logo

Genes within 1Mb (chr12:94775632:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0621 0.0942 0.173 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 5.03e-02 -0.216 0.11 0.173 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0708 0.0828 0.173 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 2.76e-01 0.114 0.104 0.173 B L1
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 1.05e-01 0.155 0.095 0.173 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0161 0.0628 0.173 B L1
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0777 0.0791 0.173 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 6.63e-01 0.0418 0.0958 0.173 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0514 0.0456 0.173 B L1
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0386 0.0774 0.173 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 7.10e-03 -0.18 0.0661 0.173 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 9.83e-01 0.00162 0.0749 0.173 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 9.13e-01 0.0112 0.102 0.173 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 7.72e-01 0.0191 0.0658 0.173 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 3.36e-01 0.0663 0.0688 0.173 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 1.20e-01 -0.112 0.0718 0.173 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 2.41e-01 0.111 0.094 0.173 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 4.88e-01 -0.044 0.0633 0.173 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00176 0.0807 0.173 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0271 0.103 0.173 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 4.14e-01 -0.075 0.0917 0.173 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 5.55e-01 0.0516 0.0873 0.173 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 1.75e-01 0.111 0.0812 0.173 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 9.37e-01 0.0053 0.0668 0.173 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 5.88e-01 0.06 0.111 0.176 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 1.80e-01 -0.157 0.117 0.176 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 2.65e-01 0.13 0.116 0.176 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 9.29e-01 -0.01 0.113 0.176 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0113 0.105 0.176 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0298 0.0935 0.176 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 1.92e-01 -0.136 0.104 0.176 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 2.01e-01 -0.112 0.0873 0.176 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 5.24e-01 0.0645 0.101 0.173 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 8.45e-01 0.0154 0.0785 0.173 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 9.74e-01 0.00261 0.0805 0.173 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0718 0.0958 0.173 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0778 0.0649 0.173 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 3.60e-01 0.0882 0.096 0.173 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0909 0.0855 0.173 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 5.98e-03 -0.168 0.0605 0.173 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 8.50e-01 0.0193 0.102 0.174 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0225 0.0959 0.174 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 7.51e-01 0.0256 0.0805 0.174 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 8.23e-01 0.0213 0.0953 0.174 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0605 0.0784 0.174 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 1.86e-01 -0.118 0.0889 0.174 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 1.24e-01 -0.101 0.0655 0.174 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 3.77e-02 -0.235 0.113 0.173 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 2.71e-01 -0.106 0.0965 0.173 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 1.99e-01 0.113 0.088 0.173 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 1.76e-01 0.149 0.11 0.173 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 5.88e-01 0.0485 0.0895 0.173 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0749 0.101 0.173 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 1.71e-02 -0.133 0.0553 0.173 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 4.39e-01 -0.102 0.131 0.163 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 4.21e-02 -0.227 0.111 0.163 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 4.29e-01 0.109 0.137 0.163 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 1.13e-01 -0.208 0.131 0.163 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 7.62e-01 0.0305 0.1 0.163 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0468 0.106 0.163 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 4.13e-01 -0.108 0.132 0.163 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 8.14e-01 0.0219 0.0931 0.163 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 2.10e-01 -0.146 0.116 0.163 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0858 0.115 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0627 0.116 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 1.02e-01 -0.173 0.106 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 2.02e-02 0.269 0.115 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 3.69e-01 0.107 0.119 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 2.53e-01 -0.112 0.0978 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 8.50e-01 0.0206 0.109 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 8.29e-01 0.023 0.107 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 1.22e-01 -0.136 0.0877 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0722 0.116 0.175 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 1.76e-02 -0.279 0.117 0.175 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 9.01e-01 0.0141 0.113 0.175 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 4.42e-01 0.0934 0.121 0.175 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 4.05e-01 0.09 0.108 0.175 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 3.81e-01 0.0801 0.0913 0.175 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 7.68e-01 0.0315 0.107 0.175 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 9.26e-01 0.01 0.108 0.175 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 7.95e-01 0.0225 0.0865 0.175 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 9.99e-02 -0.182 0.11 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 1.44e-01 -0.164 0.112 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0449 0.0944 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0403 0.115 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0798 0.114 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 1.58e-01 -0.134 0.095 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00658 0.0986 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 8.97e-01 -0.014 0.108 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 3.26e-01 0.0618 0.0628 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 4.00e-02 0.245 0.119 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 7.08e-01 -0.041 0.109 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 4.22e-01 -0.089 0.111 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 9.48e-01 0.00787 0.121 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0482 0.111 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 3.83e-01 0.0894 0.102 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0207 0.108 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 8.72e-01 0.0147 0.0907 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0468 0.0891 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 1.04e-01 0.201 0.123 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 2.59e-01 -0.146 0.129 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 8.88e-01 0.0183 0.13 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0628 0.103 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 2.38e-01 -0.136 0.115 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0127 0.118 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 7.78e-02 -0.188 0.106 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 7.78e-01 0.0247 0.0876 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 3.61e-02 -0.158 0.0751 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0811 0.0925 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00671 0.107 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 8.04e-01 0.0181 0.0726 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 5.98e-01 0.0415 0.0785 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 9.90e-02 -0.111 0.067 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 2.17e-01 -0.115 0.0927 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 1.11e-01 -0.139 0.0867 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0619 0.101 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 1.91e-01 0.154 0.118 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 6.65e-02 0.159 0.0862 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 6.56e-01 0.0413 0.0926 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 1.91e-01 -0.104 0.0795 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 8.36e-01 0.0251 0.121 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0983 0.107 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 4.92e-02 0.222 0.112 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 9.04e-01 0.0137 0.114 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 9.60e-01 0.00484 0.097 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 3.38e-01 0.104 0.109 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 6.14e-01 0.0497 0.0984 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 2.17e-01 0.133 0.108 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 8.66e-01 0.0161 0.0953 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 7.16e-01 0.0395 0.108 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 2.97e-01 -0.125 0.119 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 4.60e-02 -0.228 0.114 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 3.09e-01 0.0995 0.0976 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 6.25e-01 0.0527 0.108 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 9.64e-01 0.00384 0.0848 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0893 0.11 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 8.29e-01 0.0186 0.086 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 6.62e-01 0.0435 0.0996 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00699 0.111 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00724 0.0998 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0432 0.101 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 4.48e-01 0.074 0.0973 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0593 0.0806 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0395 0.12 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 7.03e-02 0.168 0.0921 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 2.91e-01 0.129 0.122 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0679 0.123 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 9.37e-01 0.00878 0.11 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 7.37e-01 0.0391 0.116 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 9.69e-01 0.00457 0.119 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0877 0.0958 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 2.78e-01 0.138 0.126 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 1.73e-02 -0.258 0.107 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 4.01e-02 -0.251 0.122 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 2.27e-01 -0.156 0.129 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 1.09e-01 0.172 0.107 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0218 0.122 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 3.79e-01 -0.111 0.126 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 9.32e-01 0.00927 0.108 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 1.68e-01 -0.166 0.12 0.171 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 1.51e-01 -0.146 0.101 0.171 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 8.24e-02 0.203 0.116 0.171 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 2.15e-01 0.141 0.113 0.171 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 2.26e-01 0.121 0.0995 0.171 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 3.29e-01 -0.112 0.114 0.171 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 3.88e-02 -0.206 0.099 0.171 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0437 0.117 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 5.37e-01 0.0694 0.112 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 1.46e-01 0.168 0.115 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 4.24e-01 0.097 0.121 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 8.80e-02 -0.169 0.0986 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 1.46e-01 -0.146 0.1 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0452 0.0963 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 2.12e-01 -0.141 0.113 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00818 0.0988 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 6.81e-01 0.0421 0.102 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 1.45e-01 0.152 0.104 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 7.69e-01 0.0269 0.0916 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 7.12e-02 -0.191 0.105 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 2.71e-02 -0.163 0.073 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 1.65e-01 0.177 0.127 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0701 0.113 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 1.77e-01 0.16 0.118 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0812 0.125 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000499 0.103 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 5.88e-01 0.0638 0.118 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 7.99e-01 0.027 0.106 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 3.97e-01 0.0892 0.105 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 9.12e-01 0.0119 0.108 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0432 0.107 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 1.45e-01 -0.161 0.11 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 8.40e-01 0.0193 0.0957 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 7.45e-01 0.0358 0.11 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0527 0.0766 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 2.82e-01 -0.152 0.14 0.17 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0759 0.127 0.17 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 1.02e-01 0.229 0.139 0.17 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0574 0.134 0.17 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 2.46e-02 0.28 0.123 0.17 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 8.15e-01 0.0305 0.13 0.17 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 4.10e-01 -0.112 0.135 0.17 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 9.99e-01 0.000185 0.112 0.17 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0502 0.0789 0.17 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0563 0.11 0.172 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 1.59e-01 -0.137 0.0973 0.172 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0398 0.0941 0.172 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0657 0.113 0.172 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0819 0.111 0.172 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 4.59e-01 0.0815 0.11 0.172 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 1.44e-01 -0.1 0.0684 0.172 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0462 0.116 0.173 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 9.28e-02 0.183 0.108 0.173 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 1.40e-01 0.17 0.115 0.173 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 1.85e-01 0.137 0.103 0.173 