logo

Genes within 1Mb (chr12:94748545:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 9.13e-01 0.0109 0.0995 0.171 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 2.01e-01 -0.149 0.116 0.171 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 7.67e-01 0.026 0.0875 0.171 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 2.16e-01 -0.137 0.11 0.171 B L1
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0274 0.101 0.171 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 9.66e-01 0.00286 0.0663 0.171 B L1
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 3.93e-02 0.172 0.0828 0.171 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0739 0.101 0.171 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 1.06e-01 0.0778 0.0479 0.171 B L1
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 6.34e-02 0.15 0.0803 0.171 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00771 0.0702 0.171 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0364 0.0782 0.171 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 7.78e-01 0.0301 0.107 0.171 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 8.79e-01 0.0105 0.0687 0.171 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0856 0.0718 0.171 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0771 0.0753 0.171 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0923 0.0964 0.171 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 4.51e-01 0.0489 0.0648 0.171 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0281 0.0826 0.171 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0792 0.105 0.171 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 4.33e-02 0.189 0.0932 0.171 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 2.62e-01 -0.1 0.0892 0.171 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 9.02e-01 0.0103 0.0835 0.171 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0352 0.0683 0.171 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 3.36e-01 -0.109 0.113 0.167 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0669 0.12 0.167 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0808 0.118 0.167 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0686 0.115 0.167 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 8.06e-02 -0.187 0.106 0.167 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0961 0.0952 0.167 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0707 0.106 0.167 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 4.45e-02 0.179 0.0886 0.167 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0109 0.105 0.171 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 1.01e-02 -0.208 0.0801 0.171 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 4.81e-02 0.164 0.0826 0.171 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 2.75e-01 0.109 0.0991 0.171 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 2.18e-01 -0.083 0.0672 0.171 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0461 0.0997 0.171 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00766 0.0888 0.171 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0721 0.0636 0.171 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 6.44e-01 0.0493 0.106 0.172 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00637 0.1 0.172 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0932 0.0839 0.172 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 4.86e-02 0.196 0.0987 0.172 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 4.62e-01 0.0604 0.082 0.172 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0681 0.0932 0.172 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0376 0.0688 0.172 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 6.10e-01 0.0605 0.119 0.171 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 8.24e-02 0.175 0.1 0.171 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0581 0.0922 0.171 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 9.67e-02 0.191 0.114 0.171 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0403 0.0934 0.171 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 2.87e-01 -0.112 0.105 0.171 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0597 0.0584 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0481 0.129 0.179 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 1.14e-01 0.174 0.109 0.179 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 3.03e-01 -0.139 0.134 0.179 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 4.70e-01 0.0933 0.129 0.179 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 9.89e-02 0.162 0.0977 0.179 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0814 0.104 0.179 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 9.77e-01 0.0037 0.129 0.179 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 9.20e-01 0.00915 0.0912 0.179 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 6.51e-03 0.308 0.112 0.179 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 1.62e-01 -0.163 0.116 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 5.18e-02 -0.229 0.117 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 3.79e-01 0.0948 0.108 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0446 0.118 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 7.30e-01 0.0419 0.121 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0874 0.0992 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00124 0.11 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 8.67e-01 0.0181 0.108 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 2.97e-01 0.0932 0.0892 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 3.52e-01 -0.116 0.124 0.168 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 3.54e-01 -0.117 0.126 0.168 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 3.24e-01 0.119 0.121 0.168 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 4.86e-01 0.0907 0.13 0.168 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0235 0.116 0.168 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0628 0.0978 0.168 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 1.83e-01 0.152 0.114 0.168 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0652 0.115 0.168 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00399 0.0926 0.168 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0414 0.117 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 7.96e-01 0.0305 0.118 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 5.84e-01 0.0545 0.0994 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 8.95e-01 0.0161 0.121 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 2.81e-01 -0.129 0.119 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 8.03e-01 0.0251 0.1 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 1.36e-01 0.155 0.103 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0248 0.114 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00414 0.0662 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 5.98e-02 0.237 0.126 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 1.95e-01 -0.15 0.115 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 1.07e-01 -0.188 0.116 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 3.33e-02 -0.271 0.127 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0234 0.117 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 6.51e-01 0.049 0.108 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 7.02e-01 0.0437 0.114 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0594 0.0957 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 3.45e-01 0.089 0.0939 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 5.94e-01 0.0667 0.125 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 9.33e-01 0.011 0.13 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 7.12e-01 0.0484 0.131 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 8.40e-01 0.0209 0.104 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 4.37e-01 0.0908 0.117 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 2.57e-01 0.135 0.119 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 5.90e-01 0.058 0.107 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 3.07e-01 0.0943 0.092 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0264 0.0799 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0411 0.0975 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 7.82e-01 0.0311 0.112 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0235 0.0765 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0959 0.0825 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0103 0.071 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 1.29e-01 0.148 0.097 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 6.07e-01 0.0471 0.0914 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 9.40e-01 0.00798 0.106 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0408 0.124 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0377 0.091 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0342 0.0971 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 3.45e-01 -0.079 0.0835 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0328 0.122 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 9.54e-01 0.0063 0.108 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 5.45e-01 0.0691 0.114 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 1.87e-01 0.151 0.114 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 8.13e-01 0.0232 0.0978 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00563 0.11 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0784 0.0991 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0554 0.109 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 6.34e-01 0.046 0.0963 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 1.38e-01 0.162 0.109 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0591 0.121 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 6.92e-01 0.046 0.116 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 8.85e-01 0.0144 0.0989 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0416 0.109 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0733 0.0856 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 2.54e-01 -0.127 0.111 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0503 0.0868 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 7.34e-01 0.0342 0.101 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 3.70e-01 -0.1 0.111 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 4.71e-01 0.0727 0.101 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 1.38e-01 -0.151 0.101 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 2.51e-01 -0.113 0.098 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 2.55e-01 0.0928 0.0812 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 2.95e-01 -0.127 0.121 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 2.64e-01 -0.104 0.0931 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 4.69e-01 0.0889 0.123 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 1.94e-01 0.16 0.123 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 9.49e-02 0.185 0.11 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 5.96e-01 0.062 0.117 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 2.84e-01 0.128 0.12 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 1.76e-01 -0.131 0.0961 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 4.23e-01 0.0993 0.124 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 5.71e-01 0.0604 0.106 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 2.48e-01 0.139 0.12 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 2.94e-01 -0.133 0.126 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 3.11e-01 -0.106 0.105 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0032 0.12 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 2.07e-01 -0.156 0.123 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 7.19e-01 -0.038 0.105 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 2.09e-01 0.15 0.119 0.171 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 1.28e-01 0.153 0.101 0.171 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 4.45e-01 0.0888 0.116 0.171 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 3.29e-01 0.11 0.112 0.171 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0694 0.0989 0.171 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0314 0.113 0.171 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 9.53e-01 0.00584 0.0992 0.171 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 5.05e-01 0.0811 0.121 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 1.69e-01 -0.16 0.116 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 4.60e-02 0.238 0.118 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00359 0.126 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 1.95e-01 -0.133 0.102 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0954 0.104 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0109 0.0999 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0116 0.119 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0347 0.104 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 8.01e-02 -0.188 0.107 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 4.92e-01 0.0756 0.11 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 7.67e-01 0.0285 0.0964 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 3.01e-01 -0.115 0.111 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00949 0.0777 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 1.96e-01 0.172 0.132 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0441 0.118 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 7.39e-01 0.0414 0.124 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 3.55e-02 0.274 0.129 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 5.80e-01 0.0591 0.107 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0761 0.122 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0722 0.11 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 5.39e-01 0.0666 0.108 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 7.57e-01 0.0345 0.111 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 9.10e-02 0.186 0.109 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 7.14e-01 0.0417 0.114 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 8.51e-02 0.169 0.0979 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 7.66e-01 0.0338 0.113 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0495 0.0789 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 5.24e-01 0.0946 0.148 0.167 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 6.59e-01 0.0591 0.134 0.167 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 2.56e-01 -0.168 0.147 0.167 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0727 0.141 0.167 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 8.52e-01 0.0248 0.133 0.167 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 1.04e-01 -0.221 0.135 0.167 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 2.91e-01 0.15 0.142 0.167 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 2.46e-01 0.137 0.118 0.167 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 9.89e-02 0.137 0.0822 0.167 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 8.85e-02 -0.199 0.116 0.167 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 1.17e-01 0.163 0.103 0.167 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 4.04e-04 -0.35 0.0973 0.167 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 7.93e-02 0.212 0.12 0.167 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0924 0.118 0.167 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 1.92e-01 -0.153 0.117 0.167 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 5.78e-03 -0.2 0.0719 0.167 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 1.48e-03 0.375 0.116 0.171 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 2.70e-01 0.124 0.112 0.171 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0508 0.119 0.171 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0501 0.107 0.171 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 2.38e-01 0.129 0.109 0.171 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 3.30e-01 -0.115 0.117 0.171 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00493 0.0901 0.171 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 6.41e-01 0.0537 0.115 0.173 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0255 0.124 0.173 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 8.50e-01 0.0239 0.126 0.173 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 6.61e-01 0.0532 0.121 0.173 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 1.61e-03 -0.337 0.105 0.173 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0773 0.101 0.173 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0463 0.116 0.173 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 2.28e-01 0.119 0.0987 0.173 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 3.93e-01 0.099 0.116 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 6.58e-04 -0.307 0.0886 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 2.41e-02 0.225 0.0989 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 7.24e-01 0.0373 0.105 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0436 0.0803 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 6.49e-01 0.0499 0.109 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0631 0.0934 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 4.66e-01 0.0484 0.0662 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 1.61e-01 -0.165 0.118 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 6.92e-02 -0.187 0.103 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 2.28e-02 0.258 0.113 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 3.19e-01 0.112 0.112 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 3.32e-02 -0.179 0.0834 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0538 0.119 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0391 0.109 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 1.28e-01 -0.118 0.0772 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 4.16e-01 0.119 0.146 0.164 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 5.14e-02 0.218 0.111 0.164 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 8.11e-01 0.0334 0.139 0.164 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 8.29e-01 0.0322 0.149 0.164 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 3.41e-01 -0.135 0.141 0.164 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 2.52e-01 0.158 0.138 0.164 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 6.53e-01 -0.054 0.12 0.164 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0396 0.127 0.173 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 3.95e-01 0.105 0.123 0.173 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 8.31e-02 0.224 0.129 0.173 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 4.05e-01 0.101 0.121 0.173 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0572 0.104 0.173 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0392 0.125 0.173 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 1.84e-01 0.149 0.112 0.173 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 5.03e-01 -0.054 0.0803 0.173 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 4.31e-01 0.0911 0.116 0.174 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0222 0.112 0.174 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0115 0.122 0.174 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0701 0.121 0.174 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0183 0.0769 0.174 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 7.50e-01 0.0384 0.12 0.174 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0423 0.114 0.174 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 5.42e-01 -0.062 0.102 0.174 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0262 0.131 0.172 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 1.77e-01 -0.172 0.127 0.172 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00394 0.134 0.172 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 1.15e-01 -0.208 0.131 0.172 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 9.04e-01 0.0153 0.127 0.172 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0658 0.137 0.172 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 2.18e-01 -0.142 0.115 0.172 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 3.14e-01 0.114 0.113 0.172 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 1.08e-01 -0.19 0.118 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 1.13e-01 -0.197 0.124 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 1.55e-01 0.157 0.11 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 1.28e-01 0.192 0.126 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 7.59e-01 0.036 0.117 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0892 0.0753 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 3.14e-01 0.106 0.105 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0304 0.105 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 1.68e-01 0.0998 0.0721 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 4.13e-01 0.0913 0.111 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0411 0.113 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0203 0.093 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 2.13e-01 -0.151 0.121 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -802931 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0834 0.107 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 7.68e-01 0.0271 0.0917 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 9.84e-02 0.158 0.095 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0445 0.118 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 7.43e-01 0.0214 0.0652 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0225 0.107 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 7.97e-04 -0.28 0.0823 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 9.59e-03 0.235 0.0898 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 4.20e-01 0.0801 0.0991 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 1.61e-01 -0.105 0.0745 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0604 0.102 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0468 0.0921 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0233 0.0633 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 5.60e-01 0.0704 0.121 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 7.21e-01 0.04 0.112 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0319 0.111 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 9.29e-01 0.011 0.124 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0395 0.0713 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 6.73e-01 0.0501 0.119 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -468937 sc-eQTL 4.59e-01 0.0751 0.101 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0892 0.0805 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -469201 sc-eQTL 8.19e-01 0.0255 0.112 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 97988 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0052 0.104 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -724975 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0873 0.089 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -325083 sc-eQTL 1.34e-01 0.151 0.101 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 599968 sc-eQTL 3.48e-01 0.0832 0.0885 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 288557 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0882 0.0996 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -255203 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0354 0.0732 0.172 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 97988 eQTL 0.0521 0.0351 0.0181 0.00187 0.0 0.151

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136014 \N -802931 2.8e-07 1.35e-07 5.72e-08 1.89e-07 9.79e-08 8.45e-08 1.67e-07 5.66e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.57e-07 1.08e-07 1.59e-07 7.37e-08 6.25e-08 7.23e-08 4.18e-08 1.4e-07 6.32e-08 4.89e-08 1.25e-07 1.25e-07 1.5e-07 2.87e-08 1.65e-07 1.22e-07 1.18e-07 9.74e-08 1.22e-07 1e-07 1.06e-07 3.03e-08 3.96e-08 8.56e-08 3.63e-08 2.95e-08 5.7e-08 8.76e-08 6.71e-08 4.55e-08 5.41e-08 1.46e-07 5.27e-08 1.52e-08 3.42e-08 1.89e-08 1e-07 1.89e-09 5.01e-08
ENSG00000258035 \N 562501 4.37e-07 2.5e-07 7.92e-08 2.54e-07 1.07e-07 1.28e-07 3.25e-07 7.52e-08 2.12e-07 1.28e-07 2.38e-07 1.91e-07 3.48e-07 8.42e-08 8.45e-08 1.17e-07 8.53e-08 2.56e-07 8.68e-08 8.87e-08 1.35e-07 2.15e-07 2.11e-07 5.01e-08 3.27e-07 1.94e-07 1.57e-07 1.46e-07 1.58e-07 2.02e-07 1.43e-07 4.75e-08 4.74e-08 9.81e-08 1.01e-07 5.05e-08 6.2e-08 5.8e-08 4.99e-08 8.06e-08 4.68e-08 2.19e-07 3.26e-08 7.24e-09 5.32e-08 1.03e-08 9.38e-08 0.0 4.61e-08