logo

Genes within 1Mb (chr12:94734494:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 7.30e-01 0.0422 0.122 0.079 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 6.11e-01 0.073 0.143 0.079 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 6.07e-02 -0.201 0.106 0.079 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0768 0.136 0.079 B L1
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00151 0.124 0.079 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 4.20e-01 0.0656 0.0812 0.079 B L1
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 6.38e-01 0.0484 0.103 0.079 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 2.78e-01 0.135 0.124 0.079 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00442 0.0592 0.079 B L1
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 1.99e-01 -0.132 0.102 0.079 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0819 0.0891 0.079 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 6.17e-01 0.0497 0.0994 0.079 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0688 0.136 0.079 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 4.25e-01 0.0698 0.0873 0.079 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0738 0.0914 0.079 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0512 0.0959 0.079 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0578 0.123 0.079 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0133 0.0829 0.079 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 3.73e-01 0.094 0.105 0.079 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 3.11e-01 0.136 0.134 0.079 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 6.57e-01 0.0535 0.12 0.079 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 2.34e-01 -0.136 0.114 0.079 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0983 0.106 0.079 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0968 0.087 0.079 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 8.25e-01 0.0314 0.142 0.081 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 5.21e-01 0.0966 0.15 0.081 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 5.00e-01 0.101 0.149 0.081 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 7.85e-01 0.0395 0.144 0.081 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 4.88e-02 0.264 0.133 0.081 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 5.35e-01 0.0744 0.12 0.081 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 5.79e-02 -0.252 0.132 0.081 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 6.31e-01 -0.054 0.112 0.081 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0237 0.132 0.079 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 7.02e-01 0.0393 0.103 0.079 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0412 0.105 0.079 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0702 0.125 0.079 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 2.49e-01 0.0981 0.0848 0.079 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 3.70e-01 0.113 0.126 0.079 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 3.71e-01 -0.1 0.112 0.079 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 1.09e-01 -0.129 0.08 0.079 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0127 0.132 0.079 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 9.04e-01 0.0151 0.125 0.079 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 5.80e-01 0.0581 0.105 0.079 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 8.69e-01 0.0205 0.124 0.079 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 3.50e-01 0.0956 0.102 0.079 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 8.82e-01 0.0173 0.116 0.079 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0851 0.0856 0.079 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 7.66e-01 0.0449 0.15 0.079 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 5.48e-01 0.0771 0.128 0.079 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0167 0.117 0.079 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 9.95e-01 0.00098 0.146 0.079 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 7.92e-02 0.208 0.118 0.079 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0463 0.133 0.079 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0541 0.0741 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 5.29e-01 0.105 0.166 0.084 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 1.55e-01 -0.201 0.141 0.084 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 2.12e-01 0.216 0.173 0.084 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 7.93e-01 0.0436 0.166 0.084 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0743 0.127 0.084 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 8.64e-01 0.023 0.134 0.084 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 3.51e-01 -0.156 0.166 0.084 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0374 0.117 0.084 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0416 0.147 0.084 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 4.75e-01 0.104 0.145 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 5.91e-01 0.0791 0.147 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 1.12e-01 -0.213 0.133 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0521 0.147 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 2.45e-01 0.175 0.15 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 2.16e-01 0.153 0.123 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 3.36e-01 0.132 0.137 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0817 0.135 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 6.93e-01 0.0441 0.111 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 1.60e-01 -0.215 0.152 0.08 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 2.07e-01 0.196 0.155 0.08 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 1.59e-01 -0.209 0.148 0.08 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 5.43e-02 -0.306 0.158 0.08 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0304 0.142 0.08 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 1.13e-01 0.19 0.119 0.08 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 5.27e-02 0.271 0.139 0.08 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 3.50e-01 -0.132 0.141 0.08 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 2.94e-01 -0.119 0.113 0.08 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 4.66e-01 0.105 0.144 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 6.53e-01 0.0654 0.146 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 3.89e-01 -0.105 0.122 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 6.35e-01 0.071 0.149 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0159 0.147 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 5.61e-02 -0.236 0.123 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 8.34e-02 -0.221 0.127 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 2.84e-02 0.305 0.138 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 2.45e-01 0.0948 0.0813 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0222 0.156 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 3.84e-01 -0.124 0.143 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 3.11e-01 -0.146 0.144 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 7.48e-01 0.0507 0.158 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 5.94e-01 -0.077 0.144 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 7.02e-02 0.241 0.133 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 7.72e-01 0.0408 0.141 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 4.03e-01 0.0989 0.118 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 3.34e-01 -0.112 0.116 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 6.45e-01 0.0711 0.154 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 3.67e-01 -0.145 0.161 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 7.98e-02 0.283 0.161 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 4.21e-01 -0.103 0.128 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 2.87e-01 -0.154 0.144 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 2.45e-01 -0.171 0.147 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0431 0.133 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0764 0.116 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0447 0.1 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 3.82e-01 -0.107 0.122 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 9.05e-01 0.0168 0.141 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 6.40e-01 0.0449 0.0958 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 7.99e-02 -0.181 0.103 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0938 0.0888 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 3.38e-01 -0.118 0.123 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0493 0.116 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 1.83e-01 0.179 0.134 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 2.65e-01 -0.175 0.156 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 1.23e-01 0.177 0.115 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0542 0.123 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0533 0.106 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00381 0.16 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 3.61e-02 -0.296 0.14 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 3.41e-01 -0.142 0.148 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 1.44e-01 -0.218 0.149 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 2.19e-01 -0.157 0.127 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 1.93e-01 0.186 0.143 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0689 0.129 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0846 0.14 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0399 0.123 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 7.90e-01 0.0373 0.14 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0259 0.155 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0475 0.148 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 4.39e-01 -0.098 0.126 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 5.67e-01 -0.08 0.139 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0174 0.11 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 6.80e-01 0.0585 0.142 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 1.92e-01 0.144 0.11 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00899 0.128 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 3.29e-02 0.302 0.141 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 4.11e-01 0.106 0.128 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 3.28e-01 -0.127 0.13 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 4.10e-01 0.103 0.125 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 4.25e-02 -0.21 0.103 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 5.58e-01 0.0905 0.154 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 1.23e-01 0.183 0.118 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 3.54e-01 0.145 0.156 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 5.09e-01 0.104 0.157 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 9.58e-02 0.235 0.14 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0812 0.149 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 1.37e-01 -0.227 0.152 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 9.29e-01 -0.011 0.123 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0518 0.158 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0851 0.136 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 2.31e-01 -0.184 0.153 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 1.54e-01 -0.23 0.16 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 5.46e-01 -0.081 0.134 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0349 0.152 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 3.54e-02 -0.33 0.156 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 8.34e-01 0.0282 0.134 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 7.41e-01 0.0505 0.153 0.078 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 3.79e-01 0.114 0.129 0.078 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 3.88e-01 -0.128 0.148 0.078 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0583 0.144 0.078 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 3.45e-02 0.266 0.125 0.078 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0276 0.145 0.078 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0817 0.127 0.078 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00737 0.153 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 8.26e-01 0.0323 0.147 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0787 0.151 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 7.07e-01 0.0597 0.158 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 2.85e-01 -0.139 0.129 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 3.40e-01 0.125 0.131 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 5.91e-01 0.0676 0.126 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 4.81e-01 -0.104 0.148 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 5.13e-01 0.0843 0.129 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 8.14e-01 0.0314 0.133 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 2.08e-01 0.171 0.135 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 9.71e-02 0.198 0.119 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 2.45e-01 -0.16 0.138 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0891 0.0961 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 4.23e-01 -0.131 0.163 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 3.81e-01 -0.127 0.144 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 1.37e-01 0.225 0.151 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 3.28e-01 -0.156 0.16 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 2.55e-02 0.291 0.129 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0515 0.15 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 6.82e-01 0.0554 0.135 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 1.80e-01 0.184 0.137 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0549 0.141 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 2.68e-01 -0.155 0.139 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 4.14e-02 -0.294 0.143 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 4.02e-01 0.105 0.125 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 1.25e-01 0.22 0.143 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0619 0.1 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 1.32e-01 0.294 0.194 0.078 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 7.69e-02 -0.31 0.174 0.078 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 4.53e-01 0.147 0.195 0.078 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 4.29e-01 0.147 0.185 0.078 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 6.70e-01 0.0746 0.175 0.078 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 7.62e-01 0.0548 0.18 0.078 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 2.15e-01 0.233 0.186 0.078 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 2.80e-02 0.34 0.153 0.078 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 1.11e-01 -0.174 0.108 0.078 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 1.15e-01 0.228 0.144 0.08 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0187 0.129 0.08 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 4.96e-01 0.0848 0.124 0.08 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 9.53e-01 0.00894 0.15 0.08 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 4.90e-01 -0.102 0.147 0.08 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 3.03e-01 0.15 0.145 0.08 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 4.61e-01 0.067 0.0908 0.08 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 4.73e-01 -0.107 0.149 0.079 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 2.35e-01 0.168 0.141 0.079 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0461 0.149 0.079 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 1.36e-01 -0.199 0.133 0.079 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 5.61e-02 0.262 0.137 0.079 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 5.62e-01 0.0856 0.147 0.079 