.09 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 9.05e-01 0.0175 0.146 0.09 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 5.35e-01 0.0958 0.154 0.09 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00887 0.138 0.09 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 1.87e-02 -0.333 0.141 0.09 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 3.17e-01 0.153 0.152 0.09 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 3.21e-01 0.116 0.117 0.09 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 1.44e-03 -0.48 0.148 0.095 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 2.68e-01 0.182 0.164 0.095 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 2.87e-01 0.178 0.167 0.095 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 4.95e-01 0.11 0.161 0.095 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0452 0.143 0.095 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 5.37e-01 0.0831 0.134 0.095 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0578 0.155 0.095 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 1.72e-01 0.18 0.131 0.095 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 6.71e-01 0.0647 0.152 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0343 0.12 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 2.42e-01 0.154 0.131 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0467 0.138 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 2.21e-01 -0.129 0.105 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 4.21e-02 -0.291 0.142 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 5.50e-01 0.0733 0.123 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 1.02e-01 0.142 0.0865 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 4.81e-01 -0.109 0.154 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00336 0.135 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0299 0.149 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0458 0.147 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 1.56e-03 -0.345 0.108 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 5.61e-01 0.0908 0.156 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 7.91e-01 0.0379 0.143 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 2.63e-02 0.225 0.1 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 5.95e-01 -0.103 0.193 0.094 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 1.23e-01 0.227 0.146 0.094 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -994583 sc-eQTL 3.15e-02 0.313 0.144 0.094 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00269 0.183 0.094 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 5.04e-01 -0.131 0.196 0.094 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 7.93e-02 -0.325 0.184 0.094 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 9.97e-01 0.000651 0.182 0.094 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 4.68e-01 -0.115 0.158 0.094 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 1.66e-01 0.231 0.166 0.091 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 2.27e-01 -0.195 0.161 0.091 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0103 0.17 0.091 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 7.59e-01 0.0486 0.158 0.091 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 3.04e-01 -0.14 0.136 0.091 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 3.37e-01 -0.158 0.164 0.091 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 3.29e-01 0.144 0.147 0.091 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 2.80e-02 0.23 0.104 0.091 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0447 0.157 0.093 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 3.24e-01 0.149 0.151 0.093 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 8.65e-01 0.0282 0.165 0.093 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 5.17e-02 0.318 0.162 0.093 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 3.29e-01 0.102 0.104 0.093 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 7.50e-01 0.0522 0.163 0.093 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 4.31e-01 0.122 0.155 0.093 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0234 0.138 0.093 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 5.99e-01 0.0883 0.168 0.102 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 7.94e-01 0.0427 0.163 0.102 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 5.00e-01 0.116 0.171 0.102 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 4.25e-02 0.341 0.167 0.102 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 6.12e-01 0.0826 0.162 0.102 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 6.45e-02 0.322 0.173 0.102 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 6.46e-01 0.0677 0.147 0.102 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 3.46e-01 0.137 0.145 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 4.54e-01 0.115 0.154 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 4.72e-01 0.117 0.162 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 9.96e-02 0.235 0.142 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 4.93e-01 0.113 0.164 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 3.08e-01 0.155 0.152 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0483 0.0982 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 6.31e-01 0.0659 0.137 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 3.52e-01 0.127 0.136 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 9.63e-01 0.00441 0.0942 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 7.87e-01 0.0388 0.143 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 2.26e-01 0.176 0.145 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 8.78e-01 0.0183 0.12 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 4.75e-01 -0.111 0.155 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -754907 sc-eQTL 1.83e-01 -0.183 0.137 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0762 0.118 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 5.04e-01 0.0822 0.123 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0115 0.152 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0193 0.0838 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0706 0.139 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 9.60e-01 0.0056 0.11 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 4.30e-01 0.0938 0.119 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0278 0.129 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 2.96e-02 -0.212 0.0966 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 1.39e-01 -0.197 0.132 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 4.58e-01 0.0893 0.12 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 1.74e-02 0.195 0.0814 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 6.92e-01 0.0635 0.16 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 8.87e-01 0.0212 0.148 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0198 0.147 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 1.93e-01 0.214 0.164 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 7.87e-01 0.0257 0.0947 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 5.15e-01 -0.102 0.157 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -420913 sc-eQTL 1.93e-01 0.175 0.134 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 3.31e-01 0.104 0.107 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -421177 sc-eQTL 2.18e-01 -0.179 0.145 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 146012 sc-eQTL 9.61e-02 0.225 0.135 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -676951 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0862 0.116 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 sc-eQTL 8.20e-01 0.03 0.132 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 647992 sc-eQTL 7.82e-01 0.032 0.115 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 336581 sc-eQTL 4.75e-01 0.0928 0.13 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 sc-eQTL 2.66e-01 0.106 0.095 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 eQTL 0.017 0.0495 0.0207 0.0018 0.0 0.0756
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 eQTL 9.06e-06 0.145 0.0324 0.0 0.0 0.0756

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 \N 146012 3.88e-06 3.7e-06 6.05e-07 1.88e-06 8.74e-07 8.28e-07 2.4e-06 9.05e-07 2.51e-06 1.47e-06 3.49e-06 1.98e-06 5.43e-06 1.24e-06 9.36e-07 2.03e-06 1.61e-06 2.12e-06 1.47e-06 1.07e-06 1.81e-06 3.42e-06 3.24e-06 1.84e-06 4.68e-06 1.24e-06 1.56e-06 1.56e-06 3.77e-06 3.61e-06 2e-06 4.69e-07 7.53e-07 1.83e-06 1.82e-06 8.53e-07 9.39e-07 4.37e-07 1.27e-06 3.82e-07 3.2e-07 4.34e-06 6.37e-07 1.62e-07 3.99e-07 3.64e-07 8.74e-07 2.38e-07 2.69e-07
ENSG00000120798 NR2C1 -277059 1.3e-06 1.07e-06 2.13e-07 1.2e-06 3.73e-07 5.87e-07 1.5e-06 3.65e-07 1.44e-06 5.9e-07 1.85e-06 7.84e-07 2.47e-06 2.86e-07 5.34e-07 9.78e-07 9.17e-07 8.82e-07 8.3e-07 5.97e-07 8.13e-07 1.69e-06 9.97e-07 5.58e-07 2.23e-06 7.38e-07 9.29e-07 9.19e-07 1.63e-06 1.23e-06 7.8e-07 2.1e-07 2.65e-07 6.11e-07 5.39e-07 5.26e-07 7.3e-07 2.74e-07 4.52e-07 2.98e-07 2.69e-07 1.64e-06 1.08e-07 1.3e-07 2.8e-07 1.35e-07 2.18e-07 4.91e-08 1.83e-07
ENSG00000184752 NDUFA12 -207179 1.87e-06 2.4e-06 2.77e-07 1.54e-06 4.39e-07 7.87e-07 1.33e-06 4.94e-07 1.78e-06 7.24e-07 1.96e-06 1.46e-06 3.25e-06 9.31e-07 4.72e-07 1.22e-06 9.43e-07 1.55e-06 6.25e-07 8.01e-07 7.78e-07 2.06e-06 1.76e-06 9.61e-07 2.69e-06 1.22e-06 1.12e-06 1.3e-06 1.81e-06 1.76e-06 9.44e-07 2.7e-07 4.61e-07 1.12e-06 9.18e-07 8.79e-07 7.47e-07 3.9e-07 7.65e-07 2.58e-07 2.44e-07 2.84e-06 4.07e-07 1.99e-07 3.5e-07 3.16e-07 4.08e-07 2.65e-07 2.13e-07