logo

Genes within 1Mb (chr12:94743443:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0409 0.0831 0.229 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 2.91e-01 0.103 0.0975 0.229 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 2.68e-01 -0.081 0.073 0.229 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 6.42e-01 0.043 0.0924 0.229 B L1
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 1.37e-01 0.125 0.0839 0.229 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 8.52e-01 0.0104 0.0554 0.229 B L1
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0698 0.0698 0.229 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 8.04e-01 0.0211 0.0845 0.229 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 7.16e-01 0.0147 0.0403 0.229 B L1
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 2.86e-01 -0.074 0.0692 0.229 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0387 0.0601 0.229 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 4.04e-01 0.0559 0.0669 0.229 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 6.28e-01 0.0444 0.0915 0.229 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 1.08e-02 -0.149 0.058 0.229 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 4.31e-01 0.0486 0.0616 0.229 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 3.88e-01 0.0559 0.0646 0.229 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0391 0.0827 0.229 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 3.83e-01 0.0485 0.0555 0.229 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 7.78e-02 0.125 0.0703 0.229 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 1.34e-01 0.135 0.0896 0.229 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0522 0.0805 0.229 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 4.06e-01 0.0637 0.0765 0.229 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 8.47e-01 0.0138 0.0716 0.229 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 2.82e-01 0.063 0.0584 0.229 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 6.07e-02 -0.181 0.0961 0.234 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 4.51e-01 0.0775 0.103 0.234 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 3.59e-01 0.0933 0.102 0.234 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 8.20e-01 0.0225 0.0985 0.234 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 8.26e-02 -0.159 0.0913 0.234 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 4.00e-01 -0.069 0.0817 0.234 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 5.38e-01 0.0562 0.0911 0.234 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 5.45e-01 0.0466 0.0767 0.234 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0521 0.0902 0.229 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 2.48e-01 0.081 0.0699 0.229 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0704 0.0717 0.229 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 4.52e-01 0.0645 0.0855 0.229 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 8.42e-01 0.0116 0.0582 0.229 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0248 0.0859 0.229 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 9.61e-01 0.00372 0.0766 0.229 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 2.13e-01 0.0684 0.0548 0.229 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 1.16e-02 -0.229 0.0899 0.23 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 5.18e-01 0.0556 0.086 0.23 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 3.26e-01 0.071 0.072 0.23 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0295 0.0855 0.23 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00378 0.0704 0.23 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 1.81e-01 0.107 0.0797 0.23 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 1.65e-01 0.0819 0.0588 0.23 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 2.18e-01 -0.125 0.101 0.229 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0344 0.0866 0.229 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0526 0.079 0.229 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0746 0.0986 0.229 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0325 0.0801 0.229 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 8.92e-01 0.0123 0.0902 0.229 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 8.26e-01 0.011 0.0502 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0919 0.117 0.222 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 2.72e-01 -0.11 0.0995 0.222 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 6.12e-01 0.0619 0.122 0.222 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 2.35e-01 0.139 0.117 0.222 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 6.03e-01 0.0465 0.0892 0.222 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 4.67e-01 0.0687 0.0942 0.222 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 2.44e-01 -0.137 0.117 0.222 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 2.28e-01 0.0996 0.0824 0.222 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0296 0.103 0.222 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 5.11e-01 0.0655 0.0995 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0791 0.101 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00118 0.0919 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 8.35e-01 0.021 0.101 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 2.97e-01 0.108 0.103 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0977 0.0845 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 4.68e-01 0.0683 0.0938 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 1.56e-01 -0.131 0.0918 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0897 0.076 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 2.87e-01 -0.112 0.105 0.231 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 1.35e-01 0.159 0.106 0.231 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0152 0.102 0.231 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 2.33e-02 -0.247 0.108 0.231 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 8.44e-01 0.0192 0.0976 0.231 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 2.01e-01 0.105 0.0822 0.231 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 7.17e-01 -0.035 0.0962 0.231 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 4.19e-01 0.0785 0.0969 0.231 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 8.01e-01 0.0197 0.0781 0.231 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 8.87e-01 -0.014 0.0987 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 7.83e-01 0.0276 0.0998 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 7.48e-01 -0.027 0.0839 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 9.64e-01 0.00464 0.102 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 8.31e-01 0.0215 0.101 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 6.82e-01 0.0348 0.0847 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 4.62e-02 -0.174 0.0867 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 2.41e-01 0.112 0.0956 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 4.76e-01 0.0399 0.0558 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0411 0.106 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 2.25e-01 0.118 0.0969 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 3.01e-01 -0.102 0.0981 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 1.89e-02 0.251 0.106 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 2.33e-01 0.117 0.098 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 9.33e-01 0.00766 0.091 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 9.01e-01 -0.012 0.096 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0457 0.0805 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 2.56e-01 0.09 0.0789 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 8.66e-01 0.0175 0.103 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000231 0.108 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 1.04e-01 0.175 0.107 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 3.14e-01 0.0865 0.0856 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0513 0.0963 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 7.17e-01 0.0358 0.0985 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 8.55e-01 0.0162 0.0888 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 1.32e-01 -0.119 0.0787 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 5.20e-01 -0.044 0.0684 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 7.44e-01 0.0273 0.0836 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 2.12e-01 0.12 0.0959 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 1.04e-02 -0.167 0.0645 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 5.14e-01 0.0463 0.0708 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 3.05e-01 0.0624 0.0607 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 7.64e-01 0.0253 0.0843 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 3.91e-01 0.0677 0.0788 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 2.98e-01 0.0956 0.0917 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 1.53e-01 -0.153 0.106 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 1.06e-01 -0.127 0.0782 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 6.61e-01 0.0369 0.0838 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 6.39e-01 0.0339 0.0722 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 6.11e-01 0.0546 0.107 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0668 0.0949 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 4.25e-02 -0.202 0.0989 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 5.99e-01 0.0529 0.1 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 6.64e-01 0.0372 0.0856 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 3.95e-01 0.0818 0.0961 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 7.91e-02 0.152 0.0863 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 4.52e-01 0.0716 0.0949 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0249 0.0838 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0066 0.0951 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 1.63e-01 0.147 0.105 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 3.74e-01 0.0896 0.101 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 1.21e-01 0.133 0.0855 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 3.36e-01 0.0912 0.0945 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 2.33e-01 0.0888 0.0743 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0127 0.0964 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 2.35e-01 0.0894 0.0751 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 8.16e-02 0.152 0.0867 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 6.48e-01 0.0442 0.0968 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0734 0.0873 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0559 0.0884 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0887 0.0851 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000725 0.0707 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0052 0.105 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 2.13e-01 0.1 0.0804 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 3.51e-01 0.099 0.106 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0441 0.107 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00214 0.0959 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 2.21e-01 0.124 0.101 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00547 0.104 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 4.09e-01 0.069 0.0834 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 1.43e-01 -0.16 0.109 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 5.32e-01 0.0589 0.0941 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 2.37e-01 -0.126 0.106 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 2.01e-01 0.143 0.111 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0528 0.0928 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 4.61e-01 -0.078 0.106 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 2.81e-01 0.117 0.109 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0871 0.0929 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 2.41e-01 -0.122 0.103 0.225 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0207 0.0879 0.225 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 2.58e-01 -0.114 0.101 0.225 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 4.56e-01 -0.073 0.0978 0.225 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0523 0.0861 0.225 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0384 0.0986 0.225 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0339 0.0862 0.225 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 8.68e-02 -0.184 0.107 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 3.26e-01 0.101 0.103 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0215 0.106 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0888 0.111 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 3.10e-01 0.0925 0.0909 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 2.73e-01 0.101 0.092 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 2.76e-01 0.0963 0.0882 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0469 0.102 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 8.25e-01 0.0197 0.0891 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 1.08e-01 0.148 0.0918 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 6.33e-01 -0.045 0.0941 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0204 0.0826 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 2.41e-01 0.112 0.0952 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 1.34e-01 0.0997 0.0663 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 1.21e-01 -0.175 0.112 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0744 0.1 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 2.90e-01 -0.111 0.105 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0537 0.111 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 4.06e-01 0.0754 0.0906 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 7.27e-01 0.0364 0.104 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0251 0.0937 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 1.82e-01 -0.126 0.0937 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0164 0.0965 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0612 0.0954 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 8.62e-01 0.0172 0.0989 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 5.44e-01 -0.052 0.0855 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 7.72e-01 0.0285 0.0982 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 1.74e-01 0.0932 0.0682 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0728 0.132 0.207 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0494 0.119 0.207 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 7.83e-01 0.0362 0.131 0.207 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0621 0.125 0.207 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 1.57e-01 -0.166 0.117 0.207 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0419 0.121 0.207 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 4.20e-01 0.102 0.126 0.207 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0912 0.105 0.207 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 7.01e-01 0.0285 0.0738 0.207 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0443 0.1 0.228 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 2.14e-01 -0.111 0.0892 0.228 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0651 0.0861 0.228 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0171 0.104 0.228 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0422 0.102 0.228 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 2.16e-01 -0.125 0.1 0.228 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0726 0.0628 0.228 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 1.58e-02 -0.244 0.1 0.229 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 1.65e-01 -0.133 0.0956 0.229 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 4.80e-01 0.0718 0.102 0.229 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 6.94e-01 0.0358 0.0909 0.229 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 2.72e-01 -0.103 0.0935 0.229 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00276 0.1 0.229 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 1.29e-01 0.117 0.0765 0.229 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 2.12e-02 -0.225 0.0966 0.232 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 9.41e-01 0.00777 0.106 0.232 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 9.59e-01 0.0055 0.107 0.232 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0566 0.103 0.232 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0813 0.0921 0.232 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 1.47e-01 -0.125 0.0861 0.232 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 5.16e-01 0.0647 0.0993 0.232 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 2.20e-01 0.104 0.0843 0.232 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 9.27e-01 0.00917 0.1 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 1.00e-01 0.129 0.0781 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0828 0.0861 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 4.71e-01 0.0655 0.0908 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00931 0.0693 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0653 0.0943 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 7.69e-01 0.0237 0.0806 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 8.12e-01 0.0136 0.0572 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 8.52e-01 0.0189 0.101 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 4.94e-01 0.0605 0.0884 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 1.70e-01 -0.134 0.0972 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0748 0.0961 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 2.33e-01 0.0859 0.0719 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 5.88e-01 0.0554 0.102 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0944 0.0932 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 1.91e-01 0.0869 0.0662 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 1.05e-01 -0.204 0.125 0.239 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 6.85e-01 0.0394 0.0969 0.239 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 4.65e-01 0.0879 0.12 0.239 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0728 0.129 0.239 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 8.05e-01 0.0302 0.122 0.239 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 3.89e-01 0.103 0.119 0.239 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 9.20e-01 0.0105 0.104 0.239 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 3.50e-01 -0.102 0.109 0.233 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 9.69e-01 0.00416 0.106 0.233 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 6.60e-01 0.0489 0.111 0.233 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0132 0.103 0.233 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0222 0.089 0.233 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0995 0.107 0.233 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 2.18e-01 0.119 0.0959 0.233 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 8.09e-01 0.0166 0.0688 0.233 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 8.14e-01 0.0239 0.101 0.231 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0379 0.0979 0.231 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 4.58e-01 0.0792 0.106 0.231 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 2.34e-01 0.126 0.105 0.231 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 9.38e-01 0.00527 0.0674 0.231 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0792 0.105 0.231 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 5.15e-01 0.0653 0.1 0.231 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 1.17e-01 0.139 0.0885 0.231 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 3.62e-01 -0.107 0.117 0.237 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 1.43e-01 0.168 0.114 0.237 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 1.69e-01 0.165 0.119 0.237 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 4.01e-02 0.242 0.117 0.237 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0218 0.114 0.237 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0546 0.123 0.237 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 4.39e-01 0.0799 0.103 0.237 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0825 0.102 0.237 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0606 0.1 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 9.15e-01 0.0114 0.106 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 5.14e-01 -0.061 0.0934 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 2.40e-01 -0.126 0.107 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 9.78e-02 0.164 0.0988 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 7.62e-01 0.0194 0.0641 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0368 0.0894 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 6.21e-01 0.044 0.0889 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0617 0.0613 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 6.87e-01 -0.038 0.094 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 3.35e-01 0.092 0.0952 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0761 0.0783 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 1.83e-01 0.136 0.102 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -808033 sc-eQTL 4.51e-01 0.0683 0.0905 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 6.28e-01 0.0376 0.0774 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 1.01e-01 -0.132 0.0802 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 4.64e-01 0.073 0.0994 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 1.13e-01 0.0871 0.0547 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0099 0.0918 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 6.06e-02 0.136 0.0721 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 1.69e-01 -0.108 0.0781 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 7.13e-01 0.0314 0.0854 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 7.57e-01 0.02 0.0645 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0117 0.0878 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0354 0.0793 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 3.27e-01 0.0534 0.0543 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 2.80e-01 -0.111 0.103 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0447 0.0955 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 2.26e-01 0.114 0.0941 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 1.03e-01 0.172 0.105 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 6.63e-01 0.0266 0.061 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 1.01e-01 -0.166 0.101 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -474039 sc-eQTL 2.55e-01 0.0984 0.0863 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 1.44e-01 0.101 0.0686 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -474303 sc-eQTL 4.66e-02 -0.186 0.0931 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 92886 sc-eQTL 6.24e-01 0.043 0.0877 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -730077 sc-eQTL 1.89e-01 0.0985 0.0748 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -330185 sc-eQTL 9.95e-01 0.00055 0.0851 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 594866 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0458 0.0746 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 283455 sc-eQTL 1.80e-01 0.113 0.0836 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 sc-eQTL 1.43e-01 0.0901 0.0614 0.228 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000184752 NDUFA12 -260305 eQTL 0.0353 0.0442 0.021 0.0 0.0 0.215
ENSG00000278916 CEP83-DT 283440 eQTL 0.0419 0.0845 0.0415 0.0 0.0 0.215

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 \N 92886 6.66e-06 9.25e-06 6.56e-07 3.34e-06 1.9e-06 3e-06 7.94e-05 1.26e-06 5.33e-06 3.09e-06 9.18e-06 3e-06 1.13e-05 3.53e-06 2.17e-06 4.07e-06 4.94e-06 4.39e-06 1.45e-06 1.44e-06 3.71e-06 6.58e-06 8.23e-05 2.64e-06 1.58e-05 2.16e-06 2.42e-06 1.55e-06 6.16e-05 6.77e-06 3.09e-06 2.35e-07 5.45e-07 1.55e-06 1.97e-06 1.49e-06 8.28e-07 4.41e-07 1.08e-06 3.79e-07 3.35e-07 1.58e-05 1.38e-06 1.62e-08 7.67e-07 4.99e-07 8.86e-07 2.32e-07 2.87e-07
ENSG00000258303 \N 907276 2.69e-07 1.27e-07 5.14e-08 1.82e-07 9.21e-08 9.9e-08 3.11e-07 5.2e-08 1.44e-07 4.57e-08 1.6e-07 8.59e-08 1.69e-07 6.56e-08 6.12e-08 7.3e-08 4.01e-08 1.44e-07 5.82e-08 4.45e-08 1.08e-07 1.24e-07 1.81e-07 2.95e-08 1.68e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.32e-08 1.36e-07 1.07e-07 9.91e-08 3.95e-08 3.28e-08 8.25e-08 3.81e-08 3.53e-08 4.72e-08 9.44e-08 6.54e-08 3e-08 4.41e-08 1.46e-07 4.33e-08 4.26e-08 5.43e-08 1.92e-08 1.23e-07 3.92e-09 4.73e-08
ENSG00000278916 CEP83-DT 283440 1.55e-06 2.46e-06 2.75e-07 1.27e-06 4.13e-07 7.28e-07 8.65e-06 4.08e-07 1.75e-06 5.93e-07 2.07e-06 9.49e-07 3.22e-06 4.76e-07 4.59e-07 1.01e-06 1.14e-06 1.21e-06 8.19e-07 4.83e-07 6.34e-07 1.91e-06 4.8e-06 8.52e-07 3.53e-06 7.4e-07 1.05e-06 6.93e-07 6.12e-06 1.37e-06 8.17e-07 6.77e-08 2.29e-07 6.29e-07 8.94e-07 5.06e-07 3.62e-07 1.18e-07 4.04e-07 3.03e-08 1.12e-07 3.33e-06 5.2e-07 7.32e-09 3.13e-07 1.59e-07 2.41e-07 8.31e-08 1.47e-07