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0321 0.113 0.079 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 8.91e-01 0.021 0.153 0.076 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 9.43e-01 0.0117 0.165 0.076 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 2.65e-01 -0.187 0.167 0.076 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0387 0.162 0.076 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 5.44e-02 0.276 0.143 0.076 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0334 0.135 0.076 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 4.72e-01 -0.112 0.155 0.076 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0302 0.132 0.076 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0474 0.147 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 7.81e-01 0.0323 0.116 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0663 0.127 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 4.25e-01 -0.107 0.134 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 1.90e-01 0.134 0.102 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 7.13e-01 0.0513 0.139 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 3.72e-01 -0.106 0.119 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 7.69e-02 -0.149 0.0837 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 7.19e-01 0.0534 0.148 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 5.45e-01 0.0788 0.13 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 9.99e-01 0.000199 0.143 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 7.86e-01 0.0384 0.141 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0197 0.106 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0768 0.15 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 5.87e-01 0.0746 0.137 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 8.44e-02 -0.168 0.0969 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0733 0.177 0.088 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 1.32e-01 -0.203 0.134 0.088 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 2.50e-01 0.193 0.167 0.088 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 3.79e-01 0.158 0.179 0.088 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0345 0.17 0.088 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00173 0.166 0.088 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 7.28e-02 0.259 0.143 0.088 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 9.27e-02 -0.267 0.158 0.078 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 7.33e-01 0.0527 0.154 0.078 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 7.56e-01 0.0505 0.162 0.078 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 2.71e-01 0.166 0.151 0.078 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 6.45e-01 -0.06 0.13 0.078 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 5.40e-01 0.0961 0.157 0.078 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 4.00e-01 -0.118 0.141 0.078 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0352 0.101 0.078 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 2.52e-01 -0.165 0.143 0.081 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 7.49e-01 0.0446 0.139 0.081 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0265 0.151 0.081 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 2.60e-01 -0.169 0.15 0.081 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 3.62e-01 0.0873 0.0955 0.081 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 7.52e-01 0.0473 0.15 0.081 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 7.70e-01 0.0416 0.142 0.081 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 9.27e-01 0.0116 0.126 0.081 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 5.14e-01 -0.115 0.175 0.076 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 1.56e-03 0.533 0.165 0.076 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 2.61e-01 0.201 0.178 0.076 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 9.05e-01 0.0212 0.177 0.076 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 3.00e-01 0.176 0.17 0.076 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 1.07e-02 0.463 0.179 0.076 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 1.07e-01 -0.247 0.153 0.076 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 7.96e-01 0.0393 0.152 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0595 0.147 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 2.49e-01 0.179 0.155 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 3.27e-02 -0.292 0.136 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 1.39e-01 -0.233 0.157 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 2.77e-01 0.159 0.146 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 2.58e-01 0.106 0.0938 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 1.83e-01 0.175 0.131 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 1.62e-01 -0.183 0.13 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0278 0.0902 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 5.39e-01 0.0848 0.138 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 6.82e-01 0.0574 0.14 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 1.51e-01 -0.165 0.114 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 7.81e-01 0.0416 0.15 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -816982 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0222 0.133 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0375 0.113 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 2.27e-01 -0.143 0.118 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 3.08e-02 0.314 0.144 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 8.35e-01 0.0168 0.0806 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 6.67e-01 0.0578 0.134 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 7.60e-01 0.0326 0.107 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0273 0.115 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0688 0.125 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 2.68e-01 0.104 0.0942 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 5.73e-01 0.0727 0.129 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0911 0.116 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 2.72e-02 -0.175 0.0789 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 5.62e-02 -0.287 0.15 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 9.67e-01 0.00586 0.14 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 9.96e-01 0.000733 0.138 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0442 0.155 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 5.11e-01 0.0587 0.0892 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 3.65e-01 0.134 0.148 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -482988 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0657 0.127 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0666 0.101 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -483252 sc-eQTL 8.62e-01 0.0237 0.136 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 83937 sc-eQTL 9.43e-01 0.00912 0.127 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -739026 sc-eQTL 5.75e-01 0.0611 0.109 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -339134 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0134 0.123 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 585917 sc-eQTL 9.08e-02 0.183 0.108 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 274506 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0433 0.122 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -269254 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0977 0.0892 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000180263 \N -482988 7.87e-07 4.93e-07 1.05e-07 3.58e-07 9.72e-08 1.71e-07 5.13e-07 1.21e-07 3.94e-07 2.14e-07 5.58e-07 3.3e-07 6.77e-07 1.1e-07 1.68e-07 2.18e-07 2.48e-07 3.73e-07 1.77e-07 1.15e-07 1.87e-07 3.49e-07 3.08e-07 1.32e-07 6.59e-07 2.34e-07 2.52e-07 2.18e-07 3.58e-07 4.3e-07 2.6e-07 7.71e-08 5.42e-08 1.39e-07 2.61e-07 6.94e-08 1.01e-07 6.97e-08 4.11e-08 5.77e-08 8.15e-08 4.42e-07 1.65e-08 1.88e-08 1.19e-07 1.78e-08 8.01e-08 3.04e-09 5.65e-08