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0969 0.106 0.173 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 9.63e-01 0.00534 0.114 0.173 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 1.88e-01 -0.115 0.0871 0.173 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 1.46e-01 0.166 0.114 0.171 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 9.65e-01 0.0054 0.123 0.171 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 1.39e-02 0.306 0.123 0.171 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 7.89e-01 0.0323 0.121 0.171 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 4.61e-01 0.0793 0.107 0.171 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 2.39e-01 -0.119 0.101 0.171 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 3.96e-02 -0.238 0.115 0.171 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 5.30e-01 -0.062 0.0985 0.171 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0307 0.112 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 9.19e-01 0.00891 0.0877 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 5.28e-01 0.0609 0.0962 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0102 0.101 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 9.35e-01 0.00628 0.0773 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 4.88e-01 0.0732 0.105 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 1.57e-01 -0.127 0.0895 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 7.19e-04 -0.213 0.0621 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 7.18e-01 0.0413 0.114 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 6.85e-01 0.0406 0.1 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 7.97e-01 0.0284 0.11 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0917 0.109 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 1.37e-01 -0.121 0.0811 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 5.55e-01 0.0682 0.115 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0496 0.105 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0618 0.075 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 4.70e-03 -0.415 0.145 0.167 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00235 0.114 0.167 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 7.18e-02 0.253 0.14 0.167 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 1.91e-01 0.197 0.15 0.167 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0554 0.143 0.167 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 2.49e-01 -0.161 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 6.40e-01 0.057 0.122 0.167 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 6.15e-01 0.062 0.123 0.173 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0142 0.119 0.173 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0498 0.125 0.173 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 7.33e-01 0.0399 0.117 0.173 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0856 0.1 0.173 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00213 0.121 0.173 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 1.56e-01 -0.154 0.108 0.173 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 1.30e-01 -0.117 0.0773 0.173 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 3.64e-01 0.102 0.112 0.174 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 8.37e-01 0.0223 0.108 0.174 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 3.36e-01 -0.114 0.118 0.174 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00466 0.117 0.174 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 8.30e-02 -0.129 0.0741 0.174 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0621 0.117 0.174 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 5.78e-01 0.0617 0.111 0.174 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0855 0.0984 0.174 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 4.24e-01 -0.102 0.128 0.172 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 3.32e-01 -0.121 0.124 0.172 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0314 0.131 0.172 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 4.32e-01 0.102 0.129 0.172 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 5.15e-01 0.0809 0.124 0.172 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 3.74e-01 0.119 0.133 0.172 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0167 0.112 0.172 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0558 0.111 0.172 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 2.99e-01 -0.117 0.113 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 1.47e-01 -0.173 0.119 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0634 0.105 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 1.51e-03 0.38 0.118 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 1.52e-01 0.16 0.111 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0223 0.0722 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 8.58e-01 0.0181 0.101 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 9.79e-01 0.00263 0.1 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0647 0.0691 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 8.85e-01 0.0154 0.106 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 1.92e-01 -0.14 0.107 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 2.50e-01 -0.102 0.0882 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0334 0.115 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -775844 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0171 0.102 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0377 0.0872 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00773 0.0909 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 9.75e-01 0.00351 0.112 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00116 0.062 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 7.16e-01 0.0373 0.102 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 9.03e-01 0.00995 0.0812 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 4.57e-01 0.0653 0.0876 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0453 0.0953 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0501 0.0719 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 6.46e-01 0.0452 0.0981 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 1.20e-01 -0.138 0.0881 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 7.03e-03 -0.163 0.0598 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 2.57e-01 0.132 0.116 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0134 0.108 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0676 0.107 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0649 0.12 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 8.07e-02 -0.12 0.0685 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 9.14e-01 0.0123 0.115 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -441850 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0405 0.0979 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 6.82e-02 -0.142 0.0775 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -442114 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00679 0.105 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 125075 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0313 0.0976 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -697888 sc-eQTL 9.74e-01 0.00268 0.0835 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -297996 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0325 0.0947 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 627055 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00375 0.083 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 315644 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0526 0.0933 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 sc-eQTL 6.60e-02 -0.126 0.0681 0.175 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111142 METAP2 -697888 eQTL 0.00664 0.0294 0.0108 0.0 0.0 0.205
ENSG00000180263 FGD6 -441850 eQTL 0.0375 -0.0488 0.0234 0.0 0.0 0.205
ENSG00000184752 NDUFA12 -228116 eQTL 0.000142 -0.0822 0.0215 0.0 0.0 0.205

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina