logo

Genes within 1Mb (chr12:94738615:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0206 0.136 0.085 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 1.43e-01 0.234 0.159 0.085 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 1.93e-01 -0.156 0.119 0.085 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 1.44e-01 0.221 0.151 0.085 B L1
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 3.61e-01 -0.126 0.138 0.085 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0114 0.0907 0.085 B L1
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0752 0.114 0.085 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 1.02e-01 -0.226 0.138 0.085 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0592 0.0659 0.085 B L1
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 1.83e-01 0.149 0.112 0.085 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 2.80e-01 0.105 0.0972 0.085 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0841 0.108 0.085 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 1.22e-01 0.229 0.147 0.085 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0354 0.0953 0.085 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 3.61e-01 0.0913 0.0997 0.085 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 4.50e-01 0.0792 0.105 0.085 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 3.41e-01 0.13 0.136 0.085 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 9.90e-01 0.00112 0.0919 0.085 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 7.34e-01 0.0398 0.117 0.085 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 2.47e-01 0.172 0.148 0.085 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 7.75e-01 0.0381 0.133 0.085 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0547 0.127 0.085 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0426 0.118 0.085 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 1.85e-01 0.128 0.0964 0.085 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 3.87e-01 0.138 0.159 0.086 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0667 0.169 0.086 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000393 0.167 0.086 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 3.87e-01 0.14 0.161 0.086 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 2.15e-01 0.187 0.15 0.086 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 9.58e-01 0.00704 0.134 0.086 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 8.59e-01 0.0266 0.15 0.086 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0568 0.126 0.086 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 3.97e-01 0.124 0.146 0.085 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 5.90e-01 0.0613 0.113 0.085 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 1.02e-02 -0.297 0.115 0.085 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 4.74e-01 0.0993 0.139 0.085 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0367 0.0941 0.085 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0719 0.139 0.085 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0862 0.124 0.085 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0067 0.0891 0.085 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 6.05e-01 0.0781 0.151 0.086 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 1.56e-01 0.201 0.142 0.086 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 9.79e-01 0.00315 0.119 0.086 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 9.21e-02 -0.238 0.14 0.086 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0505 0.116 0.086 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 5.07e-01 0.0879 0.132 0.086 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 8.84e-01 0.0143 0.0977 0.086 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 5.05e-01 -0.112 0.167 0.085 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 5.68e-01 0.0815 0.143 0.085 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 1.75e-01 0.176 0.13 0.085 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 5.53e-02 0.311 0.161 0.085 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 3.30e-01 -0.128 0.132 0.085 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0579 0.148 0.085 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 6.77e-01 0.0345 0.0826 0.085 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 7.95e-01 0.0483 0.186 0.084 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 1.58e-01 0.224 0.158 0.084 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 7.04e-01 0.0737 0.194 0.084 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 9.41e-01 0.0137 0.186 0.084 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 1.05e-01 -0.229 0.141 0.084 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 1.23e-01 -0.231 0.149 0.084 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0673 0.186 0.084 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0745 0.131 0.084 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 4.19e-01 0.133 0.164 0.084 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 1.40e-01 0.236 0.159 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 4.08e-01 0.134 0.162 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0949 0.148 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 7.58e-02 0.287 0.161 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 2.19e-01 -0.204 0.166 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 9.81e-02 0.225 0.136 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0745 0.151 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 1.29e-01 -0.225 0.148 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0517 0.123 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 9.76e-01 0.00508 0.17 0.086 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 5.17e-01 -0.112 0.172 0.086 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0213 0.165 0.086 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 4.70e-01 -0.128 0.177 0.086 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 1.31e-01 -0.238 0.157 0.086 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0339 0.134 0.086 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 3.87e-01 -0.135 0.156 0.086 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 2.07e-01 -0.198 0.157 0.086 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0361 0.126 0.086 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 1.52e-01 -0.231 0.161 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 3.96e-01 0.139 0.163 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 2.05e-01 -0.174 0.137 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0344 0.168 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 1.88e-01 0.218 0.165 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0754 0.139 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 6.86e-01 0.058 0.143 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 9.14e-01 -0.017 0.157 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0748 0.0914 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 3.39e-01 0.168 0.175 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 3.19e-01 0.16 0.16 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 7.96e-01 0.0419 0.162 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 3.39e-01 0.169 0.177 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 4.00e-01 -0.136 0.162 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 6.41e-01 -0.07 0.15 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 7.60e-01 0.0484 0.158 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0449 0.133 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0695 0.13 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 2.61e-01 0.192 0.17 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 5.03e-01 0.119 0.178 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0855 0.179 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 1.35e-01 0.212 0.141 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 3.02e-01 -0.164 0.159 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 4.73e-01 0.117 0.163 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 6.28e-01 0.0712 0.147 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 6.30e-01 0.0613 0.127 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 2.09e-01 0.138 0.11 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 1.52e-01 -0.192 0.134 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 1.95e-01 0.201 0.154 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0876 0.105 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 1.90e-01 0.149 0.114 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 5.18e-01 0.0633 0.0978 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 1.35e-01 0.204 0.136 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 4.85e-01 0.0893 0.128 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0799 0.149 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 6.45e-01 0.0797 0.173 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 7.67e-01 0.0378 0.127 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 6.94e-01 0.0534 0.136 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 8.08e-01 0.0284 0.117 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 7.05e-01 0.0664 0.175 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 7.31e-01 0.0535 0.155 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0821 0.163 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 8.02e-01 0.0411 0.164 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 1.33e-01 -0.21 0.139 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 3.60e-01 -0.144 0.157 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 6.48e-01 0.0649 0.142 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 7.19e-01 0.0559 0.155 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 8.07e-01 0.0335 0.137 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 2.30e-01 -0.186 0.155 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 3.55e-01 0.159 0.172 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 7.48e-02 0.293 0.163 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 8.47e-01 0.0272 0.141 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 3.26e-01 0.152 0.154 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0165 0.122 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 1.78e-02 0.372 0.156 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 2.52e-01 0.141 0.123 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 9.30e-01 0.0125 0.143 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 7.30e-01 0.0547 0.158 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 2.49e-01 -0.165 0.142 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0705 0.145 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0723 0.139 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 4.26e-01 0.0921 0.115 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 7.84e-01 0.0484 0.177 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 9.43e-01 0.00971 0.136 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 4.56e-01 0.134 0.179 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 7.06e-01 -0.068 0.18 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 3.02e-01 -0.167 0.161 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0974 0.171 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 1.57e-01 -0.248 0.174 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 8.83e-02 0.24 0.14 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 5.18e-01 -0.115 0.178 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 6.60e-01 0.0676 0.153 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 9.30e-01 0.0152 0.173 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 2.94e-01 0.191 0.182 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 6.52e-02 0.278 0.15 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 8.16e-01 0.0401 0.172 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0964 0.177 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 1.43e-01 0.222 0.151 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 8.06e-01 0.042 0.171 0.084 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0866 0.145 0.084 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 5.33e-01 0.104 0.166 0.084 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 6.08e-01 0.0828 0.161 0.084 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0149 0.142 0.084 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0307 0.163 0.084 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 8.83e-01 0.021 0.142 0.084 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 3.31e-01 -0.169 0.174 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 1.48e-02 0.404 0.164 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 3.80e-01 0.15 0.171 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 9.16e-01 0.0191 0.18 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 5.16e-01 0.0957 0.147 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 9.17e-01 0.0156 0.149 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 8.41e-01 0.0287 0.143 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0247 0.17 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 7.52e-02 0.263 0.147 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 7.79e-01 0.0431 0.153 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0785 0.156 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 4.26e-01 -0.109 0.137 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0436 0.159 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0114 0.111 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 1.70e-01 0.252 0.183 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0492 0.163 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 5.98e-02 0.321 0.17 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 6.05e-01 0.0936 0.181 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0617 0.148 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 2.09e-01 0.213 0.169 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0884 0.152 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 5.36e-01 0.0951 0.153 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 2.30e-01 0.189 0.157 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 5.59e-02 -0.297 0.154 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 9.22e-02 -0.271 0.16 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 5.14e-02 -0.271 0.138 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0596 0.16 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 4.46e-01 0.0853 0.112 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 6.43e-01 0.0934 0.201 0.096 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 6.34e-01 0.0867 0.181 0.096 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 5.24e-01 0.128 0.201 0.096 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 1.41e-01 -0.281 0.189 0.096 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 6.21e-01 0.0893 0.18 0.096 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 2.45e-01 0.216 0.185 0.096 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 3.72e-01 -0.173 0.193 0.096 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 3.59e-01 -0.148 0.16 0.096 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 9.63e-01 0.00531 0.113 0.096 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0475 0.163 0.087 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 6.82e-01 0.0597 0.145 0.087 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 1.79e-02 0.33 0.138 0.087 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 3.83e-01 -0.148 0.169 0.087 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 8.09e-01 0.04 0.166 0.087 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 8.37e-02 -0.283 0.163 0.087 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 3.83e-01 0.0894 0.102 0.087 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 3.08e-01 0.17 0.166 0.085 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0954 0.157 0.085 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 8.62e-01 -0.029 0.166 0.085 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 7.87e-01 0.0403 0.149 0.085 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 1.91e-01 -0.2 0.153 0.085 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0288 0.164 0.085 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 8.48e-01 0.0242 0.126 0.085 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 4.83e-02 0.329 0.166 0.078 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 9.36e-01 0.0145 0.18 0.078 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 5.05e-01 -0.123 0.183 0.078 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 4.17e-01 0.143 0.176 0.078 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 2.72e-01 0.173 0.157 0.078 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0927 0.148 0.078 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 8.19e-01 -0.039 0.17 0.078 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 5.04e-01 0.0966 0.144 0.078 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000907 0.161 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 5.19e-02 0.245 0.126 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 2.91e-01 -0.147 0.139 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 5.69e-01 0.0835 0.146 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0227 0.112 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 9.54e-01 0.00879 0.152 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 7.88e-01 0.035 0.13 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00613 0.0922 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 4.25e-01 0.131 0.164 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0481 0.144 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 1.40e-01 -0.234 0.158 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 9.38e-01 0.0121 0.156 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 7.84e-01 0.0321 0.117 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0073 0.166 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0977 0.152 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 9.18e-01 0.0111 0.108 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 5.60e-01 -0.115 0.197 0.091 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 3.24e-01 0.149 0.151 0.091 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 2.55e-01 0.214 0.187 0.091 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 4.38e-02 0.402 0.198 0.091 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 3.10e-01 -0.193 0.19 0.091 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0302 0.186 0.091 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0799 0.162 0.091 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 1.08e-01 0.288 0.178 0.084 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0388 0.174 0.084 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 2.92e-01 -0.192 0.182 0.084 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00171 0.171 0.084 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 3.23e-01 -0.145 0.146 0.084 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0528 0.177 0.084 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 1.79e-02 -0.374 0.157 0.084 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 7.87e-02 0.199 0.112 0.084 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0577 0.164 0.079 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0788 0.158 0.079 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0525 0.172 0.079 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 6.87e-01 0.069 0.171 0.079 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 1.56e-01 -0.155 0.109 0.079 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 1.00e+00 -2.02e-05 0.171 0.079 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 4.64e-01 -0.119 0.162 0.079 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0312 0.144 0.079 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 3.84e-01 -0.167 0.192 0.076 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0535 0.187 0.076 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 2.89e-01 -0.208 0.195 0.076 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 5.94e-01 0.103 0.194 0.076 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 7.09e-01 0.0695 0.186 0.076 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 7.22e-01 0.0714 0.2 0.076 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0183 0.168 0.076 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 3.38e-01 0.159 0.166 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 2.46e-01 0.189 0.162 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 8.14e-01 0.0404 0.172 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 6.26e-01 -0.074 0.152 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 4.43e-01 0.134 0.174 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 1.71e-01 -0.221 0.161 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 8.00e-01 0.0264 0.104 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 2.93e-01 -0.153 0.145 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 5.69e-02 -0.274 0.143 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00734 0.0998 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 4.73e-01 -0.11 0.154 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 2.31e-01 0.187 0.155 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 2.94e-01 -0.135 0.128 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 2.82e-01 0.18 0.166 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -812861 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00152 0.148 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0662 0.126 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 7.32e-01 0.0453 0.132 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0101 0.163 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0959 0.0897 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 5.74e-01 0.0831 0.148 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 3.56e-01 0.108 0.117 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 1.98e-02 -0.293 0.125 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 6.06e-01 0.071 0.137 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0147 0.104 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0246 0.141 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0136 0.128 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0156 0.0877 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 5.66e-01 0.0985 0.171 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0907 0.159 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0973 0.157 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00729 0.176 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 6.55e-02 -0.186 0.101 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 9.92e-01 0.00173 0.168 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -478867 sc-eQTL 2.01e-01 -0.184 0.143 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 9.70e-01 0.00426 0.115 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -479131 sc-eQTL 3.69e-01 0.14 0.156 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 88058 sc-eQTL 1.14e-01 0.23 0.145 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -734905 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0588 0.125 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -335013 sc-eQTL 8.71e-02 -0.241 0.14 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 590038 sc-eQTL 2.76e-01 -0.135 0.123 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 278627 sc-eQTL 7.51e-01 0.0443 0.139 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -265133 sc-eQTL 8.58e-01 0.0183 0.102 0.086 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028203 VEZT -479131 eQTL 0.0411 0.0479 0.0234 0.0 0.0 0.0967
ENSG00000057704 TMCC3 88058 eQTL 0.068 -0.0396 0.0217 0.00298 0.0 0.0967
ENSG00000236349 SUCLG2P2 190374 eQTL 0.0458 -0.0742 0.0371 0.00165 0.0 0.0967

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina