logo

Genes within 1Mb (chr12:94792434:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 4.52e-01 0.0901 0.12 0.098 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 1.38e-01 0.209 0.14 0.098 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 5.58e-01 0.0617 0.105 0.098 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0286 0.133 0.098 B L1
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0343 0.121 0.098 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 5.23e-01 -0.051 0.0797 0.098 B L1
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 3.58e-01 0.0927 0.101 0.098 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 3.38e-01 0.117 0.122 0.098 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0516 0.058 0.098 B L1
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0355 0.0987 0.098 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 2.48e-01 -0.099 0.0854 0.098 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 7.62e-03 0.253 0.0939 0.098 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 4.85e-01 0.0911 0.13 0.098 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 8.39e-01 -0.017 0.0839 0.098 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 3.30e-01 0.0855 0.0877 0.098 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 2.03e-02 0.213 0.0909 0.098 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 4.96e-02 0.23 0.117 0.098 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 1.03e-01 0.128 0.0785 0.098 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0645 0.101 0.098 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0949 0.128 0.098 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 8.77e-01 0.0177 0.115 0.098 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 4.09e-01 0.09 0.109 0.098 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 2.94e-02 -0.221 0.101 0.098 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 6.54e-01 0.0374 0.0832 0.098 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 1.90e-02 -0.329 0.139 0.099 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 5.67e-01 0.0855 0.149 0.099 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 2.67e-01 0.164 0.147 0.099 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 2.23e-01 0.174 0.143 0.099 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0255 0.134 0.099 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 2.96e-01 0.124 0.119 0.099 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 8.58e-01 0.0238 0.133 0.099 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 1.62e-01 0.156 0.111 0.099 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 9.60e-01 0.00656 0.129 0.098 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 8.78e-01 0.0155 0.1 0.098 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 9.50e-01 0.00643 0.103 0.098 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0317 0.123 0.098 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 1.07e-01 -0.134 0.0828 0.098 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 4.37e-02 -0.247 0.122 0.098 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 2.96e-01 0.115 0.109 0.098 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 7.12e-02 0.142 0.0782 0.098 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 3.21e-01 -0.131 0.131 0.099 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 6.49e-02 0.228 0.123 0.099 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0309 0.104 0.099 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0316 0.123 0.099 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 7.84e-01 0.0279 0.102 0.099 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 8.24e-01 0.0258 0.115 0.099 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 2.13e-01 0.106 0.0849 0.099 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 9.27e-01 0.0135 0.146 0.098 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 1.73e-01 0.169 0.124 0.098 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -998718 sc-eQTL 6.96e-01 0.0431 0.11 0.098 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0643 0.114 0.098 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 5.44e-02 -0.272 0.141 0.098 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 8.60e-01 0.0203 0.115 0.098 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0805 0.129 0.098 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 3.11e-01 0.0731 0.0719 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 7.01e-01 0.0633 0.164 0.099 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00158 0.14 0.099 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 2.10e-01 0.215 0.171 0.099 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 7.78e-01 0.0464 0.164 0.099 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 1.51e-01 0.18 0.125 0.099 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 9.68e-01 0.0054 0.132 0.099 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 3.47e-01 -0.155 0.164 0.099 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 1.26e-01 0.177 0.115 0.099 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 7.48e-02 -0.258 0.144 0.099 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0283 0.143 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 2.21e-01 0.177 0.144 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 4.21e-01 0.106 0.132 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0422 0.144 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0886 0.148 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 1.05e-01 -0.197 0.121 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 5.98e-02 0.253 0.133 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0533 0.132 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 4.76e-01 0.078 0.109 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 2.51e-01 0.173 0.151 0.099 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 2.88e-01 -0.163 0.153 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 3.73e-01 0.131 0.146 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 5.07e-01 0.105 0.157 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 9.63e-02 0.233 0.139 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 7.44e-01 0.0388 0.119 0.099 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 2.00e-01 -0.177 0.138 0.099 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 3.43e-01 0.133 0.139 0.099 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0412 0.112 0.099 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 3.90e-01 0.122 0.142 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 3.12e-01 0.145 0.143 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 7.52e-01 0.0382 0.121 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 4.71e-01 -0.106 0.147 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 1.04e-01 -0.236 0.144 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00896 0.122 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 2.00e-01 0.161 0.125 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 3.88e-01 0.119 0.138 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 9.77e-01 0.00233 0.0804 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 2.13e-02 -0.353 0.152 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 8.84e-02 0.239 0.14 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0809 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 5.97e-01 0.0823 0.156 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0245 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 2.96e-01 -0.138 0.131 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0509 0.139 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 5.37e-01 0.072 0.116 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 7.23e-01 0.0406 0.115 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 7.46e-01 -0.049 0.151 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 1.68e-01 -0.217 0.157 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 3.37e-01 0.152 0.158 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 9.07e-01 0.0147 0.126 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 6.19e-01 0.0701 0.141 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 1.95e-01 0.187 0.144 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 8.97e-03 0.337 0.128 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0159 0.113 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0594 0.0976 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 3.49e-02 0.25 0.118 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 5.63e-01 0.0794 0.137 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0191 0.0935 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 6.97e-01 0.0394 0.101 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 5.10e-02 0.169 0.086 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 1.79e-01 -0.161 0.12 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 1.50e-01 -0.162 0.112 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 1.44e-01 0.191 0.13 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 8.51e-01 0.0286 0.152 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 9.30e-01 0.00987 0.112 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 8.74e-01 -0.019 0.12 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 5.24e-02 0.199 0.102 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 4.15e-01 0.126 0.155 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0645 0.137 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 3.23e-01 -0.143 0.144 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0374 0.145 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 4.42e-01 0.0953 0.124 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 5.04e-01 0.093 0.139 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 2.05e-01 0.159 0.125 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 7.53e-01 0.0426 0.135 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 4.39e-02 0.239 0.118 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0453 0.135 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 9.11e-01 0.0168 0.149 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 9.22e-01 -0.014 0.143 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 5.73e-01 0.069 0.122 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 7.68e-01 0.0398 0.135 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0288 0.106 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 5.80e-02 0.262 0.137 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0092 0.108 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 8.95e-01 0.0166 0.125 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00262 0.139 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0927 0.125 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 8.64e-01 0.0217 0.127 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 1.06e-01 -0.198 0.122 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0581 0.101 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 6.80e-02 0.278 0.151 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 2.86e-02 0.256 0.116 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0173 0.155 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0904 0.156 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 6.61e-01 0.0614 0.14 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 5.68e-01 0.0843 0.147 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 3.99e-01 -0.128 0.151 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 1.27e-01 0.185 0.121 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 6.27e-01 0.0776 0.16 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 8.38e-01 0.028 0.137 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0437 0.155 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 2.66e-01 -0.182 0.163 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 1.78e-01 0.182 0.135 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 7.10e-02 0.278 0.153 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 1.60e-01 -0.223 0.158 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 4.32e-01 0.107 0.136 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 6.13e-01 0.0756 0.149 0.1 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 5.45e-01 0.0767 0.126 0.1 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -998718 sc-eQTL 8.46e-01 0.0225 0.115 0.1 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 3.46e-01 -0.137 0.145 0.1 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 1.78e-01 -0.19 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 4.88e-01 0.0861 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 2.61e-01 -0.16 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 8.33e-02 0.215 0.123 0.1 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 6.76e-02 -0.288 0.157 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 1.00e-01 0.248 0.15 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 4.43e-01 0.119 0.155 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 4.87e-01 0.114 0.163 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 6.30e-01 0.0645 0.134 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0464 0.135 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 9.84e-01 0.00268 0.13 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 1.25e-01 -0.227 0.148 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 5.76e-04 0.439 0.126 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 5.46e-01 0.0809 0.134 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 5.02e-01 0.0916 0.136 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0169 0.12 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0194 0.138 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 9.74e-02 0.16 0.096 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 5.22e-01 -0.103 0.161 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 7.35e-01 0.0484 0.143 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 2.95e-01 -0.157 0.15 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 5.44e-01 0.0962 0.158 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 7.32e-01 0.0443 0.129 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0418 0.149 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 8.06e-01 0.0329 0.134 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 5.69e-01 0.0778 0.136 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 1.47e-01 -0.203 0.139 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0178 0.139 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 1.79e-01 -0.192 0.143 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00122 0.124 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 1.03e-01 0.232 0.142 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 3.47e-01 0.0934 0.0992 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 9.50e-01 -0.012 0.191 0.096 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 5.32e-01 -0.108 0.172 0.096 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 5.81e-01 -0.105 0.19 0.096 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 5.51e-01 0.108 0.181 0.096 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 3.65e-01 0.155 0.17 0.096 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0471 0.176 0.096 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0623 0.183 0.096 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 1.15e-01 0.239 0.151 0.096 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 9.56e-01 0.00589 0.107 0.096 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 1.26e-01 -0.22 0.143 0.098 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 4.01e-01 -0.108 0.128 0.098 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -998718 sc-eQTL 5.98e-01 0.0553 0.105 0.098 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 6.64e-01 0.0539 0.124 0.098 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 7.96e-02 0.261 0.148 0.098 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0203 0.146 0.098 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 9.83e-01 0.00313 0.145 0.098 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 2.06e-01 -0.114 0.09 0.098 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 4.32e-01 -0.115 0.146 0.098 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 6.55e-01 0.0617 0.138 0.098 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 7.11e-01 0.054 0.146 0.098 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0207 0.131 0.098 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 2.32e-02 -0.304 0.133 0.098 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 8.37e-02 0.248 0.143 0.098 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 2.82e-01 0.119 0.11 0.098 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 1.54e-03 -0.445 0.138 0.105 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 3.20e-01 0.153 0.153 0.105 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 8.64e-01 0.0268 0.156 0.105 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 6.37e-01 0.0709 0.15 0.105 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 6.77e-01 0.0558 0.134 0.105 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 7.74e-01 0.0361 0.126 0.105 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0154 0.144 0.105 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 1.46e-01 0.178 0.122 0.105 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 5.10e-01 0.0949 0.144 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 9.88e-01 0.00176 0.113 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 4.35e-01 0.0971 0.124 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0641 0.131 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 2.20e-01 -0.122 0.0994 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 1.34e-02 -0.334 0.134 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 6.50e-01 0.0527 0.116 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 3.29e-01 0.0805 0.0822 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0841 0.146 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 8.81e-01 0.0192 0.128 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0307 0.141 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 4.04e-01 -0.116 0.139 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 2.81e-03 -0.308 0.102 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 7.04e-01 0.0561 0.147 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 7.81e-01 0.0375 0.135 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 3.01e-02 0.207 0.0949 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 9.66e-01 0.00814 0.191 0.097 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 2.81e-01 0.158 0.146 0.097 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -998718 sc-eQTL 9.66e-03 0.373 0.142 0.097 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00347 0.182 0.097 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0781 0.194 0.097 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 1.85e-01 -0.244 0.183 0.097 