logo

Genes within 1Mb (chr12:94761920:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 8.00e-01 0.0364 0.143 0.071 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0509 0.169 0.071 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 5.01e-01 -0.085 0.126 0.071 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0529 0.159 0.071 B L1
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0623 0.145 0.071 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 1.38e-01 0.142 0.0951 0.071 B L1
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 6.52e-03 0.326 0.119 0.071 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 5.19e-01 0.0942 0.146 0.071 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 1.16e-01 0.109 0.0692 0.071 B L1
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0182 0.118 0.071 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 9.45e-01 0.00711 0.103 0.071 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 3.61e-01 -0.105 0.114 0.071 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0281 0.156 0.071 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 4.84e-01 0.0705 0.101 0.071 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 7.84e-01 0.0289 0.105 0.071 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 5.21e-01 -0.071 0.11 0.071 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 1.99e-01 -0.182 0.141 0.071 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0567 0.0954 0.071 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0508 0.121 0.071 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 6.52e-01 0.0699 0.155 0.071 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 2.74e-02 0.304 0.137 0.071 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 4.00e-01 -0.111 0.131 0.071 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 2.80e-01 0.133 0.123 0.071 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 8.98e-02 -0.17 0.0999 0.071 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 3.70e-01 -0.155 0.172 0.07 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 3.16e-01 -0.183 0.182 0.07 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 4.14e-01 -0.148 0.181 0.07 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 6.95e-01 0.0689 0.175 0.07 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 9.17e-01 -0.017 0.164 0.07 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0803 0.146 0.07 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 1.63e-01 0.226 0.161 0.07 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000823 0.137 0.07 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0767 0.157 0.071 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 1.51e-01 -0.175 0.122 0.071 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0233 0.125 0.071 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 4.69e-01 0.108 0.149 0.071 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 9.77e-01 0.00299 0.101 0.071 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 7.78e-01 0.0424 0.15 0.071 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0758 0.133 0.071 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 1.45e-01 -0.14 0.0954 0.071 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 9.29e-02 0.263 0.156 0.071 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0225 0.148 0.071 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 2.69e-01 -0.137 0.124 0.071 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0504 0.147 0.071 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 2.20e-01 0.148 0.121 0.071 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 8.02e-01 0.0345 0.138 0.071 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0322 0.101 0.071 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0549 0.175 0.071 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 6.03e-01 0.0774 0.149 0.071 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 2.14e-01 -0.169 0.135 0.071 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 6.81e-01 0.0698 0.17 0.071 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 2.09e-01 0.173 0.137 0.071 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 9.32e-01 0.0132 0.155 0.071 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 7.20e-01 0.031 0.0862 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 7.72e-01 0.0542 0.187 0.082 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 7.44e-01 0.052 0.159 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0526 0.195 0.082 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 2.67e-01 -0.207 0.186 0.082 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 9.96e-01 0.000763 0.143 0.082 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 2.88e-01 0.16 0.15 0.082 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 1.02e-01 -0.306 0.186 0.082 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 6.65e-01 0.0573 0.132 0.082 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 1.43e-01 0.241 0.164 0.082 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 9.66e-01 0.00729 0.171 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 7.18e-02 -0.311 0.172 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 7.71e-01 0.0462 0.158 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 1.78e-01 -0.234 0.173 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 4.79e-01 0.126 0.177 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 4.02e-02 0.298 0.144 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 2.75e-01 0.176 0.161 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 9.07e-01 0.0186 0.159 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 2.07e-01 0.166 0.131 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 7.79e-01 0.0509 0.181 0.069 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 6.72e-02 0.336 0.183 0.069 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0688 0.176 0.069 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 1.37e-01 0.281 0.188 0.069 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 1.57e-01 -0.238 0.168 0.069 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 1.15e-01 -0.224 0.142 0.069 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 5.57e-02 0.317 0.165 0.069 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 1.39e-01 0.248 0.167 0.069 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 4.44e-02 0.27 0.134 0.069 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 5.57e-01 0.0993 0.169 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 4.75e-01 0.122 0.171 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 3.77e-01 -0.127 0.143 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 8.11e-01 -0.042 0.175 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 5.61e-01 -0.1 0.173 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 2.93e-01 0.153 0.145 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 6.13e-02 0.28 0.149 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0435 0.164 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 4.40e-01 -0.074 0.0955 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 5.22e-01 0.117 0.183 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0142 0.167 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 4.15e-01 -0.138 0.169 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 3.43e-01 0.175 0.184 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0442 0.169 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 2.84e-01 0.168 0.156 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 3.25e-01 0.162 0.165 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 6.07e-01 0.0713 0.138 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 5.57e-01 0.0799 0.136 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 7.31e-02 -0.33 0.183 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 4.31e-01 0.152 0.192 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 2.36e-01 -0.229 0.193 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0407 0.153 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 8.12e-01 -0.041 0.172 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0471 0.176 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 5.49e-01 0.0951 0.159 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 3.70e-01 -0.121 0.134 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0723 0.116 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0516 0.142 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0228 0.164 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00876 0.112 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 8.90e-01 0.0167 0.121 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0701 0.103 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 1.27e-01 0.22 0.143 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 7.68e-02 0.239 0.134 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 8.65e-01 0.0269 0.157 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 3.65e-01 -0.166 0.183 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0851 0.135 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 2.42e-01 0.168 0.143 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 3.06e-01 -0.127 0.123 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 2.07e-01 -0.231 0.183 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 2.21e-01 -0.199 0.162 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0874 0.171 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 5.26e-01 0.109 0.171 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 1.91e-01 0.191 0.146 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0268 0.164 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0464 0.149 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0263 0.163 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0904 0.143 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 2.47e-01 0.189 0.162 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0469 0.18 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 3.98e-01 0.146 0.172 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 4.34e-01 -0.115 0.147 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 4.49e-01 0.123 0.162 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 3.53e-01 -0.119 0.127 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0153 0.165 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 8.87e-01 0.0184 0.129 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 1.16e-01 -0.234 0.149 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 7.55e-01 0.0517 0.166 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 2.90e-01 0.158 0.149 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 4.59e-01 -0.112 0.151 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 4.17e-01 0.119 0.146 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 6.09e-01 -0.062 0.121 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0948 0.186 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 1.98e-01 -0.185 0.143 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 1.48e-01 -0.272 0.188 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 8.92e-02 0.322 0.188 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 7.08e-01 -0.064 0.17 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 1.81e-01 -0.24 0.179 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0841 0.184 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 2.88e-01 -0.158 0.148 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0523 0.183 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 2.23e-01 0.192 0.157 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 6.37e-01 0.0841 0.178 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 3.37e-01 0.18 0.187 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0257 0.155 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 6.53e-01 0.0796 0.177 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 1.55e-01 -0.26 0.182 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 6.84e-02 -0.283 0.155 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0547 0.181 0.069 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 9.27e-01 0.0141 0.153 0.069 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 4.29e-02 -0.355 0.174 0.069 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 2.39e-01 0.201 0.17 0.069 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 9.57e-01 0.00809 0.15 0.069 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 5.64e-01 0.0993 0.172 0.069 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 9.45e-01 0.0103 0.15 0.069 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 8.18e-01 0.0424 0.184 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 5.46e-01 -0.106 0.176 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0133 0.181 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 5.45e-01 -0.115 0.19 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00305 0.156 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 6.33e-01 0.0754 0.157 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 4.38e-01 -0.117 0.151 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 2.42e-02 0.396 0.174 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0252 0.154 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 1.65e-01 -0.221 0.159 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 9.96e-01 0.000885 0.162 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 4.52e-01 0.107 0.142 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 5.27e-01 -0.104 0.165 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 6.39e-01 0.054 0.115 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 9.99e-01 0.000198 0.198 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00558 0.176 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0316 0.185 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 7.63e-01 0.059 0.195 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0726 0.159 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 1.05e-01 0.296 0.182 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 2.16e-01 -0.204 0.164 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 4.85e-01 0.114 0.164 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 3.44e-01 0.159 0.168 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 7.98e-01 0.0427 0.166 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 1.96e-01 -0.223 0.172 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 1.82e-01 0.199 0.148 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 2.47e-01 0.198 0.171 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 1.53e-01 -0.17 0.119 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 9.28e-01 0.0202 0.223 0.063 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 4.13e-01 -0.164 0.2 0.063 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 4.33e-02 -0.446 0.218 0.063 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 1.90e-01 -0.276 0.21 0.063 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0338 0.199 0.063 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0436 0.205 0.063 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 4.63e-01 0.157 0.213 0.063 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 2.77e-02 0.388 0.174 0.063 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 9.03e-03 0.322 0.121 0.063 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0651 0.175 0.07 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 5.67e-01 0.0894 0.156 0.07 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 1.33e-01 -0.226 0.149 0.07 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 5.06e-01 0.121 0.181 0.07 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 2.13e-01 0.221 0.177 0.07 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 5.48e-01 -0.106 0.175 0.07 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0257 0.11 0.07 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 1.79e-02 0.417 0.175 0.071 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 4.16e-01 -0.136 0.167 0.071 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 7.72e-02 -0.312 0.176 0.071 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0762 0.158 0.071 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 1.78e-01 0.22 0.163 0.071 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 5.58e-01 0.102 0.175 0.071 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 9.13e-01 0.0147 0.134 0.071 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 7.70e-01 0.0505 0.173 0.073 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 1.60e-01 -0.261 0.185 0.073 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 4.72e-01 -0.136 0.189 0.073 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 6.42e-01 0.0847 0.182 0.073 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 5.19e-01 0.105 0.162 0.073 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 4.24e-01 -0.122 0.152 0.073 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 4.39e-02 0.351 0.173 0.073 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0577 0.149 0.073 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0492 0.173 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0707 0.136 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 5.43e-01 0.0909 0.149 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0197 0.158 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 6.45e-01 0.0554 0.12 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 6.86e-01 0.0663 0.164 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 2.89e-01 -0.148 0.139 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 7.86e-01 0.027 0.0991 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 4.58e-01 -0.131 0.177 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 1.74e-02 -0.366 0.153 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 7.88e-01 0.046 0.171 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 2.69e-01 0.186 0.168 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0697 0.126 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 6.97e-02 0.323 0.177 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00855 0.163 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 2.91e-01 -0.123 0.116 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 9.63e-01 0.0103 0.221 0.073 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 5.12e-01 -0.111 0.169 0.073 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0754 0.21 0.073 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 9.39e-02 -0.375 0.222 0.073 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 3.65e-01 0.193 0.212 0.073 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 1.05e-01 0.336 0.206 0.073 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 6.40e-01 0.0847 0.181 0.073 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 4.11e-01 -0.155 0.188 0.071 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 7.04e-01 0.0696 0.183 0.071 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 1.17e-01 -0.301 0.191 0.071 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 9.29e-01 -0.016 0.179 0.071 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 2.65e-01 0.172 0.154 0.071 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 4.65e-01 -0.136 0.186 0.071 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0165 0.167 0.071 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 2.01e-01 -0.152 0.119 0.071 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 5.27e-01 0.109 0.172 0.072 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0884 0.166 0.072 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 5.47e-01 0.109 0.181 0.072 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0374 0.18 0.072 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 3.52e-01 -0.107 0.114 0.072 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 6.87e-01 0.0722 0.179 0.072 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 8.97e-01 -0.022 0.17 0.072 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 8.22e-01 0.034 0.151 0.072 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0857 0.193 0.076 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0295 0.188 0.076 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 8.61e-01 0.0346 0.197 0.076 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 3.30e-01 -0.189 0.194 0.076 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0226 0.187 0.076 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 8.51e-01 0.0378 0.201 0.076 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 7.27e-01 0.0591 0.169 0.076 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 7.84e-01 0.0457 0.167 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0144 0.174 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00358 0.184 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 6.67e-01 0.0698 0.162 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 4.07e-01 -0.155 0.186 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 7.35e-01 0.0586 0.173 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 2.03e-01 0.141 0.111 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 1.84e-01 0.206 0.155 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 2.75e-01 0.169 0.154 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 1.66e-02 0.254 0.105 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 6.16e-01 0.081 0.161 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 7.63e-01 0.0493 0.164 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 3.03e-01 -0.139 0.134 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 9.27e-01 0.0161 0.175 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -789556 sc-eQTL 7.09e-01 -0.058 0.155 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 2.27e-01 0.16 0.132 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 2.57e-02 0.307 0.137 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0261 0.171 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0268 0.0943 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 4.56e-01 -0.119 0.159 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 6.73e-02 -0.231 0.125 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 7.84e-01 0.0374 0.136 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 6.26e-01 0.0723 0.148 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 8.73e-01 0.0179 0.112 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 3.77e-01 0.135 0.152 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0929 0.138 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0682 0.0945 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0208 0.18 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 8.76e-01 0.0262 0.167 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0731 0.165 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0663 0.185 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0617 0.107 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0213 0.177 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -455562 sc-eQTL 8.33e-01 -0.032 0.151 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 3.99e-01 -0.102 0.121 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -455826 sc-eQTL 3.61e-02 0.338 0.16 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 111363 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0228 0.151 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -711600 sc-eQTL 2.89e-01 -0.137 0.129 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -311708 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0831 0.146 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 613343 sc-eQTL 1.30e-01 0.194 0.128 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 301932 sc-eQTL 9.33e-01 0.0122 0.144 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -241828 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0118 0.106 0.071 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136014 \N -789556 4.68e-07 2.17e-07 7.45e-08 2.54e-07 1.02e-07 8.85e-08 3.25e-07 5.82e-08 1.86e-07 1.28e-07 2.98e-07 1.62e-07 6.47e-07 8.54e-08 7.35e-08 9.01e-08 1.01e-07 2.75e-07 7.36e-08 6.16e-08 1.33e-07 2.3e-07 1.73e-07 4.15e-08 4.54e-07 1.39e-07 1.22e-07 1.42e-07 1.4e-07 1.85e-07 2.19e-07 5.54e-08 5.53e-08 1.01e-07 6.98e-08 5.04e-08 6.2e-08 8.25e-08 6.39e-08 5.13e-08 5.65e-08 2.65e-07 2.32e-08 7.35e-09 3.61e-08 8.59e-09 7.66e-08 2.75e-09 5.58e-08