logo

Genes within 1Mb (chr12:94719757:TATC:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 5.49e-02 0.186 0.0965 0.177 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 4.02e-01 0.0959 0.114 0.177 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0882 0.0855 0.177 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 5.33e-01 0.0676 0.108 0.177 B L1
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0708 0.0986 0.177 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 4.12e-01 0.0532 0.0648 0.177 B L1
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0294 0.0818 0.177 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0509 0.0989 0.177 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0689 0.047 0.177 B L1
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 3.92e-01 0.0693 0.0809 0.177 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0761 0.0701 0.177 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0326 0.0783 0.177 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0451 0.107 0.177 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 7.18e-01 0.0249 0.0688 0.177 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0714 0.0719 0.177 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 6.71e-01 0.0321 0.0756 0.177 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00692 0.0981 0.177 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 9.49e-03 -0.17 0.0649 0.177 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0842 0.0837 0.177 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0509 0.107 0.177 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 9.47e-01 0.00635 0.0956 0.177 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 9.10e-01 0.0103 0.0909 0.177 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0299 0.0848 0.177 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 9.11e-01 0.00774 0.0694 0.177 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 2.20e-01 -0.145 0.118 0.173 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0288 0.126 0.173 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 9.31e-01 0.0108 0.124 0.173 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 3.35e-01 -0.116 0.12 0.173 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0668 0.112 0.173 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0241 0.1 0.173 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 1.64e-01 0.155 0.111 0.173 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0456 0.0937 0.173 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 1.70e-03 0.341 0.107 0.177 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 8.12e-02 -0.148 0.0846 0.177 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 2.45e-01 0.102 0.0871 0.177 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 7.01e-01 0.04 0.104 0.177 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 7.12e-01 0.0261 0.0707 0.177 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 6.58e-01 0.0463 0.104 0.177 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 2.13e-01 0.116 0.0927 0.177 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 2.20e-01 0.0819 0.0666 0.177 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00984 0.107 0.178 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 5.61e-02 -0.192 0.0997 0.178 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0466 0.0844 0.178 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0316 0.0999 0.178 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0697 0.0822 0.178 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 5.03e-04 -0.321 0.0909 0.178 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0303 0.0691 0.178 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 2.39e-01 0.14 0.119 0.177 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0249 0.101 0.177 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 4.47e-01 0.0704 0.0925 0.177 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0822 0.115 0.177 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0866 0.0936 0.177 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0277 0.106 0.177 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0831 0.0585 0.177 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 7.43e-01 -0.044 0.134 0.166 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0841 0.114 0.166 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 6.96e-01 0.0546 0.139 0.166 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 3.08e-01 -0.136 0.133 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 1.44e-01 0.149 0.101 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 5.66e-01 -0.062 0.108 0.166 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 9.60e-01 0.00681 0.134 0.166 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0301 0.0945 0.166 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 7.22e-01 0.0421 0.118 0.166 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 5.11e-01 0.0775 0.118 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 1.60e-01 0.167 0.118 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 2.90e-01 -0.115 0.108 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 8.17e-01 0.0275 0.119 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 3.96e-01 0.104 0.122 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 7.81e-01 0.0279 0.1 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0885 0.111 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 8.01e-01 0.0275 0.109 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 2.96e-02 -0.195 0.0891 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 6.16e-01 0.0617 0.123 0.177 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 8.54e-01 0.0229 0.125 0.177 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 8.80e-01 -0.018 0.119 0.177 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 2.20e-01 0.157 0.128 0.177 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 2.26e-01 -0.138 0.114 0.177 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 2.77e-01 0.105 0.0963 0.177 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 5.06e-01 0.075 0.113 0.177 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 5.06e-01 0.0755 0.113 0.177 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0427 0.0914 0.177 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00303 0.117 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00341 0.119 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0107 0.0999 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0871 0.122 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 3.62e-01 -0.11 0.12 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 1.54e-01 0.144 0.1 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 4.90e-01 0.072 0.104 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0178 0.114 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 2.53e-01 -0.076 0.0663 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 1.45e-01 0.185 0.127 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 7.23e-01 0.0413 0.116 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 1.33e-01 -0.176 0.117 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 1.32e-01 0.194 0.128 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 9.64e-02 -0.195 0.117 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0989 0.109 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 2.90e-01 -0.122 0.115 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 2.98e-01 -0.1 0.0962 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 8.82e-01 0.014 0.0947 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 6.57e-01 0.0551 0.124 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 1.22e-01 0.2 0.129 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 4.04e-01 -0.109 0.13 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 4.68e-01 -0.075 0.103 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 4.53e-01 -0.087 0.116 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0599 0.119 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0836 0.107 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 9.66e-02 0.153 0.0917 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 1.03e-01 -0.13 0.0794 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0102 0.0976 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 2.43e-01 -0.131 0.112 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00782 0.0765 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0353 0.0827 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 6.98e-01 0.0276 0.0711 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 2.73e-01 0.107 0.0977 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00333 0.0918 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 1.01e-01 -0.175 0.106 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 4.38e-01 0.0964 0.124 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 4.07e-01 0.0759 0.0913 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00315 0.0975 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0144 0.084 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0086 0.125 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 7.53e-01 0.0349 0.111 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 1.12e-01 0.184 0.115 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 4.73e-01 0.0838 0.117 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 4.96e-01 0.0679 0.0996 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 2.14e-02 -0.256 0.111 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 7.50e-01 0.0323 0.101 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 5.71e-01 0.0633 0.112 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 6.97e-02 -0.178 0.0977 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 2.52e-01 -0.128 0.111 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 1.66e-01 -0.171 0.123 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0389 0.118 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 8.42e-01 0.0202 0.101 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0603 0.111 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 3.30e-01 0.0854 0.0874 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0512 0.114 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 8.30e-01 0.019 0.0889 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0389 0.103 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 1.95e-01 -0.148 0.114 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 8.64e-01 0.0177 0.103 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000303 0.104 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000793 0.101 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0152 0.0833 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0436 0.126 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0359 0.0969 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 2.98e-02 0.276 0.126 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 9.29e-01 0.0115 0.128 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 3.22e-01 0.114 0.115 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0941 0.121 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 1.74e-01 -0.169 0.124 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 4.50e-02 -0.2 0.0992 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 1.24e-02 0.31 0.123 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 4.82e-02 -0.211 0.106 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 4.42e-01 0.0931 0.121 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 4.33e-01 0.1 0.127 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 4.42e-01 0.0812 0.106 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 7.84e-01 -0.033 0.12 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 8.35e-01 -0.026 0.124 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 5.59e-01 0.0621 0.106 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 4.94e-01 0.0829 0.121 0.177 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0693 0.102 0.177 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 2.02e-02 0.272 0.116 0.177 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 9.41e-01 0.00845 0.114 0.177 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 7.88e-01 -0.027 0.1 0.177 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0727 0.115 0.177 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0892 0.1 0.177 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000308 0.124 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0452 0.119 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 7.15e-01 0.0448 0.122 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 8.04e-01 0.0319 0.129 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 7.19e-01 -0.038 0.105 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 1.09e-01 -0.171 0.106 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 8.05e-01 0.0253 0.102 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 9.65e-02 -0.199 0.119 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 2.45e-01 -0.122 0.104 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 4.08e-01 0.0898 0.108 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0972 0.11 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 1.88e-01 -0.128 0.0967 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 2.59e-01 -0.127 0.112 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0173 0.0783 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 1.95e-01 0.172 0.132 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 8.98e-03 -0.305 0.115 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 8.59e-01 -0.022 0.124 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 3.32e-01 -0.126 0.13 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 1.90e-01 -0.139 0.106 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 2.23e-01 -0.149 0.122 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 1.82e-01 0.147 0.11 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 6.44e-01 0.0513 0.111 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 3.47e-01 -0.107 0.114 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 2.84e-01 -0.121 0.112 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 1.01e-01 0.191 0.116 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00127 0.101 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 6.38e-04 -0.391 0.113 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0912 0.0806 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 3.84e-01 0.13 0.149 0.174 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 2.39e-01 -0.158 0.133 0.174 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 1.99e-01 0.191 0.148 0.174 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 2.12e-01 0.176 0.14 0.174 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 4.79e-01 0.0944 0.133 0.174 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 4.96e-01 0.0936 0.137 0.174 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 2.56e-01 -0.162 0.142 0.174 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0524 0.119 0.174 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0475 0.0834 0.174 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0385 0.118 0.178 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0682 0.105 0.178 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 6.24e-01 0.0496 0.101 0.178 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 9.23e-01 0.0118 0.122 0.178 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 1.83e-02 -0.28 0.118 0.178 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 1.22e-01 0.182 0.117 0.178 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0444 0.0737 0.178 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 2.80e-01 -0.129 0.12 0.177 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0922 0.113 0.177 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 1.47e-01 0.173 0.119 0.177 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 5.52e-01 0.0637 0.107 0.177 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0145 0.11 0.177 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0497 0.118 0.177 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 3.79e-01 0.0797 0.0904 0.177 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 3.54e-01 -0.114 0.123 0.171 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 8.68e-01 0.022 0.133 0.171 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 3.09e-02 0.29 0.133 0.171 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0478 0.13 0.171 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0306 0.116 0.171 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 3.79e-01 0.0958 0.109 0.171 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 3.13e-01 0.126 0.125 0.171 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 5.20e-01 0.0685 0.106 0.171 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 5.36e-02 0.23 0.119 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 6.54e-02 -0.173 0.0933 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 2.23e-01 0.126 0.103 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 5.10e-01 0.0717 0.109 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 6.05e-01 0.043 0.0829 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 3.46e-01 0.106 0.113 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 2.59e-01 0.109 0.0961 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 5.30e-01 0.043 0.0684 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 4.09e-02 0.246 0.12 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 5.63e-01 0.0613 0.106 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 8.89e-01 0.0163 0.117 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 4.13e-01 0.0942 0.115 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 2.13e-01 -0.107 0.0859 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 4.17e-01 -0.099 0.122 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 6.29e-01 0.0541 0.112 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 4.97e-02 0.155 0.0787 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 9.51e-01 0.00938 0.153 0.179 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 3.18e-01 0.117 0.117 0.179 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 1.16e-01 0.228 0.144 0.179 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 3.02e-01 -0.161 0.155 0.179 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 6.55e-01 0.0661 0.148 0.179 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 2.91e-02 -0.313 0.142 0.179 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0604 0.125 0.179 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 8.77e-01 0.0204 0.131 0.176 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 3.08e-01 -0.13 0.127 0.176 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 3.42e-01 0.127 0.134 0.176 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0388 0.125 0.176 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 9.94e-01 0.000772 0.108 0.176 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 4.16e-01 0.105 0.129 0.176 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 7.75e-01 0.0333 0.116 0.176 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 3.93e-01 0.0709 0.0829 0.176 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 7.97e-01 0.0322 0.125 0.172 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 4.98e-03 -0.335 0.118 0.172 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0433 0.131 0.172 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00936 0.13 0.172 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 4.53e-01 0.0622 0.0827 0.172 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 8.30e-01 0.0278 0.13 0.172 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 2.20e-01 0.151 0.123 0.172 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 2.56e-01 0.124 0.109 0.172 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0341 0.133 0.181 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 9.16e-01 0.0136 0.13 0.181 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0391 0.136 0.181 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0637 0.134 0.181 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 2.04e-01 -0.164 0.129 0.181 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 6.07e-02 -0.26 0.137 0.181 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 3.05e-01 -0.12 0.116 0.181 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0516 0.115 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 4.37e-01 0.0923 0.118 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 5.56e-01 0.0738 0.125 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0919 0.11 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 2.04e-01 0.161 0.126 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 4.16e-01 0.0956 0.117 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 3.28e-01 0.0741 0.0755 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 7.79e-01 0.0297 0.106 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 8.23e-01 0.0235 0.105 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 1.11e-01 -0.116 0.0721 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 5.16e-01 0.0724 0.111 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 5.45e-01 0.0683 0.113 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 5.04e-01 -0.062 0.0927 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00871 0.121 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -831719 sc-eQTL 8.40e-02 -0.185 0.106 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 9.96e-01 0.0005 0.0916 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 7.92e-01 0.0252 0.0955 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 5.41e-01 -0.072 0.118 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0324 0.065 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 6.00e-04 0.372 0.107 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0862 0.0869 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 3.34e-01 0.0909 0.0938 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 3.17e-01 0.102 0.102 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00966 0.0772 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 6.46e-01 0.0484 0.105 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 1.64e-01 0.132 0.0946 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 9.79e-02 0.108 0.0648 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 5.99e-01 0.0665 0.126 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 5.62e-03 -0.322 0.115 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 7.19e-01 0.0418 0.116 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 3.97e-01 -0.11 0.129 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 7.79e-01 0.021 0.0748 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 8.55e-01 0.0227 0.124 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -497725 sc-eQTL 2.83e-01 0.114 0.106 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 5.48e-01 0.0508 0.0846 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -497989 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0598 0.11 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 69200 sc-eQTL 8.68e-02 -0.176 0.102 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -753763 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0462 0.088 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -353871 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0505 0.0997 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 571180 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0678 0.0874 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259769 sc-eQTL 1.33e-03 -0.313 0.096 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0443 0.0722 0.177 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 69200 eQTL 0.00203 -0.052 0.0168 0.0 0.0 0.192
ENSG00000184752 NDUFA12 -283991 eQTL 0.00935 0.0596 0.0229 0.0 0.0 0.192

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 TMCC3 69200 8.09e-06 9.27e-06 1.35e-06 3.51e-06 8.74e-07 1.57e-06 9.53e-06 8.47e-07 4.86e-06 2.81e-06 8.18e-06 3.34e-06 1.13e-05 2.15e-06 2.18e-06 4.62e-06 3.75e-06 3.89e-06 1.38e-06 1.16e-06 2.87e-06 5.46e-06 5.37e-06 1.56e-06 9.79e-06 1.52e-06 2.29e-06 1.62e-06 5.89e-06 4.98e-06 2.83e-06 4.97e-08 3.71e-07 1.8e-06 1.99e-06 9.36e-07 7.58e-07 3.45e-07 1.23e-06 5.64e-07 2.6e-07 1.58e-05 1.39e-06 1.74e-07 5.95e-07 7.26e-07 8.93e-07 6.05e-08 1.56e-07
ENSG00000180263 \N -497725 2.67e-07 1.25e-07 3.28e-08 1.8e-07 1.02e-07 9.57e-08 1.44e-07 5.24e-08 1.41e-07 4.4e-08 1.55e-07 8.02e-08 1.71e-07 6.56e-08 5.44e-08 7.37e-08 5.1e-08 1.18e-07 5.2e-08 3.15e-08 1.04e-07 1.23e-07 1.3e-07 4.99e-08 1.32e-07 1.13e-07 1.12e-07 9.15e-08 1.02e-07 1.12e-07 9.64e-08 3.19e-08 2.75e-08 8.68e-08 9.14e-08 4.26e-08 4.85e-08 8.48e-08 8.3e-08 3.64e-08 3.18e-08 2e-07 4.01e-08 0.0 1.12e-07 1.74e-08 1.46e-07 4.96e-09 4.72e-08