logo

Genes within 1Mb (chr12:94719115:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 1.39e-01 0.153 0.103 0.158 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 4.11e-01 0.1 0.121 0.158 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0773 0.091 0.158 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 5.24e-01 0.0734 0.115 0.158 B L1
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00368 0.105 0.158 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 5.62e-01 0.04 0.0689 0.158 B L1
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0613 0.087 0.158 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0471 0.105 0.158 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 9.48e-02 -0.0837 0.0499 0.158 B L1
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00752 0.0855 0.158 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0914 0.074 0.158 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0471 0.0826 0.158 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0618 0.113 0.158 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0443 0.0726 0.158 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 7.52e-02 -0.135 0.0755 0.158 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 6.67e-01 0.0344 0.0797 0.158 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0247 0.102 0.158 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 6.69e-03 -0.185 0.0677 0.158 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 1.08e-01 -0.141 0.0872 0.158 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 1.90e-01 -0.146 0.111 0.158 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00644 0.0999 0.158 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0552 0.0949 0.158 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0154 0.0886 0.158 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 3.66e-01 0.0657 0.0724 0.158 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 4.03e-01 -0.101 0.121 0.162 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0894 0.128 0.162 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 9.45e-01 0.00883 0.127 0.162 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 1.52e-01 -0.176 0.122 0.162 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 6.77e-01 0.0479 0.115 0.162 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 9.76e-01 0.00304 0.102 0.162 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 1.68e-01 0.157 0.113 0.162 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0376 0.0957 0.162 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 2.20e-04 0.41 0.109 0.158 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 1.67e-01 -0.121 0.0872 0.158 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 4.69e-01 0.065 0.0896 0.158 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0187 0.107 0.158 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 9.12e-01 0.00807 0.0726 0.158 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 5.77e-01 0.0598 0.107 0.158 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 6.46e-01 0.0439 0.0955 0.158 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 8.31e-02 0.119 0.0682 0.158 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0369 0.113 0.159 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 2.58e-02 -0.236 0.105 0.159 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 1.46e-01 -0.13 0.0889 0.159 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0513 0.106 0.159 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 1.49e-01 -0.126 0.0867 0.159 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 4.64e-03 -0.278 0.0972 0.159 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0222 0.0731 0.159 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 9.35e-01 0.0102 0.124 0.158 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 1.13e-01 -0.168 0.105 0.158 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 3.54e-01 0.0896 0.0965 0.158 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 2.97e-01 -0.126 0.12 0.158 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0126 0.098 0.158 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 2.25e-01 -0.134 0.11 0.158 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0391 0.0613 0.158 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0435 0.147 0.148 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0705 0.125 0.148 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000409 0.153 0.148 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 1.69e-01 -0.202 0.146 0.148 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 5.00e-02 0.219 0.111 0.148 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 7.69e-01 0.0349 0.118 0.148 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 1.64e-01 -0.205 0.147 0.148 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 5.57e-01 0.061 0.104 0.148 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 6.86e-01 0.0526 0.13 0.148 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 8.84e-01 0.018 0.123 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 4.22e-02 0.252 0.123 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0411 0.114 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 7.51e-01 0.0397 0.125 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 4.23e-01 0.102 0.128 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0491 0.105 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 5.94e-01 -0.062 0.116 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 3.79e-01 -0.1 0.114 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 2.83e-02 -0.206 0.0933 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0183 0.129 0.157 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 9.52e-01 0.00797 0.131 0.157 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 9.72e-01 0.00436 0.126 0.157 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 4.16e-01 0.11 0.135 0.157 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 1.66e-01 -0.166 0.12 0.157 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 2.82e-01 0.109 0.101 0.157 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 8.21e-01 0.0269 0.119 0.157 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 7.10e-01 0.0445 0.12 0.157 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0901 0.0961 0.157 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 4.93e-01 0.0851 0.124 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0454 0.125 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 8.35e-01 -0.022 0.106 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 2.83e-01 -0.138 0.128 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0551 0.127 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 4.61e-01 0.0787 0.106 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0275 0.11 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 3.18e-01 0.12 0.12 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0429 0.0702 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 1.50e-01 0.192 0.133 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 8.04e-01 0.0304 0.122 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0876 0.123 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 1.76e-02 0.319 0.133 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0349 0.124 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0459 0.114 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0752 0.121 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0569 0.101 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 5.76e-01 0.0557 0.0994 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 3.13e-01 0.13 0.129 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 3.08e-01 0.137 0.135 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 1.92e-01 -0.177 0.135 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0976 0.107 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 7.50e-01 0.0385 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0225 0.123 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 9.97e-01 -0.00037 0.111 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 6.31e-01 0.047 0.0975 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0994 0.0842 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0721 0.103 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 3.06e-01 -0.122 0.119 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 1.18e-01 -0.126 0.0804 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 8.42e-02 -0.151 0.0869 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 8.30e-01 0.0161 0.0751 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 3.07e-01 0.105 0.103 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0939 0.0965 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 1.47e-01 -0.163 0.112 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 8.11e-01 0.0314 0.131 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 9.11e-01 0.0108 0.0963 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 9.83e-01 0.00213 0.103 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00594 0.0885 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0633 0.131 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 6.40e-01 0.0544 0.116 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 1.32e-01 0.184 0.122 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 5.48e-01 0.0739 0.123 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 2.02e-01 0.134 0.104 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 1.68e-01 -0.162 0.117 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 6.98e-01 0.0414 0.106 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 3.15e-01 0.118 0.117 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 2.52e-02 -0.23 0.102 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0858 0.117 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 1.45e-01 -0.189 0.129 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 2.79e-01 -0.135 0.124 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00375 0.106 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0181 0.117 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 4.49e-02 0.184 0.091 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0299 0.12 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 8.71e-01 0.0152 0.0935 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 2.15e-01 -0.134 0.108 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 1.04e-01 -0.195 0.119 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00336 0.108 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0244 0.11 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 6.64e-01 0.0461 0.106 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 5.02e-01 0.0589 0.0876 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 9.29e-01 -0.012 0.134 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0421 0.103 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 2.00e-02 0.314 0.134 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 9.33e-01 0.0116 0.137 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 8.63e-01 0.0211 0.123 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0841 0.129 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 3.46e-02 -0.279 0.131 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0803 0.107 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 9.32e-02 0.22 0.131 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 8.69e-03 -0.294 0.111 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 9.92e-01 0.00122 0.128 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 5.52e-01 0.08 0.134 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 4.06e-01 0.0927 0.111 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 2.94e-01 -0.133 0.127 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00474 0.131 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 7.46e-01 0.0363 0.112 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0639 0.127 0.158 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 2.19e-01 -0.132 0.107 0.158 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 2.46e-02 0.275 0.122 0.158 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 3.03e-01 0.123 0.119 0.158 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 6.17e-01 0.0526 0.105 0.158 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 1.96e-01 -0.155 0.12 0.158 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 7.21e-01 0.0376 0.105 0.158 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00291 0.129 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 4.72e-01 0.0891 0.124 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 6.20e-01 0.0632 0.127 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0235 0.134 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0792 0.109 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 1.08e-01 -0.178 0.11 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 4.25e-01 0.0849 0.106 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 3.36e-02 -0.267 0.125 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 6.23e-02 -0.204 0.109 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0343 0.114 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 2.24e-01 -0.141 0.116 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 1.44e-01 -0.149 0.102 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 2.02e-01 -0.15 0.117 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 9.51e-01 0.00509 0.0823 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 8.02e-02 0.245 0.139 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 9.23e-06 -0.539 0.118 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 9.20e-01 0.0131 0.131 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0872 0.138 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0827 0.113 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 3.16e-01 -0.13 0.129 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 1.25e-01 0.178 0.116 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 4.71e-01 0.0846 0.117 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 1.58e-01 -0.17 0.12 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 3.00e-01 -0.124 0.119 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 2.50e-01 0.142 0.123 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0205 0.107 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 4.13e-02 -0.249 0.121 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0999 0.0852 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 3.77e-02 0.344 0.164 0.141 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 4.20e-01 -0.121 0.15 0.141 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 2.76e-01 0.181 0.166 0.141 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 5.19e-01 0.102 0.158 0.141 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 1.76e-01 0.201 0.148 0.141 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 6.80e-01 0.0636 0.154 0.141 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 1.11e-01 -0.254 0.158 0.141 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0122 0.133 0.141 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0413 0.0934 0.141 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 7.84e-01 0.0338 0.123 0.159 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 1.01e-01 -0.179 0.109 0.159 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 8.59e-01 0.0188 0.106 0.159 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 3.52e-01 -0.119 0.127 0.159 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 4.77e-02 -0.246 0.124 0.159 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 9.69e-01 0.00481 0.124 0.159 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0612 0.0771 0.159 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 3.75e-01 -0.111 0.125 0.158 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 3.24e-01 -0.117 0.118 0.158 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 2.11e-01 0.157 0.125 0.158 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 4.76e-01 0.0802 0.112 0.158 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 9.83e-01 0.00245 0.116 0.158 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 2.56e-01 -0.141 0.123 0.158 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 3.06e-01 0.0972 0.0947 0.158 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0267 0.125 0.159 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 8.15e-01 0.0316 0.135 0.159 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 1.99e-02 0.318 0.135 0.159 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 1.76e-01 -0.179 0.132 0.159 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 6.95e-01 0.0463 0.118 0.159 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 4.97e-01 0.0752 0.111 0.159 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 9.91e-02 0.209 0.126 0.159 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 3.83e-01 0.0944 0.108 0.159 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 1.21e-02 0.308 0.122 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0782 0.0971 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 1.07e-01 0.172 0.106 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0765 0.112 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0212 0.0858 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 4.27e-01 0.0929 0.117 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 8.92e-01 0.0135 0.0998 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 2.33e-01 0.0845 0.0706 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 3.36e-02 0.267 0.125 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 9.88e-01 0.00169 0.111 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 9.63e-01 0.00567 0.122 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 3.60e-01 0.11 0.12 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0543 0.09 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 8.39e-01 0.0259 0.127 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0224 0.117 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 2.84e-02 0.181 0.0821 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 7.36e-01 0.0522 0.155 0.173 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 7.59e-01 0.0364 0.118 0.173 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 3.19e-02 0.313 0.145 0.173 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 2.24e-01 -0.191 0.156 0.173 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 6.84e-01 0.0608 0.149 0.173 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 1.03e-02 -0.37 0.142 0.173 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0125 0.127 0.173 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 2.13e-01 0.166 0.133 0.16 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 3.49e-01 -0.121 0.129 0.16 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0123 0.136 0.16 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0393 0.127 0.16 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0414 0.109 0.16 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 4.56e-01 0.0982 0.132 0.16 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 8.10e-01 0.0285 0.118 0.16 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 3.67e-01 0.0763 0.0843 0.16 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 6.69e-01 0.0541 0.126 0.156 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 3.05e-02 -0.263 0.12 0.156 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0834 0.133 0.156 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00405 0.132 0.156 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 8.82e-01 0.0125 0.084 0.156 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0542 0.131 0.156 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 1.20e-01 0.194 0.124 0.156 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 2.59e-01 0.125 0.111 0.156 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0899 0.136 0.164 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 5.99e-01 -0.07 0.133 0.164 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 4.53e-01 -0.105 0.139 0.164 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0222 0.138 0.164 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 1.07e-01 -0.213 0.131 0.164 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 4.45e-02 -0.285 0.141 0.164 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 1.25e-01 -0.183 0.119 0.164 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0181 0.118 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 9.18e-01 0.0128 0.125 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 4.24e-01 0.106 0.132 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 6.62e-01 -0.051 0.117 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 3.39e-01 0.128 0.134 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 2.82e-01 0.133 0.124 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 5.52e-01 0.0476 0.0799 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 9.80e-01 0.00286 0.112 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0481 0.111 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 3.38e-02 -0.162 0.0759 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 2.14e-01 0.147 0.118 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 5.90e-01 0.0648 0.12 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 6.64e-01 -0.043 0.0988 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 8.20e-01 0.0292 0.129 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -832361 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0392 0.114 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0121 0.0975 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0392 0.102 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 5.61e-01 0.0729 0.125 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0216 0.0692 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 3.00e-04 0.406 0.11 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 4.58e-01 -0.067 0.0902 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 3.78e-01 0.0859 0.0973 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 9.24e-01 0.0101 0.106 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0458 0.08 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 5.24e-01 0.0695 0.109 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 7.53e-01 0.031 0.0985 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 3.61e-02 0.141 0.0669 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 1.13e-01 0.204 0.128 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 1.45e-02 -0.291 0.118 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0211 0.118 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0943 0.132 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0222 0.0763 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0445 0.127 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -498367 sc-eQTL 1.91e-01 0.142 0.108 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 2.74e-01 0.0943 0.0861 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -498631 sc-eQTL 4.83e-01 -0.082 0.117 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 68558 sc-eQTL 1.47e-02 -0.265 0.107 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -754405 sc-eQTL 2.10e-01 -0.117 0.0929 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -354513 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0909 0.106 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 sc-eQTL 2.16e-01 -0.115 0.0924 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 259127 sc-eQTL 1.85e-02 -0.244 0.103 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -284633 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0383 0.0766 0.157 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 68558 eQTL 2.45e-07 -0.0925 0.0178 0.0 0.0 0.175
ENSG00000136040 PLXNC1 570538 eQTL 0.0556 0.0217 0.0113 0.00146 0.0 0.175
ENSG00000258357 AC023161.2 197246 eQTL 0.0111 -0.111 0.0436 0.0 0.0 0.175
ENSG00000258365 AC073655.2 436271 eQTL 0.00843 0.121 0.0458 0.0 0.0 0.175

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 TMCC3 68558 7.28e-06 9.12e-06 1.36e-06 4.25e-06 2.24e-06 3.52e-06 9.48e-06 1.8e-06 6.61e-06 4.24e-06 1.04e-05 4.77e-06 1.16e-05 3.81e-06 2.11e-06 5.95e-06 3.84e-06 5.6e-06 2.63e-06 2.79e-06 4.57e-06 7.85e-06 6.94e-06 3.21e-06 1.18e-05 3.36e-06 4.47e-06 3.16e-06 8.25e-06 7.86e-06 4.3e-06 9.42e-07 1.26e-06 2.99e-06 3.41e-06 2.19e-06 1.72e-06 1.84e-06 1.94e-06 1.01e-06 9.78e-07 9.93e-06 1.16e-06 1.9e-07 7.68e-07 1.49e-06 1.31e-06 8.03e-07 4.36e-07
ENSG00000136014 \N -832361 2.77e-07 1.35e-07 5.72e-08 1.9e-07 9.87e-08 8.45e-08 1.73e-07 5.85e-08 1.5e-07 6.75e-08 1.63e-07 1.15e-07 1.71e-07 7.64e-08 5.72e-08 7.97e-08 4.31e-08 1.44e-07 6.75e-08 5.04e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.58e-07 3.17e-08 1.65e-07 1.26e-07 1.12e-07 1.01e-07 1.24e-07 1.03e-07 1.06e-07 3.59e-08 3.43e-08 8.7e-08 3.52e-08 3.07e-08 5.65e-08 9.17e-08 6.76e-08 4.19e-08 5.8e-08 1.46e-07 5.08e-08 1.11e-08 3.42e-08 1.77e-08 9.96e-08 1.92e-09 4.8e-08
ENSG00000236349 \N 170874 3e-06 2.6e-06 5.33e-07 2.01e-06 7.44e-07 7.53e-07 2.29e-06 8.52e-07 2.24e-06 1.24e-06 2.6e-06 1.65e-06 3.75e-06 1.36e-06 9.27e-07 2.06e-06 1.56e-06 2.21e-06 1.46e-06 1.28e-06 1.37e-06 3.2e-06 2.69e-06 1.62e-06 4.02e-06 1.28e-06 1.46e-06 1.81e-06 2.77e-06 2.29e-06 2e-06 4.53e-07 5.79e-07 1.36e-06 1.56e-06 9.1e-07 9.25e-07 4.21e-07 1.22e-06 3.63e-07 2.22e-07 3.56e-06 6.14e-07 1.89e-07 3.61e-07 3.72e-07 8.74e-07 2.32e-07 1.59e-07