logo

Genes within 1Mb (chr12:94719637:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 1.10e-01 0.176 0.11 0.128 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 3.50e-01 0.121 0.129 0.128 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 1.54e-01 0.138 0.0967 0.128 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 1.60e-01 0.172 0.122 0.128 B L1
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 9.72e-01 0.00395 0.112 0.128 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 5.04e-02 -0.143 0.0729 0.128 B L1
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0432 0.0928 0.128 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 2.27e-01 0.136 0.112 0.128 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 6.54e-01 -0.024 0.0535 0.128 B L1
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0445 0.0899 0.128 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 7.45e-01 0.0254 0.078 0.128 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 5.61e-01 0.0505 0.0869 0.128 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 2.29e-01 0.143 0.118 0.128 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 5.32e-01 0.0478 0.0763 0.128 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 3.42e-01 0.076 0.0799 0.128 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 6.14e-02 0.157 0.0832 0.128 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 4.31e-01 0.0844 0.107 0.128 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 4.88e-01 -0.05 0.0719 0.128 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 2.60e-01 -0.103 0.0914 0.128 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 8.83e-01 0.0172 0.117 0.128 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 1.46e-01 0.152 0.104 0.128 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 2.92e-01 0.104 0.0989 0.128 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 6.69e-01 0.0396 0.0926 0.128 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 2.61e-02 0.168 0.0749 0.128 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0694 0.126 0.128 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 2.76e-01 0.145 0.133 0.128 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0382 0.132 0.128 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 3.66e-01 0.116 0.127 0.128 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0649 0.119 0.128 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 2.84e-01 0.114 0.106 0.128 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 2.40e-02 -0.265 0.117 0.128 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 1.77e-01 0.134 0.099 0.128 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00303 0.116 0.128 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 8.85e-01 0.013 0.0898 0.128 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 9.90e-01 0.00116 0.092 0.128 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 6.02e-01 0.0572 0.11 0.128 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 1.41e-01 0.109 0.0741 0.128 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0989 0.11 0.128 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 4.07e-01 0.0813 0.0978 0.128 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 1.15e-02 0.177 0.0694 0.128 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 2.69e-02 -0.261 0.117 0.127 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 5.69e-01 0.0637 0.112 0.127 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0115 0.0937 0.127 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 6.87e-01 0.0448 0.111 0.127 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 2.74e-01 -0.1 0.0912 0.127 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 4.17e-01 0.0844 0.104 0.127 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 1.07e-02 0.195 0.0755 0.127 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0518 0.132 0.128 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 6.01e-01 0.059 0.113 0.128 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 3.40e-01 0.0982 0.103 0.128 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 2.73e-01 -0.141 0.128 0.128 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 4.60e-01 -0.077 0.104 0.128 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 8.11e-01 0.0281 0.117 0.128 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 4.64e-01 0.0477 0.0651 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 3.17e-01 0.162 0.161 0.107 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 1.52e-01 -0.197 0.137 0.107 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 6.46e-01 0.0775 0.168 0.107 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 7.01e-01 -0.062 0.161 0.107 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 1.94e-01 -0.16 0.123 0.107 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 3.31e-01 -0.126 0.13 0.107 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 6.89e-01 0.0649 0.162 0.107 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 1.19e-01 -0.178 0.113 0.107 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 8.43e-02 -0.246 0.141 0.107 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00626 0.131 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 8.00e-01 0.0336 0.132 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 9.98e-01 0.000337 0.121 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 3.03e-03 0.389 0.13 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 3.27e-01 0.133 0.135 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 5.23e-03 -0.309 0.109 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 7.00e-02 0.223 0.123 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 2.73e-01 0.133 0.121 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 2.70e-01 -0.111 0.1 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 8.82e-02 0.23 0.134 0.127 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 6.57e-01 0.0609 0.137 0.127 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00936 0.131 0.127 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 1.59e-01 0.198 0.14 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0176 0.126 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 3.16e-01 -0.106 0.106 0.127 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 5.25e-03 -0.343 0.122 0.127 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 2.54e-01 0.142 0.124 0.127 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0459 0.1 0.127 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 1.47e-01 0.188 0.129 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 5.60e-01 0.0765 0.131 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 8.63e-02 0.189 0.11 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0255 0.135 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 4.43e-01 -0.102 0.133 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 7.51e-01 0.0354 0.111 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 1.56e-01 -0.163 0.115 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 9.72e-01 0.00439 0.126 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 6.62e-01 0.0321 0.0735 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 2.24e-01 -0.171 0.141 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 2.36e-01 0.153 0.128 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 7.77e-01 0.037 0.13 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 2.62e-01 0.16 0.142 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 4.61e-01 0.0962 0.13 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 1.34e-01 -0.181 0.12 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 2.80e-01 0.138 0.127 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 4.01e-01 0.0897 0.107 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0178 0.105 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0656 0.134 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0311 0.14 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 1.02e-01 -0.23 0.14 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 2.69e-01 -0.123 0.111 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0221 0.125 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 6.91e-01 -0.051 0.128 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 4.14e-01 0.0944 0.115 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 7.65e-01 0.0306 0.103 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 9.68e-01 0.00353 0.0889 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 6.58e-01 0.0481 0.108 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 2.82e-01 0.134 0.125 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 7.49e-01 0.0272 0.0851 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 2.95e-01 0.0963 0.0918 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 4.07e-02 0.161 0.0782 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 2.89e-01 -0.115 0.108 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 8.87e-01 0.0145 0.102 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 6.42e-01 -0.055 0.118 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 2.74e-01 0.151 0.137 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 8.71e-01 0.0165 0.101 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 5.16e-01 0.0702 0.108 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 2.19e-01 0.114 0.0926 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 1.72e-01 -0.189 0.138 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 2.38e-01 0.145 0.122 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0446 0.129 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00887 0.129 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 5.30e-01 0.0694 0.11 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 9.53e-01 0.00726 0.124 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 2.12e-01 0.14 0.112 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 3.94e-01 0.104 0.122 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0619 0.107 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 3.07e-01 -0.124 0.122 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0819 0.135 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 1.74e-01 0.176 0.129 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00305 0.11 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0828 0.121 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 2.12e-01 0.119 0.0952 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 3.79e-01 -0.11 0.125 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 2.16e-01 -0.121 0.0977 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0111 0.114 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 5.42e-01 0.0769 0.126 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 7.79e-01 0.0319 0.114 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 5.31e-01 0.0722 0.115 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 4.25e-01 0.0886 0.111 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 2.46e-01 0.107 0.0917 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 4.98e-01 0.0914 0.135 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 5.90e-01 0.056 0.104 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0253 0.137 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0421 0.138 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 7.94e-01 0.0323 0.123 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 3.67e-01 0.117 0.13 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0782 0.133 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 1.23e-01 0.166 0.107 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 9.46e-01 0.00947 0.14 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 4.88e-01 0.0837 0.121 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 4.31e-01 -0.107 0.136 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 1.06e-01 0.231 0.142 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0745 0.119 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 6.58e-01 0.06 0.135 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 7.19e-01 0.0503 0.14 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0409 0.119 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 8.27e-01 0.0295 0.135 0.13 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 4.13e-01 0.0935 0.114 0.13 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 3.84e-01 0.114 0.131 0.13 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 7.28e-01 0.0443 0.127 0.13 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0243 0.112 0.13 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 7.34e-01 0.0435 0.128 0.13 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 4.44e-01 0.0858 0.112 0.13 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 1.13e-01 -0.217 0.136 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 4.12e-01 0.108 0.131 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 4.22e-01 -0.108 0.135 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 7.91e-01 0.0376 0.142 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0068 0.116 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 6.98e-01 0.0457 0.118 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 2.32e-01 0.135 0.112 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 3.19e-01 -0.132 0.132 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 5.49e-01 0.0693 0.115 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0397 0.12 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 5.91e-01 0.0656 0.122 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0374 0.107 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 4.09e-01 0.102 0.124 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 1.84e-01 0.115 0.0861 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 1.46e-02 -0.353 0.143 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 4.04e-01 0.108 0.129 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 8.22e-02 -0.235 0.135 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0791 0.143 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0523 0.117 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 7.46e-01 0.0436 0.134 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 1.39e-01 0.178 0.12 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0408 0.121 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00961 0.125 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00337 0.123 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 1.44e-01 0.186 0.127 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0762 0.11 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 8.87e-01 0.018 0.127 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 1.03e-02 0.225 0.0871 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 3.72e-01 -0.16 0.178 0.115 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00915 0.161 0.115 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 4.82e-01 0.126 0.178 0.115 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 2.47e-01 -0.196 0.169 0.115 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 3.26e-01 -0.157 0.159 0.115 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00132 0.165 0.115 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 4.74e-01 0.123 0.172 0.115 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 9.41e-01 0.0107 0.143 0.115 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 4.54e-01 0.0752 0.1 0.115 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0884 0.128 0.128 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0164 0.114 0.128 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 7.41e-01 0.0365 0.11 0.128 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 2.74e-01 -0.145 0.132 0.128 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 8.67e-01 0.0218 0.13 0.128 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 2.07e-01 -0.162 0.128 0.128 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 1.85e-01 0.106 0.0801 0.128 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 5.10e-02 -0.26 0.133 0.128 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 6.73e-02 -0.23 0.125 0.128 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0274 0.134 0.128 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 9.16e-01 0.0126 0.12 0.128 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00659 0.123 0.128 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 6.93e-01 0.0521 0.132 0.128 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 2.74e-01 0.111 0.101 0.128 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 3.23e-01 -0.124 0.125 0.137 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 2.18e-01 0.166 0.135 0.137 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0394 0.137 0.137 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 3.99e-01 -0.112 0.132 0.137 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 7.91e-01 0.0313 0.118 0.137 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000853 0.111 0.137 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 2.49e-02 -0.284 0.125 0.137 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 4.43e-02 0.217 0.107 0.137 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0252 0.129 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0184 0.101 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 9.86e-01 0.00197 0.111 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0282 0.117 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 2.15e-01 0.111 0.089 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 2.35e-01 -0.145 0.121 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 7.31e-01 0.0358 0.104 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 2.73e-01 0.0808 0.0735 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 7.75e-01 0.0374 0.131 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0605 0.114 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 9.00e-01 0.0159 0.126 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 9.52e-02 -0.207 0.124 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 8.23e-01 -0.021 0.0933 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0252 0.132 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 6.85e-01 0.0491 0.121 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 3.67e-02 0.179 0.0851 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 2.42e-01 -0.185 0.158 0.13 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 9.44e-01 0.0085 0.121 0.13 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0707 0.151 0.13 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 3.93e-02 -0.33 0.159 0.13 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 1.73e-01 0.208 0.152 0.13 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0448 0.149 0.13 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 6.77e-01 0.0542 0.13 0.13 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 4.05e-01 -0.116 0.139 0.129 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0841 0.135 0.129 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 8.71e-02 -0.242 0.141 0.129 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 6.50e-02 0.244 0.131 0.129 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 2.71e-02 0.251 0.113 0.129 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 3.65e-01 0.125 0.137 0.129 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 6.01e-01 0.0645 0.123 0.129 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 2.39e-03 0.265 0.0861 0.129 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 5.52e-02 0.244 0.127 0.129 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 5.96e-02 0.232 0.122 0.129 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0721 0.134 0.129 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 9.59e-03 0.343 0.131 0.129 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 3.27e-01 0.0832 0.0848 0.129 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 1.59e-01 -0.187 0.132 0.129 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 4.60e-01 0.0933 0.126 0.129 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 1.83e-01 0.149 0.112 0.129 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 9.05e-01 0.0168 0.141 0.141 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 4.54e-01 -0.103 0.137 0.141 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 8.66e-01 0.0243 0.144 0.141 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 1.36e-02 0.347 0.139 0.141 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 4.22e-01 -0.11 0.136 0.141 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 1.23e-01 0.226 0.146 0.141 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00794 0.124 0.141 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0143 0.122 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 1.65e-01 0.183 0.131 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0455 0.139 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 7.83e-01 0.034 0.123 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 1.71e-02 0.335 0.139 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0191 0.131 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 1.41e-02 -0.206 0.0831 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 7.30e-01 0.0407 0.118 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 1.25e-01 0.18 0.116 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0766 0.0807 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 5.08e-01 0.0824 0.124 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 4.73e-01 0.0906 0.126 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 9.78e-02 0.171 0.103 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 6.57e-01 0.06 0.135 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -831839 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0367 0.12 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0292 0.102 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0889 0.107 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 8.51e-01 0.0247 0.132 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 7.47e-01 0.0235 0.0727 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0263 0.118 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 9.16e-01 0.00987 0.0936 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 4.68e-01 0.0733 0.101 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0913 0.11 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 4.69e-01 0.0601 0.0828 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 2.89e-01 -0.12 0.113 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 8.49e-01 0.0195 0.102 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 4.00e-02 0.143 0.0694 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 3.58e-01 0.122 0.132 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 8.38e-01 0.0252 0.123 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 2.73e-01 -0.133 0.121 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 2.35e-03 0.41 0.133 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 8.84e-02 0.133 0.078 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0573 0.13 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -497845 sc-eQTL 2.46e-01 0.129 0.111 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 1.50e-02 0.215 0.0876 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -498109 sc-eQTL 8.55e-02 -0.211 0.122 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 69080 sc-eQTL 5.21e-01 0.0736 0.115 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -753883 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00964 0.0981 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -353991 sc-eQTL 2.17e-01 0.137 0.111 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 571060 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0885 0.0973 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259649 sc-eQTL 4.13e-01 0.0898 0.11 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -284111 sc-eQTL 1.39e-02 0.197 0.0794 0.125 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111142 METAP2 -753883 pQTL 0.0298 0.0415 0.0191 0.0 0.0 0.124

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina