logo

Genes within 1Mb (chr12:94761905:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00712 0.114 0.111 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 4.77e-02 -0.263 0.132 0.111 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0696 0.0999 0.111 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 2.79e-01 0.137 0.126 0.111 B L1
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 7.83e-01 0.0317 0.115 0.111 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0396 0.0756 0.111 B L1
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0352 0.0955 0.111 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 3.12e-01 -0.117 0.115 0.111 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0235 0.0551 0.111 B L1
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0257 0.0932 0.111 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 1.95e-01 -0.105 0.0806 0.111 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0383 0.0901 0.111 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 4.88e-01 0.0853 0.123 0.111 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 6.29e-01 0.0383 0.0791 0.111 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 4.79e-01 0.0587 0.0828 0.111 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 7.02e-02 -0.157 0.0863 0.111 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 3.99e-01 0.0954 0.113 0.111 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0563 0.0758 0.111 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 2.52e-01 -0.111 0.0963 0.111 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0579 0.123 0.111 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 8.49e-01 0.021 0.11 0.111 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 9.00e-01 0.0132 0.105 0.111 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 2.87e-01 0.104 0.0974 0.111 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00242 0.08 0.111 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 7.92e-01 -0.035 0.132 0.11 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 2.70e-02 -0.309 0.139 0.11 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 8.21e-01 0.0315 0.139 0.11 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0681 0.135 0.11 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0328 0.126 0.11 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0467 0.112 0.11 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0845 0.124 0.11 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0924 0.105 0.11 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 6.60e-01 0.0537 0.122 0.111 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 8.41e-01 -0.019 0.0947 0.111 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0122 0.097 0.111 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 3.84e-01 -0.101 0.115 0.111 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 6.84e-01 -0.032 0.0785 0.111 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 4.52e-01 0.0873 0.116 0.111 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0122 0.103 0.111 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 9.51e-03 -0.191 0.0731 0.111 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0248 0.123 0.112 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 5.63e-01 -0.067 0.116 0.112 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 5.54e-01 0.0575 0.097 0.112 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0623 0.115 0.112 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 2.23e-01 -0.115 0.0944 0.112 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 4.14e-01 -0.088 0.108 0.112 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 7.47e-02 -0.141 0.0789 0.112 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 2.29e-01 -0.163 0.135 0.111 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00781 0.116 0.111 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 4.16e-01 0.0859 0.105 0.111 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 3.79e-02 0.273 0.13 0.111 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 2.07e-01 0.135 0.107 0.111 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0207 0.12 0.111 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 2.62e-02 -0.148 0.0662 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0253 0.151 0.11 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 1.06e-01 -0.208 0.128 0.11 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 9.51e-01 0.00965 0.158 0.11 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 2.52e-02 -0.337 0.149 0.11 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 6.75e-01 0.0484 0.115 0.11 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 8.35e-01 0.0254 0.122 0.11 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0595 0.152 0.11 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0228 0.107 0.11 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0403 0.134 0.11 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 2.50e-01 -0.155 0.135 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 8.15e-01 -0.032 0.137 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 8.30e-02 -0.216 0.124 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 2.93e-02 0.297 0.135 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 5.88e-01 0.076 0.14 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0139 0.115 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00331 0.128 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0283 0.125 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 2.01e-02 -0.24 0.102 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0722 0.14 0.112 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 4.84e-02 -0.28 0.141 0.112 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 4.30e-01 0.107 0.136 0.112 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 7.78e-01 0.0413 0.146 0.112 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 3.81e-01 0.114 0.13 0.112 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 5.41e-01 0.0675 0.11 0.112 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 5.71e-01 0.0729 0.129 0.112 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 3.41e-01 -0.124 0.13 0.112 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 9.07e-01 0.0123 0.104 0.112 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 1.20e-01 -0.207 0.133 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 1.69e-01 -0.186 0.135 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 9.19e-01 0.0116 0.114 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 8.52e-01 0.0259 0.139 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 1.89e-01 -0.18 0.136 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 4.97e-01 -0.078 0.115 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0457 0.119 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 1.36e-01 -0.194 0.129 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 2.16e-01 0.0936 0.0755 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 6.45e-03 0.389 0.141 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 3.02e-01 -0.136 0.131 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0894 0.133 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0086 0.145 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 3.84e-01 -0.116 0.133 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 8.11e-01 0.0294 0.123 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 4.27e-01 0.103 0.13 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 1.85e-01 0.144 0.108 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 3.56e-01 0.0987 0.107 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 1.13e-01 0.229 0.144 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 1.96e-01 -0.196 0.151 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 2.30e-01 -0.183 0.152 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0926 0.12 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0434 0.135 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0167 0.139 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0758 0.125 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 2.05e-01 0.134 0.105 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0883 0.0914 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0685 0.112 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 5.82e-01 0.0709 0.129 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 6.47e-01 0.0402 0.0877 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 3.60e-01 0.087 0.0947 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 1.22e-01 -0.126 0.081 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 1.00e-01 -0.184 0.112 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 3.14e-01 -0.106 0.105 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 2.56e-01 -0.139 0.122 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 1.42e-01 0.21 0.142 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 3.50e-01 0.0983 0.105 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 6.85e-01 0.0455 0.112 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 4.34e-02 -0.194 0.0955 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 3.06e-01 -0.149 0.145 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0608 0.129 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 8.23e-02 0.234 0.134 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 7.33e-01 0.0464 0.136 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 7.87e-01 0.0314 0.116 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0363 0.13 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00329 0.118 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 3.57e-01 0.118 0.128 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 5.25e-01 0.0719 0.113 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00518 0.128 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 4.64e-01 -0.104 0.142 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 3.70e-01 -0.122 0.136 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 9.18e-02 0.195 0.115 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 7.95e-01 0.0333 0.128 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0441 0.1 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0166 0.133 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 9.07e-01 0.0121 0.104 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0773 0.12 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0712 0.133 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 6.92e-01 0.0477 0.12 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0914 0.122 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 6.25e-01 0.0574 0.117 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 4.86e-01 0.0678 0.0971 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 1.76e-01 -0.195 0.144 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 1.96e-01 0.144 0.111 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 9.14e-01 0.0158 0.146 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 9.87e-01 0.00239 0.147 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 9.18e-01 0.0136 0.132 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0689 0.139 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 9.96e-01 0.000726 0.143 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 7.46e-02 -0.204 0.114 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0201 0.15 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 1.60e-03 -0.403 0.126 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 4.00e-01 -0.123 0.146 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 3.24e-01 -0.151 0.153 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 1.66e-02 0.303 0.125 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 9.07e-01 0.0169 0.145 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00868 0.15 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 9.47e-01 0.00851 0.128 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 8.43e-01 -0.028 0.141 0.11 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00446 0.12 0.11 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 4.80e-02 0.27 0.136 0.11 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 2.42e-01 0.156 0.133 0.11 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 1.34e-01 0.175 0.116 0.11 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 2.43e-01 -0.157 0.134 0.11 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 3.11e-01 -0.119 0.117 0.11 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0851 0.141 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 4.11e-01 0.111 0.135 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 3.17e-01 0.139 0.138 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 5.57e-01 0.0856 0.146 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 3.42e-01 -0.113 0.119 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 3.52e-01 -0.112 0.121 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0429 0.116 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 9.86e-02 -0.225 0.136 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0896 0.119 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 3.70e-01 0.11 0.123 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 8.04e-01 0.0312 0.125 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0292 0.11 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 3.95e-02 -0.261 0.126 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 2.54e-02 -0.198 0.0878 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 7.40e-02 0.268 0.149 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0218 0.134 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 1.17e-01 0.22 0.14 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00604 0.148 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 8.13e-01 0.0286 0.121 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 2.89e-01 0.147 0.139 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0418 0.125 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 6.68e-01 0.0544 0.127 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 9.19e-01 0.0132 0.13 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 9.87e-01 0.00206 0.129 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 2.88e-01 -0.141 0.133 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0438 0.115 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 8.47e-01 0.0256 0.132 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0848 0.092 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 5.03e-01 -0.115 0.17 0.119 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0301 0.154 0.119 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 2.41e-01 0.2 0.169 0.119 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0599 0.162 0.119 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 1.62e-01 0.213 0.151 0.119 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0309 0.157 0.119 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 2.12e-01 -0.204 0.163 0.119 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 6.13e-01 -0.069 0.136 0.119 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0472 0.0956 0.119 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00334 0.133 0.109 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0719 0.118 0.109 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 3.78e-01 -0.101 0.114 0.109 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 6.42e-01 0.064 0.138 0.109 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 2.47e-01 -0.156 0.134 0.109 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 7.42e-01 0.0439 0.133 0.109 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 1.28e-01 -0.126 0.0829 0.109 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00918 0.139 0.111 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 1.18e-01 0.204 0.13 0.111 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 8.01e-01 0.0349 0.139 0.111 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 6.19e-01 0.0618 0.124 0.111 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 8.53e-01 0.0237 0.128 0.111 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 4.24e-01 -0.109 0.137 0.111 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 6.21e-02 -0.195 0.104 0.111 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 3.84e-02 0.281 0.135 0.11 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0972 0.147 0.11 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 7.06e-02 0.269 0.148 0.11 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 6.75e-01 0.0605 0.144 0.11 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 4.45e-01 0.0981 0.128 0.11 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 3.06e-01 -0.123 0.12 0.11 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 1.02e-01 -0.226 0.137 0.11 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0738 0.118 0.11 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 7.72e-01 0.0393 0.135 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0398 0.106 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00853 0.117 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 9.03e-01 -0.015 0.123 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 4.65e-01 0.0686 0.0937 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 2.33e-01 0.153 0.127 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0897 0.109 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 5.44e-04 -0.264 0.0753 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0673 0.139 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 4.04e-01 0.102 0.122 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 2.51e-01 0.155 0.134 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0479 0.133 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0975 0.0993 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0961 0.141 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 7.33e-01 0.044 0.129 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 9.05e-01 0.011 0.0917 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 4.97e-02 -0.333 0.168 0.115 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 7.27e-01 0.0456 0.131 0.115 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 2.34e-01 0.193 0.161 0.115 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 2.39e-01 0.204 0.173 0.115 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 4.59e-01 0.122 0.164 0.115 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 3.49e-01 -0.151 0.16 0.115 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 2.50e-01 -0.161 0.139 0.115 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 7.99e-01 0.038 0.149 0.109 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 6.11e-01 0.0736 0.145 0.109 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 3.39e-01 -0.145 0.152 0.109 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 9.97e-01 0.00045 0.142 0.109 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 2.95e-01 -0.128 0.122 0.109 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 5.02e-01 0.0986 0.147 0.109 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 2.22e-01 -0.161 0.131 0.109 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 1.40e-01 -0.139 0.0937 0.109 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 1.00e-01 0.224 0.136 0.109 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0268 0.132 0.109 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 1.00e+00 1.15e-05 0.144 0.109 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0597 0.143 0.109 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00975 0.0909 0.109 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0766 0.142 0.109 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0789 0.135 0.109 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0709 0.12 0.109 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 4.79e-02 -0.305 0.153 0.105 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 6.08e-02 -0.282 0.149 0.105 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0158 0.158 0.105 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0348 0.156 0.105 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 7.68e-01 0.0444 0.15 0.105 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 4.11e-01 0.133 0.161 0.105 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00327 0.136 0.105 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0734 0.134 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 4.02e-01 -0.114 0.136 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 1.68e-01 -0.198 0.143 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0563 0.127 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 5.27e-02 0.282 0.145 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 3.72e-01 0.121 0.135 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0139 0.087 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 9.32e-01 0.0104 0.122 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 2.88e-01 -0.128 0.121 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 1.36e-01 -0.124 0.083 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 6.17e-01 0.0638 0.127 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 1.43e-01 -0.189 0.129 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0637 0.106 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 9.66e-01 0.00586 0.138 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -789571 sc-eQTL 2.12e-01 -0.153 0.122 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0474 0.105 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 9.67e-01 0.00447 0.109 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0477 0.135 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 2.48e-01 0.0861 0.0743 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 9.66e-01 0.00531 0.125 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 9.51e-01 0.00614 0.0988 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 6.12e-01 0.0541 0.107 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0317 0.116 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0122 0.0876 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 7.96e-01 0.0308 0.119 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0229 0.108 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 1.39e-02 -0.181 0.073 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 1.06e-01 0.227 0.14 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0308 0.13 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 2.01e-01 -0.165 0.128 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0225 0.144 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0503 0.0831 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 8.10e-01 0.0333 0.138 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -455577 sc-eQTL 2.73e-01 -0.129 0.118 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 1.05e-01 -0.152 0.0935 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -455841 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0419 0.126 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 111348 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0912 0.118 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -711615 sc-eQTL 5.62e-01 0.0585 0.101 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -311723 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0947 0.114 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0848 0.1 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 301917 sc-eQTL 5.23e-01 -0.072 0.113 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 sc-eQTL 3.79e-02 -0.171 0.0819 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111142 METAP2 -711615 eQTL 0.00133 0.0405 0.0126 0.0 0.0 0.139
ENSG00000136040 PLXNC1 613328 eQTL 0.0361 -0.0246 0.0117 0.0 0.0 0.139
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 eQTL 6.41e-06 -0.114 0.0251 0.0 0.0 0.139

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000184752 NDUFA12 -241843 3.99e-06 4.63e-06 9.13e-07 3.22e-06 1.21e-06 1.62e-06 3.08e-06 6.98e-07 3.32e-06 1.91e-06 4.22e-06 3.43e-06 5.56e-06 1.77e-06 1.3e-06 2.42e-06 1.56e-06 2.72e-06 1.45e-06 1.52e-06 2.2e-06 3.42e-06 3.51e-06 1.71e-06 4.77e-06 1.13e-06 1.84e-06 1.44e-06 4.18e-06 4.14e-06 2.05e-06 5.09e-07 5.68e-07 1.78e-06 1.74e-06 8.71e-07 1.06e-06 4.39e-07 1.32e-06 3.42e-07 1.82e-07 5.65e-06 1.28e-06 1.53e-07 7.84e-07 3.33e-07 6.79e-07 5.06e-07 3.41e-07