logo

Genes within 1Mb (chr12:94729162:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0436 0.0856 0.274 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 6.54e-01 0.0451 0.101 0.274 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0126 0.0753 0.274 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 1.85e-01 -0.126 0.0948 0.274 B L1
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0861 0.0866 0.274 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 1.89e-01 0.0748 0.0568 0.274 B L1
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 2.04e-01 0.0914 0.0717 0.274 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 1.33e-01 -0.13 0.0866 0.274 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 9.05e-02 0.0701 0.0412 0.274 B L1
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 4.67e-02 0.139 0.0697 0.274 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00919 0.0611 0.274 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 1.96e-01 0.0879 0.0678 0.274 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 6.51e-01 0.042 0.0929 0.274 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 1.19e-01 0.093 0.0594 0.274 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0181 0.0626 0.274 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0481 0.0656 0.274 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 6.72e-01 0.0356 0.084 0.274 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 9.14e-01 0.00609 0.0565 0.274 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0745 0.0717 0.274 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0577 0.0914 0.274 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 2.18e-02 0.187 0.0809 0.274 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0495 0.0778 0.274 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 8.84e-01 0.0106 0.0727 0.274 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0739 0.0593 0.274 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 7.86e-01 0.0276 0.102 0.268 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0177 0.108 0.268 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0234 0.107 0.268 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 8.13e-01 0.0245 0.103 0.268 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 9.60e-01 0.00484 0.0964 0.268 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 7.70e-02 -0.151 0.0852 0.268 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 9.07e-01 0.0112 0.0956 0.268 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 9.05e-01 0.00962 0.0805 0.268 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0103 0.0933 0.274 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0861 0.0722 0.274 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00417 0.0743 0.274 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 7.55e-01 0.0277 0.0885 0.274 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0101 0.0601 0.274 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 3.24e-01 0.0877 0.0886 0.274 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 7.29e-01 0.0275 0.0791 0.274 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 1.06e-01 -0.0917 0.0565 0.274 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 9.31e-02 0.156 0.0925 0.273 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0677 0.0877 0.273 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0516 0.0736 0.273 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 2.12e-01 0.109 0.087 0.273 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 7.53e-01 0.0227 0.0719 0.273 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 8.55e-01 0.015 0.0817 0.273 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0558 0.0602 0.273 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0478 0.104 0.274 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 2.49e-01 0.102 0.0882 0.274 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0768 0.0806 0.274 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00635 0.101 0.274 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 8.95e-01 0.0108 0.0819 0.274 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 8.94e-01 0.0123 0.0921 0.274 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 2.43e-02 -0.115 0.0507 0.274 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 3.27e-02 0.243 0.113 0.278 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 2.38e-01 0.115 0.0971 0.278 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 4.54e-01 0.0893 0.119 0.278 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 6.91e-01 0.0454 0.114 0.278 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 9.40e-01 0.00661 0.0871 0.278 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0762 0.0919 0.278 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 1.54e-01 -0.163 0.114 0.278 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0291 0.0807 0.278 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 8.43e-01 0.02 0.101 0.278 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0151 0.103 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0401 0.104 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 4.49e-01 0.0721 0.0951 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 9.12e-01 0.0115 0.104 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0605 0.107 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0537 0.0877 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 1.31e-01 -0.147 0.0967 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 5.66e-01 0.0549 0.0954 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 3.78e-02 0.163 0.0782 0.275 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 2.95e-02 -0.234 0.107 0.272 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 3.00e-01 -0.114 0.109 0.272 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 3.46e-01 0.0989 0.105 0.272 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 2.06e-01 -0.143 0.112 0.272 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 5.41e-01 0.0614 0.1 0.272 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 9.44e-02 0.142 0.0844 0.272 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 2.81e-02 0.217 0.0979 0.272 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 4.31e-02 -0.201 0.099 0.272 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 9.27e-01 0.00738 0.0804 0.272 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0817 0.0997 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 6.59e-01 0.0446 0.101 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 5.02e-01 0.057 0.0848 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 5.98e-01 0.0547 0.104 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 5.64e-01 -0.059 0.102 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 6.12e-01 0.0435 0.0857 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 1.89e-01 0.116 0.0882 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0563 0.097 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 2.73e-01 0.0619 0.0564 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 1.59e-01 0.154 0.109 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 1.06e-01 0.161 0.0993 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 2.09e-02 -0.232 0.0997 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 2.04e-02 -0.255 0.109 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0216 0.101 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 4.90e-01 0.0646 0.0933 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 5.19e-01 0.0637 0.0985 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 8.75e-01 0.013 0.0827 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 2.96e-01 -0.085 0.0811 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 1.53e-01 0.157 0.11 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 6.97e-01 0.045 0.115 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 5.72e-01 0.0655 0.116 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 1.31e-01 -0.138 0.0912 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 6.37e-01 0.0487 0.103 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 6.36e-01 0.0498 0.105 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 5.48e-01 -0.057 0.0948 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 1.11e-01 0.127 0.0796 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0425 0.0692 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 5.34e-01 0.0526 0.0845 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 9.97e-01 0.0004 0.0974 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 1.41e-01 0.0975 0.066 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0383 0.0717 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0373 0.0616 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 7.47e-01 0.0275 0.0851 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 7.86e-01 0.0217 0.0798 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 2.73e-01 0.102 0.0926 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 1.74e-01 0.147 0.108 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 8.84e-01 0.0116 0.0795 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 5.60e-01 0.0495 0.0847 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0512 0.0729 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 4.79e-01 0.0771 0.109 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 9.42e-01 0.00703 0.0964 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 3.76e-01 0.0898 0.101 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0126 0.102 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 7.54e-01 0.0273 0.0869 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 2.94e-01 -0.103 0.0973 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0346 0.0882 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 3.57e-01 0.089 0.0965 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 3.24e-01 0.0841 0.085 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 5.36e-01 -0.06 0.0966 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 1.24e-01 -0.164 0.106 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 1.80e-01 0.137 0.102 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 7.79e-01 0.0245 0.0874 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 8.73e-01 0.0154 0.0963 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 4.78e-02 -0.149 0.0751 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0118 0.099 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 9.82e-01 0.00176 0.0773 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0938 0.0893 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 8.59e-01 0.0177 0.0993 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 6.33e-02 0.166 0.089 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 9.34e-01 0.00753 0.0908 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 3.89e-01 0.0754 0.0874 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0455 0.0724 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0928 0.108 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0479 0.0832 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 9.51e-01 0.00668 0.11 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00684 0.11 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 6.99e-01 0.0383 0.0989 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00741 0.104 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 9.68e-01 0.00424 0.107 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 9.98e-01 0.000177 0.0861 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 8.99e-02 0.184 0.108 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 1.37e-01 -0.139 0.093 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 1.78e-01 0.142 0.105 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0709 0.111 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 8.23e-01 0.0206 0.0923 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 8.46e-01 0.0204 0.105 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0721 0.108 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0996 0.0923 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 3.12e-01 0.107 0.106 0.273 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 3.25e-01 0.0884 0.0895 0.273 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 5.55e-01 0.0609 0.103 0.273 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 1.45e-01 -0.146 0.0994 0.273 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 7.76e-01 0.0251 0.0879 0.273 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 8.27e-01 0.0221 0.101 0.273 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0756 0.0879 0.273 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 6.20e-01 -0.054 0.109 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 3.02e-01 -0.107 0.104 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 1.87e-01 0.141 0.106 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0153 0.112 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0968 0.0918 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 9.80e-01 0.00237 0.0932 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0477 0.0892 0.271 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 1.63e-01 0.145 0.103 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0894 0.0902 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 1.39e-01 -0.138 0.0933 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 1.00e-01 0.157 0.0949 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 2.97e-01 0.0876 0.0837 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0209 0.097 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0109 0.0676 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 1.98e-01 0.151 0.117 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 6.71e-01 0.0442 0.104 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 3.00e-01 0.113 0.109 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 4.26e-02 0.233 0.114 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0215 0.0943 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 7.54e-01 0.034 0.108 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 4.93e-02 -0.191 0.0965 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 2.55e-01 0.11 0.0962 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0909 0.0988 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 4.40e-01 0.0757 0.0979 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 8.00e-01 0.0257 0.101 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 3.84e-01 0.0764 0.0876 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 8.07e-01 0.0247 0.101 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0935 0.07 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0456 0.129 0.263 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00984 0.116 0.263 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0815 0.129 0.263 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 9.54e-01 0.0071 0.123 0.263 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 2.90e-01 0.122 0.115 0.263 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 2.75e-01 -0.13 0.119 0.263 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 4.06e-02 0.252 0.122 0.263 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 6.77e-01 -0.043 0.103 0.263 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 5.83e-01 0.0398 0.0724 0.263 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 2.89e-01 -0.109 0.102 0.27 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 1.14e-03 0.294 0.0892 0.27 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0616 0.0881 0.27 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 2.24e-01 0.129 0.106 0.27 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0991 0.104 0.27 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 6.77e-01 0.043 0.103 0.27 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 2.78e-02 -0.141 0.0637 0.27 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 8.59e-01 0.0185 0.104 0.274 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 4.11e-03 0.28 0.0964 0.274 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 3.09e-01 0.106 0.104 0.274 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 9.08e-01 0.0108 0.0931 0.274 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 9.10e-02 0.162 0.0952 0.274 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 9.31e-01 0.00894 0.103 0.274 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 2.00e-01 -0.101 0.0784 0.274 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0315 0.102 0.276 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 7.75e-01 0.0316 0.11 0.276 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00641 0.112 0.276 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 5.97e-01 0.0573 0.108 0.276 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0707 0.0963 0.276 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 1.03e-01 -0.147 0.0898 0.276 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 5.36e-01 0.0644 0.104 0.276 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0964 0.0882 0.276 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0444 0.104 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 1.89e-01 -0.107 0.0813 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 9.39e-01 0.00686 0.0896 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0167 0.0944 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0294 0.072 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 4.91e-01 0.0675 0.098 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 7.82e-01 0.0231 0.0837 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0561 0.0593 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00739 0.104 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 7.23e-02 -0.164 0.0907 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 1.89e-01 0.133 0.1 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 3.53e-01 0.0924 0.0992 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 3.55e-01 -0.069 0.0744 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 3.54e-01 0.0977 0.105 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0579 0.0964 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0762 0.0684 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 2.69e-01 0.14 0.126 0.27 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 6.42e-01 0.0451 0.0968 0.27 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0776 0.12 0.27 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 4.84e-02 0.252 0.127 0.27 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 9.85e-01 0.00233 0.122 0.27 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 7.95e-01 0.031 0.119 0.27 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0838 0.103 0.27 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0269 0.113 0.276 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0337 0.109 0.276 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 1.39e-01 0.17 0.114 0.276 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 8.03e-01 0.0268 0.107 0.276 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 4.45e-01 0.0705 0.0922 0.276 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 3.09e-01 -0.113 0.111 0.276 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 5.62e-02 0.19 0.099 0.276 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0698 0.0711 0.276 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 1.86e-01 0.14 0.105 0.271 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 7.23e-01 0.0362 0.102 0.271 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 8.68e-02 -0.19 0.11 0.271 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 2.33e-01 -0.131 0.11 0.271 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0218 0.0703 0.271 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 6.84e-03 0.295 0.108 0.271 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0352 0.104 0.271 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 1.25e-01 -0.142 0.0923 0.271 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 5.43e-01 0.0731 0.12 0.268 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0893 0.117 0.268 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 1.89e-01 0.161 0.122 0.268 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 8.36e-02 -0.209 0.12 0.268 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 1.05e-01 0.188 0.115 0.268 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 1.45e-01 -0.182 0.124 0.268 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 6.31e-01 0.0506 0.105 0.268 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 2.80e-01 0.112 0.103 0.268 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 3.30e-01 -0.101 0.103 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0327 0.109 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 2.18e-01 0.118 0.0959 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00415 0.111 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0265 0.102 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 9.60e-01 0.00331 0.066 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 8.82e-01 0.0136 0.0921 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 1.16e-01 -0.144 0.0911 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 1.15e-01 0.0996 0.0629 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 7.16e-01 0.0347 0.0953 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 3.67e-01 0.0873 0.0965 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0433 0.0795 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0496 0.103 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -822314 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0212 0.0918 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 6.02e-01 0.041 0.0784 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 8.16e-02 0.142 0.0812 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0533 0.101 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00767 0.0558 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0312 0.0953 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 1.13e-01 -0.12 0.0751 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 6.63e-01 0.0356 0.0815 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 6.42e-01 0.0413 0.0887 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0505 0.0669 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 5.35e-01 0.0567 0.0912 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 8.94e-01 0.011 0.0824 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 1.24e-01 -0.087 0.0563 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 5.89e-01 0.0587 0.109 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 9.56e-01 0.00554 0.101 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0533 0.0994 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 9.76e-01 0.00334 0.111 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00315 0.0643 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 2.08e-01 0.134 0.106 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -488320 sc-eQTL 2.06e-01 0.115 0.0908 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 6.93e-02 -0.132 0.0721 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -488584 sc-eQTL 3.60e-02 0.201 0.0951 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 78605 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0856 0.0895 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -744358 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0654 0.0766 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -344466 sc-eQTL 1.06e-01 0.14 0.0864 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 580585 sc-eQTL 2.98e-01 0.0794 0.0761 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 269174 sc-eQTL 9.60e-01 0.00434 0.0858 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -274586 sc-eQTL 3.91e-01 -0.054 0.0629 0.274 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000258035 AC123567.2 543118 eQTL 0.0188 0.0702 0.0298 0.00168 0.0 0.221

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina