logo

Genes within 1Mb (chr12:94740112:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0408 0.0843 0.218 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 2.56e-01 0.113 0.0988 0.218 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0556 0.0741 0.218 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 7.74e-01 0.0269 0.0937 0.218 B L1
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 7.91e-02 0.15 0.0849 0.218 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000639 0.0562 0.218 B L1
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0368 0.0709 0.218 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 5.42e-01 0.0524 0.0857 0.218 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0304 0.0408 0.218 B L1
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0783 0.0702 0.218 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 1.06e-01 -0.0985 0.0607 0.218 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 6.84e-01 0.0277 0.068 0.218 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 5.96e-01 0.0493 0.0928 0.218 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 1.80e-02 -0.141 0.059 0.218 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 5.01e-01 0.0421 0.0625 0.218 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 4.12e-01 0.0539 0.0655 0.218 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0533 0.0836 0.218 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 5.43e-01 0.0342 0.0562 0.218 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 3.98e-01 0.0605 0.0715 0.218 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 3.26e-01 0.0894 0.0909 0.218 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0111 0.0815 0.218 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 2.78e-01 0.0841 0.0773 0.218 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 5.79e-01 0.0401 0.0723 0.218 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 3.14e-01 0.0596 0.0591 0.218 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 5.40e-02 -0.188 0.0972 0.223 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 7.40e-01 0.0345 0.104 0.223 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 5.00e-01 0.0695 0.103 0.223 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0314 0.0997 0.223 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 3.20e-02 -0.199 0.0919 0.223 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0745 0.0827 0.223 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 6.25e-01 0.0452 0.0922 0.223 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 1.39e-01 0.115 0.0772 0.223 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0927 0.0917 0.218 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 1.08e-01 0.115 0.071 0.218 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0316 0.0731 0.218 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 4.57e-01 0.0648 0.0871 0.218 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0118 0.0592 0.218 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 6.87e-01 0.0354 0.0875 0.218 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 9.59e-01 0.00397 0.0779 0.218 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 1.98e-01 0.0721 0.0558 0.218 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 7.99e-04 -0.306 0.0899 0.219 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 5.70e-01 0.0496 0.0871 0.219 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 3.86e-01 0.0634 0.073 0.219 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0462 0.0865 0.219 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00176 0.0713 0.219 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 7.18e-02 0.146 0.0804 0.219 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 6.65e-02 0.109 0.0593 0.219 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0918 0.102 0.218 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00729 0.0873 0.218 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0542 0.0796 0.218 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0796 0.0993 0.218 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0292 0.0807 0.218 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 9.76e-01 0.00272 0.0909 0.218 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 9.39e-01 0.00391 0.0506 0.218 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0576 0.119 0.209 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0701 0.101 0.209 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 4.35e-01 0.0968 0.124 0.209 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 9.07e-02 0.201 0.118 0.209 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 4.74e-01 0.0649 0.0906 0.209 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 4.73e-01 0.0687 0.0956 0.209 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 1.79e-01 -0.16 0.119 0.209 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 2.47e-01 0.0972 0.0837 0.209 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0382 0.105 0.209 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 4.96e-01 0.0687 0.101 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0503 0.102 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 8.45e-01 0.0183 0.0931 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 8.78e-01 0.0157 0.102 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 3.60e-01 0.0958 0.104 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 1.29e-01 -0.13 0.0854 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 5.25e-01 0.0605 0.0951 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 2.44e-01 -0.109 0.0931 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0728 0.0771 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 2.78e-01 -0.115 0.106 0.22 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 3.63e-01 0.0982 0.108 0.22 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0126 0.103 0.22 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 9.75e-02 -0.183 0.11 0.22 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 9.52e-01 0.00597 0.0988 0.22 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 2.15e-01 0.103 0.0832 0.22 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0246 0.0974 0.22 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 2.80e-01 0.106 0.098 0.22 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 7.81e-01 -0.022 0.0791 0.22 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0192 0.0996 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 7.22e-01 0.0359 0.101 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 8.80e-01 0.0128 0.0847 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 8.84e-01 0.0151 0.103 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 5.39e-01 0.0626 0.102 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 7.32e-01 0.0294 0.0855 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 1.16e-01 -0.139 0.0879 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 7.54e-02 0.172 0.0961 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0279 0.0564 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0705 0.108 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 1.14e-01 0.156 0.0982 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 1.89e-01 -0.131 0.0995 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 6.77e-02 0.199 0.108 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 9.74e-02 0.165 0.0993 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 9.68e-01 0.00369 0.0925 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 7.66e-01 0.029 0.0976 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 5.42e-01 -0.05 0.0818 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 4.86e-01 0.0561 0.0803 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 9.22e-01 0.0102 0.104 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0351 0.109 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 2.70e-01 0.121 0.109 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 2.73e-01 0.0948 0.0864 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 7.11e-01 -0.036 0.0973 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 9.55e-01 0.00562 0.0995 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 3.42e-01 0.0852 0.0894 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0942 0.0798 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0891 0.0691 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 7.48e-01 0.0273 0.0847 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 1.92e-01 0.127 0.0971 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 1.08e-02 -0.168 0.0654 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 7.03e-01 0.0275 0.0718 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 2.43e-01 0.0719 0.0615 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 9.08e-01 0.00988 0.0855 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 8.66e-01 0.0136 0.0801 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 6.74e-01 0.0392 0.0933 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 1.55e-01 -0.154 0.108 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0978 0.0796 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 4.64e-01 0.0624 0.085 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 8.89e-01 0.0102 0.0734 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 5.86e-01 0.0591 0.108 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 8.37e-02 -0.166 0.0953 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 6.39e-02 -0.186 0.1 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 3.32e-01 0.0983 0.101 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 6.35e-01 0.0411 0.0865 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 2.16e-01 0.12 0.0969 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 4.11e-02 0.179 0.087 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 4.69e-01 0.0695 0.0957 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0513 0.0844 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0502 0.0958 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 4.20e-01 0.0855 0.106 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 1.76e-01 0.137 0.101 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 1.59e-01 0.122 0.0862 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 6.16e-01 0.0479 0.0954 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 1.97e-01 0.0968 0.0748 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0527 0.0971 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 2.57e-01 0.086 0.0757 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 2.06e-01 0.111 0.0876 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 5.53e-01 0.058 0.0975 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0407 0.088 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 9.54e-01 0.00514 0.0891 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0333 0.0859 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 9.37e-01 0.00566 0.0712 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 9.27e-01 0.00975 0.107 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 2.62e-01 0.0924 0.0821 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 3.20e-01 0.108 0.108 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0671 0.109 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 7.53e-01 0.0308 0.0978 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 1.95e-01 0.134 0.103 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0353 0.106 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 8.14e-01 0.02 0.0852 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 2.11e-01 -0.138 0.11 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 3.52e-01 0.0881 0.0945 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 1.00e-01 -0.176 0.106 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 4.25e-01 0.0898 0.112 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0658 0.0933 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0301 0.106 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 4.35e-01 0.0857 0.11 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0561 0.0936 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0938 0.104 0.214 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 9.57e-01 0.00474 0.0886 0.214 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0995 0.102 0.214 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0633 0.0985 0.214 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 5.19e-01 -0.056 0.0867 0.214 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0086 0.0994 0.214 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0426 0.0869 0.214 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 5.76e-02 -0.207 0.108 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 9.51e-02 0.174 0.104 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0406 0.107 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 8.17e-01 0.0261 0.113 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 8.04e-01 0.023 0.0925 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 4.60e-02 0.186 0.0928 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 2.90e-01 0.0949 0.0895 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 1.42e-01 -0.152 0.103 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0155 0.0904 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 7.14e-02 0.169 0.093 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0718 0.0953 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00478 0.0839 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 1.96e-01 0.125 0.0965 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 5.75e-02 0.128 0.067 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 1.24e-01 -0.175 0.113 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0243 0.101 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 2.81e-01 -0.115 0.106 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 1.89e-01 -0.147 0.111 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 1.54e-01 0.13 0.091 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 8.54e-01 0.0194 0.105 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 9.39e-01 0.00727 0.0945 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 1.66e-01 -0.132 0.0947 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0428 0.0976 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0862 0.0964 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00996 0.1 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0443 0.0865 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 6.26e-01 0.0485 0.0993 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 1.06e-01 0.112 0.0689 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0408 0.13 0.204 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0561 0.117 0.204 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 8.05e-01 0.0321 0.13 0.204 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0469 0.123 0.204 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 1.53e-01 -0.166 0.115 0.204 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0672 0.12 0.204 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 4.52e-01 0.094 0.125 0.204 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 5.06e-01 -0.069 0.104 0.204 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 8.83e-01 0.0108 0.0729 0.204 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0263 0.101 0.217 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 2.29e-01 -0.108 0.0895 0.217 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0909 0.0863 0.217 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00384 0.104 0.217 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 9.21e-01 0.0102 0.102 0.217 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0835 0.101 0.217 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0774 0.0629 0.217 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 2.79e-03 -0.306 0.101 0.218 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 1.12e-01 -0.155 0.0969 0.218 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 7.54e-01 0.0324 0.103 0.218 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 9.87e-01 0.00155 0.0923 0.218 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0833 0.0949 0.218 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0112 0.102 0.218 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 1.23e-01 0.12 0.0776 0.218 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 9.82e-03 -0.254 0.0973 0.22 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 9.91e-01 0.00122 0.107 0.22 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 9.44e-01 0.0077 0.109 0.22 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0862 0.104 0.22 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 9.68e-02 -0.154 0.0926 0.22 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 2.04e-01 -0.111 0.0871 0.22 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 5.95e-01 0.0535 0.1 0.22 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 4.23e-02 0.173 0.0845 0.22 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 7.91e-01 -0.027 0.102 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 7.15e-02 0.144 0.0792 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0502 0.0876 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 6.62e-01 0.0404 0.0923 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0398 0.0704 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00615 0.0959 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00986 0.0819 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 7.79e-01 0.0163 0.0581 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0233 0.103 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 3.68e-01 0.0809 0.0896 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0863 0.0989 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0708 0.0975 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 3.46e-01 0.069 0.0731 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 6.31e-01 0.0497 0.103 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0771 0.0946 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 1.81e-01 0.0901 0.0671 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 8.52e-02 -0.222 0.128 0.227 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 6.37e-01 0.0468 0.0989 0.227 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 4.22e-01 0.0987 0.123 0.227 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 1.88e-01 -0.173 0.131 0.227 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 5.79e-01 0.0693 0.125 0.227 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 7.74e-01 0.035 0.122 0.227 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0572 0.106 0.227 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 2.93e-01 -0.116 0.11 0.222 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 9.35e-01 0.00882 0.107 0.222 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0713 0.112 0.222 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 8.02e-01 0.0264 0.105 0.222 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0467 0.0904 0.222 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 5.63e-01 -0.063 0.109 0.222 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 2.72e-01 0.108 0.0975 0.222 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 3.54e-01 0.0648 0.0697 0.222 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 5.84e-01 0.0562 0.103 0.219 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 7.57e-01 0.0307 0.0991 0.219 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 9.71e-01 0.00394 0.108 0.219 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 5.42e-02 0.206 0.106 0.219 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 9.13e-01 0.00745 0.0683 0.219 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0521 0.107 0.219 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 1.76e-01 0.137 0.101 0.219 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 7.75e-02 0.159 0.0895 0.219 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 2.97e-01 -0.128 0.123 0.22 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 1.90e-01 0.157 0.119 0.22 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 1.30e-01 0.19 0.125 0.22 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 5.94e-02 0.233 0.123 0.22 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0207 0.119 0.22 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0487 0.128 0.22 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 3.21e-01 0.107 0.108 0.22 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0136 0.107 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0589 0.101 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 9.28e-01 0.00974 0.107 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0319 0.0946 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0896 0.109 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 1.72e-01 0.137 0.1 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 9.39e-01 0.00493 0.0649 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0299 0.0905 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 4.49e-01 0.0682 0.0899 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0762 0.062 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0613 0.0952 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 2.56e-01 0.11 0.0963 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0509 0.0794 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 3.28e-01 0.101 0.103 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -811364 sc-eQTL 2.24e-01 0.112 0.0914 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 8.91e-01 0.0108 0.0784 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0937 0.0815 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 2.13e-01 0.125 0.1 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 5.90e-01 0.0301 0.0557 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0621 0.0932 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 3.09e-02 0.159 0.0731 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0548 0.0797 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 9.08e-01 0.0101 0.0868 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0088 0.0655 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 6.94e-01 0.0352 0.0893 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0504 0.0806 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 2.55e-01 0.063 0.0552 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 2.89e-01 -0.111 0.104 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 8.81e-01 0.0145 0.0967 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 7.79e-01 0.0269 0.0955 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 3.39e-02 0.226 0.106 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 7.16e-01 0.0225 0.0617 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 2.22e-01 -0.125 0.102 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -477370 sc-eQTL 1.12e-01 0.139 0.087 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 6.37e-02 0.129 0.0692 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -477634 sc-eQTL 5.28e-03 -0.264 0.0935 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 89555 sc-eQTL 8.14e-01 0.021 0.089 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -733408 sc-eQTL 1.89e-01 0.0999 0.0758 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -333516 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0451 0.0862 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 591535 sc-eQTL 6.82e-01 -0.031 0.0757 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 280124 sc-eQTL 1.02e-01 0.139 0.0846 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 sc-eQTL 5.57e-02 0.119 0.062 0.218 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000184752 NDUFA12 -263636 eQTL 0.0282 0.0483 0.022 0.0 0.0 0.196

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 \N 89555 8.08e-06 9.91e-06 1.33e-06 7.87e-06 2.26e-06 4.47e-06 1.09e-05 1.91e-06 9.65e-06 4.99e-06 1.19e-05 6.14e-06 1.3e-05 4.08e-06 2.19e-06 6.57e-06 3.84e-06 7.38e-06 2.5e-06 2.76e-06 4.39e-06 7.74e-06 7.17e-06 3.3e-06 1.5e-05 2.92e-06 5.53e-06 3.74e-06 8.29e-06 7.77e-06 4.69e-06 9.57e-07 7.36e-07 3.07e-06 5.11e-06 2.18e-06 1.72e-06 1.85e-06 1.89e-06 1.3e-06 9.63e-07 1.16e-05 1.48e-06 2.1e-07 6.99e-07 1.75e-06 1.38e-06 6.85e-07 5.22e-07