logo

Genes within 1Mb (chr12:94765003:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0262 0.115 0.109 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 4.94e-02 -0.264 0.133 0.109 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0934 0.101 0.109 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 2.02e-01 0.162 0.127 0.109 B L1
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 8.00e-01 0.0295 0.116 0.109 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0211 0.0763 0.109 B L1
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0379 0.0963 0.109 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 3.16e-01 -0.117 0.116 0.109 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0311 0.0555 0.109 B L1
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 6.93e-01 -0.037 0.0937 0.109 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 1.44e-01 -0.119 0.081 0.109 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 5.74e-01 -0.051 0.0906 0.109 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 4.26e-01 0.0987 0.124 0.109 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 5.55e-01 0.0471 0.0796 0.109 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 3.93e-01 0.0713 0.0833 0.109 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 6.16e-02 -0.163 0.0868 0.109 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 3.41e-01 0.108 0.113 0.109 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 3.88e-01 -0.066 0.0763 0.109 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 1.90e-01 -0.127 0.0969 0.109 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0591 0.124 0.109 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 9.26e-01 0.0103 0.111 0.109 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 9.92e-01 0.00111 0.105 0.109 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 2.68e-01 0.109 0.0981 0.109 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 9.64e-01 0.00368 0.0805 0.109 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 7.92e-01 -0.035 0.132 0.11 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 2.70e-02 -0.309 0.139 0.11 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 8.21e-01 0.0315 0.139 0.11 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0681 0.135 0.11 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0328 0.126 0.11 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0467 0.112 0.11 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0845 0.124 0.11 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0924 0.105 0.11 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 3.73e-01 0.109 0.122 0.109 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00649 0.095 0.109 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 9.20e-01 0.00979 0.0973 0.109 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 3.35e-01 -0.112 0.116 0.109 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0332 0.0787 0.109 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 5.41e-01 0.0713 0.116 0.109 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 6.03e-01 -0.054 0.104 0.109 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 9.21e-03 -0.193 0.0733 0.109 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 8.40e-01 -0.025 0.124 0.109 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0743 0.117 0.109 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 6.19e-01 0.0487 0.0978 0.109 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0602 0.116 0.109 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 2.33e-01 -0.114 0.0952 0.109 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 3.27e-01 -0.106 0.108 0.109 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 8.80e-02 -0.136 0.0795 0.109 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 2.00e-01 -0.175 0.136 0.109 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0407 0.117 0.109 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 5.75e-01 0.0597 0.106 0.109 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 3.89e-02 0.273 0.131 0.109 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 2.86e-01 0.115 0.108 0.109 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 9.93e-01 0.00114 0.121 0.109 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 2.48e-02 -0.151 0.0667 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0707 0.153 0.107 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 5.30e-02 -0.252 0.129 0.107 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0586 0.16 0.107 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 3.80e-02 -0.316 0.151 0.107 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 6.25e-01 0.0572 0.117 0.107 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 8.21e-01 0.0279 0.123 0.107 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0576 0.154 0.107 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0141 0.108 0.107 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0689 0.135 0.107 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 2.67e-01 -0.151 0.136 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 6.96e-01 -0.054 0.138 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 7.26e-02 -0.225 0.125 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 2.04e-02 0.318 0.136 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 5.90e-01 0.076 0.141 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 9.87e-01 0.00183 0.116 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00804 0.128 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 9.11e-01 0.0141 0.126 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 1.72e-02 -0.247 0.103 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 3.95e-01 -0.12 0.141 0.11 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 3.55e-02 -0.301 0.142 0.11 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 5.11e-01 0.0902 0.137 0.11 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 8.31e-01 0.0315 0.148 0.11 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 3.82e-01 0.115 0.131 0.11 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 4.88e-01 0.0772 0.111 0.11 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 6.40e-01 0.0607 0.13 0.11 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 2.93e-01 -0.137 0.13 0.11 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 9.96e-01 0.000464 0.105 0.11 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 9.78e-02 -0.223 0.134 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 2.30e-01 -0.163 0.136 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 9.99e-01 0.000196 0.115 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 8.20e-01 0.0318 0.14 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 2.19e-01 -0.169 0.137 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0677 0.116 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0516 0.12 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 1.26e-01 -0.2 0.13 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 2.12e-01 0.0953 0.076 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 1.07e-02 0.368 0.143 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 2.99e-01 -0.138 0.132 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 4.07e-01 -0.111 0.134 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 8.53e-01 0.0273 0.147 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 3.27e-01 -0.131 0.134 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 6.65e-01 0.0537 0.124 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 4.89e-01 0.0907 0.131 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 2.82e-01 0.118 0.109 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 3.51e-01 0.101 0.108 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 1.15e-01 0.229 0.145 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 1.68e-01 -0.21 0.152 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 3.05e-01 -0.157 0.153 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 4.07e-01 -0.101 0.121 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0537 0.136 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0216 0.139 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 5.78e-01 -0.07 0.126 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 2.88e-01 0.113 0.106 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 2.74e-01 -0.101 0.092 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0707 0.112 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 5.70e-01 0.0737 0.13 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 5.99e-01 0.0465 0.0882 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 2.99e-01 0.0992 0.0953 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 9.01e-02 -0.139 0.0815 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 8.60e-02 -0.194 0.112 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 2.57e-01 -0.12 0.106 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 1.55e-01 -0.175 0.123 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 1.13e-01 0.228 0.143 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 2.74e-01 0.116 0.105 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 6.26e-01 0.055 0.113 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 3.96e-02 -0.199 0.0961 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 3.72e-01 -0.131 0.146 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0602 0.13 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 9.57e-02 0.226 0.135 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 7.07e-01 0.0514 0.137 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 6.84e-01 0.0475 0.117 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 8.67e-01 -0.022 0.131 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0228 0.119 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 3.04e-01 0.133 0.129 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 6.32e-01 0.0546 0.114 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0211 0.129 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 4.82e-01 -0.101 0.143 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 2.63e-01 -0.153 0.136 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 9.67e-02 0.193 0.116 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 7.69e-01 0.0379 0.129 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0469 0.101 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0243 0.134 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 8.56e-01 0.019 0.104 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0979 0.121 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0771 0.134 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 6.44e-01 0.0559 0.121 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0837 0.122 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 5.49e-01 0.0708 0.118 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 4.76e-01 0.0698 0.0977 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 1.77e-01 -0.196 0.145 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 1.70e-01 0.154 0.111 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 8.80e-01 0.0222 0.147 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 9.76e-01 0.00447 0.148 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 8.65e-01 0.0227 0.133 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0685 0.14 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 9.62e-01 0.00686 0.144 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 9.10e-02 -0.195 0.115 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0171 0.151 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 8.79e-04 -0.428 0.127 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 3.47e-01 -0.138 0.147 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 2.81e-01 -0.167 0.154 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 2.18e-02 0.293 0.127 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00712 0.146 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0174 0.151 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 9.33e-01 0.0108 0.129 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0505 0.142 0.108 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0279 0.12 0.108 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 6.87e-02 0.251 0.137 0.108 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 2.67e-01 0.149 0.134 0.108 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 1.98e-01 0.152 0.117 0.108 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 3.06e-01 -0.138 0.135 0.108 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 3.49e-01 -0.11 0.118 0.108 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 4.37e-01 -0.111 0.142 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 4.00e-01 0.114 0.136 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 4.10e-01 0.115 0.14 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 4.63e-01 0.108 0.147 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 3.88e-01 -0.104 0.12 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 2.87e-01 -0.13 0.122 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0502 0.117 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 9.43e-02 -0.229 0.137 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 3.95e-01 -0.102 0.119 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 3.85e-01 0.108 0.124 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 7.55e-01 0.0395 0.126 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0357 0.111 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 2.81e-02 -0.28 0.127 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 3.72e-02 -0.186 0.0886 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 7.48e-02 0.27 0.151 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 8.24e-01 -0.03 0.135 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 1.38e-01 0.21 0.141 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0166 0.149 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 8.41e-01 0.0245 0.122 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 2.26e-01 0.169 0.14 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0559 0.126 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 6.03e-01 0.0664 0.128 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 8.68e-01 0.0217 0.131 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0155 0.13 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 2.85e-01 -0.143 0.134 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0333 0.116 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 9.54e-01 0.00763 0.133 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0787 0.0928 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 5.03e-01 -0.115 0.17 0.119 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0301 0.154 0.119 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 2.41e-01 0.2 0.169 0.119 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0599 0.162 0.119 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 1.62e-01 0.213 0.151 0.119 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0309 0.157 0.119 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 2.12e-01 -0.204 0.163 0.119 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 6.13e-01 -0.069 0.136 0.119 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0472 0.0956 0.119 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 9.16e-01 0.0142 0.134 0.107 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0945 0.119 0.107 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 3.27e-01 -0.113 0.115 0.107 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 6.89e-01 0.0556 0.139 0.107 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 2.49e-01 -0.157 0.135 0.107 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 7.43e-01 0.0441 0.134 0.107 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 1.17e-01 -0.132 0.0835 0.107 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 9.83e-01 0.00301 0.14 0.109 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 1.50e-01 0.19 0.131 0.109 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 8.30e-01 0.0301 0.14 0.109 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 4.50e-01 0.0945 0.125 0.109 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 9.34e-01 0.0107 0.129 0.109 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0902 0.138 0.109 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 8.46e-02 -0.182 0.105 0.109 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 3.84e-02 0.281 0.135 0.11 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0972 0.147 0.11 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 7.06e-02 0.269 0.148 0.11 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 6.75e-01 0.0605 0.144 0.11 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 4.45e-01 0.0981 0.128 0.11 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 3.06e-01 -0.123 0.12 0.11 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 1.02e-01 -0.226 0.137 0.11 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0738 0.118 0.11 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 7.32e-01 0.0465 0.136 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0373 0.107 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 9.93e-01 -0.0011 0.117 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0227 0.123 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 4.34e-01 0.0736 0.0939 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 2.37e-01 0.151 0.128 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0886 0.109 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 5.48e-04 -0.265 0.0755 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0526 0.139 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 3.64e-01 0.11 0.121 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 1.79e-01 0.18 0.134 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0493 0.132 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 3.11e-01 -0.1 0.0989 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0942 0.14 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 8.96e-01 0.0168 0.128 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 8.26e-01 0.0201 0.0913 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 5.12e-02 -0.328 0.167 0.112 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 9.49e-01 0.00826 0.129 0.112 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 2.24e-01 0.195 0.16 0.112 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 2.48e-01 0.198 0.171 0.112 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 3.46e-01 0.154 0.162 0.112 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 3.17e-01 -0.159 0.159 0.112 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 2.04e-01 -0.176 0.138 0.112 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 7.99e-01 0.038 0.149 0.109 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 6.11e-01 0.0736 0.145 0.109 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 3.39e-01 -0.145 0.152 0.109 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 9.97e-01 0.00045 0.142 0.109 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 2.95e-01 -0.128 0.122 0.109 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 5.02e-01 0.0986 0.147 0.109 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 2.22e-01 -0.161 0.131 0.109 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 1.40e-01 -0.139 0.0937 0.109 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 1.39e-01 0.204 0.137 0.106 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00358 0.133 0.106 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0569 0.145 0.106 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0758 0.144 0.106 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0375 0.0917 0.106 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0969 0.143 0.106 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0686 0.136 0.106 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0638 0.121 0.106 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 4.79e-02 -0.305 0.153 0.105 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 6.08e-02 -0.282 0.149 0.105 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0158 0.158 0.105 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0348 0.156 0.105 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 7.68e-01 0.0444 0.15 0.105 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 4.11e-01 0.133 0.161 0.105 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00327 0.136 0.105 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0734 0.134 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 3.18e-01 -0.137 0.137 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 1.07e-01 -0.233 0.144 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0798 0.128 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 4.00e-02 0.3 0.145 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 3.67e-01 0.123 0.136 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0026 0.0876 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 9.64e-01 0.00551 0.122 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 3.41e-01 -0.116 0.121 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 9.42e-02 -0.14 0.0834 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 7.20e-01 0.0461 0.128 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 1.84e-01 -0.173 0.13 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0852 0.107 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 8.34e-01 0.0292 0.139 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -786473 sc-eQTL 2.04e-01 -0.157 0.123 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0295 0.106 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000267 0.11 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0666 0.136 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 2.54e-01 0.0856 0.0749 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 6.76e-01 0.0523 0.125 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 9.99e-01 8.2e-05 0.099 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 4.42e-01 0.0821 0.107 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0462 0.116 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 9.96e-01 0.000457 0.0878 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 8.26e-01 0.0263 0.12 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0516 0.108 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 1.54e-02 -0.179 0.0731 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 1.06e-01 0.228 0.141 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0193 0.131 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 2.64e-01 -0.145 0.129 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0839 0.145 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0667 0.0836 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 8.10e-01 0.0334 0.139 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -452479 sc-eQTL 3.24e-01 -0.117 0.119 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 1.21e-01 -0.147 0.0942 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -452743 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0367 0.127 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 114446 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0994 0.119 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -708517 sc-eQTL 6.12e-01 0.0515 0.102 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -308625 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0942 0.115 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0845 0.101 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 305015 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0895 0.113 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 sc-eQTL 4.87e-02 -0.164 0.0826 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111142 METAP2 -708517 eQTL 0.00124 0.0401 0.0124 0.0 0.0 0.14
ENSG00000136040 PLXNC1 616426 eQTL 0.0419 -0.0235 0.0115 0.0 0.0 0.14
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 eQTL 3.02e-06 -0.116 0.0247 0.0 0.0 0.14

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000184752 NDUFA12 -238745 4e-06 1.34e-06 2.87e-07 1.27e-06 3.57e-07 6.91e-07 1.41e-06 4.1e-07 1.66e-06 5.06e-07 2.03e-06 1.05e-06 2.64e-06 2.68e-07 5.34e-07 9.48e-07 9.71e-07 1.16e-06 8.35e-07 4.74e-07 5.61e-07 1.91e-06 9.18e-07 6.68e-07 2.35e-06 7.32e-07 9.36e-07 8.04e-07 1.53e-06 1.16e-06 8.13e-07 2.42e-07 3.01e-07 6.78e-07 6.86e-07 4.6e-07 4.82e-07 1.7e-07 3.87e-07 7.66e-08 1.85e-07 1.73e-06 4.85e-07 1.06e-07 1.82e-07 2.15e-07 2.45e-07 4.82e-08 9.42e-08