logo

Genes within 1Mb (chr12:94740491:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 2.44e-01 0.182 0.155 0.06 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 1.09e-02 -0.463 0.18 0.06 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 7.84e-01 0.0376 0.137 0.06 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0673 0.173 0.06 B L1
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 6.80e-01 0.0652 0.158 0.06 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0907 0.104 0.06 B L1
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 3.16e-01 -0.131 0.131 0.06 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00166 0.158 0.06 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0943 0.0753 0.06 B L1
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 1.96e-01 -0.167 0.129 0.06 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 4.04e-02 -0.229 0.111 0.06 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 2.20e-01 -0.153 0.124 0.06 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 2.28e-01 -0.205 0.17 0.06 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 3.15e-02 0.235 0.109 0.06 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 5.45e-02 0.22 0.114 0.06 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 8.50e-01 0.0228 0.121 0.06 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0425 0.155 0.06 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0422 0.104 0.06 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 5.96e-03 -0.363 0.131 0.06 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0641 0.169 0.06 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 1.47e-01 -0.219 0.151 0.06 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 7.62e-01 0.0436 0.144 0.06 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0236 0.134 0.06 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0782 0.11 0.06 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 4.53e-01 -0.138 0.184 0.059 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0166 0.195 0.059 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0119 0.193 0.059 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 8.81e-01 0.0282 0.187 0.059 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 4.71e-01 0.126 0.175 0.059 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 5.84e-01 0.0853 0.156 0.059 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 4.18e-01 -0.141 0.173 0.059 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0531 0.146 0.059 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 3.18e-01 0.17 0.17 0.06 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 8.48e-01 0.0254 0.132 0.06 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0903 0.136 0.06 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0879 0.162 0.06 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 1.06e-01 0.177 0.109 0.06 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 1.92e-01 -0.212 0.162 0.06 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 1.87e-01 0.191 0.144 0.06 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0279 0.104 0.06 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 4.81e-01 0.122 0.173 0.06 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0697 0.164 0.06 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 3.39e-01 -0.131 0.137 0.06 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 7.15e-01 0.0594 0.163 0.06 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 1.93e-01 -0.174 0.133 0.06 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 1.10e-01 -0.243 0.151 0.06 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 7.43e-01 0.0369 0.112 0.06 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 3.79e-01 0.171 0.194 0.06 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 9.44e-01 0.0116 0.166 0.06 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 1.10e-01 0.241 0.15 0.06 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 4.01e-01 -0.159 0.189 0.06 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 3.41e-01 -0.146 0.153 0.06 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 6.96e-01 0.0674 0.172 0.06 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0931 0.0958 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 7.29e-01 -0.075 0.216 0.056 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 3.53e-01 -0.172 0.184 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 8.36e-02 0.389 0.224 0.056 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 8.83e-01 0.0319 0.216 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0881 0.165 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 2.27e-01 -0.211 0.174 0.056 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 7.02e-01 0.083 0.217 0.056 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 3.56e-01 -0.141 0.152 0.056 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 1.78e-01 -0.257 0.19 0.056 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 3.38e-01 -0.179 0.187 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0656 0.189 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 2.17e-01 -0.213 0.172 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 3.78e-01 0.167 0.189 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0136 0.194 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 4.76e-02 -0.314 0.158 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 2.76e-01 -0.192 0.176 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 4.80e-01 0.122 0.173 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 7.86e-02 -0.251 0.142 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 1.04e-01 0.316 0.193 0.06 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 1.63e-01 -0.275 0.197 0.06 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 2.80e-01 0.204 0.188 0.06 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 2.23e-01 0.247 0.202 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0193 0.181 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 5.19e-01 0.0985 0.153 0.06 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 2.35e-01 0.212 0.178 0.06 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 5.73e-01 0.101 0.18 0.06 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 5.13e-01 0.0948 0.145 0.06 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 7.42e-01 0.0616 0.187 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 2.38e-02 -0.426 0.187 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 3.52e-01 0.148 0.159 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0288 0.194 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 5.03e-01 -0.129 0.192 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0516 0.161 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0793 0.166 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 2.66e-01 -0.203 0.182 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0389 0.106 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 4.80e-01 0.143 0.202 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0443 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 1.87e-01 -0.246 0.186 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0695 0.204 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 5.10e-01 -0.123 0.187 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0213 0.173 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 8.40e-01 0.0368 0.182 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 6.51e-01 0.0693 0.153 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 4.90e-01 -0.104 0.15 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 9.15e-02 -0.336 0.198 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 9.00e-01 0.0262 0.208 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0536 0.209 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 1.54e-01 -0.236 0.165 