logo

Genes within 1Mb (chr12:94784615:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 1.93e-01 -0.121 0.0927 0.173 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 7.57e-03 -0.29 0.107 0.173 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0562 0.0818 0.173 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 3.88e-01 0.0892 0.103 0.173 B L1
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 8.49e-02 0.162 0.0937 0.173 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 6.18e-01 -0.031 0.0619 0.173 B L1
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 1.22e-01 -0.121 0.0778 0.173 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 7.09e-01 0.0353 0.0946 0.173 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0515 0.045 0.173 B L1
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0284 0.0767 0.173 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 6.73e-03 -0.179 0.0655 0.173 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0358 0.0742 0.173 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00498 0.101 0.173 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 8.77e-01 0.0101 0.0652 0.173 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 4.22e-01 0.0548 0.0682 0.173 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 1.03e-01 -0.117 0.0712 0.173 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 2.36e-01 0.11 0.0927 0.173 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0496 0.0624 0.173 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 9.50e-01 0.00501 0.0796 0.173 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0443 0.101 0.173 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0814 0.0905 0.173 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 2.92e-01 0.0907 0.0859 0.173 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 4.16e-01 0.0654 0.0803 0.173 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 9.88e-01 -0.000987 0.0658 0.173 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 3.53e-01 0.102 0.109 0.176 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 3.77e-01 -0.102 0.116 0.176 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 2.75e-01 0.125 0.114 0.176 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0231 0.111 0.176 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 9.24e-01 0.00991 0.104 0.176 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0173 0.0923 0.176 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 1.82e-01 -0.137 0.102 0.176 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 1.25e-01 -0.133 0.086 0.176 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 5.65e-01 0.0576 0.1 0.173 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 6.13e-01 0.0394 0.0777 0.173 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 9.51e-01 0.00495 0.0797 0.173 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 3.17e-01 -0.095 0.0948 0.173 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0795 0.0643 0.173 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 3.25e-01 0.0938 0.0951 0.173 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 2.05e-01 -0.108 0.0846 0.173 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 4.06e-03 -0.174 0.0598 0.173 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 8.97e-01 0.013 0.1 0.174 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 9.33e-01 0.00794 0.0947 0.174 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 9.65e-01 0.0035 0.0794 0.174 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 5.48e-01 0.0566 0.094 0.174 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0597 0.0774 0.174 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 1.01e-01 -0.144 0.0875 0.174 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0935 0.0647 0.174 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 3.66e-02 -0.232 0.11 0.173 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 1.85e-01 -0.126 0.0947 0.173 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 2.03e-01 0.11 0.0865 0.173 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 3.61e-01 0.099 0.108 0.173 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 4.04e-01 0.0734 0.0878 0.173 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0694 0.0988 0.173 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 4.13e-02 -0.112 0.0545 0.173 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0932 0.133 0.163 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 3.96e-02 -0.233 0.113 0.163 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 3.55e-01 0.129 0.139 0.163 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 1.62e-01 -0.187 0.133 0.163 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 7.37e-01 0.0343 0.102 0.163 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0526 0.108 0.163 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 4.35e-01 -0.105 0.134 0.163 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 8.65e-01 0.0161 0.0944 0.163 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 1.64e-01 -0.164 0.117 0.163 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 3.28e-01 -0.113 0.116 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0724 0.117 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 1.21e-01 -0.166 0.106 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 8.73e-02 0.2 0.116 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 3.89e-01 0.103 0.12 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 1.58e-01 -0.139 0.0982 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 9.94e-01 0.000865 0.109 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 7.89e-01 0.0287 0.107 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 1.63e-01 -0.124 0.0884 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0966 0.116 0.175 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 1.57e-02 -0.282 0.116 0.175 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 9.77e-01 0.0033 0.112 0.175 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 4.52e-01 0.091 0.121 0.175 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 4.03e-01 0.09 0.107 0.175 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 4.18e-01 0.0738 0.0909 0.175 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 5.83e-01 0.0584 0.106 0.175 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 9.67e-01 0.00448 0.107 0.175 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 7.83e-01 0.0238 0.0861 0.175 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 7.88e-02 -0.194 0.11 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 6.98e-02 -0.202 0.111 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0353 0.0938 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0909 0.114 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0829 0.113 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 1.48e-01 -0.137 0.0944 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0168 0.0979 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0257 0.107 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 4.04e-01 0.0522 0.0624 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 4.41e-02 0.241 0.119 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 3.59e-01 -0.101 0.109 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 4.65e-01 -0.081 0.111 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0402 0.121 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0497 0.111 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 4.61e-01 0.0757 0.102 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0545 0.108 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 8.73e-01 0.0146 0.0907 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00573 0.0892 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 1.84e-01 0.163 0.122 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 4.07e-01 -0.106 0.128 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0513 0.129 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0621 0.102 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 2.44e-01 -0.134 0.114 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0716 0.117 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 7.77e-02 -0.186 0.105 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 7.52e-01 0.0274 0.0867 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 3.82e-02 -0.155 0.0743 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 2.73e-01 -0.1 0.0914 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0295 0.106 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 8.81e-01 0.0107 0.0719 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 6.23e-01 0.0383 0.0777 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 7.66e-02 -0.118 0.0663 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 2.36e-01 -0.109 0.0917 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 7.86e-02 -0.151 0.0856 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0987 0.1 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 2.12e-01 0.146 0.116 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 8.08e-02 0.15 0.0853 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 9.88e-01 0.00136 0.0916 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0995 0.0786 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 9.49e-01 0.00771 0.12 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0608 0.107 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 1.34e-01 0.168 0.112 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 9.76e-01 0.00346 0.113 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 9.48e-01 0.00629 0.0962 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 1.63e-01 0.151 0.108 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 8.26e-01 0.0215 0.0976 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 2.26e-01 0.129 0.106 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 8.73e-01 0.015 0.0942 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 6.45e-01 0.0494 0.107 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 3.41e-01 -0.113 0.118 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 1.86e-02 -0.265 0.112 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 1.90e-01 0.127 0.0963 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 7.67e-01 0.0316 0.106 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 9.95e-01 0.000514 0.0838 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0664 0.108 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 9.33e-01 0.00716 0.0847 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 5.23e-01 0.0627 0.098 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0605 0.109 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 1.00e+00 1.33e-05 0.0983 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0189 0.0994 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 7.87e-01 0.0259 0.0959 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0576 0.0793 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0314 0.118 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 2.09e-01 0.115 0.0909 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 3.51e-01 0.112 0.12 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0519 0.121 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0186 0.108 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 4.24e-01 0.0915 0.114 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0202 0.117 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0961 0.0942 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 2.30e-01 0.154 0.128 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 8.24e-03 -0.288 0.108 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 4.69e-02 -0.246 0.123 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 3.78e-01 -0.115 0.13 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 1.60e-01 0.152 0.108 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0101 0.124 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 3.21e-01 -0.126 0.127 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 7.95e-01 0.0283 0.109 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 2.04e-01 -0.151 0.118 0.171 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 4.86e-02 -0.198 0.0996 0.171 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 9.26e-02 0.194 0.115 0.171 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 2.28e-01 0.135 0.112 0.171 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 1.21e-01 0.153 0.0979 0.171 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 3.71e-01 -0.101 0.113 0.171 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 5.90e-02 -0.186 0.0978 0.171 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0191 0.116 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 6.78e-01 0.046 0.111 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 1.35e-01 0.17 0.113 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 1.87e-01 0.158 0.119 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 9.89e-02 -0.161 0.0971 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 7.51e-02 -0.176 0.0983 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 6.74e-01 -0.04 0.0948 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 1.73e-01 -0.153 0.112 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 9.08e-01 0.0113 0.0977 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 9.81e-01 0.00238 0.101 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 1.87e-01 0.136 0.103 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 9.02e-01 0.0112 0.0906 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 6.61e-02 -0.192 0.104 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 2.12e-02 -0.167 0.0721 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 2.53e-01 0.143 0.125 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0391 0.111 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 1.66e-01 0.161 0.116 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 5.53e-01 -0.073 0.123 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0248 0.1 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 8.57e-01 0.0208 0.115 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 6.31e-01 0.0499 0.104 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 3.88e-01 0.0896 0.104 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 6.42e-01 0.0495 0.106 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0452 0.105 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 2.38e-01 -0.129 0.109 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 8.26e-01 0.0208 0.0944 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 8.64e-01 0.0186 0.108 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0277 0.0756 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 1.77e-01 -0.187 0.137 0.167 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0745 0.125 0.167 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 1.23e-01 0.213 0.137 0.167 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 6.11e-01 -0.067 0.131 0.167 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 9.91e-03 0.315 0.12 0.167 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00777 0.128 0.167 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 3.73e-01 -0.119 0.133 0.167 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00943 0.111 0.167 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0534 0.0775 0.167 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0519 0.108 0.174 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 2.76e-01 -0.105 0.0961 0.174 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0199 0.0928 0.174 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0902 0.112 0.174 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0846 0.109 0.174 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 5.16e-01 0.0705 0.108 0.174 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0883 0.0675 0.174 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 8.52e-01 0.0215 0.115 0.173 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 8.60e-02 0.186 0.108 0.173 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 2.62e-01 0.129 0.114 0.173 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 2.47e-01 0.119 0.102 0.173 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 2.27e-01 -0.128 0.105 0.173 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00316 0.113 0.173 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 1.42e-01 -0.127 0.0863 0.173 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 9.14e-02 0.194 0.114 0.168 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 7.94e-01 0.0325 0.124 0.168 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 4.77e-03 0.353 0.124 0.168 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 8.50e-01 0.023 0.122 0.168 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 3.69e-01 0.0976 0.108 0.168 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 2.62e-01 -0.114 0.101 0.168 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 6.09e-02 -0.218 0.116 0.168 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0435 0.0995 0.168 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0272 0.11 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 6.72e-01 0.0367 0.0866 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 3.20e-01 0.0945 0.0949 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0255 0.1 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000237 0.0764 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 3.30e-01 0.101 0.104 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 1.22e-01 -0.137 0.0883 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 1.10e-03 -0.203 0.0615 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 9.19e-01 0.0115 0.113 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 5.91e-01 0.0532 0.0989 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0126 0.109 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 2.56e-01 -0.122 0.107 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 1.50e-01 -0.116 0.0803 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 6.43e-01 0.053 0.114 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0871 0.104 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0812 0.0741 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 2.04e-03 -0.452 0.144 0.164 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00614 0.114 0.164 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 5.06e-02 0.275 0.139 0.164 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 3.87e-01 0.131 0.151 0.164 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0538 0.143 0.164 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 3.01e-01 -0.145 0.14 0.164 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 2.85e-01 0.13 0.121 0.164 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 4.08e-01 0.101 0.122 0.173 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0313 0.118 0.173 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00863 0.124 0.173 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 7.21e-01 0.0414 0.116 0.173 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0652 0.0996 0.173 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 8.20e-01 0.0274 0.12 0.173 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 1.52e-01 -0.154 0.107 0.173 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 1.06e-01 -0.124 0.0765 0.173 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 3.91e-01 0.0949 0.11 0.176 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 6.06e-01 0.0551 0.107 0.176 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0812 0.116 0.176 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 9.83e-01 0.00251 0.115 0.176 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 5.37e-02 -0.141 0.0728 0.176 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0914 0.115 0.176 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 6.96e-01 0.0427 0.109 0.176 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 2.70e-01 -0.107 0.0968 0.176 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0888 0.129 0.169 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 4.07e-01 -0.104 0.126 0.169 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0506 0.132 0.169 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 4.20e-01 0.105 0.13 0.169 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 4.87e-01 0.0872 0.125 0.169 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 4.03e-01 0.113 0.134 0.169 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0316 0.113 0.169 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0593 0.112 0.169 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 1.52e-01 -0.162 0.113 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 1.20e-01 -0.186 0.119 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0566 0.106 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 6.95e-03 0.326 0.119 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 1.40e-01 0.166 0.112 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0439 0.0725 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 8.61e-01 0.0178 0.101 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00511 0.101 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 4.64e-01 -0.051 0.0695 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 9.42e-01 0.00765 0.105 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 5.03e-02 -0.209 0.106 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0932 0.0877 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0982 0.114 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -766861 sc-eQTL 9.22e-01 -0.01 0.102 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0473 0.0867 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0323 0.0904 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0222 0.112 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 9.55e-01 0.00344 0.0617 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 8.83e-01 0.0149 0.101 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 6.87e-01 0.0324 0.0803 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 4.83e-01 0.0609 0.0866 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0735 0.0942 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0545 0.0711 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 5.75e-01 0.0544 0.097 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 6.38e-02 -0.162 0.0869 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 5.59e-03 -0.165 0.0591 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 1.44e-01 0.168 0.114 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 9.01e-01 0.0133 0.107 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0429 0.105 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0766 0.118 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 5.12e-02 -0.132 0.0675 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 9.04e-01 0.0137 0.113 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -432867 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0579 0.0965 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 6.19e-02 -0.143 0.0764 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -433131 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0145 0.103 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 134058 sc-eQTL 9.50e-01 0.00606 0.0964 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -688905 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0203 0.0825 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -289013 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0181 0.0935 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 636038 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0141 0.082 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 324627 sc-eQTL 3.51e-01 -0.086 0.0921 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 sc-eQTL 8.24e-02 -0.117 0.0673 0.175 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111142 METAP2 -688905 eQTL 0.00972 0.027 0.0104 0.0 0.0 0.22
ENSG00000184752 NDUFA12 -219133 eQTL 0.00085 -0.0696 0.0208 0.0 0.0 0.22

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111142 METAP2 -688905 3.14e-07 1.56e-07 6.45e-08 2.35e-07 1.07e-07 8.85e-08 1.99e-07 5.56e-08 1.54e-07 9.35e-08 1.69e-07 1.2e-07 2.13e-07 8.15e-08 5.69e-08 7.98e-08 4.35e-08 1.8e-07 7.36e-08 5.75e-08 1.26e-07 1.56e-07 1.58e-07 3.51e-08 2.28e-07 1.23e-07 1.22e-07 1.12e-07 1.31e-07 1.29e-07 1.14e-07 4.43e-08 3.59e-08 9.3e-08 5.41e-08 3.18e-08 4.62e-08 7.49e-08 6.41e-08 4.41e-08 4.92e-08 1.55e-07 3.55e-08 1.72e-08 4e-08 6.68e-09 8.46e-08 2.13e-09 4.72e-08
ENSG00000278916 \N 324612 1.27e-06 9.53e-07 3.12e-07 1.04e-06 3.2e-07 6.22e-07 1.26e-06 3.46e-07 1.2e-06 4.28e-07 1.56e-06 5.98e-07 2e-06 3e-07 4.91e-07 7.41e-07 8.13e-07 6.21e-07 7.76e-07 6.96e-07 5.47e-07 1.28e-06 8.52e-07 5.86e-07 2.26e-06 2.89e-07 7.97e-07 7.25e-07 1.02e-06 1.34e-06 5.45e-07 1.72e-07 1.5e-07 5.53e-07 6.02e-07 4.66e-07 4.79e-07 1.66e-07 2.18e-07 8.88e-08 1.67e-07 1.5e-06 9.48e-08 1.3e-07 1.69e-07 1.26e-07 2.3e-07 8.87e-08 1.07e-07