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 9.18e-01 0.0186 0.18 0.097 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 4.35e-01 -0.122 0.156 0.097 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 2.12e-01 0.196 0.156 0.1 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 2.63e-01 -0.17 0.152 0.1 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0458 0.16 0.1 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0426 0.149 0.1 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0799 0.128 0.1 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 4.99e-01 -0.105 0.155 0.1 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 4.91e-01 0.0956 0.139 0.1 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 2.52e-02 0.221 0.098 0.1 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 9.37e-01 0.0117 0.147 0.102 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 3.72e-01 0.127 0.142 0.102 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 7.85e-01 0.0421 0.154 0.102 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 1.88e-01 0.202 0.153 0.102 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 2.41e-01 0.115 0.0974 0.102 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 5.02e-01 0.103 0.153 0.102 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 4.69e-01 0.105 0.145 0.102 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0277 0.129 0.102 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 5.25e-01 0.101 0.158 0.11 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00619 0.154 0.11 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 2.61e-01 0.181 0.161 0.11 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 6.03e-02 0.298 0.158 0.11 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 7.38e-01 0.0515 0.153 0.11 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 2.34e-01 0.196 0.164 0.11 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 4.16e-01 0.113 0.138 0.11 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 2.54e-01 0.156 0.136 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 5.66e-01 0.0833 0.145 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 5.26e-01 0.0969 0.153 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 1.06e-01 0.217 0.134 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 5.42e-01 0.0946 0.155 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 6.14e-01 0.0725 0.143 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0636 0.0924 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 6.34e-01 0.0616 0.129 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 7.13e-01 0.0472 0.128 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0114 0.0887 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 9.88e-01 0.00195 0.135 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 1.35e-01 0.204 0.136 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 9.22e-01 0.0111 0.113 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 4.16e-01 -0.119 0.146 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -759042 sc-eQTL 2.26e-01 -0.157 0.13 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0523 0.111 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 2.90e-01 0.122 0.115 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 7.10e-01 0.0531 0.143 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0334 0.0789 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0189 0.132 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 6.66e-01 0.045 0.104 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 5.82e-01 0.062 0.112 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 4.38e-01 -0.095 0.122 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 3.25e-02 -0.197 0.0914 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 4.92e-02 -0.247 0.125 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 5.19e-01 0.0734 0.114 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 9.23e-02 0.131 0.0775 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 5.51e-01 0.0901 0.151 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 9.30e-01 0.0123 0.14 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0292 0.138 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 6.28e-01 0.075 0.155 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 6.15e-01 0.0449 0.0892 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0262 0.148 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -425048 sc-eQTL 2.82e-01 0.136 0.126 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 3.30e-01 0.0984 0.101 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -425312 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0862 0.136 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 141877 sc-eQTL 4.26e-02 0.257 0.126 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -681086 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0607 0.109 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -281194 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0147 0.123 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 643857 sc-eQTL 9.97e-01 0.000379 0.108 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 332446 sc-eQTL 4.46e-01 0.0926 0.121 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 sc-eQTL 1.66e-01 0.124 0.0889 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 eQTL 0.000154 0.12 0.0316 0.0 0.0 0.0829

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120798 \N -281194 1.31e-06 1.57e-06 2.4e-07 1.44e-06 3.73e-07 6.48e-07 1.36e-06 3.75e-07 1.69e-06 6.9e-07 1.95e-06 1.32e-06 2.66e-06 5.4e-07 4.26e-07 9.91e-07 9.81e-07 1.13e-06 5.65e-07 5.9e-07 6.18e-07 1.92e-06 1.27e-06 7.61e-07 2.48e-06 9.37e-07 1.03e-06 1.05e-06 1.64e-06 1.3e-06 8.65e-07 2.65e-07 4e-07 6.11e-07 9.17e-07 6.6e-07 7.5e-07 3.26e-07 7.18e-07 3.96e-07 2.11e-07 2.14e-06 3.52e-07 1.99e-07 3.71e-07 2.14e-07 3.69e-07 2.18e-07 2.27e-07
ENSG00000184752 NDUFA12 -211314 2.63e-06 3.18e-06 4.62e-07 1.97e-06 5.62e-07 8.07e-07 2.18e-06 8.73e-07 2.29e-06 1.18e-06 3.09e-06 2.2e-06 3.69e-06 1.35e-06 8.91e-07 2.1e-06 1.41e-06 2.15e-06 1.42e-06 1.21e-06 1.39e-06 2.99e-06 2.69e-06 1.42e-06 4.02e-06 1.28e-06 1.52e-06 1.56e-06 2.55e-06 1.93e-06 2.01e-06 5.93e-07 7.33e-07 1.32e-06 1.74e-06 8.84e-07 9.22e-07 4.68e-07 1.29e-06 4.28e-07 5.7e-07 3.96e-06 5.89e-07 1.83e-07 3.27e-07 3.33e-07 8.59e-07 4.43e-07 2.72e-07