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 3.17e-01 0.186 0.186 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 7.89e-02 -0.334 0.189 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 7.40e-01 -0.057 0.172 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 2.81e-01 -0.159 0.147 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 6.26e-02 -0.237 0.127 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 2.50e-01 -0.179 0.155 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 1.24e-01 -0.275 0.178 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 6.31e-02 0.226 0.121 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 1.28e-01 0.201 0.131 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0838 0.113 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 4.44e-01 -0.12 0.156 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 1.28e-01 -0.223 0.146 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 2.09e-01 -0.214 0.17 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 5.35e-01 -0.124 0.199 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 1.77e-01 0.197 0.146 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 7.86e-02 0.274 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 5.49e-01 0.0806 0.134 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0215 0.202 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 5.41e-01 0.109 0.179 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 2.20e-02 0.428 0.186 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0146 0.189 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 1.23e-03 0.515 0.157 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000874 0.181 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0347 0.164 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 2.56e-01 0.202 0.177 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 8.05e-01 0.0388 0.157 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 6.01e-02 -0.333 0.176 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 3.14e-01 0.198 0.196 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 5.38e-01 -0.116 0.188 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 1.55e-01 0.228 0.16 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 8.38e-01 0.0363 0.177 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0566 0.139 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 1.38e-02 -0.449 0.181 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0149 0.143 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 7.71e-02 -0.292 0.165 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 3.48e-01 -0.172 0.184 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 3.32e-01 -0.161 0.166 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 3.88e-01 0.145 0.168 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 4.66e-01 0.118 0.162 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0111 0.134 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 3.92e-01 -0.175 0.204 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0614 0.158 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 5.16e-01 -0.135 0.207 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 6.93e-02 -0.378 0.207 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 1.12e-01 -0.297 0.186 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 9.79e-02 -0.326 0.196 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 2.85e-01 0.217 0.202 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 1.28e-01 -0.248 0.162 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0543 0.199 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 1.10e-01 -0.273 0.17 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 1.49e-01 -0.278 0.192 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 5.17e-01 0.132 0.203 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 7.37e-02 0.301 0.167 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 1.01e-01 -0.314 0.191 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 6.43e-01 0.0921 0.198 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0523 0.169 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 4.60e-01 -0.144 0.194 0.061 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 8.25e-01 0.0366 0.165 0.061 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 1.27e-01 0.288 0.188 0.061 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 4.54e-01 0.137 0.183 0.061 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00971 0.161 0.061 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 9.52e-01 0.0112 0.185 0.061 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 1.94e-01 -0.21 0.161 0.061 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 5.37e-01 -0.123 0.199 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 4.25e-01 -0.152 0.19 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 2.61e-01 -0.22 0.195 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00841 0.206 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0479 0.169 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 1.80e-01 -0.229 0.17 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 2.80e-01 -0.177 0.163 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 1.84e-01 -0.256 0.192 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 6.99e-01 0.065 0.168 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0631 0.174 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 1.66e-01 0.245 0.176 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 1.31e-01 -0.235 0.155 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0092 0.18 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 7.89e-01 0.0335 0.125 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 8.12e-02 0.372 0.212 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 4.94e-01 -0.13 0.189 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 9.75e-01 0.00616 0.199 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 9.71e-01 0.0076 0.21 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 3.70e-01 -0.154 0.171 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00191 0.197 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 2.54e-01 -0.202 0.177 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 1.94e-01 0.23 0.177 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 6.96e-01 0.0712 0.182 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 2.19e-01 0.221 0.18 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 4.78e-01 -0.132 0.186 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 4.90e-01 -0.112 0.161 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 8.06e-02 -0.323 0.184 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 5.93e-01 0.0692 0.129 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 4.23e-01 -0.197 0.245 0.059 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 4.17e-01 0.18 0.221 0.059 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 4.17e-01 0.199 0.245 0.059 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0824 0.233 0.059 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 1.94e-01 0.285 0.218 0.059 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 6.96e-01 0.0887 0.227 0.059 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 4.03e-01 -0.197 0.235 0.059 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 7.61e-01 0.0597 0.196 0.059 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 8.25e-01 0.0305 0.138 0.059 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0992 0.188 0.061 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 7.25e-01 -0.059 0.168 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00464 0.161 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 5.73e-02 -0.369 0.193 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 2.53e-01 -0.218 0.19 0.061 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 4.23e-01 -0.151 0.188 0.061 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0774 0.118 0.061 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 6.57e-01 0.0869 0.195 0.06 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 3.99e-01 -0.156 0.184 0.06 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 6.99e-01 0.0755 0.195 0.06 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 5.91e-01 0.0939 0.175 0.06 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 2.16e-01 0.223 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00868 0.193 0.06 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 7.66e-01 0.0439 0.148 0.06 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 9.31e-01 0.0162 0.187 0.061 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 2.81e-01 -0.217 0.201 0.061 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 6.99e-01 0.0794 0.205 0.061 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 5.58e-01 0.116 0.197 0.061 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 1.85e-01 0.233 0.175 0.061 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 4.65e-01 0.121 0.165 0.061 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 1.05e-01 -0.307 0.189 0.061 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 7.30e-01 0.0559 0.161 0.061 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 4.84e-01 0.132 0.188 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 5.33e-01 0.0924 0.148 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 4.42e-01 0.125 0.162 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 3.24e-01 -0.169 0.171 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 8.27e-02 0.226 0.13 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 1.32e-01 -0.267 0.177 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 2.91e-01 0.16 0.151 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 2.60e-01 -0.121 0.107 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0707 0.191 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 6.25e-01 0.0817 0.167 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 5.59e-01 -0.108 0.184 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 4.62e-01 0.134 0.182 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 9.30e-01 -0.012 0.136 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 5.56e-01 -0.114 0.193 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 1.44e-01 0.257 0.176 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 3.25e-01 0.124 0.125 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 1.53e-01 0.295 0.205 0.06 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 6.63e-01 0.0875 0.2 0.06 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0364 0.21 0.06 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 5.98e-01 -0.104 0.196 0.06 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0159 0.169 0.06 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 7.01e-01 0.0783 0.203 0.06 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 5.12e-01 0.12 0.183 0.06 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 8.43e-02 -0.225 0.129 0.06 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 1.20e-01 0.297 0.191 0.059 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 5.10e-01 -0.122 0.185 0.059 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 8.43e-02 -0.347 0.2 0.059 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 1.96e-01 0.259 0.199 0.059 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 1.54e-01 0.181 0.127 0.059 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 5.87e-01 -0.108 0.199 0.059 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 8.86e-01 0.0273 0.189 0.059 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 7.65e-01 0.0503 0.168 0.059 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0959 0.209 0.059 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 3.21e-01 0.202 0.203 0.059 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 7.64e-01 0.0641 0.213 0.059 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 6.92e-01 0.0836 0.211 0.059 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 6.17e-01 0.102 0.203 0.059 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 7.81e-01 0.0607 0.218 0.059 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 4.22e-01 0.148 0.183 0.059 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 5.18e-01 -0.117 0.181 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 5.15e-01 0.123 0.188 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 3.22e-01 -0.197 0.198 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 9.58e-01 0.00922 0.175 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 3.21e-01 0.2 0.201 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00286 0.187 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 1.59e-01 -0.169 0.12 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 5.66e-01 0.0965 0.168 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 6.56e-01 0.0744 0.167 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 1.71e-01 -0.158 0.115 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 5.97e-01 0.0947 0.179 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 6.08e-02 -0.339 0.18 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 8.61e-01 0.0262 0.149 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0361 0.194 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -810985 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00354 0.172 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0376 0.147 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0641 0.154 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 4.68e-01 -0.137 0.189 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0825 0.105 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 5.53e-01 0.103 0.173 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 6.39e-01 0.0644 0.137 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0172 0.148 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0393 0.161 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 2.15e-01 0.151 0.121 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 6.06e-02 -0.31 0.164 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 1.60e-01 0.21 0.149 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0292 0.103 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 5.73e-02 0.377 0.197 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0739 0.184 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 2.04e-01 -0.231 0.182 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 9.04e-01 0.0246 0.204 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 3.90e-01 0.101 0.118 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 8.31e-01 0.0418 0.196 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -476991 sc-eQTL 7.79e-01 0.0469 0.167 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 3.13e-01 -0.134 0.133 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -477255 sc-eQTL 5.25e-01 0.114 0.179 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 89934 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0468 0.167 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -733029 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0535 0.143 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -333137 sc-eQTL 7.50e-01 0.0516 0.162 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 591914 sc-eQTL 1.83e-01 -0.189 0.141 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 280503 sc-eQTL 3.30e-01 -0.156 0.159 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -263257 sc-eQTL 8.00e-01 0.0297 0.117 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 89934 eQTL 0.00652 -0.0732 0.0268 0.0 0.0 0.0633
ENSG00000173588 CEP83 280503 eQTL 0.042 -0.104 0.0512 0.0 0.0 0.0633

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina