logo

Genes within 1Mb (chr12:94750252:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 6.23e-01 0.0384 0.0779 0.248 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 1.81e-01 0.122 0.0912 0.248 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0978 0.0682 0.248 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 3.18e-01 0.0864 0.0864 0.248 B L1
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0283 0.079 0.248 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0363 0.0518 0.248 B L1
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 5.83e-01 0.036 0.0655 0.248 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 9.62e-01 0.00374 0.0792 0.248 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 9.86e-02 -0.0623 0.0375 0.248 B L1
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 1.13e-01 -0.103 0.0644 0.248 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0329 0.0562 0.248 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 8.74e-01 -0.00998 0.0626 0.248 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00716 0.0856 0.248 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 7.29e-01 0.0191 0.055 0.248 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 3.55e-02 0.121 0.0571 0.248 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 2.92e-01 0.0636 0.0603 0.248 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0232 0.0775 0.248 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 4.80e-01 0.0369 0.0521 0.248 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0885 0.0661 0.248 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0392 0.0844 0.248 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 1.41e-01 0.111 0.0752 0.248 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 8.51e-01 0.0135 0.0718 0.248 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0317 0.067 0.248 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 8.58e-01 -0.00982 0.0549 0.248 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 2.18e-01 -0.11 0.0892 0.245 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0729 0.0948 0.245 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00753 0.094 0.245 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0293 0.091 0.245 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 2.22e-01 0.104 0.0846 0.245 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 7.15e-02 0.136 0.075 0.245 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0246 0.0842 0.245 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 8.94e-01 0.00943 0.0709 0.245 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 6.83e-01 0.0347 0.0848 0.248 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 7.92e-01 0.0174 0.0659 0.248 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 8.47e-02 -0.116 0.0671 0.248 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 3.89e-02 -0.166 0.0797 0.248 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 8.01e-01 0.0138 0.0547 0.248 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0565 0.0807 0.248 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 6.72e-01 0.0305 0.072 0.248 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0426 0.0516 0.248 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 6.71e-02 -0.159 0.0862 0.249 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 1.37e-01 0.122 0.0815 0.249 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 4.84e-01 0.0482 0.0687 0.249 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0396 0.0814 0.249 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 1.09e-01 -0.107 0.0667 0.249 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0164 0.0763 0.249 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 7.64e-01 0.0169 0.0563 0.249 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0228 0.0942 0.248 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 1.14e-01 0.127 0.0798 0.248 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 9.68e-01 0.00292 0.0733 0.248 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 2.67e-01 -0.102 0.0912 0.248 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 4.78e-01 0.0527 0.0741 0.248 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 7.24e-01 0.0295 0.0835 0.248 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00595 0.0465 0.248 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 4.32e-01 0.0819 0.104 0.25 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 3.21e-01 0.0883 0.0887 0.25 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 2.29e-01 0.131 0.108 0.25 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0521 0.104 0.25 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 8.04e-02 -0.139 0.0789 0.25 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0674 0.0839 0.25 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 3.34e-01 -0.101 0.104 0.25 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 6.76e-01 0.0308 0.0737 0.25 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0489 0.0921 0.25 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 7.77e-01 0.0266 0.0937 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 4.58e-02 0.189 0.0939 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0764 0.0864 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 2.13e-01 0.118 0.0945 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0564 0.0971 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0502 0.0797 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 1.81e-01 0.118 0.0881 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0518 0.0868 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 5.04e-01 -0.048 0.0718 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 2.95e-01 0.102 0.097 0.25 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 5.37e-02 -0.19 0.0979 0.25 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00321 0.0944 0.25 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 9.34e-01 0.00848 0.102 0.25 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0687 0.0903 0.25 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 1.50e-01 -0.11 0.0761 0.25 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0534 0.0891 0.25 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 8.43e-01 0.0178 0.0899 0.25 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 8.94e-01 0.0097 0.0724 0.25 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0722 0.0925 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 3.75e-01 0.0831 0.0935 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0815 0.0786 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 7.25e-01 0.0338 0.0961 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 5.23e-01 0.0606 0.0947 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0792 0.0794 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 5.51e-01 0.0491 0.0822 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0557 0.09 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0585 0.0523 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 8.06e-01 0.0252 0.102 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 9.62e-01 0.0045 0.0935 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 1.01e-01 -0.155 0.0939 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 1.30e-01 0.156 0.103 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0433 0.0945 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 7.52e-01 0.0277 0.0874 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 4.25e-01 0.0737 0.0922 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 7.96e-01 0.02 0.0774 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0304 0.076 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 4.00e-01 -0.083 0.0983 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0832 0.103 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0468 0.103 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 7.42e-01 0.027 0.0819 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 9.35e-01 0.00748 0.0921 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 8.53e-01 0.0175 0.0941 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 5.37e-02 0.163 0.084 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0532 0.0734 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 8.67e-01 0.0107 0.0636 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0366 0.0776 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 7.35e-01 0.0303 0.0894 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 6.69e-01 -0.026 0.0609 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 6.33e-02 0.122 0.0653 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 5.87e-01 0.0308 0.0565 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 4.64e-02 -0.155 0.0775 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0549 0.0732 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0896 0.0851 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 2.55e-01 -0.113 0.099 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 5.94e-01 0.0389 0.073 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 3.54e-01 0.0721 0.0777 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 5.09e-01 0.0444 0.067 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0636 0.0997 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0731 0.0883 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0517 0.0929 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 1.74e-01 -0.127 0.093 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 4.76e-01 0.0569 0.0797 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 7.97e-01 -0.023 0.0895 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 7.23e-01 0.0287 0.0809 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0408 0.0883 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 7.19e-01 0.0281 0.0779 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 3.45e-02 -0.186 0.0875 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0529 0.0977 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 6.90e-02 0.17 0.093 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 7.34e-01 0.0272 0.0799 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0553 0.088 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0963 0.069 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 3.09e-01 0.0918 0.0901 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 3.18e-01 0.0704 0.0704 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0971 0.0814 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 3.63e-01 0.0825 0.0904 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0187 0.0818 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0101 0.0828 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 7.28e-01 0.0278 0.0798 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 6.48e-01 0.0302 0.0661 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0398 0.0991 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 2.82e-02 0.167 0.0755 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0355 0.1 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 2.81e-01 -0.109 0.101 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 9.53e-01 0.00535 0.0908 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0554 0.0957 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0778 0.0981 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0536 0.079 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00783 0.103 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0584 0.088 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 2.83e-02 -0.217 0.0983 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 7.30e-01 0.0362 0.105 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 1.02e-01 0.142 0.0863 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 1.73e-02 0.234 0.0975 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 8.69e-02 -0.174 0.101 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 4.82e-01 0.0613 0.0871 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 4.99e-01 0.0665 0.0982 0.247 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 8.53e-01 0.0154 0.0832 0.247 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0453 0.0955 0.247 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0449 0.0926 0.247 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 8.31e-02 0.141 0.0809 0.247 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0249 0.0933 0.247 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0901 0.0814 0.247 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 2.20e-01 -0.124 0.101 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 1.53e-02 0.233 0.0953 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0822 0.0992 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 1.85e-01 0.138 0.104 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00654 0.0855 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 3.62e-01 0.079 0.0864 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 4.90e-01 0.0574 0.0829 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 1.11e-02 -0.244 0.0953 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 9.74e-02 0.139 0.0837 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 2.31e-01 0.105 0.087 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 2.81e-01 0.096 0.0887 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0955 0.0779 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 1.54e-01 -0.129 0.0899 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 7.32e-01 0.0216 0.063 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 7.50e-01 0.0338 0.106 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 7.05e-01 0.0356 0.0937 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 5.23e-02 0.191 0.0977 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 8.78e-01 0.016 0.104 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0831 0.0848 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 6.14e-01 0.0492 0.0975 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 3.50e-01 -0.082 0.0876 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0163 0.089 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 7.90e-01 0.0244 0.0913 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 1.30e-01 -0.136 0.0899 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 6.42e-02 -0.173 0.0928 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 1.03e-01 -0.132 0.0804 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 7.20e-01 0.0333 0.0929 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 6.35e-01 0.0308 0.0648 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0502 0.121 0.267 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0836 0.109 0.267 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 2.07e-01 0.152 0.12 0.267 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 1.43e-01 -0.168 0.114 0.267 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 7.27e-01 0.0379 0.108 0.267 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 7.81e-02 0.196 0.11 0.267 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00416 0.116 0.267 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 5.16e-01 0.0629 0.0965 0.267 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0658 0.0676 0.267 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0791 0.0925 0.252 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0327 0.0825 0.252 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 2.10e-01 0.0997 0.0792 0.252 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 2.56e-01 -0.109 0.0956 0.252 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0332 0.0938 0.252 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0433 0.0929 0.252 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 4.82e-01 0.0409 0.058 0.252 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0102 0.0963 0.248 