logo

Genes within 1Mb (chr12:94723104:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 2.57e-02 0.269 0.12 0.1 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 6.54e-01 0.0639 0.142 0.1 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 4.29e-02 0.215 0.106 0.1 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 7.43e-01 0.0442 0.135 0.1 B L1
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00326 0.123 0.1 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 3.55e-02 0.169 0.0798 0.1 B L1
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 1.60e-01 0.143 0.101 0.1 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 3.20e-01 0.122 0.123 0.1 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 9.97e-01 0.000194 0.0587 0.1 B L1
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 8.46e-01 0.0198 0.102 0.1 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 5.91e-01 0.0474 0.0881 0.1 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0608 0.0981 0.1 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 2.94e-01 0.141 0.134 0.1 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 8.50e-01 0.0163 0.0863 0.1 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00455 0.0904 0.1 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0658 0.0946 0.1 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 7.27e-01 0.0424 0.121 0.1 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 5.96e-03 -0.222 0.08 0.1 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 4.22e-01 0.0832 0.103 0.1 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 2.34e-01 -0.157 0.131 0.1 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 2.70e-01 0.13 0.118 0.1 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0594 0.112 0.1 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0208 0.105 0.1 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 2.37e-01 -0.101 0.0854 0.1 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0399 0.145 0.099 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 3.25e-01 0.151 0.153 0.099 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 1.27e-01 0.231 0.151 0.099 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 8.82e-01 0.0219 0.147 0.099 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0467 0.137 0.099 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0179 0.122 0.099 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00532 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00247 0.115 0.099 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 5.90e-01 0.0733 0.136 0.1 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 3.50e-01 0.0988 0.105 0.1 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 2.16e-01 0.134 0.108 0.1 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0699 0.129 0.1 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 4.89e-01 0.0607 0.0876 0.1 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00195 0.13 0.1 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 2.72e-01 0.127 0.115 0.1 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 3.63e-01 0.0755 0.0827 0.1 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 7.53e-01 0.0425 0.135 0.101 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 3.82e-02 -0.262 0.126 0.101 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 6.25e-01 0.0521 0.106 0.101 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 4.74e-01 0.0903 0.126 0.101 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 3.99e-01 0.0876 0.104 0.101 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 6.72e-02 -0.216 0.117 0.101 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0817 0.0869 0.101 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 2.19e-02 0.341 0.148 0.1 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0292 0.127 0.1 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 4.46e-02 -0.233 0.115 0.1 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 6.30e-01 0.0701 0.145 0.1 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 5.33e-01 0.0735 0.118 0.1 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 8.92e-01 0.0181 0.133 0.1 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 3.19e-01 0.0736 0.0736 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 6.92e-01 0.0634 0.16 0.105 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 2.05e-01 -0.173 0.136 0.105 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 4.85e-01 0.117 0.166 0.105 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 4.58e-01 -0.119 0.16 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 1.69e-01 0.168 0.121 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 3.88e-02 0.265 0.127 0.105 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 3.08e-01 0.163 0.16 0.105 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 9.14e-02 -0.19 0.112 0.105 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 1.69e-02 -0.335 0.139 0.105 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 5.84e-04 0.498 0.143 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0635 0.148 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0875 0.135 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 2.00e-01 -0.19 0.148 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 1.68e-01 0.21 0.151 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 4.45e-01 0.0955 0.125 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 2.50e-01 0.159 0.138 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 7.56e-01 0.0423 0.136 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 7.03e-01 -0.043 0.112 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 8.50e-01 0.0294 0.155 0.101 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 6.61e-02 0.288 0.156 0.101 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0894 0.15 0.101 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0653 0.162 0.101 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 1.12e-01 0.228 0.143 0.101 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 3.48e-01 0.114 0.122 0.101 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00805 0.142 0.101 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 3.85e-01 0.125 0.143 0.101 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0635 0.115 0.101 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 5.01e-01 0.0973 0.144 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 8.99e-01 0.0186 0.146 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 2.56e-03 0.367 0.12 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 1.69e-01 0.206 0.149 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 3.52e-01 -0.138 0.148 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 1.63e-01 0.173 0.124 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 5.90e-01 0.0692 0.128 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 4.64e-01 0.103 0.14 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 2.65e-01 0.0912 0.0817 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 7.99e-01 0.0403 0.158 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 3.65e-01 -0.131 0.144 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 9.81e-01 0.0034 0.146 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 4.65e-01 0.117 0.159 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0573 0.146 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 7.05e-01 0.0512 0.135 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 6.22e-01 0.0703 0.142 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 3.29e-02 0.254 0.118 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 7.41e-01 0.0389 0.117 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0192 0.156 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0728 0.163 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 8.64e-01 0.028 0.163 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 4.14e-01 -0.106 0.129 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 2.41e-01 -0.17 0.145 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 1.17e-01 0.233 0.148 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 5.66e-01 -0.077 0.134 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 3.05e-01 0.118 0.115 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 6.43e-01 0.0461 0.0994 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 1.86e-01 -0.16 0.121 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 5.46e-01 0.0845 0.14 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 3.84e-01 0.0829 0.0951 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 8.56e-01 0.0187 0.103 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 7.92e-01 0.0234 0.0885 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0436 0.122 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00645 0.115 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0577 0.133 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 2.20e-01 0.191 0.155 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 2.24e-01 0.139 0.114 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 1.62e-01 -0.17 0.121 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0551 0.105 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0593 0.158 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 4.29e-01 -0.11 0.139 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 6.12e-01 0.0745 0.147 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 9.68e-01 0.00583 0.148 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 2.47e-02 -0.282 0.124 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 9.81e-01 0.00344 0.141 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0656 0.128 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 9.53e-01 0.0083 0.139 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 1.02e-01 -0.2 0.122 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 6.25e-01 0.0682 0.139 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0303 0.154 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0964 0.148 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 1.18e-02 -0.315 0.124 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0983 0.139 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0117 0.109 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00868 0.141 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 6.00e-02 -0.207 0.109 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0254 0.128 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 9.19e-02 -0.238 0.141 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 1.81e-01 0.171 0.128 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 3.64e-01 0.118 0.129 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0289 0.125 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 1.59e-01 -0.146 0.103 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 4.24e-01 0.123 0.153 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 8.79e-01 0.0181 0.118 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 2.82e-01 0.167 0.155 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 4.54e-01 0.117 0.156 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 3.37e-04 0.496 0.136 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0107 0.148 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 4.41e-01 -0.117 0.152 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0857 0.122 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 1.39e-01 0.233 0.157 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 1.83e-01 -0.18 0.135 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 2.45e-01 0.178 0.153 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0647 0.161 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0918 0.133 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 4.84e-01 0.107 0.152 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00522 0.157 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 2.43e-01 -0.156 0.134 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 2.53e-02 0.341 0.151 0.102 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 3.10e-01 -0.131 0.129 0.102 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 1.36e-01 -0.222 0.148 0.102 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0659 0.144 0.102 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0511 0.127 0.102 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0821 0.145 0.102 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 3.86e-01 0.11 0.127 0.102 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 5.13e-01 0.103 0.157 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 6.34e-02 -0.278 0.149 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 3.99e-01 -0.13 0.154 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 8.89e-01 0.0226 0.162 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 7.74e-01 0.0382 0.133 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 6.25e-01 -0.066 0.135 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 7.76e-01 0.0368 0.129 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 6.38e-01 0.0697 0.148 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 3.97e-01 -0.109 0.129 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00208 0.134 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 7.68e-01 0.0403 0.136 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 1.65e-01 0.166 0.119 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 2.55e-01 -0.157 0.138 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0359 0.0964 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 7.16e-01 0.06 0.164 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 3.90e-01 -0.125 0.145 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 2.64e-01 -0.171 0.153 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 7.38e-01 -0.054 0.161 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 7.31e-01 0.0454 0.132 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0677 0.151 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 1.64e-01 -0.19 0.136 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0703 0.139 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 2.15e-02 -0.326 0.141 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 9.32e-01 -0.012 0.141 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 1.11e-01 0.233 0.145 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 7.43e-01 0.0416 0.126 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0453 0.145 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 2.76e-01 -0.11 0.101 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 8.94e-01 0.0269 0.201 0.085 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 5.89e-01 0.0979 0.181 0.085 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 3.72e-01 0.179 0.2 0.085 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 6.31e-02 -0.353 0.188 0.085 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000714 0.18 0.085 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 1.63e-01 0.258 0.184 0.085 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 7.19e-01 0.0697 0.193 0.085 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 4.89e-01 -0.111 0.16 0.085 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0447 0.113 0.085 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 2.48e-01 0.168 0.145 0.1 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 3.26e-01 0.127 0.13 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0276 0.125 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 7.53e-02 0.268 0.15 0.1 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 6.16e-01 0.0741 0.148 0.1 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 1.53e-02 0.353 0.144 0.1 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 7.02e-01 0.035 0.0913 0.1 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 5.15e-01 0.0981 0.15 0.1 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 9.97e-01 0.000523 0.142 0.1 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 1.97e-01 0.193 0.15 0.1 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 5.02e-01 0.0904 0.134 0.1 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 3.46e-01 -0.13 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 8.60e-01 0.0261 0.148 0.1 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 7.81e-02 -0.2 0.113 0.1 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0442 0.15 0.098 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 7.83e-02 0.284 0.161 0.098 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0513 0.165 0.098 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0197 0.159 0.098 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0128 0.141 0.098 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 6.98e-01 0.0516 0.133 0.098 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 4.81e-01 0.107 0.152 0.098 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0865 0.129 0.098 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 9.15e-01 0.0161 0.151 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0369 0.119 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0776 0.13 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 5.63e-01 0.0793 0.137 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 7.75e-01 0.0299 0.105 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0342 0.142 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 1.27e-01 0.185 0.121 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0218 0.0863 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 7.51e-01 0.0484 0.152 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 2.17e-02 0.304 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 3.81e-01 0.129 0.147 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 4.29e-01 -0.115 0.145 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 8.59e-01 0.0194 0.109 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0526 0.154 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 4.02e-01 -0.118 0.14 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 5.21e-01 0.0642 0.0999 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 4.41e-01 0.136 0.176 0.109 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 1.20e-01 -0.21 0.134 0.109 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 1.92e-01 -0.219 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 5.72e-01 0.102 0.18 0.109 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 3.01e-01 0.176 0.17 0.109 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0023 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 6.58e-01 0.0643 0.145 0.109 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0966 0.16 0.102 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 3.43e-01 -0.147 0.155 0.102 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 8.05e-01 0.0404 0.163 0.102 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00988 0.152 0.102 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0179 0.131 0.102 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 5.69e-01 0.09 0.158 0.102 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 6.82e-01 0.058 0.142 0.102 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 4.42e-03 0.285 0.0991 0.102 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 7.77e-01 0.0419 0.147 0.102 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 6.03e-01 -0.074 0.142 0.102 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 6.90e-01 0.0618 0.155 0.102 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 2.87e-01 -0.164 0.153 0.102 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 2.31e-02 0.221 0.0967 0.102 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0965 0.153 0.102 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 5.57e-01 0.0855 0.145 0.102 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 7.48e-01 0.0416 0.129 0.102 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0777 0.163 0.102 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 7.57e-01 0.0491 0.159 0.102 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 7.16e-01 0.0605 0.166 0.102 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0644 0.164 0.102 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 4.36e-01 -0.123 0.158 0.102 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0199 0.17 0.102 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 7.78e-02 -0.251 0.141 0.102 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 6.89e-01 0.0565 0.141 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 6.62e-02 0.271 0.147 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 5.25e-01 0.0992 0.156 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0228 0.138 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 5.27e-01 -0.1 0.158 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 1.20e-01 0.227 0.146 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 5.31e-02 0.182 0.0935 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 3.50e-01 0.123 0.131 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 4.34e-01 0.103 0.131 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0874 0.0903 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 4.23e-01 0.11 0.137 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0455 0.139 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 4.95e-03 0.319 0.112 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 3.64e-01 0.135 0.149 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -828372 sc-eQTL 1.57e-01 -0.187 0.132 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 2.04e-01 0.143 0.113 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 5.76e-01 0.0659 0.118 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 9.20e-02 0.244 0.144 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 4.39e-01 0.0621 0.0802 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 5.69e-01 0.0797 0.14 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 3.74e-01 0.0984 0.111 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 3.91e-01 0.103 0.119 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00112 0.13 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 6.76e-01 0.041 0.0981 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0323 0.134 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 3.62e-01 0.11 0.121 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00192 0.0829 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 7.59e-01 0.0468 0.153 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 3.19e-01 -0.141 0.141 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 5.62e-01 0.0811 0.14 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 3.18e-01 -0.156 0.156 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 1.85e-01 0.12 0.09 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 9.46e-01 0.0102 0.15 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -494378 sc-eQTL 5.16e-01 0.0833 0.128 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 2.98e-02 0.221 0.101 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -494642 sc-eQTL 6.82e-01 0.0567 0.138 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 72547 sc-eQTL 7.46e-02 -0.23 0.128 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -750416 sc-eQTL 7.64e-01 0.0331 0.11 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -350524 sc-eQTL 4.87e-01 0.0871 0.125 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 574527 sc-eQTL 3.99e-01 0.0926 0.11 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 263116 sc-eQTL 1.20e-01 -0.192 0.123 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0827 0.0905 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000184752 NDUFA12 -280644 eQTL 0.0115 0.0754 0.0298 0.0 0.0 0.0991
ENSG00000236349 SUCLG2P2 174863 eQTL 0.0411 0.0768 0.0376 0.0011 0.0 0.0991

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina