logo

Genes within 1Mb (chr12:94731593:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0379 0.0875 0.252 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 6.59e-01 0.0455 0.103 0.252 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0151 0.077 0.252 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0862 0.0971 0.252 B L1
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0769 0.0886 0.252 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 1.40e-01 0.0859 0.058 0.252 B L1
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 2.06e-01 0.0931 0.0733 0.252 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 1.05e-01 -0.144 0.0884 0.252 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 8.38e-02 0.0732 0.0421 0.252 B L1
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 2.02e-02 0.166 0.071 0.252 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0483 0.0623 0.252 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 6.18e-01 0.0347 0.0695 0.252 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 6.13e-01 0.048 0.0949 0.252 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 1.36e-01 0.0908 0.0608 0.252 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0187 0.064 0.252 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0551 0.067 0.252 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 2.36e-01 0.102 0.0858 0.252 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 8.75e-01 0.00911 0.0578 0.252 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 1.58e-01 -0.104 0.0733 0.252 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 8.83e-01 0.0139 0.0937 0.252 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 5.80e-02 0.158 0.0831 0.252 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 7.17e-01 -0.029 0.0797 0.252 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 4.36e-01 0.0581 0.0743 0.252 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 3.25e-01 -0.06 0.0608 0.252 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 6.42e-01 0.0484 0.104 0.248 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 3.93e-01 0.0941 0.11 0.248 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0415 0.109 0.248 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 3.44e-01 0.1 0.105 0.248 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0451 0.0985 0.248 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 3.47e-02 -0.184 0.0867 0.248 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 7.27e-01 0.0341 0.0976 0.248 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 9.39e-01 0.00635 0.0822 0.248 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 9.21e-01 0.00945 0.0948 0.252 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 1.27e-01 -0.112 0.0733 0.252 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 9.38e-01 0.00591 0.0755 0.252 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 5.35e-01 0.0558 0.0899 0.252 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 9.22e-01 0.00601 0.0611 0.252 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 2.82e-01 0.097 0.0901 0.252 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 4.69e-01 0.0582 0.0803 0.252 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 6.04e-02 -0.108 0.0573 0.252 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 3.89e-02 0.198 0.095 0.251 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 3.54e-01 -0.084 0.0904 0.251 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 5.99e-01 -0.04 0.0759 0.251 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 3.08e-01 0.0917 0.0897 0.251 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 3.14e-01 0.0747 0.0739 0.251 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 8.91e-01 0.0115 0.0842 0.251 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0679 0.062 0.251 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0555 0.106 0.252 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 5.71e-02 0.172 0.0898 0.252 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00594 0.0827 0.252 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 4.17e-01 0.0838 0.103 0.252 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0498 0.0837 0.252 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 9.63e-01 0.00432 0.0942 0.252 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 2.04e-02 -0.121 0.0518 0.252 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 8.31e-02 0.203 0.117 0.258 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 2.91e-01 0.106 0.1 0.258 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 3.94e-01 0.104 0.122 0.258 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 5.08e-01 0.0779 0.117 0.258 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 9.05e-01 0.0107 0.0897 0.258 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0829 0.0945 0.258 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 3.11e-01 -0.119 0.118 0.258 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 1.75e-01 -0.113 0.0827 0.258 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 4.41e-01 0.0802 0.104 0.258 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0282 0.106 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 7.01e-01 -0.041 0.107 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 8.82e-01 0.0145 0.0975 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 7.82e-01 0.0297 0.107 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0381 0.109 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0654 0.0899 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0541 0.0996 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 2.92e-01 0.103 0.0976 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 8.81e-03 0.211 0.0797 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 8.78e-02 -0.189 0.11 0.25 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 5.39e-01 -0.069 0.112 0.25 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 3.72e-01 0.0959 0.107 0.25 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 3.26e-01 -0.113 0.115 0.25 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 6.76e-01 0.0431 0.103 0.25 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 2.04e-02 0.201 0.0859 0.25 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 4.24e-02 0.205 0.1 0.25 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 4.88e-02 -0.201 0.101 0.25 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 6.51e-01 0.0373 0.0823 0.25 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0448 0.103 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 8.28e-01 0.0225 0.104 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 6.20e-01 0.0433 0.0872 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 3.04e-01 0.109 0.106 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 3.29e-01 -0.102 0.105 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 7.41e-01 0.0291 0.0881 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 2.88e-01 0.0968 0.0908 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0831 0.0996 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 5.58e-01 0.0341 0.0581 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 1.31e-01 0.168 0.111 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 2.20e-01 0.125 0.102 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 3.84e-02 -0.213 0.102 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 1.57e-02 -0.271 0.111 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 8.90e-01 0.0143 0.103 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 6.13e-01 0.0483 0.0953 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 7.35e-01 0.0341 0.101 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00345 0.0845 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0961 0.0827 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 5.64e-02 0.21 0.11 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 7.85e-01 0.0316 0.116 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0144 0.116 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 9.61e-02 -0.153 0.0914 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0238 0.103 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 5.63e-01 0.0612 0.106 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0372 0.0952 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 1.75e-01 0.111 0.0816 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0969 0.0706 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 8.06e-01 0.0213 0.0866 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 6.58e-01 0.0442 0.0997 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 1.33e-01 0.102 0.0676 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 5.05e-01 -0.049 0.0734 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0225 0.0631 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 1.20e-01 0.135 0.0866 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 8.68e-01 0.0136 0.0816 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 4.87e-01 0.0661 0.0949 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 5.42e-01 0.0675 0.11 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 8.45e-01 0.0159 0.0813 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 5.13e-01 0.0568 0.0866 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0667 0.0745 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 4.06e-01 0.0923 0.111 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00743 0.0984 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 3.18e-01 0.103 0.103 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 9.83e-01 0.00221 0.104 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 9.49e-01 0.00569 0.0887 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0821 0.0995 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0449 0.09 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 7.36e-02 0.176 0.0977 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 4.00e-01 0.0731 0.0867 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0161 0.0985 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0951 0.109 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 2.06e-01 0.132 0.104 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 6.65e-01 0.0386 0.089 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 3.45e-01 0.0927 0.0979 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 1.83e-01 -0.103 0.0769 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0153 0.101 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0348 0.0789 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 2.07e-01 -0.115 0.0912 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 7.59e-01 0.0312 0.101 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 5.99e-02 0.172 0.0909 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0133 0.0927 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 4.36e-01 0.0697 0.0893 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0423 0.074 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0418 0.11 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0587 0.0848 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 7.84e-01 0.0306 0.112 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 9.43e-01 0.00802 0.112 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 6.64e-01 0.0438 0.101 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 6.95e-01 0.0418 0.106 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0573 0.109 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 7.86e-01 0.0239 0.0878 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 1.08e-01 0.177 0.11 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 1.73e-01 -0.129 0.0945 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 1.89e-01 0.141 0.107 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 2.15e-01 -0.14 0.112 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 8.80e-01 0.0142 0.0936 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 7.98e-01 0.0274 0.107 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0861 0.11 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0907 0.0937 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 2.67e-01 0.121 0.108 0.251 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 4.66e-02 0.183 0.0912 0.251 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 3.65e-01 0.0958 0.106 0.251 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0507 0.102 0.251 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 9.12e-01 -0.01 0.0902 0.251 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 5.89e-01 0.0558 0.103 0.251 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0834 0.0902 0.251 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0672 0.111 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 1.80e-01 -0.142 0.106 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 8.74e-02 0.186 0.108 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0586 0.114 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0894 0.0935 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 8.63e-01 0.0164 0.0949 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 2.14e-01 -0.113 0.0906 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 2.83e-01 0.115 0.107 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 2.16e-01 -0.115 0.0927 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 9.48e-02 -0.161 0.0958 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 1.83e-01 0.131 0.0979 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 1.04e-01 0.14 0.0858 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 9.60e-01 0.00505 0.0998 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0132 0.0696 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 1.55e-01 0.169 0.118 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 4.71e-01 0.076 0.105 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 1.88e-01 0.146 0.11 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 1.84e-01 0.155 0.116 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 6.77e-01 0.0398 0.0954 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 8.18e-01 0.0252 0.11 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 1.67e-01 -0.136 0.0982 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 3.27e-02 0.21 0.0977 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0589 0.101 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 1.90e-01 0.131 0.0999 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 7.11e-01 0.0386 0.104 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 2.03e-01 0.114 0.0895 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00764 0.103 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 1.28e-01 -0.109 0.0716 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 4.20e-01 -0.11 0.135 0.237 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 8.81e-01 0.0184 0.122 0.237 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0314 0.136 0.237 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0031 0.129 0.237 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 2.50e-01 0.14 0.121 0.237 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 2.55e-01 -0.142 0.125 0.237 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 6.67e-02 0.238 0.128 0.237 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00891 0.108 0.237 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 1.35e-01 0.113 0.0754 0.237 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 2.47e-01 -0.121 0.105 0.248 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 2.46e-03 0.281 0.0915 0.248 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0702 0.09 0.248 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 2.03e-01 0.138 0.108 0.248 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 1.02e-01 -0.173 0.106 0.248 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 5.89e-01 0.057 0.105 0.248 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 2.18e-02 -0.15 0.065 0.248 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 5.33e-01 0.0664 0.106 0.252 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 3.72e-02 0.208 0.0994 0.252 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 4.34e-01 0.0831 0.106 0.252 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00815 0.0951 0.252 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 1.09e-01 0.157 0.0974 0.252 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 6.89e-01 0.0421 0.105 0.252 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 1.34e-01 -0.12 0.08 0.252 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 9.74e-01 0.00344 0.105 0.251 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 5.42e-01 0.0693 0.113 0.251 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0337 0.115 0.251 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 3.52e-01 0.103 0.111 0.251 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0745 0.099 0.251 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 4.86e-02 -0.183 0.092 0.251 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 5.67e-01 0.0613 0.107 0.251 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 2.25e-01 -0.11 0.0905 0.251 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 4.83e-01 -0.074 0.105 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 6.10e-02 -0.155 0.0822 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 7.54e-01 0.0285 0.091 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0332 0.0959 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0219 0.0731 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 8.21e-01 0.0225 0.0996 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 5.23e-01 0.0543 0.0849 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0627 0.0602 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 6.48e-01 0.0486 0.106 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 1.03e-01 -0.151 0.0925 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 2.49e-01 0.118 0.102 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 1.10e-01 0.161 0.101 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0531 0.0758 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 1.29e-01 0.163 0.107 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00619 0.0982 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 9.98e-02 -0.115 0.0694 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 5.12e-01 0.086 0.131 0.242 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 6.94e-01 0.0395 0.1 0.242 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 7.88e-01 0.0335 0.124 0.242 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 1.04e-01 0.216 0.132 0.242 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 5.22e-01 -0.081 0.126 0.242 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0694 0.123 0.242 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0314 0.107 0.242 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0236 0.113 0.253 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 8.96e-01 0.0144 0.11 0.253 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 2.44e-01 0.135 0.115 0.253 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 3.57e-01 0.0993 0.108 0.253 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 3.72e-01 0.0829 0.0925 0.253 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0438 0.112 0.253 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 3.52e-02 0.21 0.0992 0.253 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0916 0.0713 0.253 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 1.40e-01 0.156 0.106 0.251 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 8.65e-01 0.0175 0.102 0.251 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 2.10e-01 -0.14 0.111 0.251 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 2.61e-01 -0.125 0.11 0.251 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0112 0.0706 0.251 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 6.76e-03 0.297 0.108 0.251 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0266 0.105 0.251 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0766 0.0931 0.251 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 6.14e-01 0.0616 0.122 0.257 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 7.68e-01 0.0351 0.119 0.257 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 5.47e-02 0.238 0.123 0.257 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 7.38e-02 -0.219 0.122 0.257 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 3.44e-01 0.112 0.118 0.257 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 3.11e-01 -0.129 0.127 0.257 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 9.10e-01 0.0121 0.107 0.257 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 3.04e-01 0.108 0.105 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0836 0.106 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0492 0.112 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 7.06e-01 0.0374 0.0989 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 7.95e-01 0.0296 0.114 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0414 0.105 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 8.04e-01 0.0169 0.0678 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 3.16e-01 0.095 0.0945 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 1.63e-01 -0.131 0.0938 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 2.84e-02 0.142 0.0643 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 4.37e-01 0.0763 0.0979 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 5.44e-01 0.0604 0.0994 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0366 0.0818 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00672 0.106 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -819883 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0181 0.0944 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 7.06e-01 0.0305 0.0807 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 2.02e-01 0.107 0.0838 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0754 0.104 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0198 0.0573 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0411 0.0969 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 4.86e-02 -0.151 0.0761 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 7.28e-01 0.0289 0.0829 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 5.46e-01 0.0545 0.0901 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0386 0.0681 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 6.20e-01 0.0461 0.0927 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 5.51e-01 0.0499 0.0837 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 6.39e-02 -0.106 0.0571 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 3.90e-01 0.0935 0.109 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 6.67e-01 0.0434 0.101 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0446 0.0996 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 7.93e-01 0.0293 0.112 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 7.67e-01 0.0191 0.0644 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 7.08e-02 0.193 0.106 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -485889 sc-eQTL 2.78e-01 0.0991 0.0911 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 6.75e-02 -0.133 0.0722 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -486153 sc-eQTL 1.60e-02 0.237 0.0976 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 81036 sc-eQTL 2.64e-01 -0.103 0.0921 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -741927 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0608 0.079 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -342035 sc-eQTL 1.67e-01 0.124 0.0892 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 583016 sc-eQTL 9.04e-02 0.133 0.0781 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 271605 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00753 0.0884 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -272155 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0592 0.0648 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000258035 AC123567.2 545549 eQTL 0.0162 0.0744 0.0309 0.00183 0.0 0.2

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000180263 \N -485889 8.48e-07 5.6e-07 1.12e-07 3.81e-07 1.1e-07 2.16e-07 5.65e-07 1.45e-07 4.3e-07 2.43e-07 7.44e-07 3.91e-07 8.16e-07 1.48e-07 2.26e-07 2.36e-07 3.35e-07 3.95e-07 2.51e-07 1.63e-07 2.09e-07 3.92e-07 3.69e-07 1.8e-07 8.62e-07 2.55e-07 2.72e-07 2.69e-07 4.06e-07 6.35e-07 3.1e-07 5.69e-08 5.31e-08 1.52e-07 3.31e-07 1.28e-07 1.02e-07 9.33e-08 6.01e-08 2.71e-08 9.99e-08 5.87e-07 2.99e-08 1.98e-08 1.48e-07 1.37e-08 1.07e-07 2.25e-08 4.97e-08