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0616 0.0908 0.248 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 8.18e-01 0.0222 0.0961 0.248 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 1.07e-01 -0.138 0.0855 0.248 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 8.96e-01 0.0116 0.0886 0.248 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 1.08e-01 0.152 0.0943 0.248 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0145 0.0727 0.248 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0685 0.0918 0.246 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0532 0.099 0.246 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0265 0.101 0.246 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0487 0.0969 0.246 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 6.87e-02 0.157 0.0857 0.246 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 2.56e-01 0.0922 0.0808 0.246 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0848 0.093 0.246 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 1.84e-01 0.105 0.0789 0.246 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 6.57e-01 0.0418 0.0941 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 2.10e-01 0.0927 0.0737 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0337 0.0812 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 2.88e-02 -0.186 0.0846 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 3.69e-01 0.0587 0.0651 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0355 0.0889 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 6.73e-01 -0.032 0.0759 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0557 0.0537 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0144 0.095 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0298 0.0831 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0391 0.0917 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 2.08e-01 -0.114 0.0901 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0489 0.0677 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0714 0.0958 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 2.31e-01 0.105 0.0875 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 8.74e-01 0.00988 0.0624 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0913 0.115 0.255 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 1.90e-01 0.116 0.0876 0.255 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 4.49e-01 0.0829 0.109 0.255 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0786 0.117 0.255 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 6.71e-01 0.0472 0.111 0.255 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0368 0.109 0.255 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0879 0.0941 0.255 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 7.44e-01 0.0334 0.102 0.247 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 6.64e-01 0.0431 0.0992 0.247 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 8.78e-02 -0.178 0.103 0.247 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 5.11e-01 0.0639 0.0972 0.247 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0862 0.0835 0.247 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 9.93e-01 0.000933 0.101 0.247 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 3.50e-02 -0.19 0.0896 0.247 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 2.07e-01 0.0815 0.0644 0.247 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 9.74e-01 0.003 0.0933 0.247 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 5.51e-01 0.0537 0.0899 0.247 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0847 0.0978 0.247 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 2.15e-01 0.121 0.0969 0.247 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 6.73e-01 0.0262 0.062 0.247 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 7.84e-01 0.0266 0.0969 0.247 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 1.99e-01 0.118 0.0917 0.247 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0288 0.0819 0.247 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 1.86e-01 -0.136 0.102 0.24 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0222 0.1 0.24 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0578 0.105 0.24 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 3.26e-01 0.102 0.103 0.24 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 4.73e-01 0.0716 0.0996 0.24 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 4.41e-02 0.215 0.106 0.24 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 9.46e-01 0.00608 0.0902 0.24 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 6.54e-01 0.0399 0.0889 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 3.97e-01 0.0797 0.0939 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 2.91e-01 0.105 0.099 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 8.47e-01 -0.017 0.0876 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 3.44e-01 0.0952 0.1 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0781 0.093 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0647 0.0599 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 5.94e-01 0.0448 0.0838 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0223 0.0834 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0269 0.0576 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0214 0.0889 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 3.11e-01 0.0913 0.0899 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 1.10e-01 -0.118 0.0737 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 2.03e-01 0.123 0.0961 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -801224 sc-eQTL 9.94e-01 0.000682 0.0856 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0237 0.0731 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 5.95e-01 0.0406 0.0762 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0335 0.094 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0604 0.0518 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 5.78e-01 0.048 0.0863 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 5.10e-01 0.0451 0.0683 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0693 0.0737 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 1.56e-02 -0.193 0.0792 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 8.05e-01 0.015 0.0606 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0454 0.0826 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 8.61e-01 0.0131 0.0746 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0462 0.0511 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00407 0.0978 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 7.04e-01 0.0344 0.0907 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 1.30e-01 -0.135 0.0891 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 5.90e-01 0.0541 0.1 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0196 0.0578 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 8.58e-01 0.0173 0.0961 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -467230 sc-eQTL 4.99e-01 0.0555 0.082 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0176 0.0654 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -467494 sc-eQTL 2.04e-01 -0.114 0.0891 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 99695 sc-eQTL 1.39e-01 0.124 0.0831 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -723268 sc-eQTL 5.57e-01 0.042 0.0714 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -323376 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0693 0.0809 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 601675 sc-eQTL 6.93e-02 -0.129 0.0705 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 290264 sc-eQTL 6.71e-01 -0.034 0.0799 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -253496 sc-eQTL 9.57e-01 0.00319 0.0587 0.25 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 99695 eQTL 0.0248 -0.033 0.0147 0.00121 0.0 0